MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017061	TTTGAA	2	12	17423	17434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017061	TCATAT	2	12	65776	65787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017061	AGTCAA	2	12	102431	102442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017061	AGGTAT	2	12	167114	167125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017061	AGGTAT	2	12	173046	173057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017061	GAGAAT	2	12	270679	270690	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017061	GATGGT	2	12	296826	296837	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017061	GATAAA	2	12	319398	319409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017061	ATTGAT	2	12	320805	320816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017061	ATATCA	2	12	335659	335670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017061	TGATAA	2	12	387933	387944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017061	TTTTTC	2	12	420249	420260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017061	AATAAA	2	12	446120	446131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017061	TCATAT	2	12	463003	463014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017061	CTTCCC	2	12	494706	494717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017061	TAAAGA	2	12	495946	495957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017061	ATGTGA	2	12	548778	548789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017061	ACTTTT	2	12	601149	601160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017061	AAAAGG	2	12	616751	616762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017061	TCAATC	2	12	639666	639677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017061	CTTTCT	2	12	651914	651925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017061	TTTCTC	2	12	671847	671858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017061	CAATCC	2	12	682306	682317	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017061	CCAATA	2	12	690726	690737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017061	AAATGA	2	12	698857	698868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017061	AAAACT	2	12	711205	711216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017061	GTTTAC	2	12	728510	728521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017061	GGCGGG	2	12	733205	733216	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017061	AGGGCC	2	12	734834	734845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017061	ACAAAA	2	12	735383	735394	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017061	ATTTTT	2	12	741777	741788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017061	TTTTTC	2	12	792650	792661	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017061	GGATTT	2	12	804882	804893	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017061	TAAAAA	2	12	806701	806712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017061	TCATTT	2	12	835981	835992	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017061	CTTTTT	2	12	844455	844466	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017061	TTATAT	2	12	866824	866835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017061	GTGCTG	2	12	869675	869686	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017061	CATCTT	2	12	871526	871537	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017061	CCTTTC	2	12	908932	908943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017061	CGGCAG	2	12	1010781	1010792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017061	TCTTTT	2	12	1010863	1010874	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017061	ATGCTC	2	12	1010989	1011000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017061	ATAATG	2	12	1021590	1021601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017061	TCTTTT	2	12	1027712	1027723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017061	GAAAAG	2	12	1036178	1036189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017061	TTACTA	2	12	1041338	1041349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017061	CTTTTT	2	12	1144433	1144444	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017061	GGCTGC	2	12	1146461	1146472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017061	TTTTTA	2	12	1158675	1158686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017061	ATAAAA	2	12	1161170	1161181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017061	AAAAAT	2	12	1165690	1165701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017061	TTAATT	2	12	1165955	1165966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017061	ATAAAA	2	12	1170338	1170349	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017061	AAAAGG	2	12	1171001	1171012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017061	ATAAGG	2	12	1176262	1176273	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017061	TGAAAT	2	12	1194342	1194353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017061	GTTAAC	2	12	1232228	1232239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017061	TAATTG	2	12	1363512	1363523	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017061	ATCATT	2	12	1376964	1376975	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017061	ATCATT	2	12	1380202	1380213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017061	ATAAAA	2	12	1492418	1492429	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017061	AATAAA	2	12	1528552	1528563	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017061	ACAAAA	2	12	1528613	1528624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017061	AATAAA	2	12	1529849	1529860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017061	CTTTTT	2	12	1580773	1580784	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017061	TCCGGT	2	12	1658723	1658734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017061	TTTGTT	2	12	1732964	1732975	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017061	TAATTA	2	12	1865527	1865538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017061	CATTAA	2	12	1868805	1868816	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017061	TTTCTT	2	12	1900832	1900843	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017061	CTATTT	2	12	1908817	1908828	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017061	AAAAAG	2	12	1920265	1920276	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017061	CTTAAA	2	12	1922949	1922960	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017061	AATAAA	2	12	1923116	1923127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017061	AATAAA	2	12	1926861	1926872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017061	ATCTTC	2	12	1938541	1938552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017061	AATAAA	2	12	1939011	1939022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017061	AATAAA	2	12	1940755	1940766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017061	ATAAAA	2	12	1948118	1948129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017061	AATAAA	2	12	1959715	1959726	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017061	ATAAAA	2	12	1960154	1960165	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017061	AATAAA	2	12	1974470	1974481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017061	ATTTTT	2	12	1987227	1987238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017061	AATAAA	2	12	1989414	1989425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017061	CACATT	2	12	1989823	1989834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017061	GAGATA	2	12	1994950	1994961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017061	CTTGAT	2	12	1995608	1995619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017061	AGATGA	2	12	1995821	1995832	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017061	GAAAGC	2	12	2003999	2004010	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017061	AACAAA	2	12	2028163	2028174	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017061	TAAAAA	2	12	2046643	2046654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017061	CTCTAT	2	12	2078935	2078946	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017061	GTCATT	2	12	2081735	2081746	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017061	CTTTAT	2	12	2166980	2166991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017061	ATAAAA	2	12	2187285	2187296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017061	AAGAGA	2	12	2187362	2187373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017061	GAAAAA	2	12	2224429	2224440	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017061	CTTTTT	2	12	2228845	2228856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017061	TTTCCT	2	12	2275421	2275432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017061	AAATAA	2	12	2319951	2319962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017061	AATGAA	2	12	2322984	2322995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017061	TACATT	2	12	2329879	2329890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017061	GAAAAA	2	12	2330477	2330488	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017061	TATATT	2	12	2330598	2330609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017061	ATAAAA	2	12	2332861	2332872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017061	ATCAAA	2	12	2433782	2433793	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017061	GGAGCG	2	12	2438293	2438304	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017061	ATAAAA	2	12	2585882	2585893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017061	CGTCAT	2	12	2601037	2601048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017061	ATATTT	2	12	2605129	2605140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017061	AACGGA	2	12	2626032	2626043	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017061	CAATCT	2	12	2649256	2649267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017061	TTCTAA	2	12	2707620	2707631	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017061	TGACTT	2	12	2733741	2733752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017061	GAAGCA	2	12	2755585	2755596	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017061	AATAAA	2	12	2772078	2772089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017061	ATTTTT	2	12	2826712	2826723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017061	ACAGGA	2	12	2836858	2836869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017061	GAATAA	2	12	2846113	2846124	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017061	GAATCA	2	12	2936881	2936892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017061	ACGCAA	2	12	2948831	2948842	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017061	CTCTTT	2	12	3011703	3011714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017061	CTTATA	2	12	3024804	3024815	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017061	TTTAAG	2	12	3038508	3038519	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017061	CAGAGA	2	12	3039162	3039173	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017061	TCTTTG	2	12	3041246	3041257	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017061	GGAAAA	2	12	3056636	3056647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017061	CTTATC	2	12	3108266	3108277	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017061	CTAAAA	2	12	3150132	3150143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017061	TGATGT	2	12	3193050	3193061	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_017061	CCGCGG	2	12	3322078	3322089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.