MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	C	6	6	264	269	0 %	0 %	0 %	100 %	383755656
2	NC_017069	A	7	7	1124	1130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017069	A	6	6	1552	1557	100 %	0 %	0 %	0 %	383755658
4	NC_017069	T	7	7	1617	1623	0 %	100 %	0 %	0 %	383755658
5	NC_017069	T	6	6	2038	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017069	T	6	6	2343	2348	0 %	100 %	0 %	0 %	383755660
7	NC_017069	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	383755661
8	NC_017069	T	6	6	2500	2505	0 %	100 %	0 %	0 %	383755661
9	NC_017069	T	7	7	2636	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	383755661
10	NC_017069	T	6	6	3220	3225	0 %	100 %	0 %	0 %	383755663
11	NC_017069	T	6	6	3439	3444	0 %	100 %	0 %	0 %	383755663
12	NC_017069	T	6	6	4136	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	383755665
13	NC_017069	T	7	7	4825	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	383755667
14	NC_017069	A	6	6	4912	4917	100 %	0 %	0 %	0 %	383755667
15	NC_017069	T	6	6	5077	5082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017069	T	6	6	5592	5597	0 %	100 %	0 %	0 %	383755668
17	NC_017069	T	6	6	5973	5978	0 %	100 %	0 %	0 %	383755670
18	NC_017069	G	6	6	6406	6411	0 %	0 %	100 %	0 %	383755670
19	NC_017069	T	7	7	7311	7317	0 %	100 %	0 %	0 %	383755673
20	NC_017069	T	7	7	7676	7682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017069	T	6	6	8532	8537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017069	A	6	6	8671	8676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017069	A	6	6	8687	8692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017069	T	7	7	9246	9252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017069	A	6	6	9503	9508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017069	T	7	7	9718	9724	0 %	100 %	0 %	0 %	383755674
27	NC_017069	A	6	6	10769	10774	100 %	0 %	0 %	0 %	383755677
28	NC_017069	G	6	6	10937	10942	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017069	A	6	6	11096	11101	100 %	0 %	0 %	0 %	383755678
30	NC_017069	A	6	6	11246	11251	100 %	0 %	0 %	0 %	383755678
31	NC_017069	T	7	7	11450	11456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017069	T	8	8	11461	11468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017069	G	6	6	11524	11529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017069	G	6	6	13721	13726	0 %	0 %	100 %	0 %	383755680
35	NC_017069	A	6	6	14739	14744	100 %	0 %	0 %	0 %	383755681
36	NC_017069	A	6	6	14957	14962	100 %	0 %	0 %	0 %	383755681
37	NC_017069	A	7	7	15039	15045	100 %	0 %	0 %	0 %	383755681
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39	NC_017069	A	6	6	16097	16102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017069	T	7	7	16334	16340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017069	T	6	6	16347	16352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017069	A	6	6	16365	16370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017069	A	6	6	16648	16653	100 %	0 %	0 %	0 %	383755683
44	NC_017069	A	6	6	18360	18365	100 %	0 %	0 %	0 %	383755686
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48	NC_017069	T	6	6	19774	19779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017069	T	6	6	20631	20636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017069	A	9	9	21003	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	383755690
51	NC_017069	A	6	6	21059	21064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_017069	A	6	6	32273	32278	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
71	NC_017069	A	7	7	33558	33564	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
72	NC_017069	A	6	6	34233	34238	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
73	NC_017069	A	6	6	34786	34791	100 %	0 %	0 %	0 %	383755697
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114	NC_017069	A	6	6	52669	52674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_017069	A	6	6	72879	72884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.