MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 1824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017066	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	383751990
2	NC_017066	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383751990
3	NC_017066	AT	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	383751992
4	NC_017066	TA	3	6	1667	1672	50 %	50 %	0 %	0 %	383751992
5	NC_017066	TA	3	6	2404	2409	50 %	50 %	0 %	0 %	383751993
6	NC_017066	TC	3	6	3294	3299	0 %	50 %	0 %	50 %	383751994
7	NC_017066	GA	3	6	3476	3481	50 %	0 %	50 %	0 %	383751994
8	NC_017066	AT	4	8	3914	3921	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
9	NC_017066	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
10	NC_017066	GA	3	6	4244	4249	50 %	0 %	50 %	0 %	383751994
11	NC_017066	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
12	NC_017066	AT	3	6	4775	4780	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
13	NC_017066	AT	3	6	5788	5793	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
14	NC_017066	TC	3	6	6565	6570	0 %	50 %	0 %	50 %	383751995
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16	NC_017066	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	383751997
17	NC_017066	TG	3	6	9502	9507	0 %	50 %	50 %	0 %	383751998
18	NC_017066	AT	3	6	10562	10567	50 %	50 %	0 %	0 %	383751999
19	NC_017066	AT	4	8	11627	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	383752000
20	NC_017066	TA	3	6	11650	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	383752000
21	NC_017066	AT	3	6	12047	12052	50 %	50 %	0 %	0 %	383752001
22	NC_017066	TA	3	6	12424	12429	50 %	50 %	0 %	0 %	383752001
23	NC_017066	CT	3	6	12515	12520	0 %	50 %	0 %	50 %	383752001
24	NC_017066	TA	3	6	13112	13117	50 %	50 %	0 %	0 %	383752002
25	NC_017066	AT	3	6	13494	13499	50 %	50 %	0 %	0 %	383752002
26	NC_017066	TA	4	8	13886	13893	50 %	50 %	0 %	0 %	383752002
27	NC_017066	TA	4	8	17671	17678	50 %	50 %	0 %	0 %	383752003
28	NC_017066	AT	3	6	17730	17735	50 %	50 %	0 %	0 %	383752003
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30	NC_017066	CT	4	8	20337	20344	0 %	50 %	0 %	50 %	383752005
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32	NC_017066	TA	3	6	20552	20557	50 %	50 %	0 %	0 %	383752005
33	NC_017066	GA	3	6	20623	20628	50 %	0 %	50 %	0 %	383752005
34	NC_017066	TA	3	6	20794	20799	50 %	50 %	0 %	0 %	383752005
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40	NC_017066	AT	4	8	22149	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	383752007
41	NC_017066	TA	3	6	22208	22213	50 %	50 %	0 %	0 %	383752007
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52	NC_017066	AT	3	6	31884	31889	50 %	50 %	0 %	0 %	383752015
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63	NC_017066	AT	3	6	37845	37850	50 %	50 %	0 %	0 %	383752017
64	NC_017066	TA	3	6	37959	37964	50 %	50 %	0 %	0 %	383752017
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73	NC_017066	AT	3	6	43124	43129	50 %	50 %	0 %	0 %	383752019
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105	NC_017066	AT	3	6	58507	58512	50 %	50 %	0 %	0 %	383752032
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113	NC_017066	AT	3	6	63831	63836	50 %	50 %	0 %	0 %	383752036
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127	NC_017066	TA	3	6	77358	77363	50 %	50 %	0 %	0 %	383752043
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