MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	ATTTTT	2	12	4461	4472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017069	TGCGGG	2	12	6386	6397	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383755670
3	NC_017069	TCCTTT	2	12	6433	6444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
4	NC_017069	CTTTTG	2	12	8229	8240	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017069	ATTTTT	2	12	9711	9722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383755674
6	NC_017069	TGCGGG	2	12	12208	12219	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383755680
7	NC_017069	AGGAAA	2	12	17572	17583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755684
8	NC_017069	AGCAAG	2	12	21016	21027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383755690
9	NC_017069	AGGCCA	2	12	22636	22647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755693
10	NC_017069	CAAGAA	2	12	27786	27797	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383755693
11	NC_017069	CAGGGA	2	12	28945	28956	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383755693
12	NC_017069	CAAAAC	2	12	31348	31359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755696
13	NC_017069	TGACAT	2	12	32766	32777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383755697
14	NC_017069	CAAAAA	2	12	34941	34952	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383755697
15	NC_017069	TTGATG	2	12	39722	39733	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383755700
16	NC_017069	ACCGCA	2	12	40114	40125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383755700
17	NC_017069	GTATCA	2	12	41288	41299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383755700
18	NC_017069	CTGCTA	2	12	41942	41953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383755700
19	NC_017069	CAATAT	2	12	42558	42569	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383755700
20	NC_017069	TGAAAA	2	12	43461	43472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383755703
21	NC_017069	ACACAG	2	12	46924	46935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383755713
22	NC_017069	GTTGAT	2	12	48599	48610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383755713
23	NC_017069	CAACCG	2	12	52111	52122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383755716
24	NC_017069	AAAATA	2	12	55708	55719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383755721
25	NC_017069	TATGCT	2	12	55914	55925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383755722
26	NC_017069	AGCGTA	2	12	57489	57500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383755723
27	NC_017069	AAAGTC	2	12	62251	62262	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383755738
28	NC_017069	GGAAGG	2	12	62292	62303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755738
29	NC_017069	AAATAA	2	12	62816	62827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017069	CCTGCC	2	12	63194	63205	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017069	GGGCGA	2	12	66660	66671	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	383755744
32	NC_017069	TGCACC	2	12	67223	67234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383755745
33	NC_017069	AAGTGC	2	12	67318	67329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383755746
34	NC_017069	AAATAT	2	12	68646	68657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755748
35	NC_017069	AAGGAA	2	12	71576	71587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.