MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 1502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	ATCAG	2	10	2642	2651	40 %	20 %	20 %	20 %	383752830
2	NC_017068	TTCAG	2	10	3572	3581	20 %	40 %	20 %	20 %	383752832
3	NC_017068	GCAAG	2	10	6997	7006	40 %	0 %	40 %	20 %	383752835
4	NC_017068	TGGGC	2	10	8130	8139	0 %	20 %	60 %	20 %	383752836
5	NC_017068	GAAAC	2	10	9147	9156	60 %	0 %	20 %	20 %	383752837
6	NC_017068	CCTGC	2	10	12362	12371	0 %	20 %	20 %	60 %	383752839
7	NC_017068	TGCTC	2	10	13996	14005	0 %	40 %	20 %	40 %	383752840
8	NC_017068	TGGAA	2	10	14056	14065	40 %	20 %	40 %	0 %	383752840
9	NC_017068	GTTCA	2	10	15898	15907	20 %	40 %	20 %	20 %	383752841
10	NC_017068	GTGGC	2	10	16682	16691	0 %	20 %	60 %	20 %	383752841
11	NC_017068	ATATC	2	10	17044	17053	40 %	40 %	0 %	20 %	383752842
12	NC_017068	AATGA	2	10	18098	18107	60 %	20 %	20 %	0 %	383752842
13	NC_017068	CGTAT	2	10	19416	19425	20 %	40 %	20 %	20 %	383752843
14	NC_017068	TGTAG	2	10	21323	21332	20 %	40 %	40 %	0 %	383752845
15	NC_017068	GATCA	2	10	23621	23630	40 %	20 %	20 %	20 %	383752847
16	NC_017068	GAAAG	2	10	35155	35164	60 %	0 %	40 %	0 %	383752859
17	NC_017068	AAGGC	2	10	35333	35342	40 %	0 %	40 %	20 %	383752859
18	NC_017068	TCGGT	2	10	36177	36186	0 %	40 %	40 %	20 %	383752860
19	NC_017068	TACGG	2	10	36352	36361	20 %	20 %	40 %	20 %	383752860
20	NC_017068	CGTGG	2	10	36488	36497	0 %	20 %	60 %	20 %	383752860
21	NC_017068	CTCCA	2	10	40242	40251	20 %	20 %	0 %	60 %	383752862
22	NC_017068	GCCTT	2	10	41308	41317	0 %	40 %	20 %	40 %	383752863
23	NC_017068	TGCCG	2	10	45079	45088	0 %	20 %	40 %	40 %	383752867
24	NC_017068	ATCAG	2	10	49068	49077	40 %	20 %	20 %	20 %	383752870
25	NC_017068	TTATT	2	10	54017	54026	20 %	80 %	0 %	0 %	383752877
26	NC_017068	CCAGG	2	10	58064	58073	20 %	0 %	40 %	40 %	383752882
27	NC_017068	TTTAT	2	10	60363	60372	20 %	80 %	0 %	0 %	383752884
28	NC_017068	AGAGC	2	10	60877	60886	40 %	0 %	40 %	20 %	383752884
29	NC_017068	GCAGG	2	10	61159	61168	20 %	0 %	60 %	20 %	383752884
30	NC_017068	CGGTA	2	10	61975	61984	20 %	20 %	40 %	20 %	383752884
31	NC_017068	CACGG	2	10	64532	64541	20 %	0 %	40 %	40 %	383752889
32	NC_017068	TTATA	2	10	66064	66073	40 %	60 %	0 %	0 %	383752891
33	NC_017068	AGGAA	2	10	66236	66245	60 %	0 %	40 %	0 %	383752891
34	NC_017068	AATAC	2	10	66568	66577	60 %	20 %	0 %	20 %	383752891
35	NC_017068	GGCAC	2	10	68162	68171	20 %	0 %	40 %	40 %	383752892
36	NC_017068	TATTG	2	10	72099	72108	20 %	60 %	20 %	0 %	383752894
37	NC_017068	GCTTG	2	10	72221	72230	0 %	40 %	40 %	20 %	383752894
38	NC_017068	CATAT	2	10	72465	72474	40 %	40 %	0 %	20 %	383752894
39	NC_017068	CGGCC	2	10	82849	82858	0 %	0 %	40 %	60 %	383752902
40	NC_017068	AAAAG	2	10	84485	84494	80 %	0 %	20 %	0 %	383752904
41	NC_017068	GATGA	2	10	87747	87756	40 %	20 %	40 %	0 %	383752907
42	NC_017068	AAAGA	2	10	88236	88245	80 %	0 %	20 %	0 %	383752907
43	NC_017068	GCAAA	2	10	88606	88615	60 %	0 %	20 %	20 %	383752907
44	NC_017068	GGCCG	2	10	92023	92032	0 %	0 %	60 %	40 %	383752910
45	NC_017068	GGCCG	2	10	96331	96340	0 %	0 %	60 %	40 %	383752913
46	NC_017068	GGCAG	2	10	96606	96615	20 %	0 %	60 %	20 %	383752913
47	NC_017068	TGTCT	2	10	97739	97748	0 %	60 %	20 %	20 %	383752914
48	NC_017068	AGCTC	2	10	100117	100126	20 %	20 %	20 %	40 %	383752917
49	NC_017068	ATGCT	2	10	104597	104606	20 %	40 %	20 %	20 %	383752921
50	NC_017068	GGCCA	2	10	105443	105452	20 %	0 %	40 %	40 %	383752921
51	NC_017068	CGCCA	2	10	106252	106261	20 %	0 %	20 %	60 %	383752921
52	NC_017068	GAGCC	2	10	109685	109694	20 %	0 %	40 %	40 %	383752924
53	NC_017068	GGGCA	2	10	110278	110287	20 %	0 %	60 %	20 %	383752924
54	NC_017068	GCCAT	2	10	111059	111068	20 %	20 %	20 %	40 %	383752924
55	NC_017068	GAGCA	2	10	111346	111355	40 %	0 %	40 %	20 %	383752924
56	NC_017068	CATTC	2	10	117986	117995	20 %	40 %	0 %	40 %	383752929
57	NC_017068	GCAGT	2	10	118668	118677	20 %	20 %	40 %	20 %	383752929
58	NC_017068	TGTGC	2	10	121441	121450	0 %	40 %	40 %	20 %	383752932
59	NC_017068	TTTAT	2	10	124969	124978	20 %	80 %	0 %	0 %	383752937
60	NC_017068	TATCG	2	10	128939	128948	20 %	40 %	20 %	20 %	383752941
61	NC_017068	TAAAA	2	10	130179	130188	80 %	20 %	0 %	0 %	383752942
62	NC_017068	CAGGC	2	10	132020	132029	20 %	0 %	40 %	40 %	383752943
63	NC_017068	TAATA	2	10	133356	133365	60 %	40 %	0 %	0 %	383752945
64	NC_017068	CTGAT	2	10	133474	133483	20 %	40 %	20 %	20 %	383752945
65	NC_017068	CAGGC	2	10	142619	142628	20 %	0 %	40 %	40 %	383752948
66	NC_017068	CTGAA	2	10	142641	142650	40 %	20 %	20 %	20 %	383752948
67	NC_017068	GCTGG	2	10	142726	142735	0 %	20 %	60 %	20 %	383752948
68	NC_017068	ACGGA	2	10	142844	142853	40 %	0 %	40 %	20 %	383752948
69	NC_017068	GGCGG	2	10	143114	143123	0 %	0 %	80 %	20 %	383752948
70	NC_017068	GAAGA	2	10	150277	150286	60 %	0 %	40 %	0 %	383752954
71	NC_017068	AGCTC	2	10	151190	151199	20 %	20 %	20 %	40 %	383752955
72	NC_017068	GTTTT	2	10	151614	151623	0 %	80 %	20 %	0 %	383752955
73	NC_017068	GTATC	2	10	154370	154379	20 %	40 %	20 %	20 %	383752957
74	NC_017068	AAGGT	2	10	154696	154705	40 %	20 %	40 %	0 %	383752957
75	NC_017068	CCGGC	2	10	156457	156466	0 %	0 %	40 %	60 %	383752959
76	NC_017068	TGCAA	2	10	156850	156859	40 %	20 %	20 %	20 %	383752959
77	NC_017068	CTGTT	2	10	157790	157799	0 %	60 %	20 %	20 %	383752960
78	NC_017068	CTGGA	2	10	158571	158580	20 %	20 %	40 %	20 %	383752960
79	NC_017068	CGGGG	2	10	159917	159926	0 %	0 %	80 %	20 %	383752961
80	NC_017068	ACGGA	2	10	160880	160889	40 %	0 %	40 %	20 %	383752962
81	NC_017068	CCGGG	2	10	166923	166932	0 %	0 %	60 %	40 %	383752967
82	NC_017068	TGCGG	2	10	171413	171422	0 %	20 %	60 %	20 %	383752971
83	NC_017068	CGGCC	2	10	174297	174306	0 %	0 %	40 %	60 %	383752974
84	NC_017068	ATGGC	2	10	174821	174830	20 %	20 %	40 %	20 %	383752974
85	NC_017068	GCAGA	2	10	175129	175138	40 %	0 %	40 %	20 %	383752974
86	NC_017068	AGTTC	2	10	176696	176705	20 %	40 %	20 %	20 %	383752976
87	NC_017068	CTGGC	2	10	177957	177966	0 %	20 %	40 %	40 %	383752977
88	NC_017068	TATTG	2	10	180702	180711	20 %	60 %	20 %	0 %	383752979
89	NC_017068	GCTTG	2	10	180824	180833	0 %	40 %	40 %	20 %	383752979
90	NC_017068	CATAT	2	10	181068	181077	40 %	40 %	0 %	20 %	383752979
91	NC_017068	CGGGA	2	10	184495	184504	20 %	0 %	60 %	20 %	383752983
92	NC_017068	GATCT	2	10	185305	185314	20 %	40 %	20 %	20 %	383752984
93	NC_017068	TATCG	2	10	185757	185766	20 %	40 %	20 %	20 %	383752984
94	NC_017068	TTCTG	2	10	187369	187378	0 %	60 %	20 %	20 %	383752986
95	NC_017068	ATCCA	2	10	187593	187602	40 %	20 %	0 %	40 %	383752987
96	NC_017068	TGGGC	2	10	189354	189363	0 %	20 %	60 %	20 %	383752989
97	NC_017068	GCAGT	2	10	190289	190298	20 %	20 %	40 %	20 %	383752989
98	NC_017068	CCGGA	2	10	191038	191047	20 %	0 %	40 %	40 %	383752990
99	NC_017068	GGTTT	2	10	195162	195171	0 %	60 %	40 %	0 %	383752994
100	NC_017068	ATGCC	2	10	199351	199360	20 %	20 %	20 %	40 %	383752996
101	NC_017068	CCCTG	2	10	199525	199534	0 %	20 %	20 %	60 %	383752996
102	NC_017068	GGTGC	2	10	200082	200091	0 %	20 %	60 %	20 %	383752997
103	NC_017068	ATGCA	2	10	202265	202274	40 %	20 %	20 %	20 %	383752999
104	NC_017068	ATAAA	2	10	205831	205840	80 %	20 %	0 %	0 %	383753001
105	NC_017068	CAGCG	2	10	209926	209935	20 %	0 %	40 %	40 %	383753006
106	NC_017068	TTGAT	2	10	210818	210827	20 %	60 %	20 %	0 %	383753009
107	NC_017068	GGCCC	2	10	212413	212422	0 %	0 %	40 %	60 %	383753009
108	NC_017068	TGCGG	2	10	214049	214058	0 %	20 %	60 %	20 %	383753011
109	NC_017068	TGGAA	2	10	216816	216825	40 %	20 %	40 %	0 %	383753014
110	NC_017068	CCAGG	2	10	216849	216858	20 %	0 %	40 %	40 %	383753014
111	NC_017068	TACGG	2	10	219369	219378	20 %	20 %	40 %	20 %	383753016
112	NC_017068	GCCGT	2	10	219379	219388	0 %	20 %	40 %	40 %	383753016
113	NC_017068	CGTTA	2	10	220045	220054	20 %	40 %	20 %	20 %	383753017
114	NC_017068	TGCCG	2	10	220191	220200	0 %	20 %	40 %	40 %	383753017
115	NC_017068	GACGA	2	10	223526	223535	40 %	0 %	40 %	20 %	383753019
116	NC_017068	GAAAA	2	10	223805	223814	80 %	0 %	20 %	0 %	383753019
117	NC_017068	CATGG	2	10	224087	224096	20 %	20 %	40 %	20 %	383753019
118	NC_017068	ATTGC	2	10	224639	224648	20 %	40 %	20 %	20 %	383753020
119	NC_017068	TGCGG	2	10	228244	228253	0 %	20 %	60 %	20 %	383753023
120	NC_017068	GACTG	2	10	228652	228661	20 %	20 %	40 %	20 %	383753024
121	NC_017068	ATCTG	2	10	229544	229553	20 %	40 %	20 %	20 %	383753024
122	NC_017068	TCAGG	2	10	229807	229816	20 %	20 %	40 %	20 %	383753025
123	NC_017068	GGCGC	2	10	230640	230649	0 %	0 %	60 %	40 %	383753026
124	NC_017068	GAAAC	2	10	235526	235535	60 %	0 %	20 %	20 %	383753030
125	NC_017068	GGGCT	2	10	235547	235556	0 %	20 %	60 %	20 %	383753030
126	NC_017068	ATGAA	2	10	238152	238161	60 %	20 %	20 %	0 %	383753032
127	NC_017068	TGCAG	2	10	242735	242744	20 %	20 %	40 %	20 %	383753035
128	NC_017068	ACAGC	2	10	245341	245350	40 %	0 %	20 %	40 %	383753036
129	NC_017068	CGCAG	2	10	245497	245506	20 %	0 %	40 %	40 %	383753036
130	NC_017068	GCTGG	2	10	248820	248829	0 %	20 %	60 %	20 %	383753040
131	NC_017068	CATTG	2	10	250618	250627	20 %	40 %	20 %	20 %	383753042
132	NC_017068	TTCCA	2	10	254232	254241	20 %	40 %	0 %	40 %	383753045
133	NC_017068	GTGCT	2	10	254461	254470	0 %	40 %	40 %	20 %	383753045
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