MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 1828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017062	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	383842825
2	NC_017062	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383842825
3	NC_017062	AT	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	383842827
4	NC_017062	TA	3	6	1667	1672	50 %	50 %	0 %	0 %	383842827
5	NC_017062	TA	3	6	2404	2409	50 %	50 %	0 %	0 %	383842828
6	NC_017062	TC	3	6	3294	3299	0 %	50 %	0 %	50 %	383842829
7	NC_017062	GA	3	6	3476	3481	50 %	0 %	50 %	0 %	383842829
8	NC_017062	AT	4	8	3914	3921	50 %	50 %	0 %	0 %	383842829
9	NC_017062	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	383842829
10	NC_017062	GA	3	6	4244	4249	50 %	0 %	50 %	0 %	383842829
11	NC_017062	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	383842829
12	NC_017062	AT	3	6	4775	4780	50 %	50 %	0 %	0 %	383842829
13	NC_017062	AT	3	6	5788	5793	50 %	50 %	0 %	0 %	383842829
14	NC_017062	TC	3	6	6565	6570	0 %	50 %	0 %	50 %	383842830
15	NC_017062	GA	3	6	7018	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	383842831
16	NC_017062	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	383842832
17	NC_017062	TG	3	6	9502	9507	0 %	50 %	50 %	0 %	383842833
18	NC_017062	AT	3	6	10562	10567	50 %	50 %	0 %	0 %	383842834
19	NC_017062	AT	4	8	11627	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	383842835
20	NC_017062	TA	3	6	11650	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	383842835
21	NC_017062	AT	3	6	12047	12052	50 %	50 %	0 %	0 %	383842836
22	NC_017062	TA	3	6	12424	12429	50 %	50 %	0 %	0 %	383842836
23	NC_017062	CT	3	6	12515	12520	0 %	50 %	0 %	50 %	383842836
24	NC_017062	TA	3	6	13112	13117	50 %	50 %	0 %	0 %	383842837
25	NC_017062	AT	3	6	13494	13499	50 %	50 %	0 %	0 %	383842837
26	NC_017062	TA	4	8	13886	13893	50 %	50 %	0 %	0 %	383842837
27	NC_017062	TA	4	8	17671	17678	50 %	50 %	0 %	0 %	383842838
28	NC_017062	AT	3	6	17730	17735	50 %	50 %	0 %	0 %	383842838
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30	NC_017062	CT	4	8	20337	20344	0 %	50 %	0 %	50 %	383842840
31	NC_017062	CT	3	6	20459	20464	0 %	50 %	0 %	50 %	383842840
32	NC_017062	TA	3	6	20552	20557	50 %	50 %	0 %	0 %	383842840
33	NC_017062	GA	3	6	20623	20628	50 %	0 %	50 %	0 %	383842840
34	NC_017062	TA	3	6	20794	20799	50 %	50 %	0 %	0 %	383842840
35	NC_017062	AT	3	6	21198	21203	50 %	50 %	0 %	0 %	383842841
36	NC_017062	AT	3	6	21342	21347	50 %	50 %	0 %	0 %	383842841
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39	NC_017062	TA	3	6	22106	22111	50 %	50 %	0 %	0 %	383842842
40	NC_017062	AT	4	8	22149	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	383842842
41	NC_017062	TA	3	6	22208	22213	50 %	50 %	0 %	0 %	383842842
42	NC_017062	AT	3	6	22360	22365	50 %	50 %	0 %	0 %	383842842
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52	NC_017062	AT	3	6	31884	31889	50 %	50 %	0 %	0 %	383842850
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63	NC_017062	AT	3	6	37845	37850	50 %	50 %	0 %	0 %	383842852
64	NC_017062	TA	3	6	37959	37964	50 %	50 %	0 %	0 %	383842852
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113	NC_017062	AT	3	6	63798	63803	50 %	50 %	0 %	0 %	383842871
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