MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 3775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017065	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017065	TTAT	2	8	2699	2706	25 %	75 %	0 %	0 %	383750645
4	NC_017065	TTAT	2	8	2921	2928	25 %	75 %	0 %	0 %	383750645
5	NC_017065	AACT	2	8	3304	3311	50 %	25 %	0 %	25 %	383750646
6	NC_017065	CAAA	2	8	3350	3357	75 %	0 %	0 %	25 %	383750646
7	NC_017065	TATT	2	8	3617	3624	25 %	75 %	0 %	0 %	383750646
8	NC_017065	TCGC	2	8	3747	3754	0 %	25 %	25 %	50 %	383750646
9	NC_017065	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	383750646
10	NC_017065	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	383750646
11	NC_017065	ATTT	2	8	6559	6566	25 %	75 %	0 %	0 %	383750648
12	NC_017065	TAAA	2	8	6655	6662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017065	ATAA	2	8	7112	7119	75 %	25 %	0 %	0 %	383750649
14	NC_017065	ACTT	2	8	7495	7502	25 %	50 %	0 %	25 %	383750650
15	NC_017065	ATTT	2	8	7902	7909	25 %	75 %	0 %	0 %	383750650
16	NC_017065	CCTC	2	8	10215	10222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_017065	CAAT	2	8	10262	10269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017065	ATTA	2	8	11261	11268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017065	ATTA	2	8	11475	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017065	TTTA	2	8	12094	12101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017065	GATT	2	8	12536	12543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017065	AAAT	2	8	12544	12551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017065	AATT	2	8	12571	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017065	TTAA	2	8	12752	12759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017065	ATGA	2	8	13446	13453	50 %	25 %	25 %	0 %	383750655
26	NC_017065	TAAA	2	8	14469	14476	75 %	25 %	0 %	0 %	383750656
27	NC_017065	TAAA	2	8	14628	14635	75 %	25 %	0 %	0 %	383750656
28	NC_017065	TCAT	2	8	14749	14756	25 %	50 %	0 %	25 %	383750656
29	NC_017065	CTTT	2	8	14883	14890	0 %	75 %	0 %	25 %	383750656
30	NC_017065	TTAG	2	8	15125	15132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017065	GCAA	2	8	15223	15230	50 %	0 %	25 %	25 %	383750657
32	NC_017065	TCTT	2	8	15300	15307	0 %	75 %	0 %	25 %	383750657
33	NC_017065	AGTA	2	8	15558	15565	50 %	25 %	25 %	0 %	383750658
34	NC_017065	GCTT	2	8	16084	16091	0 %	50 %	25 %	25 %	383750659
35	NC_017065	AATT	2	8	16433	16440	50 %	50 %	0 %	0 %	383750659
36	NC_017065	GCTT	2	8	16704	16711	0 %	50 %	25 %	25 %	383750659
37	NC_017065	AATA	2	8	17057	17064	75 %	25 %	0 %	0 %	383750660
38	NC_017065	TCTA	2	8	17524	17531	25 %	50 %	0 %	25 %	383750660
39	NC_017065	ACGT	2	8	17947	17954	25 %	25 %	25 %	25 %	383750660
40	NC_017065	CTTG	2	8	18062	18069	0 %	50 %	25 %	25 %	383750660
41	NC_017065	AGTA	2	8	19059	19066	50 %	25 %	25 %	0 %	383750662
42	NC_017065	ATTA	2	8	19084	19091	50 %	50 %	0 %	0 %	383750662
43	NC_017065	AATA	2	8	19128	19135	75 %	25 %	0 %	0 %	383750662
44	NC_017065	CTTT	2	8	19173	19180	0 %	75 %	0 %	25 %	383750662
45	NC_017065	TGAA	2	8	19321	19328	50 %	25 %	25 %	0 %	383750662
46	NC_017065	TAAA	2	8	19364	19371	75 %	25 %	0 %	0 %	383750662
47	NC_017065	AGAT	2	8	19552	19559	50 %	25 %	25 %	0 %	383750662
48	NC_017065	TAAA	2	8	19717	19724	75 %	25 %	0 %	0 %	383750663
49	NC_017065	GATA	2	8	19797	19804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017065	AGCA	2	8	19865	19872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017065	AGTA	2	8	20130	20137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017065	AAAC	2	8	20180	20187	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017065	TAAA	2	8	20256	20263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017065	TTAT	2	8	20451	20458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017065	GTAA	2	8	21371	21378	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
56	NC_017065	AGAT	2	8	21625	21632	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
57	NC_017065	AGCA	2	8	21744	21751	50 %	0 %	25 %	25 %	383750665
58	NC_017065	AAAT	2	8	21787	21794	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
59	NC_017065	AATG	2	8	21988	21995	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
60	NC_017065	ATTA	2	8	22289	22296	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
61	NC_017065	ATAG	2	8	22337	22344	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
62	NC_017065	ATAG	2	8	22349	22356	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
63	NC_017065	CGTT	2	8	22767	22774	0 %	50 %	25 %	25 %	383750665
64	NC_017065	CAAA	2	8	23084	23091	75 %	0 %	0 %	25 %	383750665
65	NC_017065	TAGT	2	8	23214	23221	25 %	50 %	25 %	0 %	383750665
66	NC_017065	AGTT	2	8	23314	23321	25 %	50 %	25 %	0 %	383750665
67	NC_017065	GTTA	2	8	24005	24012	25 %	50 %	25 %	0 %	383750665
68	NC_017065	TAAA	2	8	24561	24568	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
69	NC_017065	AAGT	2	8	25086	25093	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
70	NC_017065	TTCA	2	8	25644	25651	25 %	50 %	0 %	25 %	383750665
71	NC_017065	AATA	2	8	26137	26144	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
72	NC_017065	TAAA	2	8	26283	26290	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
73	NC_017065	TTAT	2	8	27049	27056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017065	AGCA	2	8	27123	27130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017065	AAGT	2	8	27575	27582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017065	TAAT	2	8	27953	27960	50 %	50 %	0 %	0 %	383750666
77	NC_017065	AAGA	2	8	28105	28112	75 %	0 %	25 %	0 %	383750666
78	NC_017065	AAAT	2	8	28197	28204	75 %	25 %	0 %	0 %	383750666
79	NC_017065	ATTA	2	8	28225	28232	50 %	50 %	0 %	0 %	383750666
80	NC_017065	TAAA	2	8	29074	29081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017065	GATA	2	8	29162	29169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017065	TAAA	2	8	29405	29412	75 %	25 %	0 %	0 %	383750669
83	NC_017065	GCTA	2	8	29415	29422	25 %	25 %	25 %	25 %	383750669
84	NC_017065	TCTA	2	8	30164	30171	25 %	50 %	0 %	25 %	383750671
85	NC_017065	ATTT	2	8	30208	30215	25 %	75 %	0 %	0 %	383750671
86	NC_017065	TGTC	2	8	30272	30279	0 %	50 %	25 %	25 %	383750671
87	NC_017065	TAAT	2	8	30662	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017065	ATAC	2	8	30869	30876	50 %	25 %	0 %	25 %	383750674
89	NC_017065	ATAA	2	8	31293	31300	75 %	25 %	0 %	0 %	383750674
90	NC_017065	CACT	2	8	31387	31394	25 %	25 %	0 %	50 %	383750674
91	NC_017065	TATT	2	8	32211	32218	25 %	75 %	0 %	0 %	383750676
92	NC_017065	AATT	2	8	33845	33852	50 %	50 %	0 %	0 %	383750679
93	NC_017065	TACC	2	8	33935	33942	25 %	25 %	0 %	50 %	383750679
94	NC_017065	GTTA	2	8	34317	34324	25 %	50 %	25 %	0 %	383750679
95	NC_017065	AAAC	2	8	35744	35751	75 %	0 %	0 %	25 %	383750681
96	NC_017065	TTAG	2	8	35920	35927	25 %	50 %	25 %	0 %	383750681
97	NC_017065	TTGC	2	8	36215	36222	0 %	50 %	25 %	25 %	383750681
98	NC_017065	ACTA	2	8	36369	36376	50 %	25 %	0 %	25 %	383750681
99	NC_017065	TTCC	2	8	36455	36462	0 %	50 %	0 %	50 %	383750681
100	NC_017065	TGTT	2	8	36923	36930	0 %	75 %	25 %	0 %	383750682
101	NC_017065	TTGT	2	8	37534	37541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017065	TATT	2	8	37564	37571	25 %	75 %	0 %	0 %	383750683
103	NC_017065	GTAA	2	8	37575	37582	50 %	25 %	25 %	0 %	383750683
104	NC_017065	AATG	2	8	38349	38356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017065	GCTT	2	8	39139	39146	0 %	50 %	25 %	25 %	383750684
106	NC_017065	ATAA	2	8	39365	39372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017065	AACA	2	8	39462	39469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017065	CTGA	2	8	41424	41431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017065	ATTG	2	8	41594	41601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017065	TAAA	2	8	41751	41758	75 %	25 %	0 %	0 %	383750688
111	NC_017065	ATTT	2	8	41856	41863	25 %	75 %	0 %	0 %	383750688
112	NC_017065	ATTA	2	8	42073	42080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017065	TGCT	2	8	42196	42203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017065	ATTA	2	8	42803	42810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017065	TAAT	2	8	43098	43105	50 %	50 %	0 %	0 %	383750689
116	NC_017065	ATTA	2	8	43168	43175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017065	TAAA	2	8	43270	43277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017065	GAAA	2	8	43482	43489	75 %	0 %	25 %	0 %	383750690
119	NC_017065	ATTT	2	8	43526	43533	25 %	75 %	0 %	0 %	383750690
120	NC_017065	ACAA	2	8	43793	43800	75 %	0 %	0 %	25 %	383750690
121	NC_017065	AAAT	2	8	43997	44004	75 %	25 %	0 %	0 %	383750691
122	NC_017065	TACC	2	8	45351	45358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017065	AAAC	2	8	45359	45366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017065	TAAT	2	8	45435	45442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017065	ATTA	2	8	45470	45477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017065	TAAA	2	8	45488	45495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017065	ATGA	2	8	45692	45699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017065	TAAC	2	8	45882	45889	50 %	25 %	0 %	25 %	383750693
129	NC_017065	ATTC	2	8	46310	46317	25 %	50 %	0 %	25 %	383750693
130	NC_017065	TTAC	2	8	46674	46681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017065	ATCA	2	8	47351	47358	50 %	25 %	0 %	25 %	383750694
132	NC_017065	TGCC	2	8	47661	47668	0 %	25 %	25 %	50 %	383750694
133	NC_017065	TATC	2	8	48220	48227	25 %	50 %	0 %	25 %	383750694
134	NC_017065	TTAA	2	8	48243	48250	50 %	50 %	0 %	0 %	383750694
135	NC_017065	AGTA	2	8	49366	49373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017065	ATAC	2	8	49584	49591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017065	TTGC	2	8	49690	49697	0 %	50 %	25 %	25 %	383750696
138	NC_017065	TGTT	2	8	50059	50066	0 %	75 %	25 %	0 %	383750697
139	NC_017065	AAGT	2	8	50096	50103	50 %	25 %	25 %	0 %	383750697
140	NC_017065	CTTG	2	8	50566	50573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017065	ATCT	2	8	51142	51149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017065	TGCT	2	8	51306	51313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017065	TTTA	2	8	51727	51734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017065	TCAC	2	8	51836	51843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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