MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2

Total Repeats: 3374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017061	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017061	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384263632
3	NC_017061	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017061	AATTT	2	10	2271	2280	40 %	60 %	0 %	0 %	384263633
5	NC_017061	AGTGA	2	10	4542	4551	40 %	20 %	40 %	0 %	384263635
6	NC_017061	TTGCA	2	10	5643	5652	20 %	40 %	20 %	20 %	384263637
7	NC_017061	GGGAC	2	10	6184	6193	20 %	0 %	60 %	20 %	384263637
8	NC_017061	TTCGG	2	10	7330	7339	0 %	40 %	40 %	20 %	384263638
9	NC_017061	ACGAT	2	10	8663	8672	40 %	20 %	20 %	20 %	384263638
10	NC_017061	TCGTG	2	10	10837	10846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017061	GGACG	2	10	11712	11721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017061	CTTCA	2	10	15393	15402	20 %	40 %	0 %	40 %	384263639
13	NC_017061	AATAA	2	10	15710	15719	80 %	20 %	0 %	0 %	384263639
14	NC_017061	CCTTT	2	10	15764	15773	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017061	CTGAA	2	10	16684	16693	40 %	20 %	20 %	20 %	384263640
16	NC_017061	AAGAG	2	10	17231	17240	60 %	0 %	40 %	0 %	384263640
17	NC_017061	AGCAC	2	10	18296	18305	40 %	0 %	20 %	40 %	384263641
18	NC_017061	CGGAA	2	10	18308	18317	40 %	0 %	40 %	20 %	384263641
19	NC_017061	AGAGA	2	10	20943	20952	60 %	0 %	40 %	0 %	384263644
20	NC_017061	CCAAG	2	10	21857	21866	40 %	0 %	20 %	40 %	384263644
21	NC_017061	ATCTG	2	10	22423	22432	20 %	40 %	20 %	20 %	384263645
22	NC_017061	CCCGC	2	10	22888	22897	0 %	0 %	20 %	80 %	384263645
23	NC_017061	GAAAT	2	10	23411	23420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017061	ACTCC	2	10	24820	24829	20 %	20 %	0 %	60 %	384263647
25	NC_017061	GTTTT	2	10	25784	25793	0 %	80 %	20 %	0 %	384263648
26	NC_017061	ATGAC	2	10	30006	30015	40 %	20 %	20 %	20 %	384263652
27	NC_017061	AGGCA	2	10	30691	30700	40 %	0 %	40 %	20 %	384263654
28	NC_017061	GAAGC	2	10	30883	30892	40 %	0 %	40 %	20 %	384263654
29	NC_017061	TTGCT	2	10	31025	31034	0 %	60 %	20 %	20 %	384263655
30	NC_017061	TCGTG	2	10	32575	32584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017061	GGACG	2	10	33450	33459	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017061	ACAAA	2	10	36549	36558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017061	AAGAA	2	10	37208	37217	80 %	0 %	20 %	0 %	384263656
34	NC_017061	TGCTC	2	10	37445	37454	0 %	40 %	20 %	40 %	384263656
35	NC_017061	AAAGA	2	10	37852	37861	80 %	0 %	20 %	0 %	384263657
36	NC_017061	CTGAT	2	10	37888	37897	20 %	40 %	20 %	20 %	384263657
37	NC_017061	TGTGC	2	10	40539	40548	0 %	40 %	40 %	20 %	384263659
38	NC_017061	GAAAA	2	10	41839	41848	80 %	0 %	20 %	0 %	384263662
39	NC_017061	GCAGA	2	10	43823	43832	40 %	0 %	40 %	20 %	384263664
40	NC_017061	GCGAT	2	10	46825	46834	20 %	20 %	40 %	20 %	384263669
41	NC_017061	TGACA	2	10	49002	49011	40 %	20 %	20 %	20 %	384263670
42	NC_017061	AGATC	2	10	50639	50648	40 %	20 %	20 %	20 %	384263671
43	NC_017061	TCAAA	2	10	51656	51665	60 %	20 %	0 %	20 %	384263672
44	NC_017061	TTTTG	2	10	54144	54153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017061	TGAAG	2	10	58470	58479	40 %	20 %	40 %	0 %	384263681
46	NC_017061	AAGCA	2	10	58524	58533	60 %	0 %	20 %	20 %	384263681
47	NC_017061	AACAC	2	10	61410	61419	60 %	0 %	0 %	40 %	384263685
48	NC_017061	TTTGC	2	10	63442	63451	0 %	60 %	20 %	20 %	384263686
49	NC_017061	AACGG	2	10	63671	63680	40 %	0 %	40 %	20 %	384263686
50	NC_017061	TAAAG	2	10	65109	65118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017061	CGGCG	2	10	66194	66203	0 %	0 %	60 %	40 %	384263688
52	NC_017061	ATGAT	2	10	66319	66328	40 %	40 %	20 %	0 %	384263688
53	NC_017061	GACGG	2	10	66657	66666	20 %	0 %	60 %	20 %	384263688
54	NC_017061	GGAGA	2	10	68907	68916	40 %	0 %	60 %	0 %	384263689
55	NC_017061	GAAAG	2	10	71453	71462	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017061	GGCCT	2	10	72073	72082	0 %	20 %	40 %	40 %	384263695
57	NC_017061	TTTCA	2	10	72215	72224	20 %	60 %	0 %	20 %	384263695
58	NC_017061	GTTCG	2	10	73341	73350	0 %	40 %	40 %	20 %	384263695
59	NC_017061	TTATT	2	10	78039	78048	20 %	80 %	0 %	0 %	384263700
60	NC_017061	TGAAG	2	10	82545	82554	40 %	20 %	40 %	0 %	384263703
61	NC_017061	CGGAG	2	10	83073	83082	20 %	0 %	60 %	20 %	384263704
62	NC_017061	GATCA	2	10	83458	83467	40 %	20 %	20 %	20 %	384263704
63	NC_017061	TAAAA	2	10	83796	83805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017061	CGGAA	2	10	84097	84106	40 %	0 %	40 %	20 %	384263705
65	NC_017061	AGAGC	2	10	85547	85556	40 %	0 %	40 %	20 %	384263706
66	NC_017061	GGCCG	2	10	89284	89293	0 %	0 %	60 %	40 %	384263711
67	NC_017061	TCGTG	2	10	92605	92614	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017061	GGACG	2	10	93306	93315	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017061	TCGTG	2	10	98430	98439	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017061	GGACG	2	10	99189	99198	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017061	GGGAC	2	10	104007	104016	20 %	0 %	60 %	20 %	384263715
72	NC_017061	TCAAA	2	10	104163	104172	60 %	20 %	0 %	20 %	384263715
73	NC_017061	GAACA	2	10	104892	104901	60 %	0 %	20 %	20 %	384263716
74	NC_017061	AAATG	2	10	107890	107899	60 %	20 %	20 %	0 %	384263717
75	NC_017061	CGGAA	2	10	109135	109144	40 %	0 %	40 %	20 %	384263718
76	NC_017061	CCGTA	2	10	110008	110017	20 %	20 %	20 %	40 %	384263719
77	NC_017061	GAAAA	2	10	114151	114160	80 %	0 %	20 %	0 %	384263723
78	NC_017061	CGGAA	2	10	114330	114339	40 %	0 %	40 %	20 %	384263723
79	NC_017061	GTTTG	2	10	115577	115586	0 %	60 %	40 %	0 %	384263724
80	NC_017061	TGAAT	2	10	119263	119272	40 %	40 %	20 %	0 %	384263731
81	NC_017061	TTACG	2	10	120940	120949	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017061	TAAAA	2	10	121580	121589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017061	TTGAA	2	10	121660	121669	40 %	40 %	20 %	0 %	384263735
84	NC_017061	GTGAA	2	10	126643	126652	40 %	20 %	40 %	0 %	384263738
85	NC_017061	ACCGG	2	10	127482	127491	20 %	0 %	40 %	40 %	384263738
86	NC_017061	GAAGA	2	10	128325	128334	60 %	0 %	40 %	0 %	384263738
87	NC_017061	CAAAG	2	10	128595	128604	60 %	0 %	20 %	20 %	384263738
88	NC_017061	GTGCT	2	10	129139	129148	0 %	40 %	40 %	20 %	384263738
89	NC_017061	CTGAC	2	10	129679	129688	20 %	20 %	20 %	40 %	384263738
90	NC_017061	GTCCT	2	10	129916	129925	0 %	40 %	20 %	40 %	384263738
91	NC_017061	CAATT	2	10	132159	132168	40 %	40 %	0 %	20 %	384263742
92	NC_017061	CTGAA	2	10	132390	132399	40 %	20 %	20 %	20 %	384263742
93	NC_017061	AAATG	2	10	133402	133411	60 %	20 %	20 %	0 %	384263742
94	NC_017061	GAGGG	2	10	135760	135769	20 %	0 %	80 %	0 %	384263744
95	NC_017061	CAAAA	2	10	136388	136397	80 %	0 %	0 %	20 %	384263745
96	NC_017061	AATCA	2	10	137715	137724	60 %	20 %	0 %	20 %	384263747
97	NC_017061	TGGTA	2	10	140077	140086	20 %	40 %	40 %	0 %	384263752
98	NC_017061	AAAGT	2	10	140992	141001	60 %	20 %	20 %	0 %	384263754
99	NC_017061	CAAAC	2	10	144988	144997	60 %	0 %	0 %	40 %	384263764
100	NC_017061	TAAAT	2	10	147837	147846	60 %	40 %	0 %	0 %	384263768
101	NC_017061	AAACA	2	10	149407	149416	80 %	0 %	0 %	20 %	384263772
102	NC_017061	TTATC	2	10	150489	150498	20 %	60 %	0 %	20 %	384263773
103	NC_017061	TTAAA	2	10	152168	152177	60 %	40 %	0 %	0 %	384263775
104	NC_017061	CGTTT	2	10	153512	153521	0 %	60 %	20 %	20 %	384263777
105	NC_017061	ATGGA	2	10	153579	153588	40 %	20 %	40 %	0 %	384263777
106	NC_017061	CGAAG	2	10	154639	154648	40 %	0 %	40 %	20 %	384263778
107	NC_017061	GCACC	2	10	154668	154677	20 %	0 %	20 %	60 %	384263778
108	NC_017061	TTGTG	2	10	154813	154822	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017061	TGCTT	2	10	155592	155601	0 %	60 %	20 %	20 %	384263780
110	NC_017061	ATTCC	2	10	156415	156424	20 %	40 %	0 %	40 %	384263781
111	NC_017061	CGGCC	2	10	159623	159632	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017061	TTTTC	2	10	160325	160334	0 %	80 %	0 %	20 %	384263787
113	NC_017061	TCGTG	2	10	163079	163088	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017061	GGACG	2	10	163780	163789	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017061	TACAT	2	10	167341	167350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017061	TCGTG	2	10	169012	169021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017061	GGACG	2	10	169712	169721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017061	TACAT	2	10	173273	173282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017061	TCGTG	2	10	174947	174956	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017061	GGACG	2	10	175648	175657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017061	TTTGC	2	10	178796	178805	0 %	60 %	20 %	20 %	384263789
122	NC_017061	ATTAT	2	10	181206	181215	40 %	60 %	0 %	0 %	384263790
123	NC_017061	TTGAA	2	10	181856	181865	40 %	40 %	20 %	0 %	384263791
124	NC_017061	GCGAT	2	10	181898	181907	20 %	20 %	40 %	20 %	384263791
125	NC_017061	CGGAC	2	10	182620	182629	20 %	0 %	40 %	40 %	384263792
126	NC_017061	AATGG	2	10	182824	182833	40 %	20 %	40 %	0 %	384263792
127	NC_017061	TTTTC	2	10	183491	183500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017061	TTCCT	2	10	183559	183568	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017061	TGGCT	2	10	185967	185976	0 %	40 %	40 %	20 %	384263794
130	NC_017061	GCGGA	2	10	186462	186471	20 %	0 %	60 %	20 %	384263795
131	NC_017061	CTTTT	2	10	187993	188002	0 %	80 %	0 %	20 %	384263797
132	NC_017061	TCCGA	2	10	188154	188163	20 %	20 %	20 %	40 %	384263797
133	NC_017061	TCCTT	2	10	189853	189862	0 %	60 %	0 %	40 %	384263798
134	NC_017061	TTTTG	2	10	193639	193648	0 %	80 %	20 %	0 %	384263801
135	NC_017061	CTGAA	2	10	194377	194386	40 %	20 %	20 %	20 %	384263801
136	NC_017061	ATCAG	2	10	196843	196852	40 %	20 %	20 %	20 %	384263803
137	NC_017061	GATGA	2	10	198796	198805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017061	TAAAA	2	10	199111	199120	80 %	20 %	0 %	0 %	384263805
139	NC_017061	CCGTT	2	10	199569	199578	0 %	40 %	20 %	40 %	384263806
140	NC_017061	AAGAT	2	10	200667	200676	60 %	20 %	20 %	0 %	384263807
141	NC_017061	CTGAG	2	10	202200	202209	20 %	20 %	40 %	20 %	384263809
142	NC_017061	AGTGA	2	10	202583	202592	40 %	20 %	40 %	0 %	384263809
143	NC_017061	CATTG	2	10	202805	202814	20 %	40 %	20 %	20 %	384263810
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145	NC_017061	ATGAA	2	10	205314	205323	60 %	20 %	20 %	0 %	384263811
146	NC_017061	AACAA	2	10	205593	205602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017061	CTGCA	2	10	207737	207746	20 %	20 %	20 %	40 %	384263812
148	NC_017061	AGTAC	2	10	208080	208089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017061	GAAAG	2	10	208515	208524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017061	TTAGA	2	10	208525	208534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017061	TCATT	2	10	213457	213466	20 %	60 %	0 %	20 %	384263815
152	NC_017061	CTTGG	2	10	213813	213822	0 %	40 %	40 %	20 %	384263816
153	NC_017061	GGATC	2	10	216259	216268	20 %	20 %	40 %	20 %	384263818
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155	NC_017061	AATTT	2	10	219309	219318	40 %	60 %	0 %	0 %	384263822
156	NC_017061	CTTTG	2	10	219503	219512	0 %	60 %	20 %	20 %	384263822
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158	NC_017061	TTTTA	2	10	224066	224075	20 %	80 %	0 %	0 %	384263827
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161	NC_017061	ATTGG	2	10	227637	227646	20 %	40 %	40 %	0 %	384263832
162	NC_017061	ATCGT	2	10	229745	229754	20 %	40 %	20 %	20 %	384263834
163	NC_017061	ACAAA	2	10	230596	230605	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017061	AAATT	2	10	232754	232763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017061	AAATG	2	10	234923	234932	60 %	20 %	20 %	0 %	384263838
166	NC_017061	CATGG	2	10	235185	235194	20 %	20 %	40 %	20 %	384263838
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172	NC_017061	TGAAG	2	10	238428	238437	40 %	20 %	40 %	0 %	384263841
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176	NC_017061	CGTTC	2	10	240311	240320	0 %	40 %	20 %	40 %	384263842
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178	NC_017061	AGATT	2	10	245185	245194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017061	ACGGT	2	10	247720	247729	20 %	20 %	40 %	20 %	384263851
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182	NC_017061	AATAA	2	10	250015	250024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017061	CGGAA	2	10	262213	262222	40 %	0 %	40 %	20 %	384263866
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500	NC_017061	AGGAA	2	10	664771	664780	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

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