MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 18133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017066	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751990
2	NC_017066	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751990
3	NC_017066	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751990
4	NC_017066	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751990
5	NC_017066	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751990
6	NC_017066	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751990
7	NC_017066	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751990
8	NC_017066	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751990
9	NC_017066	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751990
10	NC_017066	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751990
11	NC_017066	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017066	AAT	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017066	ACA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017066	CTT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017066	GTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383751991
16	NC_017066	ATA	2	6	1098	1103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751991
17	NC_017066	TGA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751991
18	NC_017066	TGT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751991
19	NC_017066	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751991
20	NC_017066	TAA	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751991
21	NC_017066	CAA	2	6	1436	1441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751992
22	NC_017066	TGC	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751992
23	NC_017066	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751992
24	NC_017066	TGA	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751992
25	NC_017066	GCA	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751992
26	NC_017066	GAA	2	6	1893	1898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751992
27	NC_017066	AAT	2	6	1923	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751992
28	NC_017066	AAG	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751992
29	NC_017066	TTA	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751992
30	NC_017066	ACA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751992
31	NC_017066	ATT	2	6	2111	2116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751993
32	NC_017066	TAG	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751993
33	NC_017066	ATA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751993
34	NC_017066	ATA	2	6	2481	2486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751993
35	NC_017066	ATG	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751993
36	NC_017066	TAA	2	6	2749	2754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751993
37	NC_017066	TTA	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751993
38	NC_017066	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
39	NC_017066	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
40	NC_017066	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
41	NC_017066	GAA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
42	NC_017066	AGC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751994
43	NC_017066	GTT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751994
44	NC_017066	TCA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751994
45	NC_017066	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751994
46	NC_017066	GAT	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751994
47	NC_017066	ATT	2	6	3540	3545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
48	NC_017066	AGC	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751994
49	NC_017066	TAT	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
50	NC_017066	GCA	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751994
51	NC_017066	AGA	2	6	3880	3885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
52	NC_017066	CTT	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751994
53	NC_017066	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
54	NC_017066	AAT	3	9	4250	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
55	NC_017066	ATG	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751994
56	NC_017066	TGA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751994
57	NC_017066	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
58	NC_017066	GGT	3	9	4502	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383751994
59	NC_017066	CTT	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751994
60	NC_017066	GCA	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751994
61	NC_017066	AGA	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
62	NC_017066	AGA	3	9	4603	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
63	NC_017066	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
64	NC_017066	GTT	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751994
65	NC_017066	AAG	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
66	NC_017066	GAA	2	6	4673	4678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
67	NC_017066	TAA	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
68	NC_017066	TAT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
69	NC_017066	ATA	2	6	5001	5006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
70	NC_017066	GAT	3	9	5015	5023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751994
71	NC_017066	AAG	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751994
72	NC_017066	AAT	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
73	NC_017066	ATT	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
74	NC_017066	TAA	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
75	NC_017066	TGC	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751994
76	NC_017066	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
77	NC_017066	CTA	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751994
78	NC_017066	AGT	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751994
79	NC_017066	CAC	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383751994
80	NC_017066	ATT	3	9	5507	5515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
81	NC_017066	TTA	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751994
82	NC_017066	TAA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
83	NC_017066	TCA	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751994
84	NC_017066	ATG	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751994
85	NC_017066	AAT	2	6	5827	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751994
86	NC_017066	ATT	2	6	5944	5949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017066	AAC	2	6	5971	5976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017066	CTA	3	9	6032	6040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751995
89	NC_017066	AAT	2	6	6058	6063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751995
90	NC_017066	ATT	2	6	6079	6084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751995
91	NC_017066	TTC	2	6	6145	6150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751995
92	NC_017066	TAC	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751995
93	NC_017066	CCA	2	6	6344	6349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383751995
94	NC_017066	ATT	2	6	6350	6355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751995
95	NC_017066	TTA	2	6	6464	6469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751995
96	NC_017066	TAT	2	6	6537	6542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751995
97	NC_017066	ATT	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751995
98	NC_017066	TAC	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751995
99	NC_017066	GTA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751995
100	NC_017066	CTT	2	6	6996	7001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751996
101	NC_017066	TAG	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751996
102	NC_017066	AGC	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751996
103	NC_017066	CTA	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751996
104	NC_017066	TAT	2	6	7240	7245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751996
105	NC_017066	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017066	ATT	2	6	7333	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017066	ACT	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751997
108	NC_017066	TTA	2	6	7445	7450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751997
109	NC_017066	ATA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751997
110	NC_017066	CTT	2	6	7536	7541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751997
111	NC_017066	CCT	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383751997
112	NC_017066	TGC	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751997
113	NC_017066	TCC	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383751997
114	NC_017066	AAT	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751997
115	NC_017066	TCT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751997
116	NC_017066	ATA	2	6	7754	7759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751997
117	NC_017066	TAG	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751997
118	NC_017066	ATT	2	6	7810	7815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751997
119	NC_017066	TAT	2	6	7848	7853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751997
120	NC_017066	ACG	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751997
121	NC_017066	TCG	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751997
122	NC_017066	TGT	2	6	7955	7960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751997
123	NC_017066	TAT	2	6	8025	8030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751997
124	NC_017066	TAA	2	6	8037	8042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751997
125	NC_017066	AAT	2	6	8107	8112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751997
126	NC_017066	ATT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751997
127	NC_017066	TAG	2	6	8130	8135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751997
128	NC_017066	AGC	2	6	8260	8265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751997
129	NC_017066	CTT	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751997
130	NC_017066	TAG	2	6	8382	8387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751997
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132	NC_017066	TAT	2	6	8520	8525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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