MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 1477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017060	CTGG	2	8	342	349	0 %	25 %	50 %	25 %	384527588
2	NC_017060	CAGC	2	8	417	424	25 %	0 %	25 %	50 %	384527588
3	NC_017060	ATGA	2	8	1372	1379	50 %	25 %	25 %	0 %	384527588
4	NC_017060	TCCA	2	8	2107	2114	25 %	25 %	0 %	50 %	384527589
5	NC_017060	GCCA	2	8	2544	2551	25 %	0 %	25 %	50 %	384527589
6	NC_017060	TGCG	2	8	2848	2855	0 %	25 %	50 %	25 %	384527589
7	NC_017060	CCAG	2	8	3008	3015	25 %	0 %	25 %	50 %	384527589
8	NC_017060	TGTT	2	8	3103	3110	0 %	75 %	25 %	0 %	384527589
9	NC_017060	GCCC	2	8	3198	3205	0 %	0 %	25 %	75 %	384527589
10	NC_017060	GACG	2	8	3297	3304	25 %	0 %	50 %	25 %	384527589
11	NC_017060	TATT	2	8	3807	3814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017060	CGTC	2	8	4089	4096	0 %	25 %	25 %	50 %	384527590
13	NC_017060	GCAG	2	8	5058	5065	25 %	0 %	50 %	25 %	384527590
14	NC_017060	TCAG	2	8	5546	5553	25 %	25 %	25 %	25 %	384527591
15	NC_017060	ATGC	2	8	5827	5834	25 %	25 %	25 %	25 %	384527591
16	NC_017060	TGAT	2	8	5837	5844	25 %	50 %	25 %	0 %	384527591
17	NC_017060	ACGC	2	8	6181	6188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017060	GTCT	2	8	7800	7807	0 %	50 %	25 %	25 %	384527593
19	NC_017060	ACGG	2	8	7850	7857	25 %	0 %	50 %	25 %	384527593
20	NC_017060	CAGC	2	8	8117	8124	25 %	0 %	25 %	50 %	384527593
21	NC_017060	CTGG	2	8	8148	8155	0 %	25 %	50 %	25 %	384527593
22	NC_017060	CTGC	2	8	8336	8343	0 %	25 %	25 %	50 %	384527593
23	NC_017060	AGCC	2	8	8719	8726	25 %	0 %	25 %	50 %	384527594
24	NC_017060	CGCT	2	8	8754	8761	0 %	25 %	25 %	50 %	384527594
25	NC_017060	CTGA	2	8	9423	9430	25 %	25 %	25 %	25 %	384527594
26	NC_017060	CAGC	2	8	9595	9602	25 %	0 %	25 %	50 %	384527595
27	NC_017060	CCAC	2	8	10085	10092	25 %	0 %	0 %	75 %	384527596
28	NC_017060	AAAT	2	8	10160	10167	75 %	25 %	0 %	0 %	384527596
29	NC_017060	CATG	2	8	10781	10788	25 %	25 %	25 %	25 %	384527597
30	NC_017060	ATTT	2	8	10930	10937	25 %	75 %	0 %	0 %	384527597
31	NC_017060	GGCG	2	8	11046	11053	0 %	0 %	75 %	25 %	384527597
32	NC_017060	TGGC	2	8	11382	11389	0 %	25 %	50 %	25 %	384527597
33	NC_017060	GGAA	2	8	11468	11475	50 %	0 %	50 %	0 %	384527597
34	NC_017060	GCTG	2	8	11632	11639	0 %	25 %	50 %	25 %	384527597
35	NC_017060	CCAT	2	8	11902	11909	25 %	25 %	0 %	50 %	384527598
36	NC_017060	GAGT	2	8	11983	11990	25 %	25 %	50 %	0 %	384527598
37	NC_017060	TGGC	2	8	12033	12040	0 %	25 %	50 %	25 %	384527598
38	NC_017060	GGCA	2	8	12492	12499	25 %	0 %	50 %	25 %	384527598
39	NC_017060	TCCA	2	8	12546	12553	25 %	25 %	0 %	50 %	384527598
40	NC_017060	CGCC	2	8	12816	12823	0 %	0 %	25 %	75 %	384527598
41	NC_017060	CATC	2	8	13210	13217	25 %	25 %	0 %	50 %	384527598
42	NC_017060	GCTC	2	8	13249	13256	0 %	25 %	25 %	50 %	384527598
43	NC_017060	GTAA	2	8	14570	14577	50 %	25 %	25 %	0 %	384527599
44	NC_017060	GGCT	2	8	15855	15862	0 %	25 %	50 %	25 %	384527601
45	NC_017060	ATCA	2	8	16173	16180	50 %	25 %	0 %	25 %	384527602
46	NC_017060	GCTG	2	8	16403	16410	0 %	25 %	50 %	25 %	384527602
47	NC_017060	GCCA	2	8	18011	18018	25 %	0 %	25 %	50 %	384527603
48	NC_017060	ACCG	2	8	18088	18095	25 %	0 %	25 %	50 %	384527603
49	NC_017060	TGAA	2	8	18143	18150	50 %	25 %	25 %	0 %	384527603
50	NC_017060	CCAG	2	8	18214	18221	25 %	0 %	25 %	50 %	384527603
51	NC_017060	GACC	2	8	18879	18886	25 %	0 %	25 %	50 %	384527603
52	NC_017060	AAGG	2	8	19000	19007	50 %	0 %	50 %	0 %	384527603
53	NC_017060	CTGA	2	8	20038	20045	25 %	25 %	25 %	25 %	384527603
54	NC_017060	CTGC	2	8	20161	20168	0 %	25 %	25 %	50 %	384527603
55	NC_017060	ATAA	2	8	20389	20396	75 %	25 %	0 %	0 %	384527603
56	NC_017060	TTTC	3	12	20593	20604	0 %	75 %	0 %	25 %	384527603
57	NC_017060	TTTC	2	8	20612	20619	0 %	75 %	0 %	25 %	384527603
58	NC_017060	TTAA	2	8	20783	20790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017060	TCAG	2	8	20912	20919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017060	TGCG	2	8	21053	21060	0 %	25 %	50 %	25 %	384527604
61	NC_017060	TGGA	2	8	21089	21096	25 %	25 %	50 %	0 %	384527604
62	NC_017060	TCTT	2	8	21100	21107	0 %	75 %	0 %	25 %	384527604
63	NC_017060	CAGC	2	8	21113	21120	25 %	0 %	25 %	50 %	384527604
64	NC_017060	AAAT	2	8	21856	21863	75 %	25 %	0 %	0 %	384527605
65	NC_017060	TGGC	2	8	22941	22948	0 %	25 %	50 %	25 %	384527606
66	NC_017060	GCCC	2	8	22956	22963	0 %	0 %	25 %	75 %	384527606
67	NC_017060	TGAC	2	8	24344	24351	25 %	25 %	25 %	25 %	384527606
68	NC_017060	GCCC	2	8	24717	24724	0 %	0 %	25 %	75 %	384527607
69	NC_017060	TAAA	2	8	26088	26095	75 %	25 %	0 %	0 %	384527607
70	NC_017060	ATGA	2	8	26194	26201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017060	GCAC	2	8	27362	27369	25 %	0 %	25 %	50 %	384527608
72	NC_017060	GCGT	2	8	29007	29014	0 %	25 %	50 %	25 %	384527610
73	NC_017060	GGCT	2	8	29775	29782	0 %	25 %	50 %	25 %	384527612
74	NC_017060	GATT	2	8	29783	29790	25 %	50 %	25 %	0 %	384527612
75	NC_017060	AGGC	2	8	29962	29969	25 %	0 %	50 %	25 %	384527612
76	NC_017060	TTAT	2	8	30054	30061	25 %	75 %	0 %	0 %	384527613
77	NC_017060	TTGA	2	8	30264	30271	25 %	50 %	25 %	0 %	384527613
78	NC_017060	GCCC	2	8	30401	30408	0 %	0 %	25 %	75 %	384527613
79	NC_017060	TCGT	2	8	31223	31230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017060	CAAT	2	8	31263	31270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017060	TCGG	2	8	31943	31950	0 %	25 %	50 %	25 %	384527614
82	NC_017060	TCAG	2	8	32058	32065	25 %	25 %	25 %	25 %	384527614
83	NC_017060	TGCG	2	8	32151	32158	0 %	25 %	50 %	25 %	384527614
84	NC_017060	TGAT	2	8	32928	32935	25 %	50 %	25 %	0 %	384527615
85	NC_017060	CCGG	2	8	33424	33431	0 %	0 %	50 %	50 %	384527615
86	NC_017060	GAAA	2	8	33517	33524	75 %	0 %	25 %	0 %	384527615
87	NC_017060	GGCA	2	8	34147	34154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017060	CGCC	2	8	34159	34166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017060	TTCA	2	8	34605	34612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017060	TTTC	2	8	35756	35763	0 %	75 %	0 %	25 %	384527617
91	NC_017060	TCAG	2	8	36296	36303	25 %	25 %	25 %	25 %	384527617
92	NC_017060	CTGG	2	8	36705	36712	0 %	25 %	50 %	25 %	384527617
93	NC_017060	CTGT	2	8	36844	36851	0 %	50 %	25 %	25 %	384527617
94	NC_017060	GGCT	2	8	36985	36992	0 %	25 %	50 %	25 %	384527617
95	NC_017060	TTAA	2	8	37072	37079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017060	GTTT	2	8	38198	38205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017060	CTGC	2	8	38802	38809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017060	CTGC	2	8	40305	40312	0 %	25 %	25 %	50 %	384527621
99	NC_017060	CAGC	2	8	40880	40887	25 %	0 %	25 %	50 %	384527621
100	NC_017060	CTGC	2	8	41403	41410	0 %	25 %	25 %	50 %	384527621
101	NC_017060	GGCG	2	8	42020	42027	0 %	0 %	75 %	25 %	384527621
102	NC_017060	CTGC	2	8	42348	42355	0 %	25 %	25 %	50 %	384527621
103	NC_017060	CTGA	2	8	42792	42799	25 %	25 %	25 %	25 %	384527621
104	NC_017060	GGCC	2	8	42922	42929	0 %	0 %	50 %	50 %	384527621
105	NC_017060	ACGG	2	8	43464	43471	25 %	0 %	50 %	25 %	384527622
106	NC_017060	TCAG	2	8	44037	44044	25 %	25 %	25 %	25 %	384527622
107	NC_017060	ACCG	2	8	44306	44313	25 %	0 %	25 %	50 %	384527622
108	NC_017060	CGTG	2	8	44353	44360	0 %	25 %	50 %	25 %	384527622
109	NC_017060	GATG	2	8	44566	44573	25 %	25 %	50 %	0 %	384527622
110	NC_017060	GGCG	2	8	44707	44714	0 %	0 %	75 %	25 %	384527622
111	NC_017060	CTGG	2	8	45253	45260	0 %	25 %	50 %	25 %	384527622
112	NC_017060	AAGC	2	8	45269	45276	50 %	0 %	25 %	25 %	384527622
113	NC_017060	CTGG	2	8	45424	45431	0 %	25 %	50 %	25 %	384527622
114	NC_017060	AGTG	2	8	45592	45599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017060	AGGC	2	8	46047	46054	25 %	0 %	50 %	25 %	384527623
116	NC_017060	ATTT	2	8	46241	46248	25 %	75 %	0 %	0 %	384527623
117	NC_017060	GATT	2	8	46593	46600	25 %	50 %	25 %	0 %	384527623
118	NC_017060	TGGC	2	8	47382	47389	0 %	25 %	50 %	25 %	384527624
119	NC_017060	CCAG	2	8	47462	47469	25 %	0 %	25 %	50 %	384527624
120	NC_017060	TGAC	2	8	47951	47958	25 %	25 %	25 %	25 %	384527625
121	NC_017060	CATC	2	8	48028	48035	25 %	25 %	0 %	50 %	384527625
122	NC_017060	TTCA	2	8	48146	48153	25 %	50 %	0 %	25 %	384527625
123	NC_017060	ACCC	2	8	48632	48639	25 %	0 %	0 %	75 %	384527626
124	NC_017060	GCTG	2	8	49076	49083	0 %	25 %	50 %	25 %	384527626
125	NC_017060	AGTG	2	8	50132	50139	25 %	25 %	50 %	0 %	384527626
126	NC_017060	TGTC	2	8	50466	50473	0 %	50 %	25 %	25 %	384527627
127	NC_017060	TCAG	2	8	50512	50519	25 %	25 %	25 %	25 %	384527627
128	NC_017060	CCCG	2	8	50557	50564	0 %	0 %	25 %	75 %	384527627
129	NC_017060	CAGG	2	8	51036	51043	25 %	0 %	50 %	25 %	384527628
130	NC_017060	TCAG	2	8	51197	51204	25 %	25 %	25 %	25 %	384527628
131	NC_017060	GCAG	2	8	52438	52445	25 %	0 %	50 %	25 %	384527629
132	NC_017060	GATG	2	8	52772	52779	25 %	25 %	50 %	0 %	384527629
133	NC_017060	TTCT	2	8	53271	53278	0 %	75 %	0 %	25 %	384527629
134	NC_017060	CAAA	2	8	53423	53430	75 %	0 %	0 %	25 %	384527629
135	NC_017060	GGCG	2	8	53478	53485	0 %	0 %	75 %	25 %	384527629
136	NC_017060	CAGC	2	8	53513	53520	25 %	0 %	25 %	50 %	384527629
137	NC_017060	TTTC	2	8	53911	53918	0 %	75 %	0 %	25 %	384527630
138	NC_017060	CCAG	2	8	54727	54734	25 %	0 %	25 %	50 %	384527630
139	NC_017060	CCAC	2	8	54804	54811	25 %	0 %	0 %	75 %	384527630
140	NC_017060	TAAT	2	8	55468	55475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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