MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 4322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017062	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017062	AAT	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017062	ACA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017062	CTT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017062	ATT	2	6	5944	5949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017062	AAC	2	6	5971	5976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017062	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017062	ATT	2	6	7333	7338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017062	TAT	2	6	8520	8525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017062	TAA	2	6	8608	8613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017062	GAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017062	TAA	2	6	8663	8668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017062	TAA	2	6	8799	8804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017062	TGG	2	6	8851	8856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017062	AAG	2	6	9019	9024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017062	AAT	2	6	9042	9047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017062	CAT	2	6	9099	9104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017062	ATA	2	6	9270	9275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017062	TTA	2	6	13972	13977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017062	TTA	2	6	13982	13987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017062	TTA	2	6	14031	14036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017062	ATT	2	6	14089	14094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017062	ATT	2	6	14254	14259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017062	AAG	2	6	14381	14386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017062	AAT	2	6	14391	14396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017062	ATT	2	6	14407	14412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017062	TCA	2	6	14540	14545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017062	ATT	2	6	14580	14585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017062	ACC	2	6	18189	18194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017062	AAG	2	6	18326	18331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017062	TAA	2	6	18351	18356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017062	ATT	2	6	18463	18468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017062	TGC	2	6	18475	18480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017062	TAT	2	6	18541	18546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017062	ATA	2	6	18548	18553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017062	ATG	2	6	18605	18610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017062	ACA	2	6	18677	18682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017062	AAT	2	6	18769	18774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017062	TAT	2	6	18905	18910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017062	AGT	2	6	18926	18931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017062	ATT	2	6	19023	19028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017062	TCT	2	6	19186	19191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017062	CAA	2	6	19226	19231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017062	TAA	2	6	19243	19248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017062	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017062	AAT	3	9	19299	19307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017062	TTC	2	6	19326	19331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017062	TTA	2	6	19364	19369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017062	ATA	2	6	19406	19411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017062	AGT	2	6	19432	19437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017062	ATA	2	6	19440	19445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017062	ATA	2	6	19478	19483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017062	TTA	2	6	19558	19563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017062	AGT	2	6	19571	19576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017062	TGT	2	6	19596	19601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017062	ATT	2	6	22535	22540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017062	AAT	2	6	22589	22594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017062	TAT	2	6	25107	25112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017062	TTA	2	6	25388	25393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017062	ATT	2	6	25501	25506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017062	CTA	2	6	26853	26858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017062	TGC	2	6	26877	26882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017062	CTT	2	6	26906	26911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017062	ATA	2	6	29321	29326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017062	TAA	2	6	29366	29371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017062	ATC	2	6	29415	29420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017062	TAA	2	6	29436	29441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017062	AGA	2	6	29462	29467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017062	CTA	2	6	29495	29500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017062	CTT	2	6	29587	29592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017062	TAT	2	6	29625	29630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017062	TTA	2	6	29653	29658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017062	TCA	2	6	35941	35946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017062	ATT	2	6	36030	36035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017062	ATA	2	6	44498	44503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017062	TTA	2	6	47076	47081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017062	ATC	2	6	47536	47541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017062	TTA	2	6	47615	47620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017062	TAA	2	6	47637	47642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017062	TAC	2	6	47663	47668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017062	ATT	2	6	47682	47687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017062	ATA	2	6	47718	47723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017062	TAA	2	6	47844	47849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017062	TTG	2	6	47852	47857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017062	TAT	3	9	47863	47871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017062	ATC	2	6	47976	47981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017062	TAG	2	6	48024	48029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017062	TAC	2	6	48047	48052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017062	TTA	2	6	48717	48722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017062	TGT	2	6	48737	48742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017062	CAA	2	6	48781	48786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017062	AAT	2	6	48869	48874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017062	TAT	2	6	48922	48927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017062	TAG	2	6	49108	49113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017062	AAT	2	6	49770	49775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017062	ACA	2	6	49858	49863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017062	ATA	2	6	49879	49884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017062	CTA	2	6	49885	49890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017062	AAT	2	6	50096	50101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017062	TTA	2	6	50116	50121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017062	TAG	2	6	50156	50161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017062	ATA	2	6	50199	50204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017062	TAA	2	6	50219	50224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017062	ACT	2	6	50302	50307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017062	ATT	2	6	50427	50432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017062	TTA	2	6	50442	50447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017062	CAA	2	6	50496	50501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017062	TAA	2	6	50555	50560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017062	TTA	2	6	50568	50573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017062	ATA	2	6	50627	50632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017062	TAC	2	6	50634	50639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017062	GTA	2	6	50655	50660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017062	ATA	2	6	50761	50766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017062	AAT	2	6	50857	50862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017062	ATA	2	6	50890	50895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017062	ACT	2	6	52805	52810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017062	ACC	2	6	54233	54238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017062	TGC	2	6	54328	54333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017062	ATA	2	6	54384	54389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017062	ATT	2	6	54395	54400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017062	TAA	2	6	54449	54454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017062	ATC	2	6	54567	54572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017062	CAA	2	6	54610	54615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017062	AAT	2	6	54617	54622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017062	CTA	2	6	54662	54667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017062	TAC	2	6	54789	54794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017062	CTA	2	6	54798	54803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017062	GAA	2	6	54873	54878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017062	ATT	2	6	57333	57338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017062	TAA	2	6	57347	57352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017062	TAT	2	6	57408	57413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017062	TTA	3	9	57417	57425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017062	ATA	2	6	58789	58794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017062	TCA	2	6	60905	60910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017062	TAA	2	6	60937	60942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017062	GTA	2	6	61024	61029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017062	GAA	2	6	61037	61042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017062	AGC	2	6	61051	61056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017062	TAT	2	6	61155	61160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017062	TAC	2	6	61232	61237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017062	AAT	2	6	61269	61274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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