MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC6

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017070	TA	4	8	1359	1366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017070	AT	3	6	1993	1998	50 %	50 %	0 %	0 %	383080678
3	NC_017070	TA	4	8	2114	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	383080678
4	NC_017070	TA	3	6	2586	2591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017070	TA	3	6	3150	3155	50 %	50 %	0 %	0 %	383080680
6	NC_017070	AT	3	6	3243	3248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017070	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017070	AT	3	6	3558	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	383080681
9	NC_017070	TC	3	6	3776	3781	0 %	50 %	0 %	50 %	383080681
10	NC_017070	AT	3	6	4487	4492	50 %	50 %	0 %	0 %	383080681
11	NC_017070	TA	3	6	4493	4498	50 %	50 %	0 %	0 %	383080681
12	NC_017070	TA	3	6	4566	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017070	TA	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017070	AT	3	6	6350	6355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017070	AT	3	6	6389	6394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017070	GC	3	6	6807	6812	0 %	0 %	50 %	50 %	383080684
17	NC_017070	TG	3	6	7027	7032	0 %	50 %	50 %	0 %	383080684
18	NC_017070	GT	3	6	8445	8450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017070	CT	3	6	9386	9391	0 %	50 %	0 %	50 %	383080685
20	NC_017070	AT	3	6	13558	13563	50 %	50 %	0 %	0 %	383080687
21	NC_017070	GC	3	6	13893	13898	0 %	0 %	50 %	50 %	383080687
22	NC_017070	GA	3	6	15737	15742	50 %	0 %	50 %	0 %	383080689
23	NC_017070	AT	3	6	17074	17079	50 %	50 %	0 %	0 %	383080690
24	NC_017070	AT	3	6	17622	17627	50 %	50 %	0 %	0 %	383080690
25	NC_017070	AT	3	6	17898	17903	50 %	50 %	0 %	0 %	383080690
26	NC_017070	AT	3	6	18081	18086	50 %	50 %	0 %	0 %	383080691
27	NC_017070	CA	3	6	18147	18152	50 %	0 %	0 %	50 %	383080691
28	NC_017070	TA	3	6	18413	18418	50 %	50 %	0 %	0 %	383080691
29	NC_017070	TG	3	6	19390	19395	0 %	50 %	50 %	0 %	383080693
30	NC_017070	CT	3	6	19987	19992	0 %	50 %	0 %	50 %	383080694
31	NC_017070	CT	3	6	21253	21258	0 %	50 %	0 %	50 %	383080695
32	NC_017070	GA	3	6	21278	21283	50 %	0 %	50 %	0 %	383080695
33	NC_017070	CA	3	6	21978	21983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017070	AT	3	6	22236	22241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017070	GA	3	6	22560	22565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017070	TA	3	6	23326	23331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017070	AT	3	6	23441	23446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017070	CT	3	6	23555	23560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017070	AT	3	6	23786	23791	50 %	50 %	0 %	0 %	383080699
40	NC_017070	TA	3	6	25561	25566	50 %	50 %	0 %	0 %	383080701
41	NC_017070	AT	3	6	26526	26531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017070	AT	3	6	26993	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017070	AC	3	6	27456	27461	50 %	0 %	0 %	50 %	383080704
44	NC_017070	TA	3	6	27627	27632	50 %	50 %	0 %	0 %	383080704
45	NC_017070	AG	3	6	28489	28494	50 %	0 %	50 %	0 %	383080705
46	NC_017070	AT	4	8	28629	28636	50 %	50 %	0 %	0 %	383080706
47	NC_017070	AT	3	6	29102	29107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017070	TA	3	6	29202	29207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017070	AT	3	6	29270	29275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017070	AT	3	6	29595	29600	50 %	50 %	0 %	0 %	383080707
51	NC_017070	TA	3	6	29603	29608	50 %	50 %	0 %	0 %	383080707
52	NC_017070	TA	3	6	29802	29807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.