MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017070	AATAT	2	10	647	656	60 %	40 %	0 %	0 %	383080677
2	NC_017070	AAAGG	2	10	780	789	60 %	0 %	40 %	0 %	383080677
3	NC_017070	AAAAT	2	10	1094	1103	80 %	20 %	0 %	0 %	383080677
4	NC_017070	TTTTA	2	10	2549	2558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017070	GTATT	2	10	2852	2861	20 %	60 %	20 %	0 %	383080680
6	NC_017070	GGTCA	2	10	3017	3026	20 %	20 %	40 %	20 %	383080680
7	NC_017070	TGGAA	2	10	4161	4170	40 %	20 %	40 %	0 %	383080681
8	NC_017070	TGGTC	2	10	6496	6505	0 %	40 %	40 %	20 %	383080684
9	NC_017070	CTACG	2	10	10386	10395	20 %	20 %	20 %	40 %	383080686
10	NC_017070	ATTGA	2	10	11522	11531	40 %	40 %	20 %	0 %	383080687
11	NC_017070	ACCAT	2	10	12120	12129	40 %	20 %	0 %	40 %	383080687
12	NC_017070	AAAGA	2	10	12494	12503	80 %	0 %	20 %	0 %	383080687
13	NC_017070	GCGGT	2	10	12836	12845	0 %	20 %	60 %	20 %	383080687
14	NC_017070	TTCGC	2	10	14711	14720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017070	AAAAT	2	10	19563	19572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017070	GTTCA	2	10	20914	20923	20 %	40 %	20 %	20 %	383080695
17	NC_017070	CCTTC	2	10	22445	22454	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017070	AAGAA	2	10	24295	24304	80 %	0 %	20 %	0 %	383080700
19	NC_017070	TTACC	2	10	28113	28122	20 %	40 %	0 %	40 %	383080704
20	NC_017070	ATTCA	2	10	28831	28840	40 %	40 %	0 %	20 %	383080706
21	NC_017070	CTACC	2	10	28884	28893	20 %	20 %	0 %	60 %	383080706
22	NC_017070	TGCTT	2	10	29576	29585	0 %	60 %	20 %	20 %	383080707

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.