MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori ELS37 chromosome

Total Repeats: 1384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017063	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	383749066
2	NC_017063	GATTA	2	10	2249	2258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017063	TTTTA	2	10	4924	4933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017063	CTTAA	2	10	5025	5034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017063	CACTT	2	10	8185	8194	20 %	40 %	0 %	40 %	383749070
6	NC_017063	TTTGA	2	10	8296	8305	20 %	60 %	20 %	0 %	383749070
7	NC_017063	TTTCT	2	10	8484	8493	0 %	80 %	0 %	20 %	383749070
8	NC_017063	TGCCA	2	10	11957	11966	20 %	20 %	20 %	40 %	383749073
9	NC_017063	TTTTG	2	10	12013	12022	0 %	80 %	20 %	0 %	383749073
10	NC_017063	TGGTG	2	10	12849	12858	0 %	40 %	60 %	0 %	383749074
11	NC_017063	GCTTT	2	10	13677	13686	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017063	TGAAA	2	10	21058	21067	60 %	20 %	20 %	0 %	383749081
13	NC_017063	CCATG	2	10	23515	23524	20 %	20 %	20 %	40 %	383749084
14	NC_017063	CTCTT	2	10	23545	23554	0 %	60 %	0 %	40 %	383749084
15	NC_017063	TTGAT	2	10	25025	25034	20 %	60 %	20 %	0 %	383749084
16	NC_017063	CTTTT	2	10	25480	25489	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017063	TAATA	2	10	25564	25573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017063	AGCCT	2	10	26158	26167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017063	CAAGC	2	10	28339	28348	40 %	0 %	20 %	40 %	383749086
20	NC_017063	GCTGG	2	10	28712	28721	0 %	20 %	60 %	20 %	383749086
21	NC_017063	TGGGT	2	10	28776	28785	0 %	40 %	60 %	0 %	383749086
22	NC_017063	TTTTA	2	10	29264	29273	20 %	80 %	0 %	0 %	383749087
23	NC_017063	TCAAA	2	10	31114	31123	60 %	20 %	0 %	20 %	383749089
24	NC_017063	TTTTC	2	10	31284	31293	0 %	80 %	0 %	20 %	383749089
25	NC_017063	GCTCC	2	10	31575	31584	0 %	20 %	20 %	60 %	383749089
26	NC_017063	TCATA	2	10	31756	31765	40 %	40 %	0 %	20 %	383749089
27	NC_017063	GTGGG	2	10	34225	34234	0 %	20 %	80 %	0 %	383749092
28	NC_017063	TGGGG	2	10	35476	35485	0 %	20 %	80 %	0 %	383749094
29	NC_017063	ATCAA	2	10	36344	36353	60 %	20 %	0 %	20 %	383749095
30	NC_017063	TGAGT	2	10	40849	40858	20 %	40 %	40 %	0 %	383749101
31	NC_017063	AGAAA	2	10	42560	42569	80 %	0 %	20 %	0 %	383749102
32	NC_017063	TTACT	2	10	43412	43421	20 %	60 %	0 %	20 %	383749103
33	NC_017063	TCGCT	2	10	44386	44395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017063	ATTGT	2	10	44556	44565	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017063	TCTTT	2	10	44920	44929	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017063	TAAAA	2	10	45925	45934	80 %	20 %	0 %	0 %	383749107
37	NC_017063	TCCCA	2	10	46937	46946	20 %	20 %	0 %	60 %	383749108
38	NC_017063	GCTCC	2	10	47258	47267	0 %	20 %	20 %	60 %	383749108
39	NC_017063	TGCGC	2	10	47372	47381	0 %	20 %	40 %	40 %	383749108
40	NC_017063	AAAAT	2	10	47437	47446	80 %	20 %	0 %	0 %	383749108
41	NC_017063	TCGCA	2	10	47795	47804	20 %	20 %	20 %	40 %	383749108
42	NC_017063	AGGCT	2	10	49676	49685	20 %	20 %	40 %	20 %	383749110
43	NC_017063	GATTG	2	10	50536	50545	20 %	40 %	40 %	0 %	383749111
44	NC_017063	GCTTT	2	10	50592	50601	0 %	60 %	20 %	20 %	383749111
45	NC_017063	AATGT	2	10	51055	51064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017063	AAATA	2	10	51830	51839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017063	ATATT	2	10	51996	52005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017063	CCAAA	2	10	52163	52172	60 %	0 %	0 %	40 %	383749112
49	NC_017063	TAAAA	2	10	54214	54223	80 %	20 %	0 %	0 %	383749112
50	NC_017063	ATCAA	2	10	54245	54254	60 %	20 %	0 %	20 %	383749112
51	NC_017063	TGAAA	2	10	54978	54987	60 %	20 %	20 %	0 %	383749113
52	NC_017063	CAGCA	2	10	56179	56188	40 %	0 %	20 %	40 %	383749114
53	NC_017063	TCAAA	2	10	58987	58996	60 %	20 %	0 %	20 %	383749114
54	NC_017063	TTAAA	2	10	60005	60014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017063	ACAAA	2	10	60034	60043	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017063	TATCC	2	10	63263	63272	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017063	GGTGG	2	10	68646	68655	0 %	20 %	80 %	0 %	383749125
58	NC_017063	TCAAT	2	10	71832	71841	40 %	40 %	0 %	20 %	383749128
59	NC_017063	TTTCT	2	10	72370	72379	0 %	80 %	0 %	20 %	383749129
60	NC_017063	CTTCT	2	10	72687	72696	0 %	60 %	0 %	40 %	383749129
61	NC_017063	TGCCT	2	10	72764	72773	0 %	40 %	20 %	40 %	383749129
62	NC_017063	TCCAA	2	10	73176	73185	40 %	20 %	0 %	40 %	383749130
63	NC_017063	TTTTA	2	10	76431	76440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017063	TTTTG	2	10	76462	76471	0 %	80 %	20 %	0 %	383749133
65	NC_017063	ACGCC	2	10	76768	76777	20 %	0 %	20 %	60 %	383749133
66	NC_017063	AAAGC	2	10	77534	77543	60 %	0 %	20 %	20 %	383749134
67	NC_017063	TTACA	2	10	78316	78325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017063	TTTGT	2	10	82250	82259	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017063	ATCTT	2	10	85978	85987	20 %	60 %	0 %	20 %	383749142
70	NC_017063	TGGCT	2	10	86519	86528	0 %	40 %	40 %	20 %	383749142
71	NC_017063	ATGCC	2	10	86936	86945	20 %	20 %	20 %	40 %	383749143
72	NC_017063	TTGAT	2	10	88022	88031	20 %	60 %	20 %	0 %	383749145
73	NC_017063	GGCGT	2	10	89835	89844	0 %	20 %	60 %	20 %	383749147
74	NC_017063	ATAAG	2	10	93011	93020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017063	GTTTT	2	10	93087	93096	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017063	TTAAA	2	10	93166	93175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017063	TGATT	2	10	96245	96254	20 %	60 %	20 %	0 %	383749152
78	NC_017063	GGCTT	2	10	97566	97575	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017063	ACGAT	2	10	102540	102549	40 %	20 %	20 %	20 %	383749157
80	NC_017063	AATTG	2	10	104382	104391	40 %	40 %	20 %	0 %	383749158
81	NC_017063	TCGTT	2	10	106281	106290	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017063	TCTTT	2	10	109639	109648	0 %	80 %	0 %	20 %	383749162
83	NC_017063	TAGGC	2	10	111229	111238	20 %	20 %	40 %	20 %	383749163
84	NC_017063	TGAAA	2	10	111416	111425	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017063	AAAGC	2	10	112407	112416	60 %	0 %	20 %	20 %	383749164
86	NC_017063	GAATG	2	10	113641	113650	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017063	TGTCT	2	10	114556	114565	0 %	60 %	20 %	20 %	383749166
88	NC_017063	CAAAT	2	10	114949	114958	60 %	20 %	0 %	20 %	383749166
89	NC_017063	ACCCT	2	10	116378	116387	20 %	20 %	0 %	60 %	383749167
90	NC_017063	AATTA	2	10	117868	117877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017063	ATTTA	2	10	117896	117905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017063	TGATT	2	10	118502	118511	20 %	60 %	20 %	0 %	383749169
93	NC_017063	AGCAG	2	10	118702	118711	40 %	0 %	40 %	20 %	383749170
94	NC_017063	CTAAA	2	10	118971	118980	60 %	20 %	0 %	20 %	383749171
95	NC_017063	GAATT	2	10	119120	119129	40 %	40 %	20 %	0 %	383749171
96	NC_017063	GGATC	2	10	122983	122992	20 %	20 %	40 %	20 %	383749173
97	NC_017063	AGCTC	2	10	123003	123012	20 %	20 %	20 %	40 %	383749173
98	NC_017063	AAGCC	2	10	124891	124900	40 %	0 %	20 %	40 %	383749174
99	NC_017063	CAATC	2	10	127147	127156	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017063	TTGAT	2	10	128245	128254	20 %	60 %	20 %	0 %	383749176
101	NC_017063	TGATC	2	10	128421	128430	20 %	40 %	20 %	20 %	383749176
102	NC_017063	CGCTG	2	10	129336	129345	0 %	20 %	40 %	40 %	383749177
103	NC_017063	GACTT	2	10	130017	130026	20 %	40 %	20 %	20 %	383749177
104	NC_017063	TGCGT	2	10	133313	133322	0 %	40 %	40 %	20 %	383749180
105	NC_017063	GAAAA	2	10	133474	133483	80 %	0 %	20 %	0 %	383749180
106	NC_017063	CGTTT	2	10	133741	133750	0 %	60 %	20 %	20 %	383749180
107	NC_017063	GAAAA	2	10	133792	133801	80 %	0 %	20 %	0 %	383749180
108	NC_017063	ATTTT	2	10	136751	136760	20 %	80 %	0 %	0 %	383749185
109	NC_017063	ATGTT	2	10	136833	136842	20 %	60 %	20 %	0 %	383749185
110	NC_017063	AAAAG	2	10	137245	137254	80 %	0 %	20 %	0 %	383749185
111	NC_017063	AAATC	2	10	139245	139254	60 %	20 %	0 %	20 %	383749186
112	NC_017063	AATGC	2	10	139273	139282	40 %	20 %	20 %	20 %	383749186
113	NC_017063	AAAAT	2	10	140717	140726	80 %	20 %	0 %	0 %	383749187
114	NC_017063	TTTTC	2	10	143278	143287	0 %	80 %	0 %	20 %	383749190
115	NC_017063	TCTTT	2	10	145729	145738	0 %	80 %	0 %	20 %	383749193
116	NC_017063	ACTTG	2	10	145942	145951	20 %	40 %	20 %	20 %	383749193
117	NC_017063	GTTTT	2	10	146891	146900	0 %	80 %	20 %	0 %	383749194
118	NC_017063	CGTGG	2	10	147410	147419	0 %	20 %	60 %	20 %	383749194
119	NC_017063	GCGAT	2	10	147685	147694	20 %	20 %	40 %	20 %	383749194
120	NC_017063	GCTTG	2	10	147941	147950	0 %	40 %	40 %	20 %	383749194
121	NC_017063	TTTTG	2	10	148600	148609	0 %	80 %	20 %	0 %	383749195
122	NC_017063	CCAAA	2	10	150440	150449	60 %	0 %	0 %	40 %	383749196
123	NC_017063	ACCAC	2	10	151648	151657	40 %	0 %	0 %	60 %	383749197
124	NC_017063	ACGCC	2	10	153962	153971	20 %	0 %	20 %	60 %	383749198
125	NC_017063	TTATT	2	10	155858	155867	20 %	80 %	0 %	0 %	383749202
126	NC_017063	GCGTT	2	10	156225	156234	0 %	40 %	40 %	20 %	383749204
127	NC_017063	ATTTG	2	10	157201	157210	20 %	60 %	20 %	0 %	383749205
128	NC_017063	CAAAT	2	10	159099	159108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017063	AGATT	2	10	161721	161730	40 %	40 %	20 %	0 %	383749210
130	NC_017063	TAAAA	2	10	164062	164071	80 %	20 %	0 %	0 %	383749214
131	NC_017063	ATTTT	2	10	165097	165106	20 %	80 %	0 %	0 %	383749215
132	NC_017063	GGGTG	2	10	165453	165462	0 %	20 %	80 %	0 %	383749215
133	NC_017063	TGAAT	2	10	166389	166398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017063	ATTCA	2	10	166748	166757	40 %	40 %	0 %	20 %	383749216
135	NC_017063	AAAAC	2	10	169084	169093	80 %	0 %	0 %	20 %	383749218
136	NC_017063	ATCTT	2	10	170149	170158	20 %	60 %	0 %	20 %	383749219
137	NC_017063	ATATT	2	10	177476	177485	40 %	60 %	0 %	0 %	383749228
138	NC_017063	GAATG	2	10	177619	177628	40 %	20 %	40 %	0 %	383749228
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267	NC_017063	AGATG	2	10	313315	313324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017063	TTGAA	2	10	313547	313556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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