MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori ELS37 chromosome

Total Repeats: 699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017063	GCTTGC	2	12	6320	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383749069
2	NC_017063	GTAGGT	2	12	6772	6783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383749069
3	NC_017063	TGCCAT	2	12	6999	7010	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383749069
4	NC_017063	GAAACC	2	12	7820	7831	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383749070
5	NC_017063	GATTTG	2	12	13027	13038	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383749074
6	NC_017063	AGCTTG	2	12	16065	16076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383749077
7	NC_017063	AGAAAA	2	12	18749	18760	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383749079
8	NC_017063	GAATGA	2	12	22128	22139	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383749082
9	NC_017063	TATCAA	2	12	30316	30327	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383749089
10	NC_017063	TCTTAT	2	12	31030	31041	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383749089
11	NC_017063	GCGTGG	2	12	33067	33078	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383749092
12	NC_017063	TTGGAT	2	12	33177	33188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383749092
13	NC_017063	TAATGA	2	12	33212	33223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383749092
14	NC_017063	TTGAAT	2	12	34263	34274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383749092
15	NC_017063	TAAGGA	2	12	34562	34573	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383749092
16	NC_017063	TAGGGG	2	12	36065	36076	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383749095
17	NC_017063	GTAAAA	2	12	36319	36330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383749095
18	NC_017063	TTCTAC	2	12	37549	37560	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383749096
19	NC_017063	AAAGAA	2	12	37577	37588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383749096
20	NC_017063	AAAGAA	2	12	39153	39164	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383749099
21	NC_017063	CAAAAT	2	12	41494	41505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383749101
22	NC_017063	CGCAAA	2	12	45990	46001	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383749107
23	NC_017063	GGCTAG	2	12	50234	50245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749111
24	NC_017063	CTTTTT	2	12	52335	52346	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383749112
25	NC_017063	ATTTGC	2	12	54459	54470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383749112
26	NC_017063	TAAAAA	2	12	56059	56070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383749113
27	NC_017063	CCACGC	2	12	57814	57825	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383749114
28	NC_017063	CCACCC	2	12	60451	60462	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	383749116
29	NC_017063	AATTTT	2	12	61121	61132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383749118
30	NC_017063	AGAAAA	2	12	61882	61893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383749119
31	NC_017063	TTTTGT	2	12	64852	64863	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383749120
32	NC_017063	AAAGAG	2	12	65131	65142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383749120
33	NC_017063	ACAGAA	2	12	66926	66937	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383749122
34	NC_017063	GAAAAA	2	12	68245	68256	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383749125
35	NC_017063	AGCGGG	2	12	68725	68736	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	383749125
36	NC_017063	ACGCCC	2	12	76506	76517	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383749133
37	NC_017063	AAGGGC	2	12	79233	79244	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383749136
38	NC_017063	AGGATA	2	12	80614	80625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383749138
39	NC_017063	CAACGA	2	12	81490	81501	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383749138
40	NC_017063	GGCATG	2	12	83012	83023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749139
41	NC_017063	AATATT	2	12	84822	84833	50 %	50 %	0 %	0 %	383749142
42	NC_017063	TTCTTT	2	12	89861	89872	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383749147
43	NC_017063	AAAAAT	2	12	95395	95406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383749151
44	NC_017063	GATTTT	2	12	98661	98672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383749154
45	NC_017063	AAACTC	2	12	98778	98789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383749154
46	NC_017063	TCAAAA	2	12	100093	100104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383749155
47	NC_017063	TATCGT	2	12	100674	100685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383749156
48	NC_017063	GCGGTG	2	12	100793	100804	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383749156
49	NC_017063	AAATCA	2	12	102429	102440	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383749157
50	NC_017063	CAATAT	2	12	103999	104010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383749157
51	NC_017063	TAAAAT	2	12	108925	108936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749161
52	NC_017063	AAGCAA	2	12	112354	112365	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383749164
53	NC_017063	TGGAGC	2	12	114928	114939	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749166
54	NC_017063	TTTTCT	2	12	116429	116440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383749167
55	NC_017063	GCAAGC	2	12	116836	116847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383749167
56	NC_017063	TAGGCA	2	12	123954	123965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383749173
57	NC_017063	CTTCTA	2	12	126287	126298	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383749175
58	NC_017063	GTTCTA	2	12	126665	126676	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383749175
59	NC_017063	CTTCTA	2	12	127781	127792	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383749176
60	NC_017063	GTTCTA	2	12	128153	128164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383749176
61	NC_017063	TTTCAA	2	12	130157	130168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383749177
62	NC_017063	AGCAAA	2	12	133502	133513	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383749180
63	NC_017063	CAAATC	2	12	143861	143872	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383749191
64	NC_017063	TAGCGA	2	12	144914	144925	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383749192
65	NC_017063	ACGATT	2	12	147438	147449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383749194
66	NC_017063	ATCGCT	2	12	149734	149745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383749195
67	NC_017063	TTCTAT	2	12	153117	153128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383749198
68	NC_017063	TTGTTT	2	12	156105	156116	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383749203
69	NC_017063	CTTGGG	2	12	156776	156787	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383749205
70	NC_017063	TTGGGT	2	12	161552	161563	0 %	50 %	50 %	0 %	383749210
71	NC_017063	GATTTT	2	12	162065	162076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383749211
72	NC_017063	AATTGA	2	12	162324	162335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383749211
73	NC_017063	ACCCTT	2	12	163207	163218	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383749213
74	NC_017063	GATGGC	2	12	165277	165288	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749215
75	NC_017063	CTTTCT	2	12	165529	165540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383749215
76	NC_017063	CCGCTC	2	12	167440	167451	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383749217
77	NC_017063	AACCCA	2	12	168591	168602	50 %	0 %	0 %	50 %	383749218
78	NC_017063	TAGTGG	2	12	171621	171632	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383749222
79	NC_017063	ATCGTT	2	12	174267	174278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383749224
80	NC_017063	AATTTC	2	12	174618	174629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383749225
81	NC_017063	TAAAAT	2	12	176142	176153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383749226
82	NC_017063	TTCTTT	2	12	176552	176563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383749226
83	NC_017063	ATTTTG	2	12	177951	177962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383749229
84	NC_017063	CGCTTT	2	12	178429	178440	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383749229
85	NC_017063	ACTTAT	2	12	178526	178537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383749229
86	NC_017063	GTTTAA	2	12	179210	179221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383749230
87	NC_017063	TCTTGT	2	12	182791	182802	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383749233
88	NC_017063	TGAAAA	2	12	186406	186417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383749236
89	NC_017063	GCAGTA	2	12	187804	187815	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383749237
90	NC_017063	AGACAT	2	12	188324	188335	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383749237
91	NC_017063	AAAAAT	2	12	190941	190952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383749240
92	NC_017063	TTCTCA	2	12	191396	191407	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383749240
93	NC_017063	AAAATA	2	12	191914	191925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383749241
94	NC_017063	AGCGTG	2	12	198042	198053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749248
95	NC_017063	CTAAAA	2	12	203614	203625	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383749255
96	NC_017063	AATTTG	2	12	203862	203873	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383749255
97	NC_017063	CTCAAG	2	12	204860	204871	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383749257
98	NC_017063	GCAATC	2	12	206360	206371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383749259
99	NC_017063	ACAACC	2	12	207500	207511	50 %	0 %	0 %	50 %	383749261
100	NC_017063	GAAAAA	2	12	208123	208134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383749262
101	NC_017063	ATGCGA	2	12	211729	211740	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383749264
102	NC_017063	GTTTAT	2	12	212400	212411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383749265
103	NC_017063	GATATT	2	12	215611	215622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383749268
104	NC_017063	AACGCT	2	12	216646	216657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383749269
105	NC_017063	GCAGAG	2	12	224956	224967	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383749277
106	NC_017063	GCTTTT	2	12	227119	227130	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383749280
107	NC_017063	TCGCTT	2	12	228556	228567	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383749281
108	NC_017063	GCCCAC	2	12	230462	230473	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383749282
109	NC_017063	ACCGCT	2	12	231303	231314	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383749283
110	NC_017063	TTTTCT	2	12	232115	232126	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383749284
111	NC_017063	TTCAAA	2	12	232552	232563	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383749284
112	NC_017063	AGGGTG	2	12	232839	232850	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383749285
113	NC_017063	GCACTT	2	12	234587	234598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383749286
114	NC_017063	ATCGCT	2	12	234838	234849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383749286
115	NC_017063	CGATGG	2	12	236973	236984	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749288
116	NC_017063	ATGGCG	2	12	237122	237133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749288
117	NC_017063	ATTTCA	2	12	241870	241881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383749292
118	NC_017063	TTTCTA	2	12	246276	246287	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383749296
119	NC_017063	GCATGC	2	12	249201	249212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383749298
120	NC_017063	GAAGTG	2	12	257594	257605	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383749306
121	NC_017063	GGCTAT	2	12	260383	260394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383749308
122	NC_017063	CGCTCA	2	12	261186	261197	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383749309
123	NC_017063	GCATGG	2	12	268949	268960	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383749317
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227	NC_017063	CTCCCA	2	12	558955	558966	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	383749585
228	NC_017063	ATCTTC	2	12	561293	561304	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383749587
229	NC_017063	CAAATT	2	12	563644	563655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383749588
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231	NC_017063	TGGAAG	2	12	577293	577304	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383749603
232	NC_017063	AATGTG	2	12	580694	580705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383749606
233	NC_017063	ATCAAA	2	12	580830	580841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383749606
234	NC_017063	CAAGCT	2	12	582152	582163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383749607
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453	NC_017063	TAGAGC	2	12	1080694	1080705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383750062
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455	NC_017063	TTAAAA	2	12	1084065	1084076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750063
456	NC_017063	TAATGG	2	12	1084330	1084341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750063
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459	NC_017063	AGCATC	2	12	1088996	1089007	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383750068
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462	NC_017063	GTATTT	2	12	1097899	1097910	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383750075
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