MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 46133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017068	TTG	2	6	75	80	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017068	GGA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017068	ATA	2	6	196	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017068	GAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
6	NC_017068	GCA	2	6	530	535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
7	NC_017068	GAA	3	9	539	547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
8	NC_017068	CTC	2	6	676	681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752829
9	NC_017068	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752829
10	NC_017068	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
11	NC_017068	ATC	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
12	NC_017068	CAG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
13	NC_017068	GAA	2	6	1031	1036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
14	NC_017068	TTC	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
15	NC_017068	ATG	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752829
16	NC_017068	TCA	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
17	NC_017068	GAA	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
18	NC_017068	CGA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
19	NC_017068	ATC	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
20	NC_017068	CTT	2	6	1443	1448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
21	NC_017068	AGA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
22	NC_017068	AAG	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
23	NC_017068	CTT	2	6	1573	1578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
24	NC_017068	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752829
25	NC_017068	ACC	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752829
26	NC_017068	CTA	4	12	1909	1920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017068	CCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
28	NC_017068	CCA	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
29	NC_017068	CCT	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752830
30	NC_017068	GCA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752830
31	NC_017068	GCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
32	NC_017068	GCT	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
33	NC_017068	ATC	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752830
34	NC_017068	GCT	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
35	NC_017068	TGA	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752830
36	NC_017068	GGC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752830
37	NC_017068	CTT	2	6	2861	2866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752830
38	NC_017068	GAA	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
39	NC_017068	GAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
40	NC_017068	AGG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752830
41	NC_017068	GCG	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752831
42	NC_017068	CGC	3	9	3251	3259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752831
43	NC_017068	GTG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752831
44	NC_017068	AGC	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
45	NC_017068	CGG	2	6	3592	3597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
46	NC_017068	ACC	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752832
47	NC_017068	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752832
48	NC_017068	GAA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752832
49	NC_017068	GGC	2	6	3870	3875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
50	NC_017068	AGG	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752832
51	NC_017068	GCG	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
52	NC_017068	TAA	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752832
53	NC_017068	GAT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
54	NC_017068	ATC	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752832
55	NC_017068	CAG	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
56	NC_017068	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
57	NC_017068	TGA	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
58	NC_017068	GAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
59	NC_017068	TCA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752833
60	NC_017068	TAT	2	6	4531	4536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752833
61	NC_017068	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
62	NC_017068	GAT	3	9	4668	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
63	NC_017068	GAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752833
64	NC_017068	ACG	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
65	NC_017068	GGC	2	6	4863	4868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752833
66	NC_017068	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
67	NC_017068	GCC	2	6	5035	5040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
68	NC_017068	AGC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
69	NC_017068	ATG	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
70	NC_017068	GCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
71	NC_017068	GCC	2	6	5256	5261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
72	NC_017068	AGC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
73	NC_017068	ATA	2	6	5279	5284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
74	NC_017068	GAG	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752833
75	NC_017068	AGC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752834
76	NC_017068	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752834
77	NC_017068	ATC	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752834
78	NC_017068	GCG	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
79	NC_017068	GGC	2	6	5667	5672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
80	NC_017068	CTG	2	6	5684	5689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752834
81	NC_017068	ATG	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752834
82	NC_017068	GAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
83	NC_017068	ACC	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752835
84	NC_017068	AGC	2	6	5823	5828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
85	NC_017068	GCA	2	6	5926	5931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
86	NC_017068	AGT	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
87	NC_017068	CGA	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
88	NC_017068	CCG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
89	NC_017068	CGG	2	6	6137	6142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
90	NC_017068	CGG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
91	NC_017068	CGT	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
92	NC_017068	TCT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752835
93	NC_017068	GAC	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
94	NC_017068	ATG	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
95	NC_017068	GGC	2	6	6498	6503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
96	NC_017068	AAG	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
97	NC_017068	GAT	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
98	NC_017068	GGC	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
99	NC_017068	TGC	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
100	NC_017068	TGA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
101	NC_017068	TCA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
102	NC_017068	GAA	2	6	6924	6929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
103	NC_017068	GGC	2	6	7125	7130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
104	NC_017068	CCG	2	6	7151	7156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
105	NC_017068	GAT	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
106	NC_017068	ATC	3	9	7314	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
107	NC_017068	GCC	2	6	7430	7435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
108	NC_017068	ACT	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
109	NC_017068	TGC	2	6	7612	7617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
110	NC_017068	GAA	2	6	7704	7709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
111	NC_017068	GTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
112	NC_017068	TGG	2	6	8001	8006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
113	NC_017068	GCT	2	6	8036	8041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
114	NC_017068	GGC	2	6	8044	8049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752836
115	NC_017068	TGG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
116	NC_017068	TGG	2	6	8070	8075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
117	NC_017068	CTG	2	6	8183	8188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
118	NC_017068	GGC	2	6	8206	8211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752836
119	NC_017068	GGA	2	6	8329	8334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752836
120	NC_017068	ATT	2	6	8382	8387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752836
121	NC_017068	CTT	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752836
122	NC_017068	TGG	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
123	NC_017068	GGT	2	6	8567	8572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
124	NC_017068	TGC	2	6	8640	8645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
125	NC_017068	CGG	2	6	8792	8797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752836
126	NC_017068	GCC	2	6	8804	8809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752836
127	NC_017068	TTA	2	6	8912	8917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752837
128	NC_017068	GTT	2	6	8946	8951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752837
129	NC_017068	CAT	3	9	9194	9202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752837
130	NC_017068	TAT	2	6	9255	9260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752837
131	NC_017068	ATC	2	6	9271	9276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752837
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133	NC_017068	TGA	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752837
134	NC_017068	GAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752837
135	NC_017068	CAG	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752837
136	NC_017068	ATG	2	6	9406	9411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752837
137	NC_017068	GCT	3	9	9449	9457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752837
138	NC_017068	GAA	2	6	9488	9493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752837
139	NC_017068	GGC	2	6	9498	9503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752837
140	NC_017068	GGC	2	6	9729	9734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752837
141	NC_017068	GGC	2	6	9777	9782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752837
142	NC_017068	GTG	2	6	9825	9830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752837
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146	NC_017068	TTG	2	6	10140	10145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752837
147	NC_017068	CAT	2	6	10176	10181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752837
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149	NC_017068	TCA	2	6	10198	10203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752837
150	NC_017068	GCT	2	6	10211	10216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752837
151	NC_017068	CCA	2	6	10243	10248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752837
152	NC_017068	TAA	2	6	10255	10260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752837
153	NC_017068	GAT	2	6	10284	10289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752837
154	NC_017068	TGG	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752837
155	NC_017068	GCT	2	6	10389	10394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752837
156	NC_017068	GCG	2	6	10400	10405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752837
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161	NC_017068	GGC	2	6	10568	10573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752837
162	NC_017068	TGC	2	6	10582	10587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752837
163	NC_017068	GAT	2	6	10632	10637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752837
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248	NC_017068	GGC	2	6	16381	16386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752841
249	NC_017068	GCA	2	6	16389	16394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752841
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251	NC_017068	CAT	2	6	16417	16422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752841
252	NC_017068	GCT	2	6	16446	16451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752841
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254	NC_017068	CAT	2	6	16482	16487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752841
255	NC_017068	GTG	2	6	16511	16516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752841
256	NC_017068	AAG	2	6	16549	16554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752841
257	NC_017068	TCC	2	6	16573	16578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752841
258	NC_017068	TGG	2	6	16661	16666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752841
259	NC_017068	CTC	2	6	16747	16752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752841
260	NC_017068	CTG	2	6	16765	16770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752841
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262	NC_017068	TTA	2	6	17029	17034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752842
263	NC_017068	ATG	2	6	17163	17168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752842
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269	NC_017068	GAA	2	6	17476	17481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752842
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272	NC_017068	ATG	2	6	17669	17674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752842
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285	NC_017068	TCT	2	6	18570	18575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_017068	ATA	2	6	18589	18594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017068	ATA	2	6	18629	18634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017068	CAA	2	6	18671	18676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_017068	AAC	2	6	18772	18777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_017068	ATT	2	6	18862	18867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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378	NC_017068	ATA	2	6	23638	23643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752847
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