MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	CAA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755656
2	NC_017069	GCT	2	6	530	535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755656
3	NC_017069	TCA	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755656
4	NC_017069	GTC	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755656
5	NC_017069	GGT	2	6	787	792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755656
6	NC_017069	AAC	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755657
7	NC_017069	AAC	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017069	ACT	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755658
9	NC_017069	AGA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755658
10	NC_017069	TAG	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755658
11	NC_017069	CAG	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755658
12	NC_017069	TGA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755658
13	NC_017069	CTC	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755658
14	NC_017069	CCT	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755659
15	NC_017069	CGT	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755659
16	NC_017069	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017069	AGT	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755660
18	NC_017069	TGG	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755660
19	NC_017069	TCA	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755660
20	NC_017069	AAC	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755661
21	NC_017069	TGA	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755661
22	NC_017069	CCT	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755661
23	NC_017069	GCT	3	9	2919	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755661
24	NC_017069	TGC	2	6	2930	2935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755661
25	NC_017069	TTC	2	6	3018	3023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755662
26	NC_017069	CCT	2	6	3197	3202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017069	CCA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755663
28	NC_017069	TCG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755663
29	NC_017069	CAT	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755663
30	NC_017069	ATA	2	6	3548	3553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755663
31	NC_017069	GAA	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755664
32	NC_017069	TCG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755664
33	NC_017069	TCG	2	6	3802	3807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755664
34	NC_017069	ACA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755664
35	NC_017069	AAT	2	6	3826	3831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755664
36	NC_017069	ATG	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755665
37	NC_017069	CCT	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017069	CAT	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017069	ATA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017069	ACC	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755666
41	NC_017069	ATT	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755666
42	NC_017069	TGT	2	6	4873	4878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755667
43	NC_017069	CTG	2	6	4940	4945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755667
44	NC_017069	TGT	2	6	5029	5034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755667
45	NC_017069	ACA	2	6	5057	5062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017069	ATG	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017069	ATG	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017069	CTA	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755668
49	NC_017069	CGC	2	6	5369	5374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755668
50	NC_017069	TGA	2	6	5411	5416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755668
51	NC_017069	TCC	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755668
52	NC_017069	CCG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755668
53	NC_017069	TAG	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755669
54	NC_017069	GTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755669
55	NC_017069	GTG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755669
56	NC_017069	CCT	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
57	NC_017069	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
58	NC_017069	GGC	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755670
59	NC_017069	TCG	2	6	5963	5968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755670
60	NC_017069	TCT	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
61	NC_017069	CTC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
62	NC_017069	CCA	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755670
63	NC_017069	CGG	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755670
64	NC_017069	CAT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755670
65	NC_017069	CGT	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755670
66	NC_017069	CCT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
67	NC_017069	GAA	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755670
68	NC_017069	GAT	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755670
69	NC_017069	ATG	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755670
70	NC_017069	TTG	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755671
71	NC_017069	AGT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755672
72	NC_017069	CCA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755672
73	NC_017069	CGA	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755672
74	NC_017069	ATT	2	6	7255	7260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755672
75	NC_017069	ATT	2	6	7361	7366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755673
76	NC_017069	CCT	2	6	7428	7433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017069	AAC	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017069	GCG	2	6	7518	7523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017069	CCT	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017069	GTG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017069	ATT	2	6	7758	7763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017069	CTA	2	6	7776	7781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017069	GTT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017069	CTT	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017069	ACA	2	6	8182	8187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017069	CAT	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017069	GGC	2	6	8651	8656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017069	AAT	2	6	8743	8748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017069	ATA	2	6	8882	8887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017069	ATA	2	6	8913	8918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017069	TAG	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017069	ATA	2	6	8971	8976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017069	AAT	2	6	9016	9021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017069	ATA	2	6	9104	9109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017069	ATA	2	6	9123	9128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017069	TAT	2	6	9258	9263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017069	TGT	2	6	9273	9278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017069	ACA	2	6	9661	9666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755674
99	NC_017069	TTA	2	6	9907	9912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017069	GCG	2	6	9922	9927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017069	TCG	2	6	9959	9964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017069	TCA	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017069	CGG	3	9	10183	10191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755675
104	NC_017069	TGT	2	6	10195	10200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755675
105	NC_017069	TGC	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755675
106	NC_017069	TCA	2	6	10345	10350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755675
107	NC_017069	CAA	2	6	10435	10440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017069	AGA	2	6	10442	10447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017069	TAT	2	6	10449	10454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017069	TAT	2	6	10473	10478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017069	TTC	2	6	10500	10505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755676
112	NC_017069	GGA	2	6	10609	10614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755676
113	NC_017069	TGA	2	6	10703	10708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755677
114	NC_017069	GGC	2	6	10848	10853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017069	CGC	2	6	10856	10861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017069	TGG	2	6	10915	10920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017069	AGG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017069	CTT	2	6	11171	11176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755678
119	NC_017069	AGA	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755678
120	NC_017069	TTA	2	6	11346	11351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017069	TCC	2	6	11542	11547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017069	CGA	2	6	11652	11657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755679
123	NC_017069	CAA	2	6	11661	11666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755679
124	NC_017069	CAA	2	6	11697	11702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755679
125	NC_017069	CAA	2	6	11835	11840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755679
126	NC_017069	AGT	2	6	12012	12017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755679
127	NC_017069	AGC	2	6	12065	12070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755679
128	NC_017069	TGA	2	6	12149	12154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755680
129	NC_017069	GGA	2	6	12323	12328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755680
130	NC_017069	GAA	2	6	12353	12358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755680
131	NC_017069	ATT	2	6	12420	12425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755680
132	NC_017069	GAA	2	6	12522	12527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755680
133	NC_017069	GAG	2	6	12567	12572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755680
134	NC_017069	ATC	2	6	12591	12596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755680
135	NC_017069	CAA	2	6	12602	12607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755680
136	NC_017069	TCA	2	6	12682	12687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755680
137	NC_017069	CGC	2	6	12732	12737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755680
138	NC_017069	CTG	2	6	12765	12770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755680
139	NC_017069	ACC	2	6	12786	12791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755680
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141	NC_017069	ACT	2	6	13054	13059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755680
142	NC_017069	ATG	2	6	13068	13073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755680
143	NC_017069	ATT	2	6	13168	13173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755680
144	NC_017069	ATT	2	6	13344	13349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755680
145	NC_017069	TGA	2	6	13607	13612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755680
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147	NC_017069	TGC	2	6	14101	14106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755681
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153	NC_017069	CGG	2	6	14506	14511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755681
154	NC_017069	ATT	2	6	14594	14599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755681
155	NC_017069	GAA	2	6	14623	14628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755681
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159	NC_017069	TAC	2	6	15103	15108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755682
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161	NC_017069	CTG	2	6	15242	15247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755682
162	NC_017069	ATA	2	6	15265	15270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755682
163	NC_017069	TGC	2	6	15311	15316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755682
164	NC_017069	GAA	2	6	15594	15599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755682
165	NC_017069	GAA	2	6	15636	15641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755682
166	NC_017069	GCA	2	6	15681	15686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755682
167	NC_017069	GAA	2	6	15711	15716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755682
168	NC_017069	CGA	2	6	15995	16000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755682
169	NC_017069	TAC	2	6	16291	16296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_017069	CTG	2	6	16426	16431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755683
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237	NC_017069	TAA	2	6	21931	21936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_017069	GGC	2	6	22115	22120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755693
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