MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017070	AAAG	2	8	195	202	75 %	0 %	25 %	0 %	383080677
2	NC_017070	TTCA	2	8	446	453	25 %	50 %	0 %	25 %	383080677
3	NC_017070	ATTT	2	8	696	703	25 %	75 %	0 %	0 %	383080677
4	NC_017070	GCCA	2	8	730	737	25 %	0 %	25 %	50 %	383080677
5	NC_017070	AATG	2	8	1009	1016	50 %	25 %	25 %	0 %	383080677
6	NC_017070	GAAG	2	8	1068	1075	50 %	0 %	50 %	0 %	383080677
7	NC_017070	ATGG	2	8	1557	1564	25 %	25 %	50 %	0 %	383080678
8	NC_017070	GGAA	2	8	2180	2187	50 %	0 %	50 %	0 %	383080678
9	NC_017070	TGAT	2	8	2225	2232	25 %	50 %	25 %	0 %	383080679
10	NC_017070	AATG	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	383080680
11	NC_017070	GACA	2	8	5349	5356	50 %	0 %	25 %	25 %	383080682
12	NC_017070	GTAG	2	8	5666	5673	25 %	25 %	50 %	0 %	383080682
13	NC_017070	TATG	2	8	5696	5703	25 %	50 %	25 %	0 %	383080682
14	NC_017070	CCCT	2	8	6277	6284	0 %	25 %	0 %	75 %	383080683
15	NC_017070	TATC	2	8	7016	7023	25 %	50 %	0 %	25 %	383080684
16	NC_017070	GCCT	2	8	7411	7418	0 %	25 %	25 %	50 %	383080684
17	NC_017070	CTGG	2	8	7574	7581	0 %	25 %	50 %	25 %	383080684
18	NC_017070	TATG	2	8	7635	7642	25 %	50 %	25 %	0 %	383080684
19	NC_017070	CGAG	2	8	8021	8028	25 %	0 %	50 %	25 %	383080684
20	NC_017070	AATG	2	8	8791	8798	50 %	25 %	25 %	0 %	383080685
21	NC_017070	TCAT	2	8	9070	9077	25 %	50 %	0 %	25 %	383080685
22	NC_017070	AGAT	2	8	9171	9178	50 %	25 %	25 %	0 %	383080685
23	NC_017070	ATAA	2	8	9674	9681	75 %	25 %	0 %	0 %	383080685
24	NC_017070	TCAA	2	8	9684	9691	50 %	25 %	0 %	25 %	383080685
25	NC_017070	CAAG	2	8	10248	10255	50 %	0 %	25 %	25 %	383080686
26	NC_017070	GATT	2	8	11865	11872	25 %	50 %	25 %	0 %	383080687
27	NC_017070	CAAG	2	8	13015	13022	50 %	0 %	25 %	25 %	383080687
28	NC_017070	GAAG	2	8	13687	13694	50 %	0 %	50 %	0 %	383080687
29	NC_017070	GCAG	2	8	13945	13952	25 %	0 %	50 %	25 %	383080687
30	NC_017070	CCAT	2	8	15192	15199	25 %	25 %	0 %	50 %	383080689
31	NC_017070	TTTC	2	8	15310	15317	0 %	75 %	0 %	25 %	383080689
32	NC_017070	AAAT	2	8	15630	15637	75 %	25 %	0 %	0 %	383080689
33	NC_017070	AGCG	2	8	16155	16162	25 %	0 %	50 %	25 %	383080689
34	NC_017070	ACAA	2	8	16702	16709	75 %	0 %	0 %	25 %	383080689
35	NC_017070	TATC	2	8	16804	16811	25 %	50 %	0 %	25 %	383080689
36	NC_017070	TTCC	2	8	17556	17563	0 %	50 %	0 %	50 %	383080690
37	NC_017070	ACAA	2	8	17870	17877	75 %	0 %	0 %	25 %	383080690
38	NC_017070	TCTG	2	8	19285	19292	0 %	50 %	25 %	25 %	383080693
39	NC_017070	CTTT	2	8	20050	20057	0 %	75 %	0 %	25 %	383080694
40	NC_017070	TGCC	2	8	20287	20294	0 %	25 %	25 %	50 %	383080694
41	NC_017070	ATTG	2	8	20378	20385	25 %	50 %	25 %	0 %	383080694
42	NC_017070	CTTT	2	8	22749	22756	0 %	75 %	0 %	25 %	383080698
43	NC_017070	CCTG	2	8	22925	22932	0 %	25 %	25 %	50 %	383080698
44	NC_017070	GCCT	2	8	22995	23002	0 %	25 %	25 %	50 %	383080698
45	NC_017070	AATC	2	8	24282	24289	50 %	25 %	0 %	25 %	383080700
46	NC_017070	AAGG	2	8	24719	24726	50 %	0 %	50 %	0 %	383080700
47	NC_017070	CTTC	2	8	24961	24968	0 %	50 %	0 %	50 %	383080700
48	NC_017070	AGAT	2	8	26187	26194	50 %	25 %	25 %	0 %	383080702
49	NC_017070	AATA	2	8	26444	26451	75 %	25 %	0 %	0 %	383080702
50	NC_017070	CCCT	2	8	27806	27813	0 %	25 %	0 %	75 %	383080704
51	NC_017070	AGGC	2	8	29499	29506	25 %	0 %	50 %	25 %	383080707

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.