MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017060	CG	3	6	119	124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017060	GT	3	6	656	661	0 %	50 %	50 %	0 %	384527588
3	NC_017060	GC	3	6	799	804	0 %	0 %	50 %	50 %	384527588
4	NC_017060	CA	3	6	1257	1262	50 %	0 %	0 %	50 %	384527588
5	NC_017060	GA	3	6	2493	2498	50 %	0 %	50 %	0 %	384527589
6	NC_017060	TG	3	6	2725	2730	0 %	50 %	50 %	0 %	384527589
7	NC_017060	CG	3	6	3485	3490	0 %	0 %	50 %	50 %	384527589
8	NC_017060	GC	3	6	5077	5082	0 %	0 %	50 %	50 %	384527590
9	NC_017060	CG	3	6	5137	5142	0 %	0 %	50 %	50 %	384527590
10	NC_017060	TC	3	6	6192	6197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017060	TA	3	6	6618	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017060	GC	3	6	6929	6934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017060	TG	3	6	7185	7190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017060	TG	3	6	7247	7252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017060	AC	3	6	7335	7340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017060	TA	3	6	7525	7530	50 %	50 %	0 %	0 %	384527593
17	NC_017060	GT	3	6	8390	8395	0 %	50 %	50 %	0 %	384527593
18	NC_017060	TA	3	6	8402	8407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017060	CA	3	6	9056	9061	50 %	0 %	0 %	50 %	384527594
20	NC_017060	GT	3	6	9934	9939	0 %	50 %	50 %	0 %	384527595
21	NC_017060	GC	3	6	10287	10292	0 %	0 %	50 %	50 %	384527596
22	NC_017060	CG	3	6	12442	12447	0 %	0 %	50 %	50 %	384527598
23	NC_017060	GT	3	6	12448	12453	0 %	50 %	50 %	0 %	384527598
24	NC_017060	CA	3	6	14224	14229	50 %	0 %	0 %	50 %	384527599
25	NC_017060	TG	3	6	14794	14799	0 %	50 %	50 %	0 %	384527600
26	NC_017060	GA	3	6	16366	16371	50 %	0 %	50 %	0 %	384527602
27	NC_017060	GC	3	6	16565	16570	0 %	0 %	50 %	50 %	384527602
28	NC_017060	CA	3	6	16942	16947	50 %	0 %	0 %	50 %	384527602
29	NC_017060	GC	3	6	17064	17069	0 %	0 %	50 %	50 %	384527602
30	NC_017060	AC	3	6	17211	17216	50 %	0 %	0 %	50 %	384527602
31	NC_017060	GA	3	6	18069	18074	50 %	0 %	50 %	0 %	384527603
32	NC_017060	GT	3	6	19353	19358	0 %	50 %	50 %	0 %	384527603
33	NC_017060	CA	3	6	20148	20153	50 %	0 %	0 %	50 %	384527603
34	NC_017060	GC	3	6	20330	20335	0 %	0 %	50 %	50 %	384527603
35	NC_017060	CG	3	6	20512	20517	0 %	0 %	50 %	50 %	384527603
36	NC_017060	CG	3	6	20572	20577	0 %	0 %	50 %	50 %	384527603
37	NC_017060	GT	3	6	20819	20824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017060	AC	3	6	21202	21207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017060	TA	3	6	22263	22268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017060	GC	3	6	22609	22614	0 %	0 %	50 %	50 %	384527606
41	NC_017060	CG	3	6	23744	23749	0 %	0 %	50 %	50 %	384527606
42	NC_017060	CA	3	6	25365	25370	50 %	0 %	0 %	50 %	384527607
43	NC_017060	AC	3	6	25395	25400	50 %	0 %	0 %	50 %	384527607
44	NC_017060	AG	3	6	25510	25515	50 %	0 %	50 %	0 %	384527607
45	NC_017060	GA	3	6	25907	25912	50 %	0 %	50 %	0 %	384527607
46	NC_017060	AG	3	6	26129	26134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017060	TA	3	6	26182	26187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017060	GT	3	6	27421	27426	0 %	50 %	50 %	0 %	384527608
49	NC_017060	CG	3	6	28411	28416	0 %	0 %	50 %	50 %	384527609
50	NC_017060	TC	3	6	28575	28580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017060	CA	3	6	29297	29302	50 %	0 %	0 %	50 %	384527611
52	NC_017060	GC	3	6	30275	30280	0 %	0 %	50 %	50 %	384527613
53	NC_017060	GC	3	6	30652	30657	0 %	0 %	50 %	50 %	384527613
54	NC_017060	CA	3	6	30742	30747	50 %	0 %	0 %	50 %	384527613
55	NC_017060	AC	3	6	30941	30946	50 %	0 %	0 %	50 %	384527613
56	NC_017060	CA	3	6	31341	31346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017060	GC	3	6	31995	32000	0 %	0 %	50 %	50 %	384527614
58	NC_017060	TC	3	6	32447	32452	0 %	50 %	0 %	50 %	384527615
59	NC_017060	GC	3	6	33159	33164	0 %	0 %	50 %	50 %	384527615
60	NC_017060	CA	3	6	33967	33972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017060	GC	3	6	34796	34801	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
62	NC_017060	CG	4	8	34887	34894	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
63	NC_017060	GC	3	6	34931	34936	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
64	NC_017060	GC	3	6	34967	34972	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
65	NC_017060	CT	3	6	35019	35024	0 %	50 %	0 %	50 %	384527616
66	NC_017060	AC	3	6	35098	35103	50 %	0 %	0 %	50 %	384527616
67	NC_017060	CG	3	6	35299	35304	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
68	NC_017060	GT	3	6	35524	35529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017060	GC	3	6	36872	36877	0 %	0 %	50 %	50 %	384527617
70	NC_017060	AT	3	6	36995	37000	50 %	50 %	0 %	0 %	384527617
71	NC_017060	TG	3	6	37480	37485	0 %	50 %	50 %	0 %	384527618
72	NC_017060	CG	3	6	37764	37769	0 %	0 %	50 %	50 %	384527618
73	NC_017060	CG	3	6	38187	38192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017060	GC	3	6	38808	38813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017060	CG	4	8	39082	39089	0 %	0 %	50 %	50 %	384527620
76	NC_017060	CG	3	6	39443	39448	0 %	0 %	50 %	50 %	384527620
77	NC_017060	GT	3	6	40133	40138	0 %	50 %	50 %	0 %	384527620
78	NC_017060	GC	3	6	40806	40811	0 %	0 %	50 %	50 %	384527621
79	NC_017060	CT	3	6	41055	41060	0 %	50 %	0 %	50 %	384527621
80	NC_017060	TG	3	6	42466	42471	0 %	50 %	50 %	0 %	384527621
81	NC_017060	AC	3	6	43680	43685	50 %	0 %	0 %	50 %	384527622
82	NC_017060	TC	3	6	43890	43895	0 %	50 %	0 %	50 %	384527622
83	NC_017060	GC	3	6	44097	44102	0 %	0 %	50 %	50 %	384527622
84	NC_017060	GC	3	6	44226	44231	0 %	0 %	50 %	50 %	384527622
85	NC_017060	GC	3	6	44553	44558	0 %	0 %	50 %	50 %	384527622
86	NC_017060	GC	3	6	44993	44998	0 %	0 %	50 %	50 %	384527622
87	NC_017060	CA	3	6	45646	45651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017060	AC	3	6	46973	46978	50 %	0 %	0 %	50 %	384527624
89	NC_017060	AC	3	6	47136	47141	50 %	0 %	0 %	50 %	384527624
90	NC_017060	TA	3	6	47571	47576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017060	TA	3	6	48429	48434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017060	GC	3	6	48606	48611	0 %	0 %	50 %	50 %	384527626
93	NC_017060	GC	3	6	48790	48795	0 %	0 %	50 %	50 %	384527626
94	NC_017060	TG	3	6	50309	50314	0 %	50 %	50 %	0 %	384527627
95	NC_017060	AG	3	6	51511	51516	50 %	0 %	50 %	0 %	384527628
96	NC_017060	TG	3	6	51781	51786	0 %	50 %	50 %	0 %	384527628
97	NC_017060	GC	3	6	52178	52183	0 %	0 %	50 %	50 %	384527629
98	NC_017060	GC	3	6	54067	54072	0 %	0 %	50 %	50 %	384527630
99	NC_017060	AC	3	6	55102	55107	50 %	0 %	0 %	50 %	384527630
100	NC_017060	CT	3	6	55788	55793	0 %	50 %	0 %	50 %	384527631
101	NC_017060	CA	3	6	56246	56251	50 %	0 %	0 %	50 %	384527631
102	NC_017060	GT	3	6	56986	56991	0 %	50 %	50 %	0 %	384527632
103	NC_017060	GA	3	6	58879	58884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017060	GC	3	6	60056	60061	0 %	0 %	50 %	50 %	384527636
105	NC_017060	GC	4	8	61757	61764	0 %	0 %	50 %	50 %	384527637
106	NC_017060	CA	3	6	61950	61955	50 %	0 %	0 %	50 %	384527637
107	NC_017060	GC	3	6	62012	62017	0 %	0 %	50 %	50 %	384527637
108	NC_017060	TG	3	6	62269	62274	0 %	50 %	50 %	0 %	384527637
109	NC_017060	TG	3	6	62587	62592	0 %	50 %	50 %	0 %	384527637
110	NC_017060	TA	3	6	62979	62984	50 %	50 %	0 %	0 %	384527637
111	NC_017060	CA	3	6	63536	63541	50 %	0 %	0 %	50 %	384527637
112	NC_017060	CA	3	6	64357	64362	50 %	0 %	0 %	50 %	384527638
113	NC_017060	GC	3	6	64381	64386	0 %	0 %	50 %	50 %	384527638
114	NC_017060	AC	3	6	66025	66030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017060	AC	3	6	66861	66866	50 %	0 %	0 %	50 %	384527641
116	NC_017060	AG	3	6	67071	67076	50 %	0 %	50 %	0 %	384527641
117	NC_017060	GT	3	6	68440	68445	0 %	50 %	50 %	0 %	384527643
118	NC_017060	GA	3	6	68694	68699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017060	TA	3	6	69218	69223	50 %	50 %	0 %	0 %	384527644
120	NC_017060	AG	3	6	69442	69447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017060	TA	3	6	69857	69862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017060	AT	3	6	70144	70149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017060	GA	3	6	70169	70174	50 %	0 %	50 %	0 %	384527645
124	NC_017060	AT	3	6	70581	70586	50 %	50 %	0 %	0 %	384527645
125	NC_017060	AT	3	6	70643	70648	50 %	50 %	0 %	0 %	384527645
126	NC_017060	AT	3	6	71211	71216	50 %	50 %	0 %	0 %	384527646
127	NC_017060	TA	3	6	71538	71543	50 %	50 %	0 %	0 %	384527646
128	NC_017060	TA	3	6	72265	72270	50 %	50 %	0 %	0 %	384527647
129	NC_017060	TC	3	6	72321	72326	0 %	50 %	0 %	50 %	384527647
130	NC_017060	TA	3	6	72830	72835	50 %	50 %	0 %	0 %	384527648
131	NC_017060	AT	3	6	72931	72936	50 %	50 %	0 %	0 %	384527648
132	NC_017060	TG	3	6	73198	73203	0 %	50 %	50 %	0 %	384527648
133	NC_017060	TG	3	6	73208	73213	0 %	50 %	50 %	0 %	384527648
134	NC_017060	AT	4	8	73255	73262	50 %	50 %	0 %	0 %	384527648
135	NC_017060	TA	3	6	73578	73583	50 %	50 %	0 %	0 %	384527648
136	NC_017060	GA	3	6	73685	73690	50 %	0 %	50 %	0 %	384527648
137	NC_017060	AG	3	6	73746	73751	50 %	0 %	50 %	0 %	384527648
138	NC_017060	TC	3	6	74356	74361	0 %	50 %	0 %	50 %	384527648
139	NC_017060	GA	3	6	74429	74434	50 %	0 %	50 %	0 %	384527648
140	NC_017060	AC	3	6	76418	76423	50 %	0 %	0 %	50 %	384527649
141	NC_017060	AG	3	6	76806	76811	50 %	0 %	50 %	0 %	384527649
142	NC_017060	GT	3	6	77171	77176	0 %	50 %	50 %	0 %	384527649
143	NC_017060	CA	3	6	77994	77999	50 %	0 %	0 %	50 %	384527650
144	NC_017060	TC	3	6	78012	78017	0 %	50 %	0 %	50 %	384527650
145	NC_017060	GA	3	6	78126	78131	50 %	0 %	50 %	0 %	384527651
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