MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 2447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017062	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383842825
2	NC_017062	ACAG	2	8	1632	1639	50 %	0 %	25 %	25 %	383842827
3	NC_017062	AGTA	2	8	2294	2301	50 %	25 %	25 %	0 %	383842828
4	NC_017062	TTAT	2	8	2605	2612	25 %	75 %	0 %	0 %	383842828
5	NC_017062	TAAT	2	8	2719	2726	50 %	50 %	0 %	0 %	383842828
6	NC_017062	TTAT	2	8	2827	2834	25 %	75 %	0 %	0 %	383842828
7	NC_017062	TATT	2	8	3547	3554	25 %	75 %	0 %	0 %	383842829
8	NC_017062	AGAA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	383842829
9	NC_017062	AATA	2	8	5209	5216	75 %	25 %	0 %	0 %	383842829
10	NC_017062	TCAC	2	8	5248	5255	25 %	25 %	0 %	50 %	383842829
11	NC_017062	ACCT	2	8	6364	6371	25 %	25 %	0 %	50 %	383842830
12	NC_017062	ACCA	2	8	6448	6455	50 %	0 %	0 %	50 %	383842830
13	NC_017062	TAAA	2	8	6456	6463	75 %	25 %	0 %	0 %	383842830
14	NC_017062	ATAA	2	8	6619	6626	75 %	25 %	0 %	0 %	383842830
15	NC_017062	ACTT	2	8	6840	6847	25 %	50 %	0 %	25 %	383842831
16	NC_017062	CCTG	2	8	7667	7674	0 %	25 %	25 %	50 %	383842832
17	NC_017062	CAAT	2	8	9454	9461	50 %	25 %	0 %	25 %	383842833
18	NC_017062	CATG	2	8	9477	9484	25 %	25 %	25 %	25 %	383842833
19	NC_017062	ATGA	2	8	9553	9560	50 %	25 %	25 %	0 %	383842833
20	NC_017062	AAAT	2	8	10269	10276	75 %	25 %	0 %	0 %	383842833
21	NC_017062	TAAA	2	8	10549	10556	75 %	25 %	0 %	0 %	383842834
22	NC_017062	TAAA	2	8	10576	10583	75 %	25 %	0 %	0 %	383842834
23	NC_017062	TCAT	2	8	10973	10980	25 %	50 %	0 %	25 %	383842834
24	NC_017062	TCTT	2	8	11439	11446	0 %	75 %	0 %	25 %	383842835
25	NC_017062	TAAT	2	8	12024	12031	50 %	50 %	0 %	0 %	383842836
26	NC_017062	GCTT	2	8	12039	12046	0 %	50 %	25 %	25 %	383842836
27	NC_017062	TTTA	2	8	12187	12194	25 %	75 %	0 %	0 %	383842836
28	NC_017062	AATA	2	8	12958	12965	75 %	25 %	0 %	0 %	383842837
29	NC_017062	GCTC	2	8	13162	13169	0 %	25 %	25 %	50 %	383842837
30	NC_017062	AATA	2	8	15250	15257	75 %	25 %	0 %	0 %	383842838
31	NC_017062	AGCA	2	8	15678	15685	50 %	0 %	25 %	25 %	383842838
32	NC_017062	TGGA	2	8	15792	15799	25 %	25 %	50 %	0 %	383842838
33	NC_017062	GAAA	2	8	16308	16315	75 %	0 %	25 %	0 %	383842838
34	NC_017062	TATG	2	8	16579	16586	25 %	50 %	25 %	0 %	383842838
35	NC_017062	AAAG	2	8	16637	16644	75 %	0 %	25 %	0 %	383842838
36	NC_017062	TTCA	2	8	17361	17368	25 %	50 %	0 %	25 %	383842838
37	NC_017062	TAAA	2	8	18000	18007	75 %	25 %	0 %	0 %	383842838
38	NC_017062	TACC	2	8	19823	19830	25 %	25 %	0 %	50 %	383842839
39	NC_017062	GCTA	2	8	20017	20024	25 %	25 %	25 %	25 %	383842839
40	NC_017062	CTTG	2	8	20191	20198	0 %	50 %	25 %	25 %	383842840
41	NC_017062	ATGC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	25 %	25 %	383842840
42	NC_017062	AACA	2	8	20222	20229	75 %	0 %	0 %	25 %	383842840
43	NC_017062	AAGC	2	8	20708	20715	50 %	0 %	25 %	25 %	383842840
44	NC_017062	TAAA	2	8	21542	21549	75 %	25 %	0 %	0 %	383842841
45	NC_017062	TAAT	2	8	21557	21564	50 %	50 %	0 %	0 %	383842841
46	NC_017062	AAAT	2	8	21859	21866	75 %	25 %	0 %	0 %	383842842
47	NC_017062	TATC	2	8	21996	22003	25 %	50 %	0 %	25 %	383842842
48	NC_017062	CAAT	2	8	22165	22172	50 %	25 %	0 %	25 %	383842842
49	NC_017062	ATAA	2	8	22987	22994	75 %	25 %	0 %	0 %	383842843
50	NC_017062	TCAA	2	8	23177	23184	50 %	25 %	0 %	25 %	383842843
51	NC_017062	TAAA	2	8	23488	23495	75 %	25 %	0 %	0 %	383842843
52	NC_017062	AAGA	2	8	24618	24625	75 %	0 %	25 %	0 %	383842844
53	NC_017062	ACTT	2	8	25001	25008	25 %	50 %	0 %	25 %	383842844
54	NC_017062	AAGA	2	8	25725	25732	75 %	0 %	25 %	0 %	383842846
55	NC_017062	TTAA	2	8	26173	26180	50 %	50 %	0 %	0 %	383842847
56	NC_017062	CAAT	2	8	27291	27298	50 %	25 %	0 %	25 %	383842848
57	NC_017062	TTTC	2	8	27466	27473	0 %	75 %	0 %	25 %	383842848
58	NC_017062	TGAT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	25 %	0 %	383842848
59	NC_017062	CTTG	2	8	28246	28253	0 %	50 %	25 %	25 %	383842849
60	NC_017062	GCAA	2	8	28417	28424	50 %	0 %	25 %	25 %	383842849
61	NC_017062	CTTC	2	8	29722	29729	0 %	50 %	0 %	50 %	383842850
62	NC_017062	TATC	2	8	30134	30141	25 %	50 %	0 %	25 %	383842850
63	NC_017062	ATAA	2	8	30237	30244	75 %	25 %	0 %	0 %	383842850
64	NC_017062	AGCA	2	8	30750	30757	50 %	0 %	25 %	25 %	383842850
65	NC_017062	TTTG	2	8	30840	30847	0 %	75 %	25 %	0 %	383842850
66	NC_017062	ATTC	2	8	30905	30912	25 %	50 %	0 %	25 %	383842850
67	NC_017062	AACG	2	8	31798	31805	50 %	0 %	25 %	25 %	383842850
68	NC_017062	AAAT	2	8	31829	31836	75 %	25 %	0 %	0 %	383842850
69	NC_017062	ATTA	2	8	32064	32071	50 %	50 %	0 %	0 %	383842850
70	NC_017062	AATA	2	8	32110	32117	75 %	25 %	0 %	0 %	383842850
71	NC_017062	AAGT	2	8	32591	32598	50 %	25 %	25 %	0 %	383842850
72	NC_017062	TCCT	2	8	33280	33287	0 %	50 %	0 %	50 %	383842851
73	NC_017062	ATTT	2	8	33321	33328	25 %	75 %	0 %	0 %	383842851
74	NC_017062	GTTA	2	8	34192	34199	25 %	50 %	25 %	0 %	383842851
75	NC_017062	TTAA	2	8	34418	34425	50 %	50 %	0 %	0 %	383842851
76	NC_017062	AATT	2	8	35079	35086	50 %	50 %	0 %	0 %	383842851
77	NC_017062	ACTA	2	8	35383	35390	50 %	25 %	0 %	25 %	383842851
78	NC_017062	ATTT	2	8	35689	35696	25 %	75 %	0 %	0 %	383842851
79	NC_017062	AATT	2	8	35757	35764	50 %	50 %	0 %	0 %	383842851
80	NC_017062	ATTT	2	8	36088	36095	25 %	75 %	0 %	0 %	383842852
81	NC_017062	CATA	2	8	36359	36366	50 %	25 %	0 %	25 %	383842852
82	NC_017062	AAAT	2	8	36666	36673	75 %	25 %	0 %	0 %	383842852
83	NC_017062	TAAA	2	8	36950	36957	75 %	25 %	0 %	0 %	383842852
84	NC_017062	TGAT	2	8	37102	37109	25 %	50 %	25 %	0 %	383842852
85	NC_017062	CAAG	2	8	37121	37128	50 %	0 %	25 %	25 %	383842852
86	NC_017062	TGAT	2	8	38143	38150	25 %	50 %	25 %	0 %	383842852
87	NC_017062	AATA	2	8	38336	38343	75 %	25 %	0 %	0 %	383842852
88	NC_017062	CATT	2	8	38509	38516	25 %	50 %	0 %	25 %	383842852
89	NC_017062	GACC	2	8	38681	38688	25 %	0 %	25 %	50 %	383842852
90	NC_017062	CATA	2	8	39560	39567	50 %	25 %	0 %	25 %	383842853
91	NC_017062	ATAC	2	8	39622	39629	50 %	25 %	0 %	25 %	383842853
92	NC_017062	ACCC	2	8	39634	39641	25 %	0 %	0 %	75 %	383842853
93	NC_017062	TAAA	2	8	39665	39672	75 %	25 %	0 %	0 %	383842853
94	NC_017062	GAAT	2	8	39680	39687	50 %	25 %	25 %	0 %	383842853
95	NC_017062	CAAT	2	8	40021	40028	50 %	25 %	0 %	25 %	383842853
96	NC_017062	ATTA	2	8	40500	40507	50 %	50 %	0 %	0 %	383842853
97	NC_017062	ATTC	2	8	41478	41485	25 %	50 %	0 %	25 %	383842854
98	NC_017062	TAAT	2	8	42270	42277	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
99	NC_017062	AGAA	2	8	42373	42380	75 %	0 %	25 %	0 %	383842854
100	NC_017062	AAAT	2	8	42944	42951	75 %	25 %	0 %	0 %	383842854
101	NC_017062	TAAG	2	8	43188	43195	50 %	25 %	25 %	0 %	383842854
102	NC_017062	ATGC	2	8	43405	43412	25 %	25 %	25 %	25 %	383842854
103	NC_017062	GCTT	2	8	43907	43914	0 %	50 %	25 %	25 %	383842854
104	NC_017062	AATT	2	8	43999	44006	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
105	NC_017062	TAAA	2	8	44109	44116	75 %	25 %	0 %	0 %	383842854
106	NC_017062	ATTT	2	8	44125	44132	25 %	75 %	0 %	0 %	383842854
107	NC_017062	ATGT	2	8	44214	44221	25 %	50 %	25 %	0 %	383842854
108	NC_017062	TGTT	2	8	44813	44820	0 %	75 %	25 %	0 %	383842855
109	NC_017062	AATT	2	8	46276	46283	50 %	50 %	0 %	0 %	383842855
110	NC_017062	GAAA	2	8	46290	46297	75 %	0 %	25 %	0 %	383842855
111	NC_017062	TTTC	2	8	46405	46412	0 %	75 %	0 %	25 %	383842855
112	NC_017062	TCTT	2	8	46877	46884	0 %	75 %	0 %	25 %	383842855
113	NC_017062	TTTA	2	8	47166	47173	25 %	75 %	0 %	0 %	383842856
114	NC_017062	AAAT	2	8	47270	47277	75 %	25 %	0 %	0 %	383842856
115	NC_017062	TACT	2	8	47318	47325	25 %	50 %	0 %	25 %	383842856
116	NC_017062	AATC	2	8	48313	48320	50 %	25 %	0 %	25 %	383842857
117	NC_017062	TAAC	2	8	48328	48335	50 %	25 %	0 %	25 %	383842857
118	NC_017062	GAAA	2	8	49199	49206	75 %	0 %	25 %	0 %	383842858
119	NC_017062	GATT	2	8	49248	49255	25 %	50 %	25 %	0 %	383842858
120	NC_017062	TAAT	2	8	51440	51447	50 %	50 %	0 %	0 %	383842861
121	NC_017062	TAAT	2	8	51821	51828	50 %	50 %	0 %	0 %	383842861
122	NC_017062	TAAC	2	8	51881	51888	50 %	25 %	0 %	25 %	383842861
123	NC_017062	AATT	2	8	52193	52200	50 %	50 %	0 %	0 %	383842862
124	NC_017062	ATAA	2	8	52629	52636	75 %	25 %	0 %	0 %	383842862
125	NC_017062	ACCA	2	8	52751	52758	50 %	0 %	0 %	50 %	383842862
126	NC_017062	TTAT	2	8	53391	53398	25 %	75 %	0 %	0 %	383842863
127	NC_017062	AGAT	2	8	53450	53457	50 %	25 %	25 %	0 %	383842863
128	NC_017062	AGAT	2	8	54113	54120	50 %	25 %	25 %	0 %	383842863
129	NC_017062	CCAT	2	8	55315	55322	25 %	25 %	0 %	50 %	383842864
130	NC_017062	AAAC	2	8	55496	55503	75 %	0 %	0 %	25 %	383842864
131	NC_017062	TAAT	2	8	55539	55546	50 %	50 %	0 %	0 %	383842865
132	NC_017062	ATAG	2	8	56272	56279	50 %	25 %	25 %	0 %	383842865
133	NC_017062	ACAA	2	8	56317	56324	75 %	0 %	0 %	25 %	383842866
134	NC_017062	TATT	2	8	56333	56340	25 %	75 %	0 %	0 %	383842866
135	NC_017062	AAAT	2	8	56424	56431	75 %	25 %	0 %	0 %	383842866
136	NC_017062	CAAA	2	8	56473	56480	75 %	0 %	0 %	25 %	383842866
137	NC_017062	TCAT	2	8	56675	56682	25 %	50 %	0 %	25 %	383842866
138	NC_017062	AATC	2	8	57040	57047	50 %	25 %	0 %	25 %	383842866
139	NC_017062	TATT	2	8	57252	57259	25 %	75 %	0 %	0 %	383842866
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