MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	GAACG	2	10	213	222	40 %	0 %	40 %	20 %	383755656
2	NC_017069	CCAGC	2	10	900	909	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017069	TGCGG	2	10	2702	2711	0 %	20 %	60 %	20 %	383755661
4	NC_017069	AACAA	2	10	3361	3370	80 %	0 %	0 %	20 %	383755663
5	NC_017069	AAACA	2	10	3534	3543	80 %	0 %	0 %	20 %	383755663
6	NC_017069	TTCAC	2	10	3667	3676	20 %	40 %	0 %	40 %	383755664
7	NC_017069	TTTTC	2	10	6029	6038	0 %	80 %	0 %	20 %	383755670
8	NC_017069	GTTCT	2	10	6288	6297	0 %	60 %	20 %	20 %	383755670
9	NC_017069	CTTTT	2	10	6852	6861	0 %	80 %	0 %	20 %	383755671
10	NC_017069	ACAAG	2	10	6955	6964	60 %	0 %	20 %	20 %	383755671
11	NC_017069	ATAAA	2	10	9006	9015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017069	TAGAA	2	10	9052	9061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017069	AAAAT	2	10	9231	9240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017069	AACAG	2	10	9279	9288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017069	CCGGC	2	10	9997	10006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017069	GTAAG	2	10	10168	10177	40 %	20 %	40 %	0 %	383755675
17	NC_017069	ACCCG	2	10	16546	16555	20 %	0 %	20 %	60 %	383755683
18	NC_017069	CTGTT	2	10	17260	17269	0 %	60 %	20 %	20 %	383755683
19	NC_017069	AAAAG	2	10	20587	20596	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017069	AAAAG	2	10	22232	22241	80 %	0 %	20 %	0 %	383755693
21	NC_017069	AAAAG	2	10	22700	22709	80 %	0 %	20 %	0 %	383755693
22	NC_017069	CGAAA	2	10	23306	23315	60 %	0 %	20 %	20 %	383755693
23	NC_017069	GTGTG	2	10	24452	24461	0 %	40 %	60 %	0 %	383755693
24	NC_017069	CAATA	2	10	25572	25581	60 %	20 %	0 %	20 %	383755693
25	NC_017069	GTTTT	2	10	26032	26041	0 %	80 %	20 %	0 %	383755693
26	NC_017069	GTAAT	2	10	27037	27046	40 %	40 %	20 %	0 %	383755693
27	NC_017069	GCGCA	2	10	28575	28584	20 %	0 %	40 %	40 %	383755693
28	NC_017069	GGCTC	2	10	29693	29702	0 %	20 %	40 %	40 %	383755694
29	NC_017069	GCACG	2	10	31219	31228	20 %	0 %	40 %	40 %	383755696
30	NC_017069	GTATG	2	10	31800	31809	20 %	40 %	40 %	0 %	383755697
31	NC_017069	ATCAC	2	10	32393	32402	40 %	20 %	0 %	40 %	383755697
32	NC_017069	GACAT	2	10	32584	32593	40 %	20 %	20 %	20 %	383755697
33	NC_017069	GAAAA	2	10	34864	34873	80 %	0 %	20 %	0 %	383755697
34	NC_017069	GCTGA	2	10	35134	35143	20 %	20 %	40 %	20 %	383755697
35	NC_017069	GCTGA	2	10	35374	35383	20 %	20 %	40 %	20 %	383755697
36	NC_017069	GTTTG	2	10	40165	40174	0 %	60 %	40 %	0 %	383755700
37	NC_017069	TCGGT	2	10	43232	43241	0 %	40 %	40 %	20 %	383755702
38	NC_017069	GAAAG	2	10	43450	43459	60 %	0 %	40 %	0 %	383755703
39	NC_017069	TGGCG	2	10	44818	44827	0 %	20 %	60 %	20 %	383755708
40	NC_017069	TGTTC	2	10	46127	46136	0 %	60 %	20 %	20 %	383755712
41	NC_017069	CAATC	2	10	48780	48789	40 %	20 %	0 %	40 %	383755713
42	NC_017069	GCAGG	2	10	48816	48825	20 %	0 %	60 %	20 %	383755713
43	NC_017069	AAGAA	2	10	49563	49572	80 %	0 %	20 %	0 %	383755713
44	NC_017069	TCTTT	2	10	51022	51031	0 %	80 %	0 %	20 %	383755715
45	NC_017069	CTTTT	2	10	51931	51940	0 %	80 %	0 %	20 %	383755716
46	NC_017069	ACATT	2	10	53930	53939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017069	CATTG	2	10	55613	55622	20 %	40 %	20 %	20 %	383755721
48	NC_017069	AGGTC	2	10	56170	56179	20 %	20 %	40 %	20 %	383755723
49	NC_017069	AATAC	2	10	59507	59516	60 %	20 %	0 %	20 %	383755725
50	NC_017069	ACAAG	2	10	60261	60270	60 %	0 %	20 %	20 %	383755727
51	NC_017069	ACTTC	2	10	62323	62332	20 %	40 %	0 %	40 %	383755738
52	NC_017069	TCAAA	2	10	63765	63774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017069	GAGGC	2	10	63914	63923	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017069	AAGGC	2	10	65817	65826	40 %	0 %	40 %	20 %	383755743
55	NC_017069	AATTC	2	10	66521	66530	40 %	40 %	0 %	20 %	383755744
56	NC_017069	GTGTT	2	10	67264	67273	0 %	60 %	40 %	0 %	383755746
57	NC_017069	AGGAT	2	10	68210	68219	40 %	20 %	40 %	0 %	383755748
58	NC_017069	CAATC	2	10	69026	69035	40 %	20 %	0 %	40 %	383755750
59	NC_017069	CTTGA	2	10	70493	70502	20 %	40 %	20 %	20 %	383755752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.