MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	TATT	2	8	1925	1932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017068	GTTC	2	8	14587	14594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017068	TGGC	2	8	14596	14603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017068	AAGG	2	8	16885	16892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017068	TTTC	2	8	18453	18460	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017068	ATAA	2	8	18952	18959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017068	AGGA	2	8	28074	28081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017068	TCAT	2	8	37030	37037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017068	GATA	2	8	41883	41890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017068	TACA	2	8	43201	43208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017068	AAAG	2	8	43253	43260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017068	AAGT	2	8	44896	44903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017068	CTTT	2	8	45370	45377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017068	GAAA	2	8	45389	45396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017068	AGTC	2	8	50928	50935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017068	TCAA	2	8	50940	50947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017068	GAAA	2	8	55870	55877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017068	GACA	2	8	70825	70832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017068	CTGC	2	8	71049	71056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017068	CATC	2	8	72788	72795	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017068	TAAA	2	8	78521	78528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017068	TAGT	2	8	84092	84099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017068	GAAT	2	8	84203	84210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017068	TTTA	2	8	88829	88836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017068	AACA	2	8	106692	106699	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017068	TTGC	2	8	108241	108248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017068	TTTA	2	8	116657	116664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017068	ATTG	2	8	128403	128410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017068	AAAT	2	8	130191	130198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017068	CAAA	2	8	132267	132274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017068	AATC	2	8	133149	133156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017068	GCTT	2	8	133788	133795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017068	GTGA	2	8	134128	134135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017068	AGTC	2	8	134321	134328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017068	TCTT	2	8	134370	134377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017068	AGAT	2	8	134739	134746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017068	GAAC	2	8	135616	135623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017068	GATA	2	8	137219	137226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017068	GACA	2	8	138053	138060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017068	GGAC	2	8	138374	138381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017068	CCAG	2	8	139106	139113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017068	GCCT	2	8	139392	139399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017068	CAGA	2	8	142514	142521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017068	TGTA	2	8	143907	143914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017068	TCAA	2	8	146183	146190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017068	AAAT	2	8	157052	157059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017068	ATAA	2	8	170404	170411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017068	GATA	2	8	171306	171313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017068	ATTT	2	8	176946	176953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017068	CTGC	2	8	179537	179544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017068	CATC	2	8	181391	181398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017068	TTTG	2	8	181727	181734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017068	AATA	2	8	182782	182789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017068	GGTT	2	8	184963	184970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017068	CCGT	2	8	185056	185063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017068	TGGC	2	8	190574	190581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017068	TTGG	2	8	192749	192756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017068	CTTT	2	8	194666	194673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017068	TTTA	2	8	195001	195008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017068	AACA	2	8	195028	195035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017068	AGAT	2	8	198354	198361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017068	TATC	2	8	198369	198376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017068	TTAT	2	8	201630	201637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017068	AAGC	2	8	204471	204478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017068	ATTT	2	8	206076	206083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017068	CAAA	2	8	213073	213080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017068	TTTG	2	8	215245	215252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017068	CCTT	2	8	231563	231570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017068	AAGG	2	8	231607	231614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017068	GTTG	2	8	231788	231795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017068	CATG	2	8	233318	233325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017068	AAAG	2	8	233332	233339	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017068	TTTG	2	8	233550	233557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017068	TAAG	2	8	233758	233765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017068	CTTT	2	8	245856	245863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017068	TTTA	2	8	246017	246024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017068	AATA	2	8	257319	257326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017068	TTGA	2	8	262059	262066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017068	AAGA	2	8	263614	263621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017068	CATA	2	8	267545	267552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017068	CTTA	2	8	269568	269575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017068	AATG	2	8	274425	274432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017068	ATTG	2	8	274470	274477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017068	ATGA	2	8	274664	274671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017068	GGCA	2	8	279466	279473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017068	TGCC	2	8	281585	281592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017068	AATT	2	8	283837	283844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017068	GAAT	2	8	287212	287219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017068	TACA	2	8	289416	289423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017068	AGAA	2	8	289493	289500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017068	ATTC	2	8	289832	289839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017068	CATT	2	8	289985	289992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017068	TCGG	2	8	293840	293847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017068	GGCT	2	8	293848	293855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017068	TGCC	2	8	294707	294714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017068	AAGT	2	8	295998	296005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017068	GAAT	2	8	296314	296321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017068	CCGC	2	8	304797	304804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017068	CGGG	2	8	304848	304855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017068	AGGA	2	8	304889	304896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017068	CGCC	2	8	314165	314172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_017068	AAGC	2	8	321710	321717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017068	AAGT	2	8	323274	323281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017068	ATTG	2	8	327415	327422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017068	GATA	2	8	327693	327700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017068	TAGT	2	8	331591	331598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017068	CTTT	2	8	337634	337641	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017068	TTGC	2	8	337652	337659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017068	ATAC	2	8	338716	338723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017068	AAAG	2	8	340401	340408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017068	AGGG	2	8	342913	342920	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017068	AAAG	2	8	342969	342976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017068	CTGC	2	8	349843	349850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017068	GCAT	2	8	351107	351114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017068	ATTA	2	8	351250	351257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017068	AGTA	2	8	351441	351448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017068	GAAA	2	8	351548	351555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017068	ACTT	2	8	352991	352998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017068	AGGG	2	8	354896	354903	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017068	AGGG	2	8	355440	355447	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017068	ATGT	2	8	358232	358239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017068	GTCA	2	8	362971	362978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017068	CGGT	2	8	363248	363255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017068	ATCC	2	8	363461	363468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017068	GTAT	2	8	363586	363593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017068	TGGA	2	8	363604	363611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017068	TACA	3	12	364374	364385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017068	GGTG	2	8	370128	370135	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017068	ATTT	2	8	370322	370329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017068	CCAG	2	8	373569	373576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017068	GTTT	2	8	376189	376196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017068	AGGC	2	8	378702	378709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017068	GAAA	2	8	381553	381560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017068	TTTC	2	8	381581	381588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017068	GCTT	2	8	381715	381722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017068	TGGA	2	8	392263	392270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017068	CCTT	2	8	398223	398230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017068	TGCT	2	8	398291	398298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017068	TTTG	2	8	414132	414139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017068	AGTC	2	8	414163	414170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017068	TAAA	2	8	414254	414261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017068	CCTG	2	8	422255	422262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017068	GGTT	2	8	424270	424277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017068	GAAG	2	8	427903	427910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017068	AGGG	2	8	427997	428004	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017068	GTAT	2	8	428097	428104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017068	TGAG	2	8	432782	432789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017068	CTGC	2	8	432948	432955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017068	GGCC	2	8	432960	432967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017068	TATG	2	8	444663	444670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017068	TTTG	2	8	446150	446157	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017068	TATT	2	8	1632099	1632106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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