MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 1072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017062	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017062	CAAA	2	8	963	970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017062	ATTT	2	8	1303	1310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017062	TTTA	2	8	5979	5986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017062	TAAA	2	8	5998	6005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017062	TAAC	2	8	8478	8485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017062	TTTA	2	8	8725	8732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017062	TAAT	2	8	8830	8837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017062	GCTC	2	8	8992	8999	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017062	TGAG	2	8	9029	9036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017062	TCTG	2	8	14041	14048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017062	TTTA	2	8	14115	14122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017062	TCTT	2	8	14123	14130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017062	ATTA	2	8	14361	14368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017062	AAAG	2	8	14443	14450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017062	TTAT	2	8	14617	14624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017062	AGTC	2	8	18113	18120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017062	AAGA	2	8	18631	18638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017062	AGTA	2	8	18727	18734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017062	ATAG	2	8	18753	18760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017062	CTTA	2	8	19036	19043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017062	TAAT	2	8	26687	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017062	TATT	2	8	26738	26745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017062	TTTA	2	8	26983	26990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017062	AGTT	2	8	29331	29338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017062	TCAT	2	8	29549	29556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017062	TGAT	2	8	29599	29606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017062	GTAA	2	8	35993	36000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017062	TTAC	2	8	44402	44409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017062	TTAA	2	8	47504	47511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017062	TAAC	2	8	47804	47811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017062	AAAT	2	8	49735	49742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017062	AGAA	2	8	49807	49814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017062	TAAA	2	8	50381	50388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017062	AATT	2	8	50794	50801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017062	GTAA	2	8	50823	50830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017062	AATT	2	8	50966	50973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017062	TAAA	2	8	57373	57380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017062	ATGA	2	8	57498	57505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017062	TAAT	2	8	57517	57524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017062	GCAT	2	8	61063	61070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017062	TAAA	2	8	61114	61121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017062	TACT	2	8	61393	61400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017062	TTAG	2	8	61495	61502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017062	TCTA	2	8	61796	61803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017062	AAAT	2	8	61883	61890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017062	TTTA	2	8	62952	62959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017062	TTAT	2	8	65885	65892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017062	TTAC	2	8	66114	66121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017062	CAAG	2	8	66193	66200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017062	ACAT	2	8	66313	66320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017062	TTAA	2	8	66672	66679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017062	ATTA	2	8	66907	66914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017062	GTAA	2	8	67035	67042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017062	ACAA	2	8	67140	67147	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017062	GCAT	2	8	67315	67322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017062	GTAA	2	8	67552	67559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017062	TACA	2	8	67571	67578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017062	TGAT	2	8	67875	67882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017062	AATA	2	8	67932	67939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017062	ATAA	2	8	73022	73029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017062	ATTT	2	8	74043	74050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017062	ATAA	2	8	76367	76374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017062	ACAT	2	8	77236	77243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017062	TAAA	2	8	77268	77275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017062	TTTA	2	8	82422	82429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017062	TTAC	2	8	82459	82466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017062	TAAG	2	8	82545	82552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017062	TTAA	2	8	82613	82620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017062	TATT	2	8	84008	84015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017062	TTTA	2	8	84253	84260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017062	TAAA	2	8	84492	84499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017062	TATT	2	8	91659	91666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017062	ATTT	2	8	91933	91940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017062	TTTA	2	8	92549	92556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017062	AAGT	2	8	101649	101656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017062	TATT	2	8	103204	103211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017062	CAAA	2	8	103249	103256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017062	TAAA	2	8	103278	103285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017062	ATCT	2	8	103495	103502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017062	GATT	2	8	104030	104037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017062	ATTA	2	8	104159	104166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017062	TAAT	2	8	104256	104263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017062	TAAT	2	8	104480	104487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017062	AATA	2	8	104529	104536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017062	TTAT	2	8	104881	104888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017062	TATT	2	8	104987	104994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017062	TCTT	2	8	106116	106123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017062	ATTA	2	8	109946	109953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017062	TTAT	2	8	110005	110012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017062	ATTA	2	8	111936	111943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017062	ATTT	2	8	113106	113113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017062	TATT	2	8	113138	113145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017062	ATAG	2	8	113163	113170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017062	ATAA	2	8	116742	116749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017062	AAAC	2	8	117980	117987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017062	TAAA	2	8	118161	118168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017062	TATT	2	8	120090	120097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017062	AATA	2	8	121387	121394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017062	TTAA	2	8	121522	121529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017062	ATTT	2	8	121780	121787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017062	ATAA	2	8	124530	124537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017062	TTAA	2	8	124596	124603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017062	TATT	2	8	125302	125309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017062	TTAA	2	8	125330	125337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017062	ATTA	2	8	126455	126462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017062	GATT	2	8	126536	126543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017062	ATTT	2	8	126612	126619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017062	TTTA	2	8	126800	126807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017062	AAAT	2	8	130079	130086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017062	ATTT	2	8	130307	130314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017062	ATTT	2	8	131139	131146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017062	TACT	2	8	131312	131319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017062	GCAT	2	8	131653	131660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017062	CATT	2	8	133376	133383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017062	AATA	2	8	134040	134047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017062	AAAT	2	8	134118	134125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017062	TACT	2	8	136015	136022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017062	TTAA	2	8	140537	140544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017062	AAAT	2	8	141829	141836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017062	TTTG	2	8	141844	141851	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017062	AGTT	2	8	141871	141878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017062	CTAT	2	8	141992	141999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017062	CTTG	2	8	142710	142717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017062	ATCT	2	8	142721	142728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017062	ATAA	2	8	143169	143176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017062	TAGA	2	8	143196	143203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017062	TCAG	2	8	143414	143421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017062	TTTA	2	8	153213	153220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017062	TAAG	2	8	154119	154126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017062	ATTA	2	8	158487	158494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017062	TATT	2	8	161373	161380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017062	ATAA	2	8	161445	161452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017062	TAAT	2	8	161478	161485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017062	TACA	2	8	165915	165922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017062	CAAA	2	8	165975	165982	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017062	AAAT	2	8	166007	166014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017062	AGAA	2	8	170675	170682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017062	ATGT	2	8	170793	170800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017062	TCTA	2	8	170823	170830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017062	ATAA	2	8	171189	171196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017062	GAAA	2	8	174213	174220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017062	ATTG	2	8	176120	176127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017062	ATTT	2	8	180383	180390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017062	TTAC	2	8	180398	180405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017062	TAAT	2	8	185598	185605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017062	AAAT	2	8	189062	189069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017062	TATT	2	8	189116	189123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017062	CTTT	2	8	189692	189699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017062	TAAT	2	8	190211	190218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017062	AGCA	2	8	193026	193033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017062	TGAT	2	8	194192	194199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017062	AATT	2	8	195929	195936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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