MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017070	AAG	2	6	1263	1268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017070	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017070	ATT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017070	TTA	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017070	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017070	TAA	2	6	2542	2547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017070	AAC	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017070	TAT	2	6	4595	4600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017070	CCT	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017070	TGT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017070	TAT	2	6	6368	6373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017070	AAC	2	6	6376	6381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017070	TAC	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017070	TCA	2	6	8304	8309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017070	GTT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017070	GCC	2	6	8506	8511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017070	ATG	2	6	8614	8619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017070	GGT	2	6	10938	10943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017070	ACT	2	6	14655	14660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017070	GAG	2	6	14742	14747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017070	TCC	2	6	18578	18583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017070	GGA	2	6	18611	18616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017070	TAT	2	6	18625	18630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017070	TTC	2	6	19516	19521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017070	ACA	2	6	19588	19593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017070	TCT	2	6	19594	19599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017070	AGA	2	6	19700	19705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017070	TAT	2	6	19809	19814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017070	TTC	2	6	19881	19886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017070	TAC	2	6	21949	21954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017070	ATA	2	6	22201	22206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017070	TAT	2	6	22270	22275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017070	TTC	2	6	22523	22528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017070	AAT	2	6	23344	23349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017070	CTC	2	6	23470	23475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017070	AAG	2	6	23676	23681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017070	GAG	2	6	23682	23687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017070	TAG	2	6	25275	25280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017070	TGT	2	6	25288	25293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017070	ATT	2	6	25375	25380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017070	GGT	2	6	25398	25403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017070	AGC	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017070	GAG	2	6	26146	26151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017070	CAT	2	6	26522	26527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017070	TTA	2	6	26532	26537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017070	AGG	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017070	TAA	2	6	28288	28293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017070	TTG	2	6	28578	28583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017070	TAA	2	6	29084	29089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017070	ATT	4	12	29113	29124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017070	TAA	3	9	29126	29134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017070	TAT	2	6	29224	29229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.