MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	GGAA	2	8	150	157	50 %	0 %	50 %	0 %	383755656
2	NC_017069	GCCA	2	8	701	708	25 %	0 %	25 %	50 %	383755656
3	NC_017069	TCGG	2	8	778	785	0 %	25 %	50 %	25 %	383755656
4	NC_017069	AGCC	3	12	922	933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017069	TGTC	2	8	957	964	0 %	50 %	25 %	25 %	383755657
6	NC_017069	ATTT	2	8	1147	1154	25 %	75 %	0 %	0 %	383755658
7	NC_017069	CAAT	2	8	1481	1488	50 %	25 %	0 %	25 %	383755658
8	NC_017069	GGAA	2	8	1546	1553	50 %	0 %	50 %	0 %	383755658
9	NC_017069	GGAA	2	8	1915	1922	50 %	0 %	50 %	0 %	383755659
10	NC_017069	TAAC	2	8	2017	2024	50 %	25 %	0 %	25 %	383755659
11	NC_017069	AGCC	2	8	2268	2275	25 %	0 %	25 %	50 %	383755660
12	NC_017069	CTGC	2	8	2397	2404	0 %	25 %	25 %	50 %	383755661
13	NC_017069	CATA	2	8	2620	2627	50 %	25 %	0 %	25 %	383755661
14	NC_017069	ATCA	2	8	3138	3145	50 %	25 %	0 %	25 %	383755662
15	NC_017069	CCGT	2	8	3299	3306	0 %	25 %	25 %	50 %	383755663
16	NC_017069	TTTG	2	8	3715	3722	0 %	75 %	25 %	0 %	383755664
17	NC_017069	CAGA	2	8	4342	4349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017069	GACG	2	8	5704	5711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017069	TCGG	2	8	6118	6125	0 %	25 %	50 %	25 %	383755670
20	NC_017069	TAAC	2	8	6199	6206	50 %	25 %	0 %	25 %	383755670
21	NC_017069	GGTT	2	8	6279	6286	0 %	50 %	50 %	0 %	383755670
22	NC_017069	CCTC	2	8	6323	6330	0 %	25 %	0 %	75 %	383755670
23	NC_017069	CAGG	2	8	6746	6753	25 %	0 %	50 %	25 %	383755670
24	NC_017069	TCTA	2	8	6993	7000	25 %	50 %	0 %	25 %	383755671
25	NC_017069	CTCG	2	8	7631	7638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017069	ACTA	2	8	8028	8035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017069	AACG	2	8	8507	8514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017069	TAAA	2	8	8608	8615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017069	AACT	2	8	8735	8742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017069	AAAT	2	8	8784	8791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017069	AAAT	2	8	8810	8817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017069	TAGG	2	8	9041	9048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017069	ATAA	2	8	9178	9185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017069	GGAG	2	8	10097	10104	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017069	CTGG	2	8	10132	10139	0 %	25 %	50 %	25 %	383755675
36	NC_017069	TGAT	2	8	10207	10214	25 %	50 %	25 %	0 %	383755675
37	NC_017069	GCAA	2	8	10353	10360	50 %	0 %	25 %	25 %	383755675
38	NC_017069	GCAA	2	8	10559	10566	50 %	0 %	25 %	25 %	383755676
39	NC_017069	GACG	2	8	11209	11216	25 %	0 %	50 %	25 %	383755678
40	NC_017069	TTTG	2	8	11431	11438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017069	TTAC	2	8	12843	12850	25 %	50 %	0 %	25 %	383755680
42	NC_017069	CTTG	2	8	15475	15482	0 %	50 %	25 %	25 %	383755682
43	NC_017069	AGCA	2	8	15963	15970	50 %	0 %	25 %	25 %	383755682
44	NC_017069	GAAC	2	8	15983	15990	50 %	0 %	25 %	25 %	383755682
45	NC_017069	CAAA	2	8	16022	16029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017069	TTAT	2	8	16039	16046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017069	AGCA	2	8	16581	16588	50 %	0 %	25 %	25 %	383755683
48	NC_017069	CGTG	2	8	16661	16668	0 %	25 %	50 %	25 %	383755683
49	NC_017069	TGAA	2	8	16762	16769	50 %	25 %	25 %	0 %	383755683
50	NC_017069	GGCT	2	8	17388	17395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017069	AGGG	2	8	17405	17412	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017069	AAGA	2	8	17450	17457	75 %	0 %	25 %	0 %	383755684
53	NC_017069	TGAT	2	8	17871	17878	25 %	50 %	25 %	0 %	383755685
54	NC_017069	ATGG	2	8	17891	17898	25 %	25 %	50 %	0 %	383755685
55	NC_017069	TGCT	2	8	18030	18037	0 %	50 %	25 %	25 %	383755685
56	NC_017069	AGGA	2	8	18740	18747	50 %	0 %	50 %	0 %	383755686
57	NC_017069	TGAT	2	8	19224	19231	25 %	50 %	25 %	0 %	383755687
58	NC_017069	GTAT	2	8	19480	19487	25 %	50 %	25 %	0 %	383755688
59	NC_017069	AAAT	2	8	19790	19797	75 %	25 %	0 %	0 %	383755689
60	NC_017069	AATA	2	8	20905	20912	75 %	25 %	0 %	0 %	383755690
61	NC_017069	CTTG	2	8	21454	21461	0 %	50 %	25 %	25 %	383755692
62	NC_017069	ATTT	2	8	21653	21660	25 %	75 %	0 %	0 %	383755692
63	NC_017069	ATCA	2	8	21882	21889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017069	GAAA	2	8	22195	22202	75 %	0 %	25 %	0 %	383755693
65	NC_017069	TCGA	2	8	22492	22499	25 %	25 %	25 %	25 %	383755693
66	NC_017069	TCCG	2	8	22940	22947	0 %	25 %	25 %	50 %	383755693
67	NC_017069	AAAG	2	8	23462	23469	75 %	0 %	25 %	0 %	383755693
68	NC_017069	AGCA	2	8	23500	23507	50 %	0 %	25 %	25 %	383755693
69	NC_017069	CTCG	2	8	24479	24486	0 %	25 %	25 %	50 %	383755693
70	NC_017069	ATCC	2	8	26766	26773	25 %	25 %	0 %	50 %	383755693
71	NC_017069	ACCA	2	8	27475	27482	50 %	0 %	0 %	50 %	383755693
72	NC_017069	CAAG	2	8	27659	27666	50 %	0 %	25 %	25 %	383755693
73	NC_017069	TCAA	2	8	27834	27841	50 %	25 %	0 %	25 %	383755693
74	NC_017069	CTGT	2	8	29930	29937	0 %	50 %	25 %	25 %	383755694
75	NC_017069	TGGC	2	8	30341	30348	0 %	25 %	50 %	25 %	383755695
76	NC_017069	AAAC	2	8	30969	30976	75 %	0 %	0 %	25 %	383755696
77	NC_017069	TTGG	2	8	31654	31661	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
78	NC_017069	TTGG	2	8	31681	31688	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
79	NC_017069	TTAT	2	8	32057	32064	25 %	75 %	0 %	0 %	383755697
80	NC_017069	AAGA	2	8	32074	32081	75 %	0 %	25 %	0 %	383755697
81	NC_017069	GCAA	2	8	32112	32119	50 %	0 %	25 %	25 %	383755697
82	NC_017069	ACGA	2	8	33925	33932	50 %	0 %	25 %	25 %	383755697
83	NC_017069	GTCT	2	8	34320	34327	0 %	50 %	25 %	25 %	383755697
84	NC_017069	AAGT	2	8	35225	35232	50 %	25 %	25 %	0 %	383755697
85	NC_017069	ACTT	2	8	35445	35452	25 %	50 %	0 %	25 %	383755697
86	NC_017069	AAGA	2	8	35623	35630	75 %	0 %	25 %	0 %	383755697
87	NC_017069	AAAG	2	8	36133	36140	75 %	0 %	25 %	0 %	383755697
88	NC_017069	TTAT	2	8	36538	36545	25 %	75 %	0 %	0 %	383755698
89	NC_017069	GATA	2	8	37022	37029	50 %	25 %	25 %	0 %	383755699
90	NC_017069	TTCT	2	8	37213	37220	0 %	75 %	0 %	25 %	383755699
91	NC_017069	CAAC	2	8	38516	38523	50 %	0 %	0 %	50 %	383755700
92	NC_017069	GCAA	2	8	38595	38602	50 %	0 %	25 %	25 %	383755700
93	NC_017069	AAGC	2	8	39436	39443	50 %	0 %	25 %	25 %	383755700
94	NC_017069	CTGG	2	8	39695	39702	0 %	25 %	50 %	25 %	383755700
95	NC_017069	GTCG	2	8	39843	39850	0 %	25 %	50 %	25 %	383755700
96	NC_017069	AACC	2	8	39872	39879	50 %	0 %	0 %	50 %	383755700
97	NC_017069	GGCT	2	8	40884	40891	0 %	25 %	50 %	25 %	383755700
98	NC_017069	CAAA	2	8	40961	40968	75 %	0 %	0 %	25 %	383755700
99	NC_017069	GACG	2	8	41599	41606	25 %	0 %	50 %	25 %	383755700
100	NC_017069	TTCT	2	8	41654	41661	0 %	75 %	0 %	25 %	383755700
101	NC_017069	TAAA	2	8	42966	42973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017069	ACAA	2	8	43395	43402	75 %	0 %	0 %	25 %	383755703
103	NC_017069	GCTG	2	8	43615	43622	0 %	25 %	50 %	25 %	383755704
104	NC_017069	TTGC	2	8	43623	43630	0 %	50 %	25 %	25 %	383755704
105	NC_017069	CTGG	2	8	43692	43699	0 %	25 %	50 %	25 %	383755704
106	NC_017069	TGAT	2	8	44020	44027	25 %	50 %	25 %	0 %	383755706
107	NC_017069	TGGC	2	8	44311	44318	0 %	25 %	50 %	25 %	383755707
108	NC_017069	AAAG	2	8	44727	44734	75 %	0 %	25 %	0 %	383755707
109	NC_017069	GAAT	2	8	44745	44752	50 %	25 %	25 %	0 %	383755708
110	NC_017069	AAGA	2	8	45325	45332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017069	TATG	2	8	45659	45666	25 %	50 %	25 %	0 %	383755710
112	NC_017069	TTGA	2	8	45706	45713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017069	TGGT	2	8	46584	46591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017069	GCCA	2	8	46795	46802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017069	GCTG	2	8	47849	47856	0 %	25 %	50 %	25 %	383755713
116	NC_017069	TCCC	2	8	48131	48138	0 %	25 %	0 %	75 %	383755713
117	NC_017069	CATC	2	8	48324	48331	25 %	25 %	0 %	50 %	383755713
118	NC_017069	TATG	2	8	48476	48483	25 %	50 %	25 %	0 %	383755713
119	NC_017069	ATCT	2	8	48839	48846	25 %	50 %	0 %	25 %	383755713
120	NC_017069	GCTG	2	8	49069	49076	0 %	25 %	50 %	25 %	383755713
121	NC_017069	CAAG	2	8	49219	49226	50 %	0 %	25 %	25 %	383755713
122	NC_017069	AGAA	2	8	50129	50136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017069	TGAT	2	8	50413	50420	25 %	50 %	25 %	0 %	383755714
124	NC_017069	TATT	2	8	50690	50697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017069	TATG	2	8	50734	50741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017069	TTAT	2	8	50823	50830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017069	ATTT	2	8	52489	52496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017069	ATTT	2	8	52505	52512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017069	TATG	2	8	52515	52522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017069	ACAA	2	8	53316	53323	75 %	0 %	0 %	25 %	383755717
131	NC_017069	TATT	2	8	53844	53851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017069	ATTT	2	8	54127	54134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017069	GCTG	2	8	54441	54448	0 %	25 %	50 %	25 %	383755719
134	NC_017069	TATG	2	8	55131	55138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017069	TGTT	2	8	55151	55158	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017069	TGTA	2	8	55161	55168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017069	TTGG	2	8	55252	55259	0 %	50 %	50 %	0 %	383755720
138	NC_017069	ATGT	2	8	55433	55440	25 %	50 %	25 %	0 %	383755720
139	NC_017069	TACA	2	8	56076	56083	50 %	25 %	0 %	25 %	383755722
140	NC_017069	TAAA	2	8	56457	56464	75 %	25 %	0 %	0 %	383755723
141	NC_017069	TATC	2	8	56592	56599	25 %	50 %	0 %	25 %	383755723
142	NC_017069	TCGG	2	8	57434	57441	0 %	25 %	50 %	25 %	383755723
143	NC_017069	TCAG	2	8	57861	57868	25 %	25 %	25 %	25 %	383755723
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.