MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 42130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	GAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
2	NC_017068	GCA	2	6	530	535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
3	NC_017068	GAA	3	9	539	547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
4	NC_017068	CTC	2	6	676	681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752829
5	NC_017068	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752829
6	NC_017068	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
7	NC_017068	ATC	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
8	NC_017068	CAG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
9	NC_017068	GAA	2	6	1031	1036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
10	NC_017068	TTC	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
11	NC_017068	ATG	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752829
12	NC_017068	TCA	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
13	NC_017068	GAA	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
14	NC_017068	CGA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752829
15	NC_017068	ATC	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752829
16	NC_017068	CTT	2	6	1443	1448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
17	NC_017068	AGA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
18	NC_017068	AAG	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752829
19	NC_017068	CTT	2	6	1573	1578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752829
20	NC_017068	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752829
21	NC_017068	ACC	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752829
22	NC_017068	CCA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
23	NC_017068	CCA	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752830
24	NC_017068	CCT	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752830
25	NC_017068	GCA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752830
26	NC_017068	GCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
27	NC_017068	GCT	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
28	NC_017068	ATC	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752830
29	NC_017068	GCT	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752830
30	NC_017068	TGA	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752830
31	NC_017068	GGC	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752830
32	NC_017068	CTT	2	6	2861	2866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752830
33	NC_017068	GAA	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
34	NC_017068	GAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752830
35	NC_017068	AGG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752830
36	NC_017068	GCG	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752831
37	NC_017068	CGC	3	9	3251	3259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752831
38	NC_017068	GTG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752831
39	NC_017068	AGC	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
40	NC_017068	CGG	2	6	3592	3597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
41	NC_017068	ACC	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752832
42	NC_017068	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752832
43	NC_017068	GAA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752832
44	NC_017068	GGC	2	6	3870	3875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
45	NC_017068	AGG	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752832
46	NC_017068	GCG	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752832
47	NC_017068	TAA	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752832
48	NC_017068	GAT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
49	NC_017068	ATC	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752832
50	NC_017068	CAG	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752832
51	NC_017068	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
52	NC_017068	TGA	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
53	NC_017068	GAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752832
54	NC_017068	TCA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752833
55	NC_017068	TAT	2	6	4531	4536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752833
56	NC_017068	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
57	NC_017068	GAT	3	9	4668	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
58	NC_017068	GAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752833
59	NC_017068	ACG	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
60	NC_017068	GGC	2	6	4863	4868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752833
61	NC_017068	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
62	NC_017068	GCC	2	6	5035	5040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
63	NC_017068	AGC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
64	NC_017068	ATG	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752833
65	NC_017068	GCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
66	NC_017068	GCC	2	6	5256	5261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752833
67	NC_017068	AGC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752833
68	NC_017068	ATA	2	6	5279	5284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752833
69	NC_017068	GAG	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752833
70	NC_017068	AGC	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752834
71	NC_017068	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752834
72	NC_017068	ATC	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752834
73	NC_017068	GCG	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
74	NC_017068	GGC	2	6	5667	5672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752834
75	NC_017068	CTG	2	6	5684	5689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752834
76	NC_017068	ATG	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752834
77	NC_017068	GAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
78	NC_017068	ACC	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752835
79	NC_017068	AGC	2	6	5823	5828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
80	NC_017068	GCA	2	6	5926	5931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
81	NC_017068	AGT	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
82	NC_017068	CGA	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
83	NC_017068	CCG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
84	NC_017068	CGG	2	6	6137	6142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
85	NC_017068	CGG	2	6	6173	6178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
86	NC_017068	CGT	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
87	NC_017068	TCT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752835
88	NC_017068	GAC	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752835
89	NC_017068	ATG	2	6	6451	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
90	NC_017068	GGC	2	6	6498	6503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
91	NC_017068	AAG	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
92	NC_017068	GAT	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
93	NC_017068	GGC	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
94	NC_017068	TGC	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
95	NC_017068	TGA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
96	NC_017068	TCA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
97	NC_017068	GAA	2	6	6924	6929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
98	NC_017068	GGC	2	6	7125	7130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752835
99	NC_017068	CCG	2	6	7151	7156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
100	NC_017068	GAT	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752835
101	NC_017068	ATC	3	9	7314	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
102	NC_017068	GCC	2	6	7430	7435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752835
103	NC_017068	ACT	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752835
104	NC_017068	TGC	2	6	7612	7617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752835
105	NC_017068	GAA	2	6	7704	7709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752835
106	NC_017068	GTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
107	NC_017068	TGG	2	6	8001	8006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
108	NC_017068	GCT	2	6	8036	8041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
109	NC_017068	GGC	2	6	8044	8049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752836
110	NC_017068	TGG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
111	NC_017068	TGG	2	6	8070	8075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
112	NC_017068	CTG	2	6	8183	8188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
113	NC_017068	GGC	2	6	8206	8211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752836
114	NC_017068	GGA	2	6	8329	8334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752836
115	NC_017068	ATT	2	6	8382	8387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752836
116	NC_017068	CTT	2	6	8524	8529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752836
117	NC_017068	TGG	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
118	NC_017068	GGT	2	6	8567	8572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752836
119	NC_017068	TGC	2	6	8640	8645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752836
120	NC_017068	CGG	2	6	8792	8797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752836
121	NC_017068	GCC	2	6	8804	8809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752836
122	NC_017068	TTA	2	6	8912	8917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752837
123	NC_017068	GTT	2	6	8946	8951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752837
124	NC_017068	CAT	3	9	9194	9202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752837
125	NC_017068	TAT	2	6	9255	9260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752837
126	NC_017068	ATC	2	6	9271	9276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752837
127	NC_017068	AGC	2	6	9301	9306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752837
128	NC_017068	TGA	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752837
129	NC_017068	GAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752837
130	NC_017068	CAG	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752837
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253	NC_017068	CCG	2	6	17383	17388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752842
254	NC_017068	GAA	2	6	17456	17461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752842
255	NC_017068	GAA	2	6	17476	17481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752842
256	NC_017068	ATG	2	6	17559	17564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752842
257	NC_017068	TCT	2	6	17571	17576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752842
258	NC_017068	ATG	2	6	17669	17674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752842
259	NC_017068	CGG	2	6	17973	17978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752842
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262	NC_017068	CGG	2	6	18112	18117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752842
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282	NC_017068	CGG	2	6	19789	19794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752843
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292	NC_017068	TGA	2	6	20045	20050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752844
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374	NC_017068	GTG	2	6	25177	25182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752848
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