MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	AAC	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017069	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017069	CCT	2	6	3197	3202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017069	CCT	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017069	CAT	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017069	ATA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017069	ACA	2	6	5057	5062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017069	ATG	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017069	ATG	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017069	CCT	2	6	7428	7433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017069	AAC	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017069	GCG	2	6	7518	7523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017069	CCT	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017069	GTG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017069	ATT	2	6	7758	7763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017069	CTA	2	6	7776	7781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017069	GTT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017069	CTT	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017069	ACA	2	6	8182	8187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017069	CAT	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017069	GGC	2	6	8651	8656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017069	AAT	2	6	8743	8748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017069	ATA	2	6	8882	8887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017069	ATA	2	6	8913	8918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017069	TAG	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017069	ATA	2	6	8971	8976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017069	AAT	2	6	9016	9021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017069	ATA	2	6	9104	9109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017069	ATA	2	6	9123	9128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017069	TAT	2	6	9258	9263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017069	TGT	2	6	9273	9278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017069	TTA	2	6	9907	9912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017069	GCG	2	6	9922	9927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017069	TCG	2	6	9959	9964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017069	TCA	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017069	CAA	2	6	10435	10440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017069	AGA	2	6	10442	10447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017069	TAT	2	6	10449	10454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017069	TAT	2	6	10473	10478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017069	GGC	2	6	10848	10853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017069	CGC	2	6	10856	10861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017069	TGG	2	6	10915	10920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017069	AGG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017069	TTA	2	6	11346	11351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017069	TCC	2	6	11542	11547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017069	TAC	2	6	16291	16296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017069	TAT	2	6	21911	21916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017069	TAA	2	6	21931	21936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017069	AGG	2	6	21948	21953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017069	CGT	2	6	37461	37466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017069	GAA	2	6	42630	42635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017069	GGT	3	9	42638	42646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017069	ACG	2	6	42917	42922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017069	CTG	2	6	46693	46698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017069	GCC	2	6	46721	46726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017069	CTT	2	6	46803	46808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017069	CTG	2	6	50074	50079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017069	GCC	2	6	50648	50653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017069	ACA	2	6	52407	52412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017069	CAA	2	6	52461	52466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017069	TAT	2	6	52571	52576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017069	CAT	2	6	52603	52608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017069	ACA	2	6	52651	52656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017069	ACA	2	6	52664	52669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017069	ACT	2	6	52778	52783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017069	CAG	2	6	52800	52805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017069	TAT	2	6	52826	52831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017069	AAT	2	6	52846	52851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017069	ATT	2	6	53755	53760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017069	AAT	2	6	53783	53788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017069	ATA	2	6	53914	53919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017069	TAT	2	6	53950	53955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017069	TAA	2	6	54116	54121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017069	AGG	2	6	54194	54199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017069	ACA	2	6	62853	62858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017069	TCT	2	6	62919	62924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017069	TGT	2	6	62942	62947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017069	CTT	2	6	63016	63021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017069	GTT	2	6	63070	63075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017069	CCT	2	6	63079	63084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017069	CCA	2	6	63111	63116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017069	TGG	2	6	63119	63124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017069	GGT	2	6	63179	63184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017069	TAT	2	6	63290	63295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017069	TAC	2	6	63297	63302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017069	CGT	2	6	63317	63322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017069	GCA	2	6	63451	63456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017069	GGT	2	6	63483	63488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017069	ATC	2	6	63512	63517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017069	AAC	2	6	63678	63683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017069	CAA	2	6	63717	63722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017069	GAA	2	6	63729	63734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017069	TAC	2	6	63743	63748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017069	AAC	2	6	63800	63805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017069	GTG	2	6	63819	63824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017069	AGG	2	6	64071	64076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017069	ATT	2	6	67527	67532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017069	TAA	2	6	68664	68669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017069	TAA	2	6	68737	68742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017069	ACC	2	6	68775	68780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017069	GGT	2	6	68785	68790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017069	GCG	2	6	70321	70326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017069	AAT	2	6	71267	71272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017069	TAT	2	6	71281	71286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017069	ATG	2	6	71425	71430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017069	CCG	2	6	71516	71521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017069	GGC	2	6	71526	71531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.