MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	AATAAG	2	12	128457	128468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017068	AAGCGA	2	12	136330	136341	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017068	TGGAGC	2	12	137436	137447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017068	TGAAAT	2	12	137713	137724	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017068	GGAAAT	2	12	162370	162381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017068	GAAAAA	2	12	176985	176996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017068	ATTTTT	2	12	227007	227018	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017068	TCTTAA	2	12	262039	262050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017068	TACATT	2	12	264562	264573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017068	ATTTTT	2	12	325040	325051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017068	CAAAGG	2	12	355371	355382	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017068	GGAAAA	2	12	438106	438117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017068	AAGCGA	2	12	452981	452992	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017068	TGGAGC	2	12	454087	454098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017068	TGAAAT	2	12	454364	454375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017068	GTCTTG	2	12	519004	519015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017068	AAAAGG	2	12	539916	539927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017068	GGGGGA	2	12	580168	580179	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017068	AGGATA	2	12	607365	607376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017068	CAAGCC	2	12	654495	654506	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017068	ACAATA	2	12	666010	666021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017068	ACAATT	2	12	715966	715977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017068	TATAGA	2	12	716024	716035	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017068	AATGTT	2	12	737558	737569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017068	TTCCTG	2	12	768968	768979	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017068	GGGGAG	2	12	809138	809149	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017068	TATTAA	2	12	830412	830423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017068	GATGGG	2	12	839383	839394	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017068	ACATAA	2	12	855772	855783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017068	AGCTGG	2	12	860405	860416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017068	GCTCCG	2	12	965607	965618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017068	ATTTTT	2	12	967981	967992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017068	CTCGAA	2	12	1013875	1013886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017068	AAGCGA	2	12	1059584	1059595	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017068	TGGAGC	2	12	1060849	1060860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017068	TGAAAT	2	12	1061126	1061137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017068	AAACCG	2	12	1083952	1083963	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017068	TGTGTT	2	12	1135996	1136007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017068	TGGAAT	2	12	1230994	1231005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017068	ACATAG	2	12	1238979	1238990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017068	GTTGAC	2	12	1244419	1244430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017068	TCTTTT	2	12	1258001	1258012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017068	GCCCCG	2	12	1281257	1281268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017068	GGGGGA	2	12	1313094	1313105	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017068	CAAAAT	2	12	1334862	1334873	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017068	ACAAAA	2	12	1353599	1353610	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017068	CAGGGG	2	12	1389742	1389753	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017068	ATGTTA	2	12	1414476	1414487	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017068	CAGATG	2	12	1447589	1447600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017068	TCCAAA	2	12	1447685	1447696	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017068	TGTTAC	2	12	1496904	1496915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017068	ATTTTT	2	12	1511344	1511355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017068	TTGTAA	2	12	1516640	1516651	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017068	AAGGAA	2	12	1577761	1577772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017068	AATAAA	2	12	1578520	1578531	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017068	TATGGC	2	12	1677639	1677650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017068	GGAAGG	2	12	1716469	1716480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017068	GCTGGC	2	12	1732010	1732021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017068	CGCAGG	2	12	1740294	1740305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017068	GTTATA	2	12	1756728	1756739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017068	AGATAA	2	12	1784152	1784163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017068	TATACT	2	12	1866589	1866600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017068	TAAAAA	2	12	1873111	1873122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017068	TCATAC	2	12	1874382	1874393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017068	GTGCCT	2	12	1962472	1962483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017068	TTTTAT	2	12	1982737	1982748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017068	AAAATC	2	12	1999684	1999695	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017068	TGACAA	2	12	2008231	2008242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017068	AAAACG	2	12	2106370	2106381	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017068	TACCGT	2	12	2111307	2111318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017068	CACTGC	2	12	2111611	2111622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017068	CCTCTC	2	12	2112010	2112021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017068	ATTTCA	2	12	2191290	2191301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017068	GCTCCA	2	12	2191567	2191578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017068	TCGCTT	2	12	2192673	2192684	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017068	TAAATA	2	12	2236214	2236225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017068	TTATAG	2	12	2287954	2287965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017068	TCATTT	2	12	2364931	2364942	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017068	CTGCCC	2	12	2385489	2385500	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017068	CAAACG	2	12	2409184	2409195	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017068	ATTTCA	2	12	2414067	2414078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017068	GCTCCA	2	12	2414344	2414355	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017068	TCGCTT	2	12	2415450	2415461	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017068	ATTTTT	2	12	2442751	2442762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017068	CTTTAT	2	12	2442806	2442817	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017068	ACAAAT	2	12	2448290	2448301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017068	AAATTC	2	12	2449664	2449675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017068	AAAATA	2	12	2524140	2524151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017068	TATTTT	2	12	2545001	2545012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017068	ATCAAA	2	12	2657762	2657773	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017068	ATTTCA	2	12	2673203	2673214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017068	GCTCCA	2	12	2673480	2673491	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017068	TCGCTT	2	12	2674586	2674597	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017068	AAAAGA	2	12	2699929	2699940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017068	TGTCAT	2	12	2709375	2709386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017068	ATTTCA	2	12	2868590	2868601	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017068	GCTCCA	2	12	2868867	2868878	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017068	TCGCTT	2	12	2869973	2869984	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017068	CGTGTC	2	12	2872823	2872834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017068	CTTGTT	2	12	2897251	2897262	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017068	TATATC	2	12	2952559	2952570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017068	TATTTT	2	12	2952756	2952767	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.