MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 19761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
2	NC_017065	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750642
3	NC_017065	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
4	NC_017065	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
5	NC_017065	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750642
6	NC_017065	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750642
7	NC_017065	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750642
8	NC_017065	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750642
9	NC_017065	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750642
10	NC_017065	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750642
11	NC_017065	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750642
12	NC_017065	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017065	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017065	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017065	GTT	2	6	1018	1023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017065	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750643
17	NC_017065	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750643
18	NC_017065	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750643
19	NC_017065	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750643
20	NC_017065	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750643
21	NC_017065	TCT	2	6	1505	1510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750644
22	NC_017065	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750644
23	NC_017065	GTA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750644
24	NC_017065	TGA	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750644
25	NC_017065	GAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750644
26	NC_017065	AAT	2	6	2022	2027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750644
27	NC_017065	AAG	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750644
28	NC_017065	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750644
29	NC_017065	CAA	3	9	2140	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750644
30	NC_017065	AGC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750645
31	NC_017065	ATA	2	6	2437	2442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750645
32	NC_017065	ATA	2	6	2575	2580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750645
33	NC_017065	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750645
34	NC_017065	ATG	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750645
35	NC_017065	TAT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750645
36	NC_017065	TTA	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750645
37	NC_017065	CTC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750646
38	NC_017065	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
39	NC_017065	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
40	NC_017065	ATT	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
41	NC_017065	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
42	NC_017065	AGA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
43	NC_017065	AGC	2	6	3407	3412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
44	NC_017065	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750646
45	NC_017065	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
46	NC_017065	GAG	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750646
47	NC_017065	TAT	2	6	3848	3853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
48	NC_017065	GCA	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
49	NC_017065	AGA	2	6	3974	3979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
50	NC_017065	CTA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750646
51	NC_017065	TAT	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
52	NC_017065	TTA	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
53	NC_017065	TGT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750646
54	NC_017065	ATA	2	6	4345	4350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
55	NC_017065	GGC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383750646
56	NC_017065	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
57	NC_017065	GGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750646
58	NC_017065	GAA	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
59	NC_017065	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
60	NC_017065	AAT	2	6	4761	4766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
61	NC_017065	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
62	NC_017065	TAA	2	6	4787	4792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
63	NC_017065	CTA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750646
64	NC_017065	GAG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750646
65	NC_017065	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
66	NC_017065	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750646
67	NC_017065	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
68	NC_017065	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
69	NC_017065	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
70	NC_017065	GAT	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750646
71	NC_017065	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750646
72	NC_017065	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
73	NC_017065	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750646
74	NC_017065	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750646
75	NC_017065	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750646
76	NC_017065	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750646
77	NC_017065	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750646
78	NC_017065	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750646
79	NC_017065	ATA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
80	NC_017065	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
81	NC_017065	ATA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
82	NC_017065	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750646
83	NC_017065	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750646
84	NC_017065	ATG	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750646
85	NC_017065	GTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017065	CTT	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750647
87	NC_017065	TCA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750647
88	NC_017065	ATA	2	6	6131	6136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750647
89	NC_017065	TAA	2	6	6175	6180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750647
90	NC_017065	GAT	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750647
91	NC_017065	AAC	3	9	6265	6273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750647
92	NC_017065	CAA	2	6	6316	6321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750647
93	NC_017065	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750648
94	NC_017065	TTC	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750648
95	NC_017065	TAA	2	6	6421	6426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750648
96	NC_017065	CTT	2	6	6441	6446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750648
97	NC_017065	GTT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750648
98	NC_017065	TCC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017065	CTA	3	9	6689	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750649
100	NC_017065	ATT	2	6	6736	6741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750649
101	NC_017065	TTC	2	6	6802	6807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750649
102	NC_017065	ATC	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750649
103	NC_017065	CCG	2	6	7001	7006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750649
104	NC_017065	ATT	2	6	7007	7012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750649
105	NC_017065	TAC	2	6	7063	7068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750649
106	NC_017065	ATT	2	6	7069	7074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750649
107	NC_017065	ATT	3	9	7120	7128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750649
108	NC_017065	TCA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750649
109	NC_017065	CCT	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750649
110	NC_017065	TAT	2	6	7194	7199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750649
111	NC_017065	TAC	2	6	7318	7323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750649
112	NC_017065	GTA	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750649
113	NC_017065	CTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750650
114	NC_017065	TAG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750650
115	NC_017065	AGC	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750650
116	NC_017065	CTA	2	6	7840	7845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750650
117	NC_017065	TCT	2	6	7915	7920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017065	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017065	GCT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017065	GAC	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017065	CAA	3	9	8061	8069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017065	ATA	3	9	8132	8140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750651
123	NC_017065	ATA	2	6	8159	8164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750651
124	NC_017065	GCC	2	6	8179	8184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750651
125	NC_017065	ATA	2	6	8342	8347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750651
126	NC_017065	TAG	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750651
127	NC_017065	ATT	2	6	8470	8475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750651
128	NC_017065	ACG	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750651
129	NC_017065	TCG	2	6	8582	8587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750651
130	NC_017065	TGT	2	6	8615	8620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750651
131	NC_017065	CTC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750651
132	NC_017065	TAT	2	6	8685	8690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750651
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