MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 461

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	GATAAA	2	12	536	547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383500937
2	NC_017058	TAAAAT	2	12	13274	13285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500947
3	NC_017058	TCTTTA	2	12	13860	13871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383500947
4	NC_017058	GGAATC	2	12	14691	14702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383500947
5	NC_017058	ATTAGC	2	12	14933	14944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383500947
6	NC_017058	TATTTT	2	12	17483	17494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383500949
7	NC_017058	ACTAAA	2	12	19128	19139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383500949
8	NC_017058	CTAAAG	2	12	19787	19798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383500949
9	NC_017058	TATCTT	2	12	19949	19960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383500949
10	NC_017058	TAGCAA	2	12	20114	20125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383500949
11	NC_017058	AATTTT	2	12	27405	27416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383500957
12	NC_017058	TTTTAT	2	12	32765	32776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383500962
13	NC_017058	ATTAAA	2	12	34143	34154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383500964
14	NC_017058	AATCTT	2	12	35329	35340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383500966
15	NC_017058	GGTAAT	2	12	38872	38883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383500967
16	NC_017058	CAAAAT	2	12	39206	39217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383500967
17	NC_017058	AATAAA	2	12	39793	39804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383500967
18	NC_017058	CAAAAA	2	12	40242	40253	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383500967
19	NC_017058	AAAAAG	2	12	40320	40331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383500967
20	NC_017058	AGAATT	2	12	40417	40428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383500967
21	NC_017058	ATTTAA	2	12	42799	42810	50 %	50 %	0 %	0 %	383500967
22	NC_017058	AATTAT	2	12	43022	43033	50 %	50 %	0 %	0 %	383500967
23	NC_017058	AGAAAA	2	12	44310	44321	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383500968
24	NC_017058	TTAGAA	2	12	49715	49726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383500975
25	NC_017058	CAGTAT	2	12	65876	65887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383500990
26	NC_017058	ACAAGC	2	12	66078	66089	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383500991
27	NC_017058	TATAAT	2	12	68843	68854	50 %	50 %	0 %	0 %	383500993
28	NC_017058	TTTTTA	2	12	69122	69133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383500993
29	NC_017058	TTAATG	2	12	72558	72569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383500995
30	NC_017058	GTGAGC	2	12	76872	76883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383500999
31	NC_017058	TGAAAT	2	12	78412	78423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501000
32	NC_017058	ATTTAT	2	12	79859	79870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501002
33	NC_017058	ATAAGG	2	12	80058	80069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383501002
34	NC_017058	TAATAG	2	12	80953	80964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501003
35	NC_017058	ATCTGT	2	12	81638	81649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501003
36	NC_017058	ATCAGA	2	12	84814	84825	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501009
37	NC_017058	TTTTTG	2	12	86619	86630	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383501011
38	NC_017058	AGGTAT	2	12	87367	87378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501011
39	NC_017058	GAAAAA	2	12	87800	87811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383501011
40	NC_017058	TAATAT	2	12	94157	94168	50 %	50 %	0 %	0 %	383501016
41	NC_017058	CAGCAA	2	12	94792	94803	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383501017
42	NC_017058	AAAAAG	2	12	95951	95962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383501017
43	NC_017058	ATCCTG	2	12	102030	102041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383501026
44	NC_017058	AAAGCT	2	12	102449	102460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501026
45	NC_017058	GTAATA	2	12	103088	103099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501026
46	NC_017058	TTTTAA	2	12	110518	110529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501033
47	NC_017058	AGTAAA	2	12	111643	111654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383501035
48	NC_017058	TAATAT	2	12	112471	112482	50 %	50 %	0 %	0 %	383501036
49	NC_017058	TAGGGG	2	12	115857	115868	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383501041
50	NC_017058	TGATCG	2	12	116980	116991	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501043
51	NC_017058	TTGATT	2	12	119332	119343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383501044
52	NC_017058	TCTTGC	2	12	119702	119713	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383501044
53	NC_017058	TCAAAG	2	12	120207	120218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501045
54	NC_017058	GAAGCA	2	12	120400	120411	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383501045
55	NC_017058	TTTTTA	2	12	126614	126625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383501049
56	NC_017058	ACGGAT	2	12	127845	127856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383501051
57	NC_017058	TGTAGG	2	12	130650	130661	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383501054
58	NC_017058	CCTATA	2	12	131714	131725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501055
59	NC_017058	ACCGCT	2	12	133298	133309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383501056
60	NC_017058	ATCTTC	2	12	137785	137796	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383501060
61	NC_017058	GCTTGA	2	12	138095	138106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
62	NC_017058	GCTTGA	2	12	138254	138265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
63	NC_017058	GCTTGA	2	12	138413	138424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
64	NC_017058	GCTTGA	2	12	138572	138583	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
65	NC_017058	GCTTGA	2	12	138731	138742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
66	NC_017058	GCTTGA	2	12	138890	138901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
67	NC_017058	GCTTGA	2	12	139049	139060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
68	NC_017058	GCTTGA	2	12	139208	139219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501060
69	NC_017058	GGTGGA	2	12	141674	141685	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383501060
70	NC_017058	ATGCAA	2	12	147775	147786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501061
71	NC_017058	TAGCGG	2	12	153392	153403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383501066
72	NC_017058	CTTTTT	2	12	153751	153762	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501066
73	NC_017058	GGGTTT	2	12	161934	161945	0 %	50 %	50 %	0 %	383501076
74	NC_017058	TACGGT	2	12	162977	162988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383501077
75	NC_017058	GAGAAA	2	12	168527	168538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501081
76	NC_017058	TACTTT	2	12	168815	168826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501082
77	NC_017058	AAGGAA	2	12	170878	170889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501084
78	NC_017058	TTGATA	2	12	171884	171895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383501085
79	NC_017058	TGATTT	2	12	178099	178110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383501090
80	NC_017058	TGTATC	2	12	179796	179807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501092
81	NC_017058	AAAAAT	2	12	181942	181953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383501094
82	NC_017058	TATAGA	2	12	185274	185285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501099
83	NC_017058	AAGGTT	2	12	187496	187507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501100
84	NC_017058	ATGTAG	2	12	188368	188379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501101
85	NC_017058	TGCAGA	2	12	190537	190548	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383501103
86	NC_017058	ATAGAT	2	12	191752	191763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501104
87	NC_017058	GTACTT	2	12	194747	194758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501109
88	NC_017058	GCAATT	2	12	195005	195016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501110
89	NC_017058	TTTCTT	2	12	196987	196998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501114
90	NC_017058	TGATTA	2	12	198431	198442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383501115
91	NC_017058	ATCATA	2	12	199455	199466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383501116
92	NC_017058	TTAAAT	2	12	205037	205048	50 %	50 %	0 %	0 %	383501122
93	NC_017058	AGCAAT	2	12	205471	205482	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501123
94	NC_017058	CAACGG	2	12	206921	206932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501123
95	NC_017058	TAATAT	2	12	214794	214805	50 %	50 %	0 %	0 %	383501129
96	NC_017058	AAATAT	2	12	214907	214918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501129
97	NC_017058	TGAAAA	2	12	216401	216412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383501131
98	NC_017058	GAAAAA	2	12	216510	216521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383501131
99	NC_017058	ATAATG	2	12	216898	216909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501131
100	NC_017058	AATGAT	2	12	229481	229492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501147
101	NC_017058	AGCTAA	2	12	230350	230361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501147
102	NC_017058	TTCATT	2	12	232678	232689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501149
103	NC_017058	TAACAT	2	12	232892	232903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383501149
104	NC_017058	ATCTGA	2	12	237530	237541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501151
105	NC_017058	CTTTTT	2	12	238004	238015	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501151
106	NC_017058	TTCTAT	2	12	239817	239828	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383501155
107	NC_017058	CCAAAT	2	12	240020	240031	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383501156
108	NC_017058	GCAATT	2	12	243237	243248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501159
109	NC_017058	CACCTA	2	12	247676	247687	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383501162
110	NC_017058	TGCCGG	2	12	251117	251128	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383501167
111	NC_017058	CACTAC	2	12	252047	252058	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383501168
112	NC_017058	ATTAAT	2	12	261641	261652	50 %	50 %	0 %	0 %	383501174
113	NC_017058	CTGCCG	2	12	262140	262151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383501174
114	NC_017058	TACCGG	2	12	263215	263226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383501174
115	NC_017058	GCTTTT	2	12	265103	265114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383501175
116	NC_017058	TAGTTT	2	12	269665	269676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383501177
117	NC_017058	TTAAGT	2	12	270074	270085	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383501177
118	NC_017058	TATGAG	2	12	299633	299644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501207
119	NC_017058	TCCTGC	2	12	300911	300922	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383501208
120	NC_017058	AGAAGC	2	12	302756	302767	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383501210
121	NC_017058	ATAAAG	2	12	305729	305740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383501213
122	NC_017058	GAAATA	2	12	305987	305998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383501214
123	NC_017058	GGAACT	2	12	307462	307473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383501214
124	NC_017058	GAGCAA	2	12	312112	312123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383501219
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126	NC_017058	ATAAAC	2	12	313911	313922	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383501220
127	NC_017058	ATTAAA	2	12	318955	318966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501225
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129	NC_017058	GGAGGT	2	12	321314	321325	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383501226
130	NC_017058	AGCATT	2	12	322222	322233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501226
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132	NC_017058	ATTATA	2	12	325870	325881	50 %	50 %	0 %	0 %	383501227
133	NC_017058	TTTACC	2	12	330780	330791	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383501232
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136	NC_017058	TTTCTT	2	12	343239	343250	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383501239
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143	NC_017058	AATATT	2	12	375347	375358	50 %	50 %	0 %	0 %	383501276
144	NC_017058	CCATAC	2	12	377213	377224	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383501278
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149	NC_017058	TGCTAT	2	12	390982	390993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501293
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220	NC_017058	GGTTTA	2	12	595217	595228	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383501499
221	NC_017058	TGTTCA	2	12	596282	596293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501501
222	NC_017058	ATGAAT	2	12	596868	596879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501502
223	NC_017058	GATATA	2	12	597484	597495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383501502
224	NC_017058	TGCTTT	2	12	599356	599367	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383501504
225	NC_017058	TTAACC	2	12	599381	599392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501504
226	NC_017058	TGCTTT	2	12	599809	599820	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383501504
227	NC_017058	CTCCTA	2	12	601007	601018	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383501506
228	NC_017058	TAATAT	2	12	613074	613085	50 %	50 %	0 %	0 %	383501516
229	NC_017058	CTTTCT	2	12	615168	615179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501518
230	NC_017058	TGAAGC	2	12	615779	615790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383501519
231	NC_017058	GGTGAA	2	12	621662	621673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383501521
232	NC_017058	CTAAAG	2	12	621787	621798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501522
233	NC_017058	TACTAT	2	12	626265	626276	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383501525
234	NC_017058	ATTTGC	2	12	635838	635849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383501537
235	NC_017058	AGCATA	2	12	636255	636266	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501537
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337	NC_017058	ACGCTG	2	12	917517	917528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383501803
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349	NC_017058	AAATAA	2	12	976799	976810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383501859
350	NC_017058	ATGCTA	2	12	983845	983856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501868
351	NC_017058	CAAAAT	2	12	984751	984762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383501869
352	NC_017058	TTTATT	2	12	984844	984855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383501869
353	NC_017058	AACCAC	2	12	986241	986252	50 %	0 %	0 %	50 %	383501869
354	NC_017058	GATGAG	2	12	988644	988655	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383501870
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369	NC_017058	TGAATC	2	12	1026767	1026778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383501904
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