MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 3519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017062	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383842825
2	NC_017062	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017062	CAAA	2	8	963	970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017062	ATTT	2	8	1303	1310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017062	ACAG	2	8	1632	1639	50 %	0 %	25 %	25 %	383842827
6	NC_017062	AGTA	2	8	2294	2301	50 %	25 %	25 %	0 %	383842828
7	NC_017062	TTAT	2	8	2605	2612	25 %	75 %	0 %	0 %	383842828
8	NC_017062	TAAT	2	8	2719	2726	50 %	50 %	0 %	0 %	383842828
9	NC_017062	TTAT	2	8	2827	2834	25 %	75 %	0 %	0 %	383842828
10	NC_017062	TATT	2	8	3547	3554	25 %	75 %	0 %	0 %	383842829
11	NC_017062	AGAA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	383842829
12	NC_017062	AATA	2	8	5209	5216	75 %	25 %	0 %	0 %	383842829
13	NC_017062	TCAC	2	8	5248	5255	25 %	25 %	0 %	50 %	383842829
14	NC_017062	TTTA	2	8	5979	5986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017062	TAAA	2	8	5998	6005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017062	ACCT	2	8	6364	6371	25 %	25 %	0 %	50 %	383842830
17	NC_017062	ACCA	2	8	6448	6455	50 %	0 %	0 %	50 %	383842830
18	NC_017062	TAAA	2	8	6456	6463	75 %	25 %	0 %	0 %	383842830
19	NC_017062	ATAA	2	8	6619	6626	75 %	25 %	0 %	0 %	383842830
20	NC_017062	ACTT	2	8	6840	6847	25 %	50 %	0 %	25 %	383842831
21	NC_017062	CCTG	2	8	7667	7674	0 %	25 %	25 %	50 %	383842832
22	NC_017062	TAAC	2	8	8478	8485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017062	TTTA	2	8	8725	8732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017062	TAAT	2	8	8830	8837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017062	GCTC	2	8	8992	8999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017062	TGAG	2	8	9029	9036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017062	CAAT	2	8	9454	9461	50 %	25 %	0 %	25 %	383842833
28	NC_017062	CATG	2	8	9477	9484	25 %	25 %	25 %	25 %	383842833
29	NC_017062	ATGA	2	8	9553	9560	50 %	25 %	25 %	0 %	383842833
30	NC_017062	AAAT	2	8	10269	10276	75 %	25 %	0 %	0 %	383842833
31	NC_017062	TAAA	2	8	10549	10556	75 %	25 %	0 %	0 %	383842834
32	NC_017062	TAAA	2	8	10576	10583	75 %	25 %	0 %	0 %	383842834
33	NC_017062	TCAT	2	8	10973	10980	25 %	50 %	0 %	25 %	383842834
34	NC_017062	TCTT	2	8	11439	11446	0 %	75 %	0 %	25 %	383842835
35	NC_017062	TAAT	2	8	12024	12031	50 %	50 %	0 %	0 %	383842836
36	NC_017062	GCTT	2	8	12039	12046	0 %	50 %	25 %	25 %	383842836
37	NC_017062	TTTA	2	8	12187	12194	25 %	75 %	0 %	0 %	383842836
38	NC_017062	AATA	2	8	12958	12965	75 %	25 %	0 %	0 %	383842837
39	NC_017062	GCTC	2	8	13162	13169	0 %	25 %	25 %	50 %	383842837
40	NC_017062	TCTG	2	8	14041	14048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017062	TTTA	2	8	14115	14122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017062	TCTT	2	8	14123	14130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017062	ATTA	2	8	14361	14368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017062	AAAG	2	8	14443	14450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017062	TTAT	2	8	14617	14624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017062	AATA	2	8	15250	15257	75 %	25 %	0 %	0 %	383842838
47	NC_017062	AGCA	2	8	15678	15685	50 %	0 %	25 %	25 %	383842838
48	NC_017062	TGGA	2	8	15792	15799	25 %	25 %	50 %	0 %	383842838
49	NC_017062	GAAA	2	8	16308	16315	75 %	0 %	25 %	0 %	383842838
50	NC_017062	TATG	2	8	16579	16586	25 %	50 %	25 %	0 %	383842838
51	NC_017062	AAAG	2	8	16637	16644	75 %	0 %	25 %	0 %	383842838
52	NC_017062	TTCA	2	8	17361	17368	25 %	50 %	0 %	25 %	383842838
53	NC_017062	TAAA	2	8	18000	18007	75 %	25 %	0 %	0 %	383842838
54	NC_017062	AGTC	2	8	18113	18120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017062	AAGA	2	8	18631	18638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017062	AGTA	2	8	18727	18734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017062	ATAG	2	8	18753	18760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017062	CTTA	2	8	19036	19043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017062	TACC	2	8	19823	19830	25 %	25 %	0 %	50 %	383842839
60	NC_017062	GCTA	2	8	20017	20024	25 %	25 %	25 %	25 %	383842839
61	NC_017062	CTTG	2	8	20191	20198	0 %	50 %	25 %	25 %	383842840
62	NC_017062	ATGC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	25 %	25 %	383842840
63	NC_017062	AACA	2	8	20222	20229	75 %	0 %	0 %	25 %	383842840
64	NC_017062	AAGC	2	8	20708	20715	50 %	0 %	25 %	25 %	383842840
65	NC_017062	TAAA	2	8	21542	21549	75 %	25 %	0 %	0 %	383842841
66	NC_017062	TAAT	2	8	21557	21564	50 %	50 %	0 %	0 %	383842841
67	NC_017062	AAAT	2	8	21859	21866	75 %	25 %	0 %	0 %	383842842
68	NC_017062	TATC	2	8	21996	22003	25 %	50 %	0 %	25 %	383842842
69	NC_017062	CAAT	2	8	22165	22172	50 %	25 %	0 %	25 %	383842842
70	NC_017062	ATAA	2	8	22987	22994	75 %	25 %	0 %	0 %	383842843
71	NC_017062	TCAA	2	8	23177	23184	50 %	25 %	0 %	25 %	383842843
72	NC_017062	TAAA	2	8	23488	23495	75 %	25 %	0 %	0 %	383842843
73	NC_017062	AAGA	2	8	24618	24625	75 %	0 %	25 %	0 %	383842844
74	NC_017062	ACTT	2	8	25001	25008	25 %	50 %	0 %	25 %	383842844
75	NC_017062	AAGA	2	8	25725	25732	75 %	0 %	25 %	0 %	383842846
76	NC_017062	TTAA	2	8	26173	26180	50 %	50 %	0 %	0 %	383842847
77	NC_017062	TAAT	2	8	26687	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017062	TATT	2	8	26738	26745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017062	TTTA	2	8	26983	26990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017062	CAAT	2	8	27291	27298	50 %	25 %	0 %	25 %	383842848
81	NC_017062	TTTC	2	8	27466	27473	0 %	75 %	0 %	25 %	383842848
82	NC_017062	TGAT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	25 %	0 %	383842848
83	NC_017062	CTTG	2	8	28246	28253	0 %	50 %	25 %	25 %	383842849
84	NC_017062	GCAA	2	8	28417	28424	50 %	0 %	25 %	25 %	383842849
85	NC_017062	AGTT	2	8	29331	29338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017062	TCAT	2	8	29549	29556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017062	TGAT	2	8	29599	29606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017062	CTTC	2	8	29722	29729	0 %	50 %	0 %	50 %	383842850
89	NC_017062	TATC	2	8	30134	30141	25 %	50 %	0 %	25 %	383842850
90	NC_017062	ATAA	2	8	30237	30244	75 %	25 %	0 %	0 %	383842850
91	NC_017062	AGCA	2	8	30750	30757	50 %	0 %	25 %	25 %	383842850
92	NC_017062	TTTG	2	8	30840	30847	0 %	75 %	25 %	0 %	383842850
93	NC_017062	ATTC	2	8	30905	30912	25 %	50 %	0 %	25 %	383842850
94	NC_017062	AACG	2	8	31798	31805	50 %	0 %	25 %	25 %	383842850
95	NC_017062	AAAT	2	8	31829	31836	75 %	25 %	0 %	0 %	383842850
96	NC_017062	ATTA	2	8	32064	32071	50 %	50 %	0 %	0 %	383842850
97	NC_017062	AATA	2	8	32110	32117	75 %	25 %	0 %	0 %	383842850
98	NC_017062	AAGT	2	8	32591	32598	50 %	25 %	25 %	0 %	383842850
99	NC_017062	TCCT	2	8	33280	33287	0 %	50 %	0 %	50 %	383842851
100	NC_017062	ATTT	2	8	33321	33328	25 %	75 %	0 %	0 %	383842851
101	NC_017062	GTTA	2	8	34192	34199	25 %	50 %	25 %	0 %	383842851
102	NC_017062	TTAA	2	8	34418	34425	50 %	50 %	0 %	0 %	383842851
103	NC_017062	AATT	2	8	35079	35086	50 %	50 %	0 %	0 %	383842851
104	NC_017062	ACTA	2	8	35383	35390	50 %	25 %	0 %	25 %	383842851
105	NC_017062	ATTT	2	8	35689	35696	25 %	75 %	0 %	0 %	383842851
106	NC_017062	AATT	2	8	35757	35764	50 %	50 %	0 %	0 %	383842851
107	NC_017062	GTAA	2	8	35993	36000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017062	ATTT	2	8	36088	36095	25 %	75 %	0 %	0 %	383842852
109	NC_017062	CATA	2	8	36359	36366	50 %	25 %	0 %	25 %	383842852
110	NC_017062	AAAT	2	8	36666	36673	75 %	25 %	0 %	0 %	383842852
111	NC_017062	TAAA	2	8	36950	36957	75 %	25 %	0 %	0 %	383842852
112	NC_017062	TGAT	2	8	37102	37109	25 %	50 %	25 %	0 %	383842852
113	NC_017062	CAAG	2	8	37121	37128	50 %	0 %	25 %	25 %	383842852
114	NC_017062	TGAT	2	8	38143	38150	25 %	50 %	25 %	0 %	383842852
115	NC_017062	AATA	2	8	38336	38343	75 %	25 %	0 %	0 %	383842852
116	NC_017062	CATT	2	8	38509	38516	25 %	50 %	0 %	25 %	383842852
117	NC_017062	GACC	2	8	38681	38688	25 %	0 %	25 %	50 %	383842852
118	NC_017062	CATA	2	8	39560	39567	50 %	25 %	0 %	25 %	383842853
119	NC_017062	ATAC	2	8	39622	39629	50 %	25 %	0 %	25 %	383842853
120	NC_017062	ACCC	2	8	39634	39641	25 %	0 %	0 %	75 %	383842853
121	NC_017062	TAAA	2	8	39665	39672	75 %	25 %	0 %	0 %	383842853
122	NC_017062	GAAT	2	8	39680	39687	50 %	25 %	25 %	0 %	383842853
123	NC_017062	CAAT	2	8	40021	40028	50 %	25 %	0 %	25 %	383842853
124	NC_017062	ATTA	2	8	40500	40507	50 %	50 %	0 %	0 %	383842853
125	NC_017062	ATTC	2	8	41478	41485	25 %	50 %	0 %	25 %	383842854
126	NC_017062	TAAT	2	8	42270	42277	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
127	NC_017062	AGAA	2	8	42373	42380	75 %	0 %	25 %	0 %	383842854
128	NC_017062	AAAT	2	8	42944	42951	75 %	25 %	0 %	0 %	383842854
129	NC_017062	TAAG	2	8	43188	43195	50 %	25 %	25 %	0 %	383842854
130	NC_017062	ATGC	2	8	43405	43412	25 %	25 %	25 %	25 %	383842854
131	NC_017062	GCTT	2	8	43907	43914	0 %	50 %	25 %	25 %	383842854
132	NC_017062	AATT	2	8	43999	44006	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
133	NC_017062	TAAA	2	8	44109	44116	75 %	25 %	0 %	0 %	383842854
134	NC_017062	ATTT	2	8	44125	44132	25 %	75 %	0 %	0 %	383842854
135	NC_017062	ATGT	2	8	44214	44221	25 %	50 %	25 %	0 %	383842854
136	NC_017062	TTAC	2	8	44402	44409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017062	TGTT	2	8	44813	44820	0 %	75 %	25 %	0 %	383842855
138	NC_017062	AATT	2	8	46276	46283	50 %	50 %	0 %	0 %	383842855
139	NC_017062	GAAA	2	8	46290	46297	75 %	0 %	25 %	0 %	383842855
140	NC_017062	TTTC	2	8	46405	46412	0 %	75 %	0 %	25 %	383842855
141	NC_017062	TCTT	2	8	46877	46884	0 %	75 %	0 %	25 %	383842855
142	NC_017062	TTTA	2	8	47166	47173	25 %	75 %	0 %	0 %	383842856
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144	NC_017062	TACT	2	8	47318	47325	25 %	50 %	0 %	25 %	383842856
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