MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	TA	3	6	9162	9167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017065	AT	3	6	9445	9450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017065	GT	3	6	9993	9998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017065	TA	3	6	10094	10099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017065	AC	3	6	12617	12622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017065	TA	3	6	12654	12659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017065	TA	3	6	12915	12920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017065	TG	3	6	18261	18266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017065	CA	3	6	18407	18412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017065	TA	3	6	19904	19909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017065	AT	3	6	20148	20153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017065	TA	4	8	20358	20365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017065	TA	3	6	20430	20435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017065	TA	3	6	26369	26374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017065	TA	3	6	26618	26623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017065	AT	3	6	27136	27141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017065	AG	3	6	27550	27555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017065	AT	3	6	28510	28515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017065	AT	4	8	29082	29089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017065	AT	3	6	35371	35376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017065	TA	3	6	35378	35383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017065	AT	3	6	38162	38167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017065	AT	3	6	38172	38177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017065	AT	3	6	38281	38286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017065	AG	3	6	38736	38741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017065	AT	3	6	39379	39384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017065	GA	3	6	39512	39517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017065	AT	3	6	40853	40858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017065	AT	3	6	41336	41341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017065	AT	3	6	41482	41487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017065	TA	4	8	41584	41591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017065	TA	3	6	42031	42036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017065	AT	3	6	42098	42103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017065	GT	3	6	42966	42971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017065	TA	3	6	44490	44495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017065	AT	3	6	44496	44501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017065	TG	3	6	45479	45484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017065	AT	3	6	49078	49083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017065	AT	3	6	50161	50166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017065	TA	3	6	50179	50184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017065	CA	3	6	51438	51443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017065	AT	3	6	51543	51548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017065	AT	3	6	53001	53006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017065	AT	3	6	58882	58887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017065	CT	4	8	59521	59528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017065	TA	3	6	59805	59810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017065	CT	3	6	62977	62982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017065	AG	3	6	65824	65829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017065	AT	3	6	73040	73045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017065	AT	3	6	74341	74346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017065	TC	3	6	74941	74946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017065	GT	3	6	75734	75739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017065	TA	4	8	84633	84640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017065	AT	5	10	84757	84766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017065	AT	4	8	87672	87679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017065	TA	3	6	88522	88527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017065	TA	3	6	89861	89866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017065	AT	3	6	96653	96658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017065	AT	3	6	96671	96676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017065	AT	3	6	96692	96697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017065	AT	3	6	96740	96745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017065	AT	3	6	98485	98490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017065	TA	3	6	104576	104581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017065	TC	3	6	107956	107961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017065	AT	4	8	108165	108172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017065	TA	3	6	108545	108550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017065	TA	3	6	114068	114073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017065	AT	3	6	114149	114154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017065	TA	3	6	115660	115665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017065	AT	3	6	115814	115819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017065	TC	3	6	118232	118237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017065	TA	3	6	122899	122904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017065	AT	3	6	125909	125914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017065	TA	3	6	131883	131888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017065	AT	3	6	131974	131979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017065	TA	3	6	132095	132100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017065	TA	3	6	132204	132209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017065	TA	3	6	152649	152654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017065	AT	3	6	152866	152871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017065	TA	3	6	153141	153146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017065	AT	3	6	154017	154022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017065	TA	3	6	155020	155025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017065	AT	3	6	155454	155459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017065	AT	3	6	155470	155475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017065	AT	3	6	157106	157111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017065	TA	3	6	157541	157546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017065	AT	3	6	157574	157579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017065	AC	3	6	160034	160039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017065	TA	3	6	163941	163946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017065	AT	3	6	164263	164268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017065	AT	3	6	164285	164290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017065	AT	4	8	164524	164531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017065	TA	3	6	166604	166609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017065	AT	4	8	166615	166622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017065	TA	4	8	174118	174125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017065	TA	4	8	174914	174921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017065	AG	3	6	175346	175351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017065	AG	3	6	178236	178241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017065	TG	3	6	179277	179282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017065	AT	3	6	180679	180684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017065	TC	3	6	181384	181389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017065	TA	3	6	182516	182521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017065	TA	3	6	187088	187093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017065	AT	5	10	195514	195523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017065	TA	3	6	196057	196062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017065	CA	3	6	200486	200491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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108	NC_017065	AT	3	6	208519	208524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017065	AT	3	6	211442	211447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017065	AT	3	6	211525	211530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017065	TA	3	6	211913	211918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017065	TA	3	6	211927	211932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017065	TA	3	6	212716	212721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017065	TA	3	6	212782	212787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017065	TA	3	6	212974	212979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017065	AT	3	6	212999	213004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017065	TC	4	8	213162	213169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017065	AT	4	8	219682	219689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017065	TA	3	6	219898	219903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017065	TA	3	6	220062	220067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017065	TG	3	6	222959	222964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017065	TA	3	6	226278	226283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017065	TA	3	6	226323	226328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017065	TA	3	6	226511	226516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017065	TA	3	6	226614	226619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017065	AT	3	6	228006	228011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017065	TA	3	6	228129	228134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017065	GA	3	6	230518	230523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017065	CT	3	6	230958	230963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017065	AT	3	6	233544	233549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017065	AT	3	6	234478	234483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017065	AT	3	6	234495	234500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017065	AT	3	6	251018	251023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017065	TA	3	6	251512	251517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017065	AG	3	6	252076	252081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017065	TA	3	6	255116	255121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017065	TA	3	6	255206	255211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017065	AT	3	6	256269	256274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017065	TA	4	8	256288	256295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017065	AG	3	6	258755	258760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017065	CT	3	6	258834	258839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017065	TA	3	6	259770	259775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017065	AG	4	8	259946	259953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017065	AT	3	6	260013	260018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017065	AT	3	6	260341	260346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017065	TA	3	6	263241	263246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017065	AT	3	6	264085	264090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017065	AT	3	6	264393	264398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017065	AG	3	6	266142	266147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017065	TA	4	8	271061	271068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017065	TA	4	8	271075	271082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017065	AT	3	6	273402	273407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017065	AT	3	6	277670	277675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017065	AT	3	6	278011	278016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017065	GA	3	6	278137	278142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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