MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 1160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	GAATT	2	10	215	224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017058	ATGCT	2	10	561	570	20 %	40 %	20 %	20 %	383500937
3	NC_017058	TAATT	2	10	2158	2167	40 %	60 %	0 %	0 %	383500940
4	NC_017058	TTTTC	2	10	2194	2203	0 %	80 %	0 %	20 %	383500940
5	NC_017058	AAATT	2	10	5039	5048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017058	TATTT	2	10	5678	5687	20 %	80 %	0 %	0 %	383500945
7	NC_017058	ATCTC	2	10	5829	5838	20 %	40 %	0 %	40 %	383500945
8	NC_017058	AAATA	2	10	7756	7765	80 %	20 %	0 %	0 %	383500945
9	NC_017058	TTATC	2	10	9260	9269	20 %	60 %	0 %	20 %	383500946
10	NC_017058	AATAA	2	10	9464	9473	80 %	20 %	0 %	0 %	383500946
11	NC_017058	CATAA	2	10	9867	9876	60 %	20 %	0 %	20 %	383500946
12	NC_017058	CTGCA	2	10	10284	10293	20 %	20 %	20 %	40 %	383500946
13	NC_017058	AACTA	2	10	11274	11283	60 %	20 %	0 %	20 %	383500946
14	NC_017058	TCGCT	2	10	12012	12021	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017058	TCTGC	2	10	12315	12324	0 %	40 %	20 %	40 %	383500947
16	NC_017058	CCAAG	2	10	16111	16120	40 %	0 %	20 %	40 %	383500948
17	NC_017058	AAAAC	2	10	16931	16940	80 %	0 %	0 %	20 %	383500948
18	NC_017058	TTTCT	2	10	17616	17625	0 %	80 %	0 %	20 %	383500949
19	NC_017058	ATTAT	2	10	20848	20857	40 %	60 %	0 %	0 %	383500950
20	NC_017058	TAAAA	2	10	21815	21824	80 %	20 %	0 %	0 %	383500950
21	NC_017058	ATATA	2	10	23553	23562	60 %	40 %	0 %	0 %	383500951
22	NC_017058	GTTAA	2	10	24020	24029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017058	GATTT	2	10	25155	25164	20 %	60 %	20 %	0 %	383500952
24	NC_017058	AAACC	2	10	25446	25455	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017058	CAAGC	2	10	26488	26497	40 %	0 %	20 %	40 %	383500955
26	NC_017058	ATCAT	2	10	26825	26834	40 %	40 %	0 %	20 %	383500956
27	NC_017058	AATTT	2	10	27465	27474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017058	ACAAG	2	10	27968	27977	60 %	0 %	20 %	20 %	383500958
29	NC_017058	CTTGC	2	10	30312	30321	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017058	TAACT	2	10	33938	33947	40 %	40 %	0 %	20 %	383500964
31	NC_017058	TACAT	2	10	38627	38636	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017058	TTTAA	2	10	38764	38773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017058	AGAAA	3	15	40291	40305	80 %	0 %	20 %	0 %	383500967
34	NC_017058	TACCT	2	10	42172	42181	20 %	40 %	0 %	40 %	383500967
35	NC_017058	AGAAC	2	10	44025	44034	60 %	0 %	20 %	20 %	383500968
36	NC_017058	ACAAA	2	10	44427	44436	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017058	AGTTT	2	10	44650	44659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017058	ATGTT	2	10	47195	47204	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017058	TAAAT	2	10	47834	47843	60 %	40 %	0 %	0 %	383500970
40	NC_017058	TTTGT	2	10	48148	48157	0 %	80 %	20 %	0 %	383500971
41	NC_017058	ATATT	2	10	48223	48232	40 %	60 %	0 %	0 %	383500971
42	NC_017058	AAAAT	2	10	49243	49252	80 %	20 %	0 %	0 %	383500974
43	NC_017058	ATACT	2	10	49787	49796	40 %	40 %	0 %	20 %	383500975
44	NC_017058	GCTCC	2	10	49863	49872	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_017058	CTCAT	2	10	49954	49963	20 %	40 %	0 %	40 %	383500976
46	NC_017058	TGCTA	2	10	50874	50883	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017058	CCATA	2	10	54310	54319	40 %	20 %	0 %	40 %	383500979
48	NC_017058	TGAGT	2	10	55158	55167	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017058	TTATT	2	10	60156	60165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017058	TTTTA	2	10	60261	60270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017058	TTTAT	2	10	61438	61447	20 %	80 %	0 %	0 %	383500984
52	NC_017058	TATCT	2	10	62977	62986	20 %	60 %	0 %	20 %	383500986
53	NC_017058	TAAGT	2	10	63812	63821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017058	TAAAG	2	10	65446	65455	60 %	20 %	20 %	0 %	383500990
55	NC_017058	TAACT	2	10	67303	67312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017058	TTTAT	2	10	67855	67864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017058	GTTTC	2	10	69345	69354	0 %	60 %	20 %	20 %	383500993
58	NC_017058	ATTTT	2	10	69894	69903	20 %	80 %	0 %	0 %	383500993
59	NC_017058	AGTAC	2	10	71804	71813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017058	TTTCT	2	10	73107	73116	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017058	CATTA	2	10	74392	74401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017058	TTGAT	2	10	76389	76398	20 %	60 %	20 %	0 %	383500999
63	NC_017058	ATATG	2	10	76582	76591	40 %	40 %	20 %	0 %	383500999
64	NC_017058	ATTAT	2	10	77489	77498	40 %	60 %	0 %	0 %	383500999
65	NC_017058	AGTCT	2	10	77850	77859	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017058	TACTA	2	10	79249	79258	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017058	ATTGA	2	10	80777	80786	40 %	40 %	20 %	0 %	383501003
68	NC_017058	AATTA	2	10	82115	82124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017058	GCTTT	2	10	85967	85976	0 %	60 %	20 %	20 %	383501010
70	NC_017058	GATAA	2	10	89082	89091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017058	AGTTA	2	10	92417	92426	40 %	40 %	20 %	0 %	383501015
72	NC_017058	ACAAA	2	10	92789	92798	80 %	0 %	0 %	20 %	383501015
73	NC_017058	ACTTT	2	10	93581	93590	20 %	60 %	0 %	20 %	383501016
74	NC_017058	GCTTA	2	10	93770	93779	20 %	40 %	20 %	20 %	383501016
75	NC_017058	TTAAA	2	10	94498	94507	60 %	40 %	0 %	0 %	383501016
76	NC_017058	TTAAT	2	10	94709	94718	40 %	60 %	0 %	0 %	383501017
77	NC_017058	CATAC	2	10	97772	97781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017058	ATTTT	2	10	97807	97816	20 %	80 %	0 %	0 %	383501020
79	NC_017058	GATTA	2	10	99207	99216	40 %	40 %	20 %	0 %	383501021
80	NC_017058	CACAC	2	10	99407	99416	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_017058	CCTTA	2	10	99483	99492	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017058	ATACA	2	10	100343	100352	60 %	20 %	0 %	20 %	383501024
83	NC_017058	TAGTA	2	10	101629	101638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017058	ATTTA	2	10	101663	101672	40 %	60 %	0 %	0 %	383501026
85	NC_017058	AAAAG	2	10	102439	102448	80 %	0 %	20 %	0 %	383501026
86	NC_017058	GGGTT	2	10	102649	102658	0 %	40 %	60 %	0 %	383501026
87	NC_017058	TTTAT	2	10	103025	103034	20 %	80 %	0 %	0 %	383501026
88	NC_017058	GCTTA	2	10	104211	104220	20 %	40 %	20 %	20 %	383501027
89	NC_017058	ACAAT	2	10	104572	104581	60 %	20 %	0 %	20 %	383501028
90	NC_017058	GTTAT	2	10	105197	105206	20 %	60 %	20 %	0 %	383501029
91	NC_017058	GTAGA	2	10	105503	105512	40 %	20 %	40 %	0 %	383501029
92	NC_017058	TAAAT	2	10	107227	107236	60 %	40 %	0 %	0 %	383501030
93	NC_017058	CAATG	2	10	107855	107864	40 %	20 %	20 %	20 %	383501031
94	NC_017058	ATAAA	2	10	108318	108327	80 %	20 %	0 %	0 %	383501032
95	NC_017058	ATTAA	2	10	109024	109033	60 %	40 %	0 %	0 %	383501032
96	NC_017058	ATACA	2	10	109160	109169	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017058	GAAAA	2	10	109508	109517	80 %	0 %	20 %	0 %	383501033
98	NC_017058	AACAA	2	10	112786	112795	80 %	0 %	0 %	20 %	383501037
99	NC_017058	TAAAA	2	10	114229	114238	80 %	20 %	0 %	0 %	383501039
100	NC_017058	TCAAA	2	10	117576	117585	60 %	20 %	0 %	20 %	383501043
101	NC_017058	AAAGA	2	10	118206	118215	80 %	0 %	20 %	0 %	383501044
102	NC_017058	CGTTA	2	10	121216	121225	20 %	40 %	20 %	20 %	383501047
103	NC_017058	TAATT	2	10	124261	124270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017058	GTGTT	2	10	124584	124593	0 %	60 %	40 %	0 %	383501048
105	NC_017058	GCAAA	2	10	125822	125831	60 %	0 %	20 %	20 %	383501048
106	NC_017058	TTTAA	2	10	126004	126013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017058	TTGTA	2	10	126085	126094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017058	ATTTA	2	10	127185	127194	40 %	60 %	0 %	0 %	383501050
109	NC_017058	AATTA	2	10	127554	127563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017058	TTAAT	2	10	129641	129650	40 %	60 %	0 %	0 %	383501053
111	NC_017058	TTAAT	2	10	130052	130061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017058	TTAGT	2	10	132642	132651	20 %	60 %	20 %	0 %	383501056
113	NC_017058	TATGT	2	10	134284	134293	20 %	60 %	20 %	0 %	383501057
114	NC_017058	CCAAA	2	10	135082	135091	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017058	TAAAA	2	10	135290	135299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017058	CGGAT	2	10	135470	135479	20 %	20 %	40 %	20 %	383501058
117	NC_017058	TAATA	2	10	136290	136299	60 %	40 %	0 %	0 %	383501059
118	NC_017058	ATAAC	2	10	136358	136367	60 %	20 %	0 %	20 %	383501059
119	NC_017058	TTAAC	2	10	136764	136773	40 %	40 %	0 %	20 %	383501060
120	NC_017058	ATTAT	2	10	137258	137267	40 %	60 %	0 %	0 %	383501060
121	NC_017058	TCTTT	2	10	137859	137868	0 %	80 %	0 %	20 %	383501060
122	NC_017058	TTTGT	2	10	139347	139356	0 %	80 %	20 %	0 %	383501060
123	NC_017058	ATTGT	2	10	139994	140003	20 %	60 %	20 %	0 %	383501060
124	NC_017058	TGCTT	2	10	140069	140078	0 %	60 %	20 %	20 %	383501060
125	NC_017058	GATTT	2	10	140295	140304	20 %	60 %	20 %	0 %	383501060
126	NC_017058	TTTAA	2	10	141889	141898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017058	TTAAA	2	10	141907	141916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017058	TTTAA	2	10	142173	142182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017058	TATAT	2	10	142277	142286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017058	ATTAT	2	10	142665	142674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017058	ATATT	2	10	144417	144426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017058	ATTTA	2	10	144430	144439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017058	CTTGT	2	10	145215	145224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017058	ATTTT	2	10	145847	145856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017058	CAAAT	2	10	150599	150608	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017058	ATTTT	2	10	152953	152962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017058	TTATA	2	10	154037	154046	40 %	60 %	0 %	0 %	383501066
138	NC_017058	TTGTC	2	10	154111	154120	0 %	60 %	20 %	20 %	383501066
139	NC_017058	ATAAA	2	10	154198	154207	80 %	20 %	0 %	0 %	383501066
140	NC_017058	TAAAA	2	10	156463	156472	80 %	20 %	0 %	0 %	383501069
141	NC_017058	AAAAC	2	10	157159	157168	80 %	0 %	0 %	20 %	383501069
142	NC_017058	TTTAA	2	10	157235	157244	40 %	60 %	0 %	0 %	383501069
143	NC_017058	TATGC	2	10	157490	157499	20 %	40 %	20 %	20 %	383501070
144	NC_017058	TGAAA	2	10	158685	158694	60 %	20 %	20 %	0 %	383501071
145	NC_017058	TAATT	2	10	161004	161013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017058	TAGAA	2	10	161849	161858	60 %	20 %	20 %	0 %	383501076
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149	NC_017058	ATTTA	2	10	165154	165163	40 %	60 %	0 %	0 %	383501079
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151	NC_017058	ATTAA	2	10	168070	168079	60 %	40 %	0 %	0 %	383501081
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155	NC_017058	TCTAT	2	10	171528	171537	20 %	60 %	0 %	20 %	383501085
156	NC_017058	AGTAG	2	10	172132	172141	40 %	20 %	40 %	0 %	383501085
157	NC_017058	AAATT	2	10	174781	174790	60 %	40 %	0 %	0 %	383501088
158	NC_017058	CATTA	2	10	176005	176014	40 %	40 %	0 %	20 %	383501089
159	NC_017058	ATATA	2	10	177787	177796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017058	TAAAT	2	10	178680	178689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017058	ATAGT	2	10	181234	181243	40 %	40 %	20 %	0 %	383501093
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163	NC_017058	TTGGC	2	10	182299	182308	0 %	40 %	40 %	20 %	383501095
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173	NC_017058	TAAAA	2	10	189083	189092	80 %	20 %	0 %	0 %	383501101
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179	NC_017058	ATACT	2	10	191898	191907	40 %	40 %	0 %	20 %	383501104
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186	NC_017058	TAAAA	2	10	196376	196385	80 %	20 %	0 %	0 %	383501113
187	NC_017058	TGTTC	2	10	197307	197316	0 %	60 %	20 %	20 %	383501115
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190	NC_017058	ATTAT	2	10	199228	199237	40 %	60 %	0 %	0 %	383501116
191	NC_017058	ATATT	2	10	200001	200010	40 %	60 %	0 %	0 %	383501117
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195	NC_017058	ATTAT	2	10	204518	204527	40 %	60 %	0 %	0 %	383501122
196	NC_017058	GAAAA	2	10	204602	204611	80 %	0 %	20 %	0 %	383501122
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200	NC_017058	TTAAC	2	10	211194	211203	40 %	40 %	0 %	20 %	383501128
201	NC_017058	TTAAT	2	10	211395	211404	40 %	60 %	0 %	0 %	383501128
202	NC_017058	TATCT	2	10	211666	211675	20 %	60 %	0 %	20 %	383501128
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204	NC_017058	TAAAA	2	10	215765	215774	80 %	20 %	0 %	0 %	383501130
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206	NC_017058	TTATA	2	10	217527	217536	40 %	60 %	0 %	0 %	383501132
207	NC_017058	TATTT	2	10	219356	219365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_017058	ATTTT	2	10	236322	236331	20 %	80 %	0 %	0 %	383501151
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248	NC_017058	TTATC	2	10	266087	266096	20 %	60 %	0 %	20 %	383501175
249	NC_017058	TCGCT	2	10	266718	266727	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
250	NC_017058	GAGCA	2	10	267427	267436	40 %	0 %	40 %	20 %	383501176
251	NC_017058	CTAAT	2	10	270434	270443	40 %	40 %	0 %	20 %	383501178
252	NC_017058	TAAAT	2	10	271597	271606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017058	TCGCT	2	10	273383	273392	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_017058	CTATA	2	10	274430	274439	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_017058	TAGTT	2	10	277832	277841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017058	TTAAT	2	10	277864	277873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017058	GTAGT	2	10	279566	279575	20 %	40 %	40 %	0 %	383501188
258	NC_017058	ATTTT	2	10	281244	281253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017058	TATAT	2	10	281926	281935	40 %	60 %	0 %	0 %	383501190
260	NC_017058	CTTTT	2	10	282755	282764	0 %	80 %	0 %	20 %	383501192
261	NC_017058	TAAAG	2	10	283306	283315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017058	ACTCT	2	10	283361	283370	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_017058	GTTAA	2	10	285241	285250	40 %	40 %	20 %	0 %	383501195
264	NC_017058	AAATT	2	10	286656	286665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017058	ATAGT	2	10	288207	288216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017058	TTTAG	2	10	288906	288915	20 %	60 %	20 %	0 %	383501199
267	NC_017058	AAATA	2	10	289070	289079	80 %	20 %	0 %	0 %	383501199
268	NC_017058	TGAAA	2	10	290720	290729	60 %	20 %	20 %	0 %	383501200
269	NC_017058	GTGAT	2	10	290776	290785	20 %	40 %	40 %	0 %	383501200
270	NC_017058	AAACA	2	10	295301	295310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_017058	AAAAT	2	10	295311	295320	80 %	20 %	0 %	0 %	383501204
272	NC_017058	AGATA	2	10	296035	296044	60 %	20 %	20 %	0 %	383501204
273	NC_017058	GCAAT	2	10	299075	299084	40 %	20 %	20 %	20 %	383501207
274	NC_017058	TCTAA	2	10	299660	299669	40 %	40 %	0 %	20 %	383501207
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404	NC_017058	AAATA	2	10	448268	448277	80 %	20 %	0 %	0 %	383501353
405	NC_017058	AGGTG	2	10	450008	450017	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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