MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 3519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017066	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383751990
2	NC_017066	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017066	CAAA	2	8	963	970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017066	ATTT	2	8	1303	1310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017066	ACAG	2	8	1632	1639	50 %	0 %	25 %	25 %	383751992
6	NC_017066	AGTA	2	8	2294	2301	50 %	25 %	25 %	0 %	383751993
7	NC_017066	TTAT	2	8	2605	2612	25 %	75 %	0 %	0 %	383751993
8	NC_017066	TAAT	2	8	2719	2726	50 %	50 %	0 %	0 %	383751993
9	NC_017066	TTAT	2	8	2827	2834	25 %	75 %	0 %	0 %	383751993
10	NC_017066	TATT	2	8	3547	3554	25 %	75 %	0 %	0 %	383751994
11	NC_017066	AGAA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	383751994
12	NC_017066	AATA	2	8	5209	5216	75 %	25 %	0 %	0 %	383751994
13	NC_017066	TCAC	2	8	5248	5255	25 %	25 %	0 %	50 %	383751994
14	NC_017066	TTTA	2	8	5979	5986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017066	TAAA	2	8	5998	6005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017066	ACCT	2	8	6364	6371	25 %	25 %	0 %	50 %	383751995
17	NC_017066	ACCA	2	8	6448	6455	50 %	0 %	0 %	50 %	383751995
18	NC_017066	TAAA	2	8	6456	6463	75 %	25 %	0 %	0 %	383751995
19	NC_017066	ATAA	2	8	6619	6626	75 %	25 %	0 %	0 %	383751995
20	NC_017066	ACTT	2	8	6840	6847	25 %	50 %	0 %	25 %	383751996
21	NC_017066	CCTG	2	8	7667	7674	0 %	25 %	25 %	50 %	383751997
22	NC_017066	TAAC	2	8	8478	8485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017066	TTTA	2	8	8725	8732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017066	TAAT	2	8	8830	8837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017066	GCTC	2	8	8992	8999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017066	TGAG	2	8	9029	9036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017066	CAAT	2	8	9454	9461	50 %	25 %	0 %	25 %	383751998
28	NC_017066	CATG	2	8	9477	9484	25 %	25 %	25 %	25 %	383751998
29	NC_017066	ATGA	2	8	9553	9560	50 %	25 %	25 %	0 %	383751998
30	NC_017066	AAAT	2	8	10269	10276	75 %	25 %	0 %	0 %	383751998
31	NC_017066	TAAA	2	8	10549	10556	75 %	25 %	0 %	0 %	383751999
32	NC_017066	TAAA	2	8	10576	10583	75 %	25 %	0 %	0 %	383751999
33	NC_017066	TCAT	2	8	10973	10980	25 %	50 %	0 %	25 %	383751999
34	NC_017066	TCTT	2	8	11439	11446	0 %	75 %	0 %	25 %	383752000
35	NC_017066	TAAT	2	8	12024	12031	50 %	50 %	0 %	0 %	383752001
36	NC_017066	GCTT	2	8	12039	12046	0 %	50 %	25 %	25 %	383752001
37	NC_017066	TTTA	2	8	12187	12194	25 %	75 %	0 %	0 %	383752001
38	NC_017066	AATA	2	8	12958	12965	75 %	25 %	0 %	0 %	383752002
39	NC_017066	GCTC	2	8	13162	13169	0 %	25 %	25 %	50 %	383752002
40	NC_017066	TCTG	2	8	14041	14048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017066	TTTA	2	8	14115	14122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017066	TCTT	2	8	14123	14130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017066	ATTA	2	8	14361	14368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017066	AAAG	2	8	14443	14450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017066	TTAT	2	8	14617	14624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017066	AATA	2	8	15250	15257	75 %	25 %	0 %	0 %	383752003
47	NC_017066	AGCA	2	8	15678	15685	50 %	0 %	25 %	25 %	383752003
48	NC_017066	TGGA	2	8	15792	15799	25 %	25 %	50 %	0 %	383752003
49	NC_017066	GAAA	2	8	16308	16315	75 %	0 %	25 %	0 %	383752003
50	NC_017066	TATG	2	8	16579	16586	25 %	50 %	25 %	0 %	383752003
51	NC_017066	AAAG	2	8	16637	16644	75 %	0 %	25 %	0 %	383752003
52	NC_017066	TTCA	2	8	17361	17368	25 %	50 %	0 %	25 %	383752003
53	NC_017066	TAAA	2	8	18000	18007	75 %	25 %	0 %	0 %	383752003
54	NC_017066	AGTC	2	8	18113	18120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017066	AAGA	2	8	18631	18638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017066	AGTA	2	8	18727	18734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017066	ATAG	2	8	18753	18760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017066	CTTA	2	8	19036	19043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017066	TACC	2	8	19823	19830	25 %	25 %	0 %	50 %	383752004
60	NC_017066	GCTA	2	8	20017	20024	25 %	25 %	25 %	25 %	383752004
61	NC_017066	CTTG	2	8	20191	20198	0 %	50 %	25 %	25 %	383752005
62	NC_017066	ATGC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	25 %	25 %	383752005
63	NC_017066	AACA	2	8	20222	20229	75 %	0 %	0 %	25 %	383752005
64	NC_017066	AAGC	2	8	20708	20715	50 %	0 %	25 %	25 %	383752005
65	NC_017066	TAAA	2	8	21542	21549	75 %	25 %	0 %	0 %	383752006
66	NC_017066	TAAT	2	8	21557	21564	50 %	50 %	0 %	0 %	383752006
67	NC_017066	AAAT	2	8	21859	21866	75 %	25 %	0 %	0 %	383752007
68	NC_017066	TATC	2	8	21996	22003	25 %	50 %	0 %	25 %	383752007
69	NC_017066	CAAT	2	8	22165	22172	50 %	25 %	0 %	25 %	383752007
70	NC_017066	ATAA	2	8	22987	22994	75 %	25 %	0 %	0 %	383752008
71	NC_017066	TCAA	2	8	23177	23184	50 %	25 %	0 %	25 %	383752008
72	NC_017066	TAAA	2	8	23488	23495	75 %	25 %	0 %	0 %	383752008
73	NC_017066	AAGA	2	8	24618	24625	75 %	0 %	25 %	0 %	383752009
74	NC_017066	ACTT	2	8	25001	25008	25 %	50 %	0 %	25 %	383752009
75	NC_017066	AAGA	2	8	25725	25732	75 %	0 %	25 %	0 %	383752011
76	NC_017066	TTAA	2	8	26173	26180	50 %	50 %	0 %	0 %	383752012
77	NC_017066	TAAT	2	8	26687	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017066	TATT	2	8	26738	26745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017066	TTTA	2	8	26983	26990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017066	CAAT	2	8	27291	27298	50 %	25 %	0 %	25 %	383752013
81	NC_017066	TTTC	2	8	27466	27473	0 %	75 %	0 %	25 %	383752013
82	NC_017066	TGAT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	25 %	0 %	383752013
83	NC_017066	CTTG	2	8	28246	28253	0 %	50 %	25 %	25 %	383752014
84	NC_017066	GCAA	2	8	28417	28424	50 %	0 %	25 %	25 %	383752014
85	NC_017066	AGTT	2	8	29331	29338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017066	TCAT	2	8	29549	29556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017066	TGAT	2	8	29599	29606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017066	CTTC	2	8	29722	29729	0 %	50 %	0 %	50 %	383752015
89	NC_017066	TATC	2	8	30134	30141	25 %	50 %	0 %	25 %	383752015
90	NC_017066	ATAA	2	8	30237	30244	75 %	25 %	0 %	0 %	383752015
91	NC_017066	AGCA	2	8	30750	30757	50 %	0 %	25 %	25 %	383752015
92	NC_017066	TTTG	2	8	30840	30847	0 %	75 %	25 %	0 %	383752015
93	NC_017066	ATTC	2	8	30905	30912	25 %	50 %	0 %	25 %	383752015
94	NC_017066	AACG	2	8	31798	31805	50 %	0 %	25 %	25 %	383752015
95	NC_017066	AAAT	2	8	31829	31836	75 %	25 %	0 %	0 %	383752015
96	NC_017066	ATTA	2	8	32064	32071	50 %	50 %	0 %	0 %	383752015
97	NC_017066	AATA	2	8	32110	32117	75 %	25 %	0 %	0 %	383752015
98	NC_017066	AAGT	2	8	32591	32598	50 %	25 %	25 %	0 %	383752015
99	NC_017066	TCCT	2	8	33280	33287	0 %	50 %	0 %	50 %	383752016
100	NC_017066	ATTT	2	8	33321	33328	25 %	75 %	0 %	0 %	383752016
101	NC_017066	GTTA	2	8	34192	34199	25 %	50 %	25 %	0 %	383752016
102	NC_017066	TTAA	2	8	34418	34425	50 %	50 %	0 %	0 %	383752016
103	NC_017066	AATT	2	8	35079	35086	50 %	50 %	0 %	0 %	383752016
104	NC_017066	ACTA	2	8	35383	35390	50 %	25 %	0 %	25 %	383752016
105	NC_017066	ATTT	2	8	35689	35696	25 %	75 %	0 %	0 %	383752016
106	NC_017066	AATT	2	8	35757	35764	50 %	50 %	0 %	0 %	383752016
107	NC_017066	GTAA	2	8	35993	36000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017066	ATTT	2	8	36088	36095	25 %	75 %	0 %	0 %	383752017
109	NC_017066	CATA	2	8	36359	36366	50 %	25 %	0 %	25 %	383752017
110	NC_017066	AAAT	2	8	36666	36673	75 %	25 %	0 %	0 %	383752017
111	NC_017066	TAAA	2	8	36950	36957	75 %	25 %	0 %	0 %	383752017
112	NC_017066	TGAT	2	8	37102	37109	25 %	50 %	25 %	0 %	383752017
113	NC_017066	CAAG	2	8	37121	37128	50 %	0 %	25 %	25 %	383752017
114	NC_017066	TGAT	2	8	38143	38150	25 %	50 %	25 %	0 %	383752017
115	NC_017066	AATA	2	8	38336	38343	75 %	25 %	0 %	0 %	383752017
116	NC_017066	CATT	2	8	38509	38516	25 %	50 %	0 %	25 %	383752017
117	NC_017066	GACC	2	8	38681	38688	25 %	0 %	25 %	50 %	383752017
118	NC_017066	CATA	2	8	39560	39567	50 %	25 %	0 %	25 %	383752018
119	NC_017066	ATAC	2	8	39622	39629	50 %	25 %	0 %	25 %	383752018
120	NC_017066	ACCC	2	8	39634	39641	25 %	0 %	0 %	75 %	383752018
121	NC_017066	TAAA	2	8	39665	39672	75 %	25 %	0 %	0 %	383752018
122	NC_017066	GAAT	2	8	39680	39687	50 %	25 %	25 %	0 %	383752018
123	NC_017066	CAAT	2	8	40021	40028	50 %	25 %	0 %	25 %	383752018
124	NC_017066	ATTA	2	8	40500	40507	50 %	50 %	0 %	0 %	383752018
125	NC_017066	ATTC	2	8	41478	41485	25 %	50 %	0 %	25 %	383752019
126	NC_017066	TAAT	2	8	42303	42310	50 %	50 %	0 %	0 %	383752019
127	NC_017066	AGAA	2	8	42406	42413	75 %	0 %	25 %	0 %	383752019
128	NC_017066	AAAT	2	8	42977	42984	75 %	25 %	0 %	0 %	383752019
129	NC_017066	TAAG	2	8	43221	43228	50 %	25 %	25 %	0 %	383752019
130	NC_017066	ATGC	2	8	43438	43445	25 %	25 %	25 %	25 %	383752019
131	NC_017066	GCTT	2	8	43940	43947	0 %	50 %	25 %	25 %	383752019
132	NC_017066	AATT	2	8	44032	44039	50 %	50 %	0 %	0 %	383752019
133	NC_017066	TAAA	2	8	44142	44149	75 %	25 %	0 %	0 %	383752019
134	NC_017066	ATTT	2	8	44158	44165	25 %	75 %	0 %	0 %	383752019
135	NC_017066	ATGT	2	8	44247	44254	25 %	50 %	25 %	0 %	383752019
136	NC_017066	TTAC	2	8	44435	44442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017066	TGTT	2	8	44846	44853	0 %	75 %	25 %	0 %	383752020
138	NC_017066	AATT	2	8	46309	46316	50 %	50 %	0 %	0 %	383752020
139	NC_017066	GAAA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	383752020
140	NC_017066	TTTC	2	8	46438	46445	0 %	75 %	0 %	25 %	383752020
141	NC_017066	TCTT	2	8	46910	46917	0 %	75 %	0 %	25 %	383752020
142	NC_017066	TTTA	2	8	47199	47206	25 %	75 %	0 %	0 %	383752021
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