MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori ELS37 chromosome

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017063	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017063	GTTAGT	2	12	4764	4775	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017063	ATTATA	2	12	9839	9850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017063	AAACAC	2	12	18399	18410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017063	TTTCTT	2	12	23022	23033	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017063	ACTTAG	2	12	45135	45146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017063	GATGTG	2	12	62562	62573	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017063	AGCCAA	2	12	62640	62651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017063	CCAACA	2	12	64514	64525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017063	TACAAA	2	12	95190	95201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017063	ATAAAA	2	12	109028	109039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017063	GTTTTA	2	12	134514	134525	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017063	ATCCCC	2	12	138028	138039	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017063	TATTTT	2	12	166318	166329	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017063	TAAAAA	2	12	170524	170535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017063	TAAAGA	2	12	182175	182186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017063	AAGCCA	2	12	240261	240272	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017063	TTAATT	2	12	270112	270123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017063	GGCTTT	2	12	291066	291077	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017063	AAAGAA	2	12	294583	294594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017063	TTAAAG	2	12	314689	314700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017063	TTGTTT	2	12	314962	314973	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017063	CAAACC	2	12	317798	317809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017063	ACCCAT	2	12	335466	335477	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017063	TTTTAA	2	12	335529	335540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017063	ATTTTA	2	12	353862	353873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017063	TTCAAT	2	12	383700	383711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017063	GAAAAT	2	12	386098	386109	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017063	ATTATA	2	12	391197	391208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017063	TTTATT	2	12	420702	420713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017063	AGAAAT	2	12	542366	542377	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017063	TTAATT	2	12	589127	589138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017063	TCCTAA	2	12	629646	629657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017063	CTAAAA	2	12	629950	629961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017063	TAGGGG	2	12	636466	636477	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017063	TTTGAT	2	12	738382	738393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017063	GTAATG	2	12	768064	768075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017063	TTCTTG	2	12	776248	776259	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017063	ATGCCC	2	12	776281	776292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017063	TTTAAA	2	12	778935	778946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017063	TTGTAA	2	12	814190	814201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017063	TTTTTA	2	12	820248	820259	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017063	TTTAAA	2	12	820369	820380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017063	TCACCT	2	12	832148	832159	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017063	TCAAAA	2	12	841733	841744	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017063	AGTGGG	2	12	847160	847171	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017063	AAACCA	2	12	878270	878281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017063	TAAATC	2	12	880872	880883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017063	GTTTTT	2	12	881708	881719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017063	CTTTTT	2	12	882017	882028	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017063	ATTTTT	2	12	900584	900595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017063	AAAGAT	2	12	906497	906508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017063	TATTTT	2	12	944051	944062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017063	ATCGCT	2	12	995926	995937	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017063	ATAAAA	2	12	1002786	1002797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017063	AAAGAA	2	12	1015333	1015344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017063	AGCCAA	2	12	1016233	1016244	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017063	AAAAAC	2	12	1017578	1017589	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017063	AACACA	2	12	1035450	1035461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017063	CAAAAA	2	12	1050350	1050361	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017063	GCTATC	2	12	1057856	1057867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017063	ATATGT	2	12	1124564	1124575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017063	TAAAAT	2	12	1127776	1127787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017063	TTTTAA	2	12	1150910	1150921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017063	GGTTTT	2	12	1152415	1152426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017063	GTTTTT	2	12	1164369	1164380	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017063	ATTATA	2	12	1164778	1164789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017063	TATCTC	2	12	1194508	1194519	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017063	TTCATT	2	12	1198643	1198654	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017063	GCATTA	2	12	1203328	1203339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017063	AAACAT	2	12	1203950	1203961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017063	AAAACT	2	12	1204294	1204305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017063	AACGCT	2	12	1208041	1208052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017063	TAAAAT	2	12	1231028	1231039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017063	ATCCTT	2	12	1255400	1255411	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017063	GCGCAT	2	12	1255419	1255430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017063	TTGTAT	2	12	1257821	1257832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017063	ACTTAA	2	12	1276027	1276038	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017063	TGTTAT	2	12	1307911	1307922	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017063	TTTGAT	2	12	1313575	1313586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017063	TGCATT	2	12	1316479	1316490	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017063	TTAAAA	2	12	1327107	1327118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017063	ATTTTT	2	12	1330115	1330126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017063	ATAAAA	2	12	1358975	1358986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017063	TGGCTT	2	12	1409899	1409910	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017063	TCCCGC	2	12	1425972	1425983	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017063	GGGATT	2	12	1426097	1426108	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017063	AGTTTT	2	12	1447687	1447698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017063	CTTTAA	2	12	1450194	1450205	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017063	AGCGGG	2	12	1458740	1458751	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017063	GTTTTA	2	12	1470798	1470809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017063	TAAAAA	2	12	1471623	1471634	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017063	CTAAGT	7	42	1482852	1482893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017063	AAACAT	2	12	1484830	1484841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017063	AAAACT	2	12	1485174	1485185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017063	TGTTTA	2	12	1491276	1491287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017063	AGAAAC	2	12	1494152	1494163	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017063	TCTTTT	2	12	1565003	1565014	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017063	CCTCTT	2	12	1566345	1566356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017063	GTCTTT	2	12	1567467	1567478	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017063	TCTTTA	2	12	1568173	1568184	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017063	ATTTTC	2	12	1568490	1568501	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017063	ATGAAA	2	12	1589588	1589599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017063	TATCAA	2	12	1605646	1605657	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017063	AACTTT	2	12	1656004	1656015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.