MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017060	AAT	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017060	ATC	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017060	CCG	2	6	182	187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017060	ATT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017060	TAA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017060	GAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017060	ATG	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017060	CTG	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017060	TGC	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017060	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017060	AAT	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017060	CAT	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017060	GCG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017060	GTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017060	CGA	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017060	GAA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017060	TCA	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017060	TGA	2	6	9516	9521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017060	GAT	2	6	10711	10716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017060	GCA	2	6	13336	13341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017060	CAG	2	6	17925	17930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017060	AAT	2	6	20681	20686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017060	TAT	2	6	20774	20779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017060	GAA	2	6	20865	20870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017060	ATA	2	6	20885	20890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017060	TAA	2	6	21385	21390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017060	TAT	2	6	21431	21436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017060	AGT	2	6	22250	22255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017060	TAA	2	6	22282	22287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017060	CGC	2	6	22288	22293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017060	CAG	2	6	26230	26235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017060	GGC	2	6	26238	26243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017060	AAT	2	6	27503	27508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017060	TGA	2	6	27652	27657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017060	CAT	2	6	27674	27679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017060	TGA	2	6	27746	27751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017060	CAG	2	6	27757	27762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017060	TCC	2	6	31317	31322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017060	ATG	2	6	31329	31334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017060	TAA	2	6	31350	31355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017060	GCC	2	6	33793	33798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017060	CAG	3	9	33829	33837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017060	CGG	2	6	33859	33864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017060	TGC	2	6	33885	33890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017060	CCA	2	6	34077	34082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017060	CGC	2	6	34098	34103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017060	CGT	2	6	34118	34123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017060	CCA	2	6	34141	34146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017060	GGT	3	9	34196	34204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017060	CCG	2	6	34281	34286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017060	GCG	2	6	34303	34308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017060	TGG	2	6	34309	34314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017060	CGG	2	6	34336	34341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017060	TGC	2	6	34352	34357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017060	AGC	3	9	34401	34409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017060	GAA	2	6	34495	34500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017060	GCC	2	6	34530	34535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017060	CGC	2	6	34568	34573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017060	CAG	2	6	34574	34579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017060	AAT	2	6	34591	34596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017060	TGA	2	6	34734	34739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017060	ATC	2	6	35546	35551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017060	TGC	2	6	35559	35564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017060	GCT	2	6	37051	37056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017060	ATG	2	6	37059	37064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017060	ATT	2	6	38011	38016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017060	TAT	3	9	38150	38158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017060	CCG	2	6	38183	38188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017060	GAC	2	6	38646	38651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017060	GCA	2	6	38783	38788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017060	GCA	2	6	45635	45640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017060	GTC	2	6	47585	47590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017060	GTC	2	6	48287	48292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017060	GGT	2	6	52103	52108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017060	TGT	2	6	52121	52126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017060	ATC	2	6	55300	55305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017060	ACT	2	6	55508	55513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017060	GCT	2	6	57770	57775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017060	ATT	2	6	58617	58622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017060	GCA	2	6	58812	58817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017060	TGA	2	6	58825	58830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017060	ATC	2	6	58836	58841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017060	GGA	2	6	58843	58848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017060	CTT	2	6	59335	59340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017060	ATT	2	6	59562	59567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017060	TGA	2	6	59572	59577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017060	CGG	2	6	59623	59628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017060	TTA	2	6	64135	64140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017060	AAT	2	6	64734	64739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017060	ATT	2	6	64757	64762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017060	ACA	2	6	65598	65603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017060	TCG	2	6	65770	65775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017060	TGA	2	6	65785	65790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017060	GAC	3	9	65794	65802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017060	AAG	2	6	65811	65816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017060	CTT	2	6	65877	65882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017060	CTA	2	6	65883	65888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017060	CAC	2	6	65911	65916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017060	ATG	2	6	65989	65994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017060	TGA	2	6	66016	66021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017060	AGC	2	6	68063	68068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017060	TCT	2	6	68097	68102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017060	CCG	2	6	68109	68114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017060	CTT	2	6	68166	68171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017060	GCT	2	6	68269	68274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017060	ATA	2	6	68592	68597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017060	GAA	2	6	68757	68762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017060	ATT	2	6	69530	69535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017060	ATA	2	6	69553	69558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017060	TAA	2	6	69590	69595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017060	ATA	2	6	69715	69720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017060	CCT	2	6	69829	69834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017060	TAC	2	6	69867	69872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017060	AGC	2	6	69914	69919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017060	GGA	2	6	70070	70075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017060	TAA	2	6	70115	70120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017060	CAA	2	6	71191	71196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017060	ATA	2	6	74619	74624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017060	CCG	2	6	74632	74637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017060	TGC	2	6	79085	79090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017060	TGA	2	6	84044	84049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017060	ACC	2	6	84080	84085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017060	ACA	2	6	84125	84130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017060	CAA	2	6	84362	84367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017060	TGC	2	6	84371	84376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017060	CGG	2	6	84380	84385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017060	CGG	2	6	84404	84409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017060	CGG	2	6	84467	84472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017060	CGG	2	6	84482	84487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017060	GCA	2	6	84497	84502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017060	GCA	2	6	84546	84551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017060	CCA	2	6	84600	84605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017060	CAG	2	6	84616	84621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017060	CGC	2	6	84642	84647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017060	GAG	2	6	84795	84800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017060	TTC	2	6	86815	86820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017060	GCG	3	9	86910	86918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017060	AAC	2	6	87061	87066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017060	CGG	2	6	87152	87157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017060	GAA	2	6	87173	87178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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