MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter hydrocarbonoclasticus ATCC 49840

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017067	GGGCT	2	10	5441	5450	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017067	GCCTT	2	10	35346	35355	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017067	AGCCG	2	10	49463	49472	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017067	CGCAG	2	10	51129	51138	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017067	CCGCG	2	10	65886	65895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017067	TCAGG	2	10	66568	66577	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017067	GACCC	2	10	86356	86365	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017067	CGGGC	2	10	113915	113924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017067	CGCGG	2	10	114088	114097	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017067	TCTTT	2	10	117018	117027	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017067	TCCAA	2	10	146143	146152	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017067	TGATC	2	10	180238	180247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017067	CCCAA	2	10	184165	184174	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017067	GCCCC	2	10	190857	190866	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_017067	AAAGC	2	10	223718	223727	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017067	GTTTT	2	10	230659	230668	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017067	ACGCC	2	10	245674	245683	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017067	TCGTT	2	10	291823	291832	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017067	CAACC	2	10	315333	315342	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017067	CGATT	2	10	319796	319805	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017067	CCGAA	2	10	340164	340173	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017067	CGAGG	2	10	343641	343650	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017067	AGAAT	2	10	357282	357291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017067	ACAAA	2	10	382266	382275	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017067	CCCCG	2	10	407619	407628	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_017067	CTGGT	2	10	424241	424250	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017067	CCAGA	2	10	428616	428625	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017067	CTGGC	2	10	433534	433543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017067	GGTCC	2	10	448698	448707	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017067	CCGGG	2	10	508868	508877	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017067	AAAGG	2	10	518295	518304	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017067	ATACT	2	10	532273	532282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017067	CAGGG	2	10	536594	536603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017067	AAACA	2	10	538840	538849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017067	GAAAA	2	10	544730	544739	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017067	TGTCC	2	10	571892	571901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017067	TCGTG	2	10	587698	587707	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017067	AGTCG	2	10	589907	589916	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017067	ATCCC	2	10	591819	591828	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017067	TAAGG	2	10	631413	631422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017067	TGGCC	2	10	646340	646349	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017067	CGGGG	2	10	656894	656903	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017067	CAGCG	2	10	658522	658531	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017067	AGAAT	2	10	668865	668874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017067	CGACC	2	10	700069	700078	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017067	AACAG	2	10	703392	703401	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017067	CAGGG	2	10	721445	721454	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017067	TCGCC	2	10	730461	730470	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_017067	ACGGG	2	10	757439	757448	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017067	TCCTG	2	10	757458	757467	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017067	TTCTT	2	10	757503	757512	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017067	TCGTG	2	10	801005	801014	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017067	AGTCG	2	10	803214	803223	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017067	ATCCC	2	10	805126	805135	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017067	GATCA	2	10	857410	857419	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017067	TTATG	2	10	859069	859078	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017067	GCCAT	2	10	881604	881613	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017067	GCAGG	2	10	881995	882004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017067	CCCCG	2	10	885483	885492	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_017067	GTGCG	2	10	899583	899592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017067	GTGCT	2	10	911231	911240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017067	GGATT	2	10	923994	924003	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017067	CTGGC	2	10	934839	934848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017067	AATAA	2	10	966912	966921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017067	CCGCG	2	10	969471	969480	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017067	CCAAA	2	10	990097	990106	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017067	TTCCA	2	10	1009096	1009105	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017067	CTGTG	2	10	1014628	1014637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017067	TGTAA	2	10	1076194	1076203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017067	GCGCT	2	10	1084066	1084075	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017067	CAGTA	2	10	1114972	1114981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017067	CGCTG	2	10	1164459	1164468	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017067	TTGGG	2	10	1166755	1166764	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017067	GGGCA	2	10	1172424	1172433	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017067	GTTTG	2	10	1174038	1174047	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017067	GAGCC	2	10	1204551	1204560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017067	GCGGG	2	10	1208340	1208349	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017067	TCGCT	2	10	1208389	1208398	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017067	TCCGC	2	10	1261524	1261533	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_017067	CAGGA	2	10	1286485	1286494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017067	ACCAG	2	10	1300697	1300706	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017067	AAGTA	2	10	1333891	1333900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017067	TCCGC	2	10	1334097	1334106	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_017067	TATTG	2	10	1335794	1335803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017067	CATCA	2	10	1367006	1367015	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017067	GGAGT	2	10	1441555	1441564	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017067	TATAA	2	10	1467055	1467064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017067	TCCGT	2	10	1473716	1473725	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017067	TAAAC	2	10	1494591	1494600	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017067	GAGCT	2	10	1499790	1499799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017067	TCAGA	2	10	1501597	1501606	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017067	AAGTT	2	10	1504399	1504408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017067	AAGGG	2	10	1570698	1570707	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017067	CCAGG	2	10	1582368	1582377	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017067	AAATT	2	10	1598067	1598076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017067	ACTGA	2	10	1657806	1657815	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017067	GTCCT	2	10	1671498	1671507	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017067	TACTT	2	10	1714348	1714357	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017067	ACCTG	2	10	1726706	1726715	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017067	AATAC	2	10	1738997	1739006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017067	TCATA	2	10	1778660	1778669	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017067	AGGAC	2	10	1807179	1807188	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017067	TTGTC	2	10	1837734	1837743	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017067	AACAT	2	10	1841329	1841338	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017067	CCGTG	2	10	1846474	1846483	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017067	CTGTC	2	10	1853336	1853345	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017067	CTGTT	2	10	1891897	1891906	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017067	GGAAG	2	10	1898392	1898401	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017067	GTGAA	2	10	1898407	1898416	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017067	GCGGG	2	10	1924062	1924071	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017067	ATTTT	2	10	1926910	1926919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017067	AAAAT	2	10	1962625	1962634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017067	CCTGA	2	10	1964975	1964984	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017067	AAGCA	2	10	1965021	1965030	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017067	TTTCA	2	10	1976981	1976990	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017067	AATTC	2	10	1977010	1977019	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017067	TCGGT	2	10	1985894	1985903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017067	AAATC	2	10	1986868	1986877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017067	CTCGA	2	10	1991947	1991956	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017067	GCCAA	2	10	2004048	2004057	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017067	AATGC	2	10	2013492	2013501	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017067	CCTGC	2	10	2035929	2035938	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_017067	ACACC	2	10	2043475	2043484	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017067	CAGGA	2	10	2048822	2048831	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017067	CCGCC	2	10	2067833	2067842	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
126	NC_017067	GCAGG	2	10	2072623	2072632	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017067	AATGG	2	10	2072646	2072655	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017067	ACTCA	2	10	2104878	2104887	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017067	CCCGG	2	10	2142683	2142692	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_017067	CCCGC	2	10	2156697	2156706	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
131	NC_017067	CTTTT	2	10	2237758	2237767	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017067	TGTCC	2	10	2253624	2253633	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017067	ATCAA	2	10	2257007	2257016	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017067	GCGGA	2	10	2265365	2265374	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017067	CACGC	2	10	2267825	2267834	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_017067	TTACC	2	10	2267895	2267904	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017067	CTGAC	2	10	2273361	2273370	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017067	AAATA	2	10	2275259	2275268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017067	TTTCA	2	10	2281028	2281037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017067	TCTTT	2	10	2281203	2281212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017067	GACAG	2	10	2333742	2333751	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017067	TTTCT	2	10	2334571	2334580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017067	TTCAT	2	10	2334795	2334804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017067	AGCGC	2	10	2341381	2341390	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017067	GTGGG	2	10	2357558	2357567	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017067	ATTCA	2	10	2366120	2366129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017067	GGTCT	2	10	2389000	2389009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017067	ACAGA	2	10	2405581	2405590	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_017067	GGGAT	2	10	2439916	2439925	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017067	CACGA	2	10	2444037	2444046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_017067	CGACC	2	10	2477277	2477286	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
155	NC_017067	CAAGC	2	10	2597727	2597736	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_017067	GCGCG	2	10	2674133	2674142	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159	NC_017067	TTGCT	2	10	2740059	2740068	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017067	TTGGA	2	10	2767321	2767330	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017067	GCCCG	2	10	2796434	2796443	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
162	NC_017067	CTTTC	2	10	2820581	2820590	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017067	TTGAC	2	10	2826302	2826311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017067	CGGCC	2	10	2858217	2858226	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
165	NC_017067	GCAAG	2	10	2883785	2883794	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017067	CTTGT	2	10	2889223	2889232	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_017067	TTTGG	2	10	2902776	2902785	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017067	ACCCA	3	15	2906969	2906983	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
169	NC_017067	ATATC	2	10	2920164	2920173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_017067	AATTG	2	10	2978160	2978169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017067	GAGAA	2	10	2978993	2979002	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017067	CTCAA	2	10	2984031	2984040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_017067	TTGTT	2	10	2984264	2984273	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017067	GTTGT	2	10	3011548	3011557	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017067	CTTTC	2	10	3058054	3058063	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_017067	TCCCC	2	10	3112208	3112217	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
179	NC_017067	AGCCT	2	10	3115028	3115037	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_017067	ACCCG	2	10	3166768	3166777	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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182	NC_017067	TCCAG	2	10	3204186	3204195	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_017067	ACGGC	2	10	3260368	3260377	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_017067	TGCCC	2	10	3277827	3277836	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
185	NC_017067	GCCCG	2	10	3292103	3292112	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
186	NC_017067	AACAG	2	10	3309958	3309967	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
187	NC_017067	AACCG	2	10	3318142	3318151	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_017067	ATGTT	2	10	3366855	3366864	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017067	TAAAG	2	10	3366875	3366884	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_017067	TCAGT	2	10	3472231	3472240	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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220	NC_017067	GGTCA	2	10	3788785	3788794	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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232	NC_017067	AATTA	2	10	3900401	3900410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_017067	GGCAA	2	10	3907317	3907326	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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235	NC_017067	TAGAT	2	10	3921329	3921338	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
236	NC_017067	GTAAA	2	10	3922124	3922133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_017067	GTCTG	2	10	3988259	3988268	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
242	NC_017067	GTTCC	2	10	3988331	3988340	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.