MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	AT	3	6	6	11	50 %	50 %	0 %	0 %	383755656
2	NC_017069	AT	3	6	50	55	50 %	50 %	0 %	0 %	383755656
3	NC_017069	TA	3	6	1569	1574	50 %	50 %	0 %	0 %	383755658
4	NC_017069	CT	3	6	2338	2343	0 %	50 %	0 %	50 %	383755660
5	NC_017069	CT	3	6	2562	2567	0 %	50 %	0 %	50 %	383755661
6	NC_017069	CT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	0 %	50 %	383755661
7	NC_017069	TC	3	6	3554	3559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017069	AT	4	8	3621	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	383755664
9	NC_017069	TG	3	6	6458	6463	0 %	50 %	50 %	0 %	383755670
10	NC_017069	AT	3	6	6612	6617	50 %	50 %	0 %	0 %	383755670
11	NC_017069	CG	3	6	6692	6697	0 %	0 %	50 %	50 %	383755670
12	NC_017069	TA	3	6	7780	7785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017069	CA	3	6	8018	8023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017069	AC	3	6	8192	8197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017069	CA	3	6	8550	8555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017069	TA	3	6	8570	8575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017069	CA	3	6	9222	9227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017069	TA	3	6	9323	9328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017069	AT	3	6	9467	9472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017069	TA	3	6	9559	9564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017069	TA	3	6	9880	9885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017069	AG	4	8	10071	10078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017069	TC	3	6	10597	10602	0 %	50 %	0 %	50 %	383755676
24	NC_017069	AG	3	6	10629	10634	50 %	0 %	50 %	0 %	383755676
25	NC_017069	AT	3	6	11518	11523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017069	AT	3	6	13541	13546	50 %	50 %	0 %	0 %	383755680
27	NC_017069	AG	3	6	13864	13869	50 %	0 %	50 %	0 %	383755681
28	NC_017069	TG	3	6	15377	15382	0 %	50 %	50 %	0 %	383755682
29	NC_017069	CT	3	6	15696	15701	0 %	50 %	0 %	50 %	383755682
30	NC_017069	TG	3	6	16805	16810	0 %	50 %	50 %	0 %	383755683
31	NC_017069	GT	3	6	17212	17217	0 %	50 %	50 %	0 %	383755683
32	NC_017069	AT	3	6	19341	19346	50 %	50 %	0 %	0 %	383755688
33	NC_017069	CT	3	6	19743	19748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017069	TC	3	6	20158	20163	0 %	50 %	0 %	50 %	383755689
35	NC_017069	GA	3	6	21396	21401	50 %	0 %	50 %	0 %	383755692
36	NC_017069	AC	3	6	21810	21815	50 %	0 %	0 %	50 %	383755692
37	NC_017069	AG	3	6	22026	22031	50 %	0 %	50 %	0 %	383755693
38	NC_017069	AG	3	6	22719	22724	50 %	0 %	50 %	0 %	383755693
39	NC_017069	GA	3	6	23270	23275	50 %	0 %	50 %	0 %	383755693
40	NC_017069	AG	3	6	23454	23459	50 %	0 %	50 %	0 %	383755693
41	NC_017069	TC	3	6	24123	24128	0 %	50 %	0 %	50 %	383755693
42	NC_017069	CT	3	6	24212	24217	0 %	50 %	0 %	50 %	383755693
43	NC_017069	CA	3	6	24382	24387	50 %	0 %	0 %	50 %	383755693
44	NC_017069	TC	3	6	24904	24909	0 %	50 %	0 %	50 %	383755693
45	NC_017069	TA	3	6	27543	27548	50 %	50 %	0 %	0 %	383755693
46	NC_017069	AT	3	6	27623	27628	50 %	50 %	0 %	0 %	383755693
47	NC_017069	TC	3	6	28880	28885	0 %	50 %	0 %	50 %	383755693
48	NC_017069	AT	3	6	30254	30259	50 %	50 %	0 %	0 %	383755695
49	NC_017069	TG	3	6	30306	30311	0 %	50 %	50 %	0 %	383755695
50	NC_017069	GT	3	6	30485	30490	0 %	50 %	50 %	0 %	383755695
51	NC_017069	TA	3	6	30708	30713	50 %	50 %	0 %	0 %	383755696
52	NC_017069	AT	3	6	30784	30789	50 %	50 %	0 %	0 %	383755696
53	NC_017069	GA	3	6	31441	31446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017069	AG	3	6	31764	31769	50 %	0 %	50 %	0 %	383755697
55	NC_017069	TG	4	8	31914	31921	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
56	NC_017069	TG	3	6	32707	32712	0 %	50 %	50 %	0 %	383755697
57	NC_017069	AT	3	6	33425	33430	50 %	50 %	0 %	0 %	383755697
58	NC_017069	GA	3	6	33879	33884	50 %	0 %	50 %	0 %	383755697
59	NC_017069	CT	3	6	34894	34899	0 %	50 %	0 %	50 %	383755697
60	NC_017069	TA	3	6	36414	36419	50 %	50 %	0 %	0 %	383755698
61	NC_017069	AG	3	6	36642	36647	50 %	0 %	50 %	0 %	383755699
62	NC_017069	GT	3	6	36749	36754	0 %	50 %	50 %	0 %	383755699
63	NC_017069	TA	3	6	36940	36945	50 %	50 %	0 %	0 %	383755699
64	NC_017069	TA	3	6	40657	40662	50 %	50 %	0 %	0 %	383755700
65	NC_017069	GT	3	6	41693	41698	0 %	50 %	50 %	0 %	383755700
66	NC_017069	AC	3	6	41759	41764	50 %	0 %	0 %	50 %	383755700
67	NC_017069	TC	3	6	42100	42105	0 %	50 %	0 %	50 %	383755700
68	NC_017069	AT	3	6	42481	42486	50 %	50 %	0 %	0 %	383755700
69	NC_017069	TA	3	6	42752	42757	50 %	50 %	0 %	0 %	383755701
70	NC_017069	GA	3	6	43052	43057	50 %	0 %	50 %	0 %	383755702
71	NC_017069	GA	3	6	45261	45266	50 %	0 %	50 %	0 %	383755708
72	NC_017069	GA	3	6	45442	45447	50 %	0 %	50 %	0 %	383755709
73	NC_017069	TG	3	6	45473	45478	0 %	50 %	50 %	0 %	383755709
74	NC_017069	CT	3	6	45500	45505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017069	AC	3	6	46483	46488	50 %	0 %	0 %	50 %	383755712
76	NC_017069	AT	4	8	46574	46581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017069	CA	3	6	47065	47070	50 %	0 %	0 %	50 %	383755713
78	NC_017069	AG	3	6	47678	47683	50 %	0 %	50 %	0 %	383755713
79	NC_017069	AG	3	6	48123	48128	50 %	0 %	50 %	0 %	383755713
80	NC_017069	GT	3	6	48568	48573	0 %	50 %	50 %	0 %	383755713
81	NC_017069	AG	3	6	49825	49830	50 %	0 %	50 %	0 %	383755713
82	NC_017069	AC	4	8	50086	50093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017069	TA	3	6	50115	50120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017069	TG	3	6	50698	50703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017069	TA	3	6	50706	50711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017069	TA	4	8	50864	50871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017069	AT	3	6	51048	51053	50 %	50 %	0 %	0 %	383755715
88	NC_017069	AT	3	6	51066	51071	50 %	50 %	0 %	0 %	383755715
89	NC_017069	AT	3	6	51412	51417	50 %	50 %	0 %	0 %	383755715
90	NC_017069	AG	3	6	51642	51647	50 %	0 %	50 %	0 %	383755716
91	NC_017069	TC	3	6	51707	51712	0 %	50 %	0 %	50 %	383755716
92	NC_017069	CT	3	6	52134	52139	0 %	50 %	0 %	50 %	383755716
93	NC_017069	AT	3	6	52607	52612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017069	GT	3	6	52614	52619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017069	CT	3	6	54264	54269	0 %	50 %	0 %	50 %	383755718
96	NC_017069	TG	3	6	54600	54605	0 %	50 %	50 %	0 %	383755719
97	NC_017069	CA	3	6	55392	55397	50 %	0 %	0 %	50 %	383755720
98	NC_017069	AC	3	6	55399	55404	50 %	0 %	0 %	50 %	383755720
99	NC_017069	TG	3	6	55422	55427	0 %	50 %	50 %	0 %	383755720
100	NC_017069	TA	3	6	56284	56289	50 %	50 %	0 %	0 %	383755723
101	NC_017069	GA	3	6	56735	56740	50 %	0 %	50 %	0 %	383755723
102	NC_017069	TG	3	6	57743	57748	0 %	50 %	50 %	0 %	383755723
103	NC_017069	TG	3	6	58029	58034	0 %	50 %	50 %	0 %	383755723
104	NC_017069	AT	3	6	58135	58140	50 %	50 %	0 %	0 %	383755724
105	NC_017069	AG	3	6	60593	60598	50 %	0 %	50 %	0 %	383755728
106	NC_017069	GA	3	6	61120	61125	50 %	0 %	50 %	0 %	383755731
107	NC_017069	GA	3	6	61940	61945	50 %	0 %	50 %	0 %	383755736
108	NC_017069	TA	3	6	62838	62843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017069	AG	3	6	65030	65035	50 %	0 %	50 %	0 %	383755741
110	NC_017069	GA	3	6	66049	66054	50 %	0 %	50 %	0 %	383755743
111	NC_017069	GA	3	6	66439	66444	50 %	0 %	50 %	0 %	383755744
112	NC_017069	AG	3	6	66980	66985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017069	TG	3	6	67493	67498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017069	TC	3	6	67926	67931	0 %	50 %	0 %	50 %	383755748
115	NC_017069	TG	3	6	69935	69940	0 %	50 %	50 %	0 %	383755751
116	NC_017069	TA	3	6	70423	70428	50 %	50 %	0 %	0 %	383755752
117	NC_017069	CT	3	6	70549	70554	0 %	50 %	0 %	50 %	383755752
118	NC_017069	AC	3	6	72246	72251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017069	AT	3	6	72337	72342	50 %	50 %	0 %	0 %	383755756
120	NC_017069	AT	3	6	72840	72845	50 %	50 %	0 %	0 %	383755756

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.