MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 7023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017060	TGG	2	6	227	232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
2	NC_017060	CGC	2	6	269	274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527588
3	NC_017060	GCC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527588
4	NC_017060	GCG	2	6	335	340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
5	NC_017060	AGC	3	9	422	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527588
6	NC_017060	TTC	2	6	484	489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527588
7	NC_017060	TGC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527588
8	NC_017060	GTG	2	6	775	780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
9	NC_017060	GTG	2	6	832	837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
10	NC_017060	TGA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527588
11	NC_017060	GGC	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
12	NC_017060	CGG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
13	NC_017060	CAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527588
14	NC_017060	GGC	2	6	1206	1211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
15	NC_017060	TGG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
16	NC_017060	GCG	3	9	1337	1345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
17	NC_017060	GAA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527588
18	NC_017060	AGT	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527589
19	NC_017060	GTT	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527589
20	NC_017060	CCA	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
21	NC_017060	TGC	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
22	NC_017060	CCG	3	9	1795	1803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
23	NC_017060	CAT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527589
24	NC_017060	TGC	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
25	NC_017060	GAC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527589
26	NC_017060	GGT	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
27	NC_017060	CCG	2	6	2257	2262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
28	NC_017060	TGT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527589
29	NC_017060	TGC	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
30	NC_017060	GCT	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
31	NC_017060	GGC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
32	NC_017060	CGT	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
33	NC_017060	CGG	2	6	2819	2824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
34	NC_017060	GCC	2	6	2883	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
35	NC_017060	GGT	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
36	NC_017060	CCA	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
37	NC_017060	AGA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527589
38	NC_017060	GGC	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
39	NC_017060	TCA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527589
40	NC_017060	CAC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
41	NC_017060	CGG	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
42	NC_017060	GTC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
43	NC_017060	ATT	2	6	3327	3332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527589
44	NC_017060	GGT	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
45	NC_017060	GTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
46	NC_017060	GCG	2	6	3556	3561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
47	NC_017060	CTG	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
48	NC_017060	GCG	2	6	3604	3609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
49	NC_017060	GTC	2	6	3625	3630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
50	NC_017060	CTG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
51	NC_017060	CAG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527590
52	NC_017060	TGC	3	9	4197	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527590
53	NC_017060	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527590
54	NC_017060	ACA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527590
55	NC_017060	CTC	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527590
56	NC_017060	CAA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527590
57	NC_017060	CGC	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
58	NC_017060	TAC	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527590
59	NC_017060	CCG	2	6	4500	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
60	NC_017060	CGC	2	6	4516	4521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
61	NC_017060	CCT	2	6	4535	4540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527590
62	NC_017060	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527590
63	NC_017060	CCG	2	6	4795	4800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
64	NC_017060	GGT	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527590
65	NC_017060	TGC	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527590
66	NC_017060	TGA	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527590
67	NC_017060	CAC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527590
68	NC_017060	CTT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527590
69	NC_017060	GCC	2	6	5200	5205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
70	NC_017060	ATA	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527590
71	NC_017060	ACG	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527591
72	NC_017060	CAT	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527591
73	NC_017060	CAA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527591
74	NC_017060	CCA	2	6	5952	5957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527591
75	NC_017060	CCG	2	6	5980	5985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527591
76	NC_017060	CTG	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527591
77	NC_017060	GCA	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527591
78	NC_017060	AAG	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527591
79	NC_017060	GCA	2	6	6264	6269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527592
80	NC_017060	CAG	2	6	6277	6282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527592
81	NC_017060	CTT	2	6	6301	6306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527592
82	NC_017060	CTG	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527592
83	NC_017060	GCG	2	6	6333	6338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527592
84	NC_017060	CTT	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527592
85	NC_017060	CAA	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527592
86	NC_017060	CGG	2	6	7665	7670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527593
87	NC_017060	ACG	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527593
88	NC_017060	GCT	2	6	7717	7722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
89	NC_017060	TCC	2	6	7747	7752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527593
90	NC_017060	ACC	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527593
91	NC_017060	GGC	2	6	7951	7956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527593
92	NC_017060	GCA	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527593
93	NC_017060	TGC	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
94	NC_017060	TGC	2	6	8055	8060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
95	NC_017060	GTC	2	6	8243	8248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527593
96	NC_017060	CAG	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527593
97	NC_017060	AGC	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527594
98	NC_017060	TGC	2	6	8693	8698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
99	NC_017060	CGC	2	6	8837	8842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527594
100	NC_017060	GCG	2	6	8911	8916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527594
101	NC_017060	CTG	2	6	8969	8974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
102	NC_017060	ACA	2	6	8977	8982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527594
103	NC_017060	TGG	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527594
104	NC_017060	CTG	2	6	9012	9017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
105	NC_017060	CGG	2	6	9050	9055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527594
106	NC_017060	GCA	2	6	9107	9112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527594
107	NC_017060	AGA	2	6	9128	9133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527594
108	NC_017060	GAT	3	9	9246	9254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527594
109	NC_017060	GAT	2	6	9275	9280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527594
110	NC_017060	TCG	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
111	NC_017060	TGC	2	6	9320	9325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527594
112	NC_017060	CGG	2	6	9638	9643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527595
113	NC_017060	GCA	2	6	9681	9686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527595
114	NC_017060	ACC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527595
115	NC_017060	AAT	2	6	9768	9773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527595
116	NC_017060	GCC	2	6	9845	9850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527595
117	NC_017060	ATG	2	6	10001	10006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527596
118	NC_017060	TAA	2	6	10041	10046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527596
119	NC_017060	GTC	2	6	10073	10078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527596
120	NC_017060	GGC	2	6	10177	10182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527596
121	NC_017060	CAG	2	6	10195	10200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527596
122	NC_017060	CTG	2	6	10313	10318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527596
123	NC_017060	CAA	2	6	10363	10368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527596
124	NC_017060	GAA	2	6	10369	10374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527596
125	NC_017060	CGG	3	9	10437	10445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527596
126	NC_017060	ATG	2	6	10598	10603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527596
127	NC_017060	CCG	2	6	10607	10612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527596
128	NC_017060	CGC	2	6	10623	10628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527596
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130	NC_017060	CCG	2	6	10849	10854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527597
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254	NC_017060	CGT	2	6	18696	18701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527603
255	NC_017060	GCG	2	6	18774	18779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527603
256	NC_017060	TTC	2	6	18802	18807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527603
257	NC_017060	CAT	2	6	18828	18833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527603
258	NC_017060	CGG	2	6	18991	18996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527603
259	NC_017060	TGA	2	6	19020	19025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527603
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269	NC_017060	GCA	2	6	19638	19643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527603
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278	NC_017060	CGG	2	6	20226	20231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527603
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499	NC_017060	GAC	2	6	41379	41384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527621
500	NC_017060	TGA	2	6	41458	41463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527621

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