MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017070	TGA	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080677
2	NC_017070	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080677
3	NC_017070	GAC	2	6	62	67	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080677
4	NC_017070	AAC	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080677
5	NC_017070	ATT	2	6	468	473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080677
6	NC_017070	ATG	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080677
7	NC_017070	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080677
8	NC_017070	AGA	2	6	564	569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080677
9	NC_017070	ATA	2	6	688	693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080677
10	NC_017070	AAC	2	6	822	827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080677
11	NC_017070	ACA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080677
12	NC_017070	GTT	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080677
13	NC_017070	TGG	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080677
14	NC_017070	AGA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080677
15	NC_017070	GTA	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080678
16	NC_017070	GGC	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080678
17	NC_017070	GAC	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080678
18	NC_017070	GCA	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080678
19	NC_017070	TCT	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080678
20	NC_017070	ATT	2	6	1788	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080678
21	NC_017070	TTA	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080678
22	NC_017070	TGG	2	6	1834	1839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080678
23	NC_017070	TAA	2	6	1852	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080678
24	NC_017070	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080678
25	NC_017070	AGA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080679
26	NC_017070	CGT	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080679
27	NC_017070	AAG	2	6	2344	2349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080679
28	NC_017070	TTA	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080679
29	NC_017070	AGA	2	6	2641	2646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
30	NC_017070	GAA	3	9	2666	2674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
31	NC_017070	GAA	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
32	NC_017070	TGT	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080680
33	NC_017070	ATT	2	6	2915	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080680
34	NC_017070	GCA	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080680
35	NC_017070	AGA	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
36	NC_017070	ATG	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080680
37	NC_017070	AAG	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080680
38	NC_017070	TGA	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080680
39	NC_017070	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080681
40	NC_017070	CTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080681
41	NC_017070	TCA	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080681
42	NC_017070	CAG	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080681
43	NC_017070	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080681
44	NC_017070	TAA	2	6	3744	3749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080681
45	NC_017070	AGC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080681
46	NC_017070	ACA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
47	NC_017070	CTT	2	6	3790	3795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080681
48	NC_017070	ACA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
49	NC_017070	GTT	2	6	3826	3831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080681
50	NC_017070	CAA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
51	NC_017070	CTG	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080681
52	NC_017070	ATA	2	6	3989	3994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080681
53	NC_017070	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080681
54	NC_017070	CAG	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080681
55	NC_017070	TGA	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080681
56	NC_017070	GGT	2	6	4144	4149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080681
57	NC_017070	AAC	2	6	4262	4267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080681
58	NC_017070	ATC	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080682
59	NC_017070	CTT	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080682
60	NC_017070	CTT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080682
61	NC_017070	GCG	2	6	4836	4841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080682
62	NC_017070	TCA	2	6	4849	4854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080682
63	NC_017070	TGC	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080682
64	NC_017070	AGA	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080682
65	NC_017070	TTC	2	6	5048	5053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080682
66	NC_017070	TCA	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080682
67	NC_017070	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080682
68	NC_017070	CTG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080682
69	NC_017070	CAC	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080682
70	NC_017070	ACA	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080682
71	NC_017070	GAA	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080683
72	NC_017070	GCT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080683
73	NC_017070	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080683
74	NC_017070	AAG	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
75	NC_017070	AGC	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080684
76	NC_017070	TTG	2	6	6553	6558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080684
77	NC_017070	TGC	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080684
78	NC_017070	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080684
79	NC_017070	AGG	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080684
80	NC_017070	TGG	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080684
81	NC_017070	CGG	2	6	6919	6924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080684
82	NC_017070	TTG	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080684
83	NC_017070	GAA	2	6	7065	7070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
84	NC_017070	GAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
85	NC_017070	GGA	2	6	7239	7244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080684
86	NC_017070	GAT	2	6	7281	7286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080684
87	NC_017070	TCC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383080684
88	NC_017070	GGA	2	6	7352	7357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080684
89	NC_017070	CCG	2	6	7369	7374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080684
90	NC_017070	CTG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080684
91	NC_017070	CAT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080684
92	NC_017070	CCG	2	6	7550	7555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080684
93	NC_017070	ACA	2	6	7615	7620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080684
94	NC_017070	GAG	2	6	7665	7670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080684
95	NC_017070	CGC	2	6	7719	7724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080684
96	NC_017070	ATG	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080684
97	NC_017070	ACA	2	6	7885	7890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080684
98	NC_017070	AAG	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
99	NC_017070	GAA	2	6	7998	8003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
100	NC_017070	CGG	2	6	8134	8139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080684
101	NC_017070	GAA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080684
102	NC_017070	TGA	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080684
103	NC_017070	GTT	2	6	8198	8203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080684
104	NC_017070	TGA	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080685
105	NC_017070	TAA	2	6	8719	8724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080685
106	NC_017070	ATG	2	6	8766	8771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080685
107	NC_017070	TAA	2	6	8817	8822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080685
108	NC_017070	CAA	2	6	8841	8846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080685
109	NC_017070	AAT	2	6	8939	8944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080685
110	NC_017070	TAT	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080685
111	NC_017070	TGA	2	6	9021	9026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080685
112	NC_017070	GAA	2	6	9083	9088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080685
113	NC_017070	CCA	2	6	9116	9121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080685
114	NC_017070	CAA	2	6	9131	9136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080685
115	NC_017070	TGA	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080685
116	NC_017070	GTT	2	6	9162	9167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080685
117	NC_017070	GTT	2	6	9363	9368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080685
118	NC_017070	TAA	2	6	9450	9455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080685
119	NC_017070	ATT	2	6	9464	9469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080685
120	NC_017070	GTA	2	6	9507	9512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080685
121	NC_017070	TGG	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080685
122	NC_017070	ATA	2	6	9522	9527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080685
123	NC_017070	TTG	2	6	9588	9593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080685
124	NC_017070	TTA	2	6	9605	9610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080685
125	NC_017070	TAT	2	6	9611	9616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080685
126	NC_017070	AGT	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080685
127	NC_017070	GGT	2	6	9874	9879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080685
128	NC_017070	TGA	2	6	9884	9889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080685
129	NC_017070	GCG	2	6	9944	9949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080686
130	NC_017070	GAA	2	6	10053	10058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080686
131	NC_017070	GCG	2	6	10356	10361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080686
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256	NC_017070	ATG	2	6	21377	21382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080695
257	NC_017070	GAA	2	6	21542	21547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080696
258	NC_017070	ATA	2	6	21570	21575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080696
259	NC_017070	CTT	2	6	21611	21616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080696
260	NC_017070	AGA	2	6	21646	21651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080696
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267	NC_017070	GCA	2	6	22799	22804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080698
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269	NC_017070	CCT	2	6	22854	22859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383080698
270	NC_017070	TGG	2	6	22876	22881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080698
271	NC_017070	CAG	2	6	23155	23160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080698
272	NC_017070	TCA	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080698
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275	NC_017070	TGC	2	6	23924	23929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080699
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282	NC_017070	CGA	2	6	24502	24507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080700
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287	NC_017070	AAT	2	6	25028	25033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080700
288	NC_017070	GAA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080700
289	NC_017070	CAG	2	6	25116	25121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080700
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292	NC_017070	TGC	2	6	25500	25505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080701
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.