MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 4319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017066	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017066	AAT	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017066	ACA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017066	CTT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017066	ATT	2	6	5944	5949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017066	AAC	2	6	5971	5976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017066	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017066	ATT	2	6	7333	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017066	TAT	2	6	8520	8525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017066	TAA	2	6	8608	8613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017066	GAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017066	TAA	2	6	8663	8668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017066	TAA	2	6	8799	8804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017066	TGG	2	6	8851	8856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017066	AAG	2	6	9019	9024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017066	AAT	2	6	9042	9047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017066	CAT	2	6	9099	9104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017066	ATA	2	6	9270	9275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017066	TTA	2	6	13972	13977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017066	TTA	2	6	13982	13987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017066	TTA	2	6	14031	14036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017066	ATT	2	6	14089	14094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017066	ATT	2	6	14254	14259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017066	AAG	2	6	14381	14386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017066	AAT	2	6	14391	14396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017066	ATT	2	6	14407	14412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017066	TCA	2	6	14540	14545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017066	ATT	2	6	14580	14585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017066	ACC	2	6	18189	18194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017066	AAG	2	6	18326	18331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017066	TAA	2	6	18351	18356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017066	ATT	2	6	18463	18468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017066	TGC	2	6	18475	18480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017066	TAT	2	6	18541	18546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017066	ATA	2	6	18548	18553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017066	ATG	2	6	18605	18610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017066	ACA	2	6	18677	18682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017066	AAT	2	6	18769	18774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017066	TAT	2	6	18905	18910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017066	AGT	2	6	18926	18931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017066	ATT	2	6	19023	19028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017066	TCT	2	6	19186	19191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017066	CAA	2	6	19226	19231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017066	TAA	2	6	19243	19248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017066	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017066	AAT	3	9	19299	19307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017066	TTC	2	6	19326	19331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017066	TTA	2	6	19364	19369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017066	ATA	2	6	19406	19411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017066	AGT	2	6	19432	19437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017066	ATA	2	6	19440	19445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017066	ATA	2	6	19478	19483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017066	TTA	2	6	19558	19563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017066	AGT	2	6	19571	19576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017066	TGT	2	6	19596	19601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017066	ATT	2	6	22535	22540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017066	AAT	2	6	22589	22594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017066	TAT	2	6	25107	25112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017066	TTA	2	6	25388	25393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017066	ATT	2	6	25501	25506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017066	CTA	2	6	26853	26858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017066	TGC	2	6	26877	26882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017066	CTT	2	6	26906	26911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017066	ATA	2	6	29321	29326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017066	TAA	2	6	29366	29371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017066	ATC	2	6	29415	29420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017066	TAA	2	6	29436	29441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017066	AGA	2	6	29462	29467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017066	CTA	2	6	29495	29500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017066	CTT	2	6	29587	29592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017066	TAT	2	6	29625	29630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017066	TTA	2	6	29653	29658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017066	TCA	2	6	35941	35946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017066	ATT	2	6	36030	36035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017066	ATA	2	6	44531	44536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017066	TTA	2	6	47109	47114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017066	ATC	2	6	47569	47574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017066	TTA	2	6	47648	47653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017066	TAA	2	6	47670	47675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017066	TAC	2	6	47696	47701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017066	ATT	2	6	47715	47720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017066	ATA	2	6	47751	47756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017066	TAA	2	6	47877	47882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017066	TTG	2	6	47885	47890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017066	TAT	3	9	47896	47904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017066	ATC	2	6	48009	48014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017066	TAG	2	6	48057	48062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017066	TAC	2	6	48080	48085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017066	TTA	2	6	48750	48755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017066	TGT	2	6	48770	48775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017066	CAA	2	6	48814	48819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017066	AAT	2	6	48902	48907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017066	TAT	2	6	48955	48960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017066	TAG	2	6	49141	49146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017066	AAT	2	6	49803	49808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017066	ACA	2	6	49891	49896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017066	ATA	2	6	49912	49917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017066	CTA	2	6	49918	49923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017066	AAT	2	6	50129	50134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017066	TTA	2	6	50149	50154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017066	TAG	2	6	50189	50194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017066	ATA	2	6	50232	50237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017066	TAA	2	6	50252	50257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017066	ACT	2	6	50335	50340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017066	ATT	2	6	50460	50465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017066	TTA	2	6	50475	50480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017066	CAA	2	6	50529	50534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017066	TAA	2	6	50588	50593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017066	TTA	2	6	50601	50606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017066	ATA	2	6	50660	50665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017066	TAC	2	6	50667	50672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017066	GTA	2	6	50688	50693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017066	ATA	2	6	50794	50799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017066	AAT	2	6	50890	50895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017066	ATA	2	6	50923	50928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017066	ACT	2	6	52838	52843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017066	ACC	2	6	54266	54271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017066	TGC	2	6	54361	54366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017066	ATA	2	6	54417	54422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017066	ATT	2	6	54428	54433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017066	TAA	2	6	54482	54487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017066	ATC	2	6	54600	54605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017066	CAA	2	6	54643	54648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017066	AAT	2	6	54650	54655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017066	CTA	2	6	54695	54700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017066	TAC	2	6	54822	54827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017066	CTA	2	6	54831	54836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017066	GAA	2	6	54906	54911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017066	ATT	2	6	57366	57371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017066	TAA	2	6	57380	57385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017066	TAT	2	6	57441	57446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017066	TTA	3	9	57450	57458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017066	ATA	2	6	58822	58827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017066	TCA	2	6	60938	60943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017066	TAA	2	6	60970	60975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017066	GTA	2	6	61057	61062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017066	GAA	2	6	61070	61075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017066	AGC	2	6	61084	61089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017066	TAT	2	6	61188	61193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017066	TAC	2	6	61265	61270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017066	AAT	2	6	61302	61307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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