MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 2944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017068	GT	3	6	6193	6198	0 %	50 %	50 %	0 %	383752835
3	NC_017068	TC	3	6	6908	6913	0 %	50 %	0 %	50 %	383752835
4	NC_017068	TA	3	6	8438	8443	50 %	50 %	0 %	0 %	383752836
5	NC_017068	TA	3	6	9385	9390	50 %	50 %	0 %	0 %	383752837
6	NC_017068	GT	3	6	9514	9519	0 %	50 %	50 %	0 %	383752837
7	NC_017068	AT	3	6	10793	10798	50 %	50 %	0 %	0 %	383752837
8	NC_017068	TC	3	6	11514	11519	0 %	50 %	0 %	50 %	383752839
9	NC_017068	AT	3	6	12717	12722	50 %	50 %	0 %	0 %	383752839
10	NC_017068	GC	3	6	13875	13880	0 %	0 %	50 %	50 %	383752840
11	NC_017068	CT	3	6	16305	16310	0 %	50 %	0 %	50 %	383752841
12	NC_017068	CT	3	6	16562	16567	0 %	50 %	0 %	50 %	383752841
13	NC_017068	CG	3	6	17593	17598	0 %	0 %	50 %	50 %	383752842
14	NC_017068	GC	3	6	20761	20766	0 %	0 %	50 %	50 %	383752844
15	NC_017068	TG	3	6	21778	21783	0 %	50 %	50 %	0 %	383752846
16	NC_017068	CA	3	6	22942	22947	50 %	0 %	0 %	50 %	383752847
17	NC_017068	AT	3	6	24535	24540	50 %	50 %	0 %	0 %	383752848
18	NC_017068	GC	3	6	26428	26433	0 %	0 %	50 %	50 %	383752849
19	NC_017068	CA	3	6	29276	29281	50 %	0 %	0 %	50 %	383752852
20	NC_017068	AT	3	6	30228	30233	50 %	50 %	0 %	0 %	383752853
21	NC_017068	AT	3	6	30484	30489	50 %	50 %	0 %	0 %	383752853
22	NC_017068	GC	3	6	31717	31722	0 %	0 %	50 %	50 %	383752855
23	NC_017068	AT	3	6	33298	33303	50 %	50 %	0 %	0 %	383752856
24	NC_017068	AT	4	8	36255	36262	50 %	50 %	0 %	0 %	383752860
25	NC_017068	AT	3	6	37060	37065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017068	GC	3	6	37965	37970	0 %	0 %	50 %	50 %	383752861
27	NC_017068	AC	3	6	38890	38895	50 %	0 %	0 %	50 %	383752861
28	NC_017068	GA	3	6	41682	41687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017068	TA	3	6	41688	41693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017068	AT	3	6	41705	41710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017068	GA	3	6	43420	43425	50 %	0 %	50 %	0 %	383752865
32	NC_017068	AT	3	6	43889	43894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017068	CA	3	6	43957	43962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017068	TA	3	6	43970	43975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017068	TC	3	6	44198	44203	0 %	50 %	0 %	50 %	383752866
36	NC_017068	AG	3	6	45181	45186	50 %	0 %	50 %	0 %	383752867
37	NC_017068	AT	3	6	45380	45385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017068	GC	3	6	45881	45886	0 %	0 %	50 %	50 %	383752869
39	NC_017068	TC	3	6	49168	49173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017068	GC	3	6	49493	49498	0 %	0 %	50 %	50 %	383752871
41	NC_017068	TA	3	6	50910	50915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017068	AT	3	6	51058	51063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017068	AT	3	6	51074	51079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017068	GT	3	6	51285	51290	0 %	50 %	50 %	0 %	383752873
45	NC_017068	AT	3	6	55708	55713	50 %	50 %	0 %	0 %	383752878
46	NC_017068	AG	3	6	55862	55867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017068	AT	3	6	57691	57696	50 %	50 %	0 %	0 %	383752882
48	NC_017068	GA	3	6	60761	60766	50 %	0 %	50 %	0 %	383752884
49	NC_017068	GA	3	6	60975	60980	50 %	0 %	50 %	0 %	383752884
50	NC_017068	TC	3	6	61228	61233	0 %	50 %	0 %	50 %	383752884
51	NC_017068	GA	3	6	61797	61802	50 %	0 %	50 %	0 %	383752884
52	NC_017068	CG	3	6	66003	66008	0 %	0 %	50 %	50 %	383752890
53	NC_017068	CT	3	6	68671	68676	0 %	50 %	0 %	50 %	383752892
54	NC_017068	TG	3	6	69118	69123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017068	TA	4	8	72808	72815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017068	AT	3	6	73306	73311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017068	GT	3	6	73981	73986	0 %	50 %	50 %	0 %	383752896
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59	NC_017068	CT	3	6	75544	75549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017068	AT	3	6	75596	75601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017068	TG	3	6	76021	76026	0 %	50 %	50 %	0 %	383752898
62	NC_017068	AC	3	6	77526	77531	50 %	0 %	0 %	50 %	383752899
63	NC_017068	CT	3	6	77546	77551	0 %	50 %	0 %	50 %	383752899
64	NC_017068	CG	3	6	79407	79412	0 %	0 %	50 %	50 %	383752900
65	NC_017068	TG	3	6	81823	81828	0 %	50 %	50 %	0 %	383752902
66	NC_017068	AT	3	6	83382	83387	50 %	50 %	0 %	0 %	383752903
67	NC_017068	GC	3	6	83994	83999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017068	AG	3	6	84360	84365	50 %	0 %	50 %	0 %	383752904
69	NC_017068	AG	3	6	84585	84590	50 %	0 %	50 %	0 %	383752904
70	NC_017068	AC	3	6	85841	85846	50 %	0 %	0 %	50 %	383752905
71	NC_017068	AT	3	6	85931	85936	50 %	50 %	0 %	0 %	383752906
72	NC_017068	TA	3	6	87105	87110	50 %	50 %	0 %	0 %	383752906
73	NC_017068	GT	3	6	87386	87391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017068	TC	3	6	87403	87408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017068	TA	3	6	87528	87533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017068	TG	3	6	87609	87614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017068	TG	3	6	88813	88818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017068	CT	3	6	90406	90411	0 %	50 %	0 %	50 %	383752909
79	NC_017068	GC	3	6	92360	92365	0 %	0 %	50 %	50 %	383752910
80	NC_017068	CT	3	6	92419	92424	0 %	50 %	0 %	50 %	383752910
81	NC_017068	TA	3	6	92718	92723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017068	TG	3	6	92801	92806	0 %	50 %	50 %	0 %	383752911
83	NC_017068	AT	3	6	94251	94256	50 %	50 %	0 %	0 %	383752911
84	NC_017068	AT	3	6	99480	99485	50 %	50 %	0 %	0 %	383752916
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88	NC_017068	CA	3	6	106773	106778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017068	AT	3	6	107019	107024	50 %	50 %	0 %	0 %	383752922
90	NC_017068	TG	3	6	107397	107402	0 %	50 %	50 %	0 %	383752922
91	NC_017068	TG	4	8	108131	108138	0 %	50 %	50 %	0 %	383752922
92	NC_017068	TA	3	6	109227	109232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017068	GC	3	6	109333	109338	0 %	0 %	50 %	50 %	383752924
94	NC_017068	GA	3	6	112091	112096	50 %	0 %	50 %	0 %	383752925
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96	NC_017068	AT	3	6	116325	116330	50 %	50 %	0 %	0 %	383752927
97	NC_017068	TA	3	6	116616	116621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_017068	AG	3	6	121642	121647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017068	AG	3	6	125250	125255	50 %	0 %	50 %	0 %	383752937
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104	NC_017068	TC	3	6	127771	127776	0 %	50 %	0 %	50 %	383752939
105	NC_017068	AT	4	8	127811	127818	50 %	50 %	0 %	0 %	383752939
106	NC_017068	GA	3	6	128805	128810	50 %	0 %	50 %	0 %	383752941
107	NC_017068	TG	3	6	131444	131449	0 %	50 %	50 %	0 %	383752943
108	NC_017068	AT	3	6	131704	131709	50 %	50 %	0 %	0 %	383752943
109	NC_017068	AT	3	6	132233	132238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017068	CT	3	6	134749	134754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017068	AC	3	6	134951	134956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017068	AG	3	6	134976	134981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017068	AC	3	6	135120	135125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017068	GA	3	6	135324	135329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017068	TC	3	6	135334	135339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017068	CA	3	6	135650	135655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017068	GA	3	6	137331	137336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017068	CG	3	6	138013	138018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017068	TC	3	6	138161	138166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017068	AT	5	10	139553	139562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017068	AT	5	10	140234	140243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017068	GC	3	6	140513	140518	0 %	0 %	50 %	50 %	383752946
123	NC_017068	TG	3	6	141517	141522	0 %	50 %	50 %	0 %	383752946
124	NC_017068	GC	3	6	143196	143201	0 %	0 %	50 %	50 %	383752948
125	NC_017068	GC	3	6	144364	144369	0 %	0 %	50 %	50 %	383752949
126	NC_017068	TA	3	6	146208	146213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017068	TC	3	6	146817	146822	0 %	50 %	0 %	50 %	383752951
128	NC_017068	CG	3	6	150598	150603	0 %	0 %	50 %	50 %	383752954
129	NC_017068	AT	3	6	150736	150741	50 %	50 %	0 %	0 %	383752955
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131	NC_017068	TA	3	6	155618	155623	50 %	50 %	0 %	0 %	383752958
132	NC_017068	TG	3	6	156318	156323	0 %	50 %	50 %	0 %	383752959
133	NC_017068	AT	3	6	157213	157218	50 %	50 %	0 %	0 %	383752960
134	NC_017068	AT	3	6	157531	157536	50 %	50 %	0 %	0 %	383752960
135	NC_017068	GA	3	6	158287	158292	50 %	0 %	50 %	0 %	383752960
136	NC_017068	AG	3	6	161643	161648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017068	GA	3	6	165475	165480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017068	TG	3	6	166640	166645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017068	TG	3	6	168235	168240	0 %	50 %	50 %	0 %	383752968
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141	NC_017068	TC	3	6	177487	177492	0 %	50 %	0 %	50 %	383752977
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143	NC_017068	TA	4	8	181411	181418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017068	GA	3	6	181879	181884	50 %	0 %	50 %	0 %	383752981
145	NC_017068	GT	3	6	181939	181944	0 %	50 %	50 %	0 %	383752981
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