MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2

Total Repeats: 1718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017061	TAAA	2	8	9718	9725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017061	AGTC	2	8	9744	9751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017061	CCTG	2	8	9887	9894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017061	GTGA	2	8	10169	10176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017061	AGCC	2	8	11223	11230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017061	AAGC	2	8	11748	11755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017061	CACG	2	8	12444	12451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017061	GCGA	2	8	13232	13239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017061	TAGG	2	8	13807	13814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017061	CGGG	2	8	13903	13910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017061	ATCG	2	8	14568	14575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017061	ATGA	2	8	17467	17474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017061	AAGA	2	8	18826	18833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017061	ATCT	2	8	18903	18910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017061	TGAA	2	8	26368	26375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017061	ATTT	2	8	27623	27630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017061	TAAG	2	8	27729	27736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017061	GGAA	2	8	27791	27798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017061	ATCA	2	8	27901	27908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017061	ATAA	2	8	30075	30082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017061	TAAA	2	8	31456	31463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017061	AGTC	2	8	31482	31489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017061	CCTG	2	8	31625	31632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017061	GTGA	2	8	31907	31914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017061	AGCC	2	8	32961	32968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017061	AAGC	2	8	33486	33493	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017061	CACG	2	8	34182	34189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017061	GCGA	2	8	34970	34977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017061	TAGG	2	8	35545	35552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017061	CGGG	2	8	35641	35648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017061	ATCG	2	8	36306	36313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017061	ATGA	2	8	36667	36674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017061	TCGT	2	8	36815	36822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017061	AATA	2	8	36989	36996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017061	AATG	2	8	40928	40935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017061	TTGT	2	8	46367	46374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017061	AGTA	2	8	46391	46398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017061	TTTA	2	8	46573	46580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017061	ATAG	2	8	46635	46642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017061	CTTC	2	8	49634	49641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017061	GCAA	2	8	51112	51119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017061	ATTC	2	8	52658	52665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017061	TGTA	2	8	56853	56860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017061	CCCG	2	8	60506	60513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017061	GAGG	2	8	60559	60566	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017061	ATAA	2	8	61142	61149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017061	TTTA	2	8	70612	70619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017061	AAAC	2	8	70629	70636	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017061	GCCG	2	8	75847	75854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017061	CTGC	2	8	77909	77916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017061	TAAA	2	8	91486	91493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017061	AGTC	2	8	91512	91519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017061	CCTG	2	8	91655	91662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017061	GTGA	2	8	91937	91944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017061	AGCC	2	8	92991	92998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017061	AAGC	2	8	93342	93349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017061	CACG	2	8	94038	94045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017061	GCGA	2	8	94826	94833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017061	TAGG	2	8	95401	95408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017061	CGGG	2	8	95497	95504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017061	ATCG	2	8	96162	96169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017061	GATA	2	8	96737	96744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017061	CATT	2	8	96926	96933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017061	TAAA	2	8	97312	97319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017061	AGTC	2	8	97338	97345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017061	CCTG	2	8	97481	97488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017061	GTGA	2	8	97763	97770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017061	AGCC	2	8	98816	98823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017061	AAGC	2	8	99225	99232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017061	CACG	2	8	99921	99928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017061	GCGA	2	8	100709	100716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017061	TAGG	2	8	101284	101291	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017061	CGGG	2	8	101380	101387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017061	ATCG	2	8	102045	102052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017061	AGAA	2	8	113556	113563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017061	TCTA	2	8	117593	117600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017061	AATG	2	8	118334	118341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017061	GGGA	2	8	118862	118869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017061	AGCT	2	8	119497	119504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017061	TCAT	2	8	119515	119522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017061	TCTT	2	8	122862	122869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017061	TGAT	2	8	126509	126516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017061	AAAT	2	8	131118	131125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017061	GCTT	2	8	133812	133819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017061	TAAA	2	8	136212	136219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017061	AAAT	2	8	141842	141849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017061	AAGG	2	8	142194	142201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017061	ATCA	2	8	148468	148475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017061	TTAT	2	8	149837	149844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017061	GTAT	2	8	154776	154783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017061	TTGT	2	8	155823	155830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017061	TGGC	2	8	157244	157251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017061	GGGA	2	8	157744	157751	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017061	TCCT	2	8	160201	160208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017061	TAAA	2	8	161960	161967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017061	AGTC	2	8	161986	161993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017061	CCTG	2	8	162129	162136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017061	GTGA	2	8	162411	162418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017061	AGCC	2	8	163465	163472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017061	AAGC	2	8	163816	163823	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017061	CACG	2	8	164512	164519	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017061	GCGA	2	8	165300	165307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017061	TAGG	2	8	165874	165881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017061	CGGG	2	8	165970	165977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017061	ATCG	2	8	166635	166642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017061	TAAT	2	8	167178	167185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017061	AATA	2	8	167293	167300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017061	ATTG	2	8	167459	167466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017061	TAAA	2	8	167896	167903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017061	AGTC	2	8	167922	167929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017061	CCTG	2	8	168065	168072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017061	GTGA	2	8	168345	168352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017061	AGCC	2	8	169397	169404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017061	AAGC	2	8	169748	169755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017061	CACG	2	8	170444	170451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017061	GCGA	2	8	171232	171239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017061	TAGG	2	8	171806	171813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017061	CGGG	2	8	171902	171909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017061	ATCG	2	8	172567	172574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017061	TAAT	2	8	173110	173117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017061	AATA	2	8	173225	173232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017061	ATTG	2	8	173391	173398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017061	TAAA	2	8	173828	173835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017061	AGTC	2	8	173854	173861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017061	CCTG	2	8	173997	174004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017061	GTGA	2	8	174279	174286	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017061	AGCC	2	8	175333	175340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017061	AAGC	2	8	175684	175691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017061	CACG	2	8	176380	176387	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017061	GCGA	2	8	177168	177175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017061	TAGG	2	8	177743	177750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017061	CGGG	2	8	177839	177846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017061	ATCG	2	8	178504	178511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017061	AAGA	2	8	180148	180155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017061	TTAT	2	8	183501	183508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017061	GCCT	2	8	183611	183618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017061	AATG	2	8	185197	185204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017061	GAAT	2	8	190004	190011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017061	CATT	2	8	191658	191665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017061	AAAT	2	8	191698	191705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017061	TCCC	2	8	196285	196292	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_017061	CCTG	2	8	200483	200490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017061	GCTT	2	8	208193	208200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017061	GAAA	2	8	208351	208358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017061	ATTT	2	8	211548	211555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017061	AATC	2	8	211828	211835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017061	AGGG	2	8	227132	227139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017061	ATGA	2	8	230397	230404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017061	AATG	2	8	230493	230500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017061	TTTC	2	8	230538	230545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017061	TTTA	2	8	231470	231477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017061	TGAG	2	8	232733	232740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017061	AAAT	2	8	233020	233027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017061	AATT	2	8	311085	311092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_017061	GAAT	2	8	1100108	1100115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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