MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	AAAATC	2	12	118	129	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017058	GATAAA	2	12	536	547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383500937
3	NC_017058	TAAAAT	2	12	13274	13285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500947
4	NC_017058	TCTTTA	2	12	13860	13871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383500947
5	NC_017058	GGAATC	2	12	14691	14702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383500947
6	NC_017058	ATTAGC	2	12	14933	14944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383500947
7	NC_017058	TATTTT	2	12	17483	17494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383500949
8	NC_017058	ACTAAA	2	12	19128	19139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383500949
9	NC_017058	CTAAAG	2	12	19787	19798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383500949
10	NC_017058	TATCTT	2	12	19949	19960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383500949
11	NC_017058	TAGCAA	2	12	20114	20125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383500949
12	NC_017058	AATTTT	2	12	27405	27416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500957
13	NC_017058	TTTTAT	2	12	32765	32776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383500962
14	NC_017058	ATTAAA	2	12	34143	34154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500964
15	NC_017058	AATCTT	2	12	35329	35340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383500966
16	NC_017058	GGTAAT	2	12	38872	38883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500967
17	NC_017058	CAAAAT	2	12	39206	39217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383500967
18	NC_017058	AATAAA	2	12	39793	39804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383500967
19	NC_017058	CAAAAA	2	12	40242	40253	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383500967
20	NC_017058	AAAAAG	2	12	40320	40331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383500967
21	NC_017058	AGAATT	2	12	40417	40428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383500967
22	NC_017058	ATTTAA	2	12	42799	42810	50 %	50 %	0 %	0 %	383500967
23	NC_017058	AATTAT	2	12	43022	43033	50 %	50 %	0 %	0 %	383500967
24	NC_017058	AGAAAA	2	12	44310	44321	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383500968
25	NC_017058	TAAAAA	2	12	45917	45928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017058	ATAGCA	2	12	47180	47191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017058	TTAGAA	2	12	49715	49726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383500975
28	NC_017058	AATACA	2	12	55795	55806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017058	TTTTTG	2	12	56370	56381	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017058	AAGAAA	2	12	57324	57335	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017058	TAATGT	2	12	57698	57709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017058	TAATCA	2	12	63724	63735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017058	CAGTAT	2	12	65876	65887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383500990
34	NC_017058	ACAAGC	2	12	66078	66089	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383500991
35	NC_017058	AAATGA	2	12	66179	66190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017058	TTAAAG	2	12	67600	67611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017058	TATAAT	2	12	68843	68854	50 %	50 %	0 %	0 %	383500993
38	NC_017058	TTTTTA	2	12	69122	69133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383500993
39	NC_017058	TTATCA	2	12	70505	70516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017058	TTAATG	2	12	72558	72569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383500995
41	NC_017058	AGTATT	2	12	74016	74027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017058	GTGAGC	2	12	76872	76883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383500999
43	NC_017058	TGAAAT	2	12	78412	78423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501000
44	NC_017058	ATTTAT	2	12	79859	79870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501002
45	NC_017058	ATAAGG	2	12	80058	80069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383501002
46	NC_017058	TAATAG	2	12	80953	80964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501003
47	NC_017058	ATCTGT	2	12	81638	81649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501003
48	NC_017058	ATCAGA	2	12	84814	84825	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501009
49	NC_017058	TTTTTG	2	12	86619	86630	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383501011
50	NC_017058	AGGTAT	2	12	87367	87378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501011
51	NC_017058	GAAAAA	2	12	87800	87811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383501011
52	NC_017058	ATAAAA	2	12	93303	93314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017058	ATTTAT	2	12	93336	93347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017058	TAATAT	2	12	94157	94168	50 %	50 %	0 %	0 %	383501016
55	NC_017058	CAGCAA	2	12	94792	94803	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383501017
56	NC_017058	AAAAAG	2	12	95951	95962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383501017
57	NC_017058	ATCCTG	2	12	102030	102041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383501026
58	NC_017058	AAAGCT	2	12	102449	102460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501026
59	NC_017058	GTAATA	2	12	103088	103099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501026
60	NC_017058	TTTTAA	2	12	110518	110529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501033
61	NC_017058	AGTAAA	2	12	111643	111654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383501035
62	NC_017058	TAATAT	2	12	112471	112482	50 %	50 %	0 %	0 %	383501036
63	NC_017058	TTAAAA	2	12	113622	113633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017058	TAGGGG	2	12	115857	115868	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383501041
65	NC_017058	TGATCG	2	12	116980	116991	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501043
66	NC_017058	TTGATT	2	12	119332	119343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383501044
67	NC_017058	TCTTGC	2	12	119702	119713	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383501044
68	NC_017058	TCAAAG	2	12	120207	120218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501045
69	NC_017058	GAAGCA	2	12	120400	120411	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383501045
70	NC_017058	TTTTTA	2	12	126614	126625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383501049
71	NC_017058	ACGGAT	2	12	127845	127856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383501051
72	NC_017058	TGTAGG	2	12	130650	130661	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383501054
73	NC_017058	TTTTAA	2	12	131615	131626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017058	CCTATA	2	12	131714	131725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501055
75	NC_017058	ACCGCT	2	12	133298	133309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383501056
76	NC_017058	ATCTTC	2	12	137785	137796	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383501060
77	NC_017058	GCTTGA	2	12	138095	138106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
78	NC_017058	GCTTGA	2	12	138254	138265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
79	NC_017058	GCTTGA	2	12	138413	138424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
80	NC_017058	GCTTGA	2	12	138572	138583	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
81	NC_017058	GCTTGA	2	12	138731	138742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
82	NC_017058	GCTTGA	2	12	138890	138901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
83	NC_017058	GCTTGA	2	12	139049	139060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
84	NC_017058	GCTTGA	2	12	139208	139219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
85	NC_017058	GGTGGA	2	12	141674	141685	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383501060
86	NC_017058	ATCTTC	2	12	143194	143205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017058	AATCAG	2	12	143823	143834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017058	GTAGAT	2	12	144224	144235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017058	CGGTGG	4	24	144328	144351	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017058	ATGCAA	2	12	147775	147786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501061
91	NC_017058	TAATAT	2	12	150461	150472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017058	TTAAAA	2	12	151750	151761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017058	TAGCGG	2	12	153392	153403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383501066
94	NC_017058	CTTTTT	2	12	153751	153762	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501066
95	NC_017058	GGGTTT	2	12	161934	161945	0 %	50 %	50 %	0 %	383501076
96	NC_017058	TACGGT	2	12	162977	162988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501077
97	NC_017058	GAGAAA	2	12	168527	168538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501081
98	NC_017058	TACTTT	2	12	168815	168826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501082
99	NC_017058	AAGGAA	2	12	170878	170889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501084
100	NC_017058	TTGATA	2	12	171884	171895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383501085
101	NC_017058	GTATTG	2	12	173731	173742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017058	TGATTT	2	12	178099	178110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383501090
103	NC_017058	TCTTTT	2	12	178488	178499	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017058	TGTATC	2	12	179796	179807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501092
105	NC_017058	AAAAAT	2	12	181942	181953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383501094
106	NC_017058	TATAGA	2	12	185274	185285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501099
107	NC_017058	AAAATA	2	12	186472	186483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017058	AAGGTT	2	12	187496	187507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501100
109	NC_017058	ATGTAG	2	12	188368	188379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501101
110	NC_017058	TGCAGA	2	12	190537	190548	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383501103
111	NC_017058	ATAGAT	2	12	191752	191763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501104
112	NC_017058	GATAAA	2	12	194238	194249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017058	GTACTT	2	12	194747	194758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501109
114	NC_017058	GCAATT	2	12	195005	195016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501110
115	NC_017058	TTTCTT	2	12	196987	196998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501114
116	NC_017058	TGATTA	2	12	198431	198442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383501115
117	NC_017058	ATCATA	2	12	199455	199466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383501116
118	NC_017058	CAATGA	2	12	201049	201060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017058	TTAAAT	2	12	205037	205048	50 %	50 %	0 %	0 %	383501122
120	NC_017058	AGCAAT	2	12	205471	205482	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501123
121	NC_017058	CAACGG	2	12	206921	206932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501123
122	NC_017058	ATATTA	2	12	213615	213626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017058	TAATAT	2	12	214794	214805	50 %	50 %	0 %	0 %	383501129
124	NC_017058	AAATAT	2	12	214907	214918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501129
125	NC_017058	TGAAAA	2	12	216401	216412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383501131
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131	NC_017058	TTCATT	2	12	232678	232689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501149
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150	NC_017058	TGTTAA	2	12	276221	276232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017058	GGAGAC	2	12	277397	277408	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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230	NC_017058	CAAAAA	2	12	467801	467812	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
231	NC_017058	CCGACT	2	12	472691	472702	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383501373
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236	NC_017058	ATCAAA	2	12	479886	479897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383501379
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239	NC_017058	TGCTTC	2	12	488850	488861	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383501386
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244	NC_017058	TTTATA	2	12	496971	496982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017058	TTTGAG	2	12	499279	499290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383501395
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355	NC_017058	TTTAAA	2	12	710946	710957	50 %	50 %	0 %	0 %	383501606
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477	NC_017058	CCTACA	2	12	978144	978155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
478	NC_017058	ATGCTA	2	12	983845	983856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501868
479	NC_017058	CAAAAT	2	12	984751	984762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383501869
480	NC_017058	TTTATT	2	12	984844	984855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383501869
481	NC_017058	AACCAC	2	12	986241	986252	50 %	0 %	0 %	50 %	383501869
482	NC_017058	ATTTTT	2	12	987413	987424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017058	GATGAG	2	12	988644	988655	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383501870
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499	NC_017058	TTATTG	2	12	1014558	1014569	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383501893
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