MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	ATGCT	2	10	561	570	20 %	40 %	20 %	20 %	383500937
2	NC_017058	TAATT	2	10	2158	2167	40 %	60 %	0 %	0 %	383500940
3	NC_017058	TTTTC	2	10	2194	2203	0 %	80 %	0 %	20 %	383500940
4	NC_017058	TATTT	2	10	5678	5687	20 %	80 %	0 %	0 %	383500945
5	NC_017058	ATCTC	2	10	5829	5838	20 %	40 %	0 %	40 %	383500945
6	NC_017058	AAATA	2	10	7756	7765	80 %	20 %	0 %	0 %	383500945
7	NC_017058	TTATC	2	10	9260	9269	20 %	60 %	0 %	20 %	383500946
8	NC_017058	AATAA	2	10	9464	9473	80 %	20 %	0 %	0 %	383500946
9	NC_017058	CATAA	2	10	9867	9876	60 %	20 %	0 %	20 %	383500946
10	NC_017058	CTGCA	2	10	10284	10293	20 %	20 %	20 %	40 %	383500946
11	NC_017058	AACTA	2	10	11274	11283	60 %	20 %	0 %	20 %	383500946
12	NC_017058	TCTGC	2	10	12315	12324	0 %	40 %	20 %	40 %	383500947
13	NC_017058	CCAAG	2	10	16111	16120	40 %	0 %	20 %	40 %	383500948
14	NC_017058	AAAAC	2	10	16931	16940	80 %	0 %	0 %	20 %	383500948
15	NC_017058	TTTCT	2	10	17616	17625	0 %	80 %	0 %	20 %	383500949
16	NC_017058	ATTAT	2	10	20848	20857	40 %	60 %	0 %	0 %	383500950
17	NC_017058	TAAAA	2	10	21815	21824	80 %	20 %	0 %	0 %	383500950
18	NC_017058	ATATA	2	10	23553	23562	60 %	40 %	0 %	0 %	383500951
19	NC_017058	GATTT	2	10	25155	25164	20 %	60 %	20 %	0 %	383500952
20	NC_017058	CAAGC	2	10	26488	26497	40 %	0 %	20 %	40 %	383500955
21	NC_017058	ATCAT	2	10	26825	26834	40 %	40 %	0 %	20 %	383500956
22	NC_017058	ACAAG	2	10	27968	27977	60 %	0 %	20 %	20 %	383500958
23	NC_017058	TAACT	2	10	33938	33947	40 %	40 %	0 %	20 %	383500964
24	NC_017058	AGAAA	3	15	40291	40305	80 %	0 %	20 %	0 %	383500967
25	NC_017058	TACCT	2	10	42172	42181	20 %	40 %	0 %	40 %	383500967
26	NC_017058	AGAAC	2	10	44025	44034	60 %	0 %	20 %	20 %	383500968
27	NC_017058	TAAAT	2	10	47834	47843	60 %	40 %	0 %	0 %	383500970
28	NC_017058	TTTGT	2	10	48148	48157	0 %	80 %	20 %	0 %	383500971
29	NC_017058	ATATT	2	10	48223	48232	40 %	60 %	0 %	0 %	383500971
30	NC_017058	AAAAT	2	10	49243	49252	80 %	20 %	0 %	0 %	383500974
31	NC_017058	ATACT	2	10	49787	49796	40 %	40 %	0 %	20 %	383500975
32	NC_017058	CTCAT	2	10	49954	49963	20 %	40 %	0 %	40 %	383500976
33	NC_017058	CCATA	2	10	54310	54319	40 %	20 %	0 %	40 %	383500979
34	NC_017058	TTTAT	2	10	61438	61447	20 %	80 %	0 %	0 %	383500984
35	NC_017058	TATCT	2	10	62977	62986	20 %	60 %	0 %	20 %	383500986
36	NC_017058	TAAAG	2	10	65446	65455	60 %	20 %	20 %	0 %	383500990
37	NC_017058	GTTTC	2	10	69345	69354	0 %	60 %	20 %	20 %	383500993
38	NC_017058	ATTTT	2	10	69894	69903	20 %	80 %	0 %	0 %	383500993
39	NC_017058	TTGAT	2	10	76389	76398	20 %	60 %	20 %	0 %	383500999
40	NC_017058	ATATG	2	10	76582	76591	40 %	40 %	20 %	0 %	383500999
41	NC_017058	ATTAT	2	10	77489	77498	40 %	60 %	0 %	0 %	383500999
42	NC_017058	ATTGA	2	10	80777	80786	40 %	40 %	20 %	0 %	383501003
43	NC_017058	GCTTT	2	10	85967	85976	0 %	60 %	20 %	20 %	383501010
44	NC_017058	AGTTA	2	10	92417	92426	40 %	40 %	20 %	0 %	383501015
45	NC_017058	ACAAA	2	10	92789	92798	80 %	0 %	0 %	20 %	383501015
46	NC_017058	ACTTT	2	10	93581	93590	20 %	60 %	0 %	20 %	383501016
47	NC_017058	GCTTA	2	10	93770	93779	20 %	40 %	20 %	20 %	383501016
48	NC_017058	TTAAA	2	10	94498	94507	60 %	40 %	0 %	0 %	383501016
49	NC_017058	TTAAT	2	10	94709	94718	40 %	60 %	0 %	0 %	383501017
50	NC_017058	ATTTT	2	10	97807	97816	20 %	80 %	0 %	0 %	383501020
51	NC_017058	GATTA	2	10	99207	99216	40 %	40 %	20 %	0 %	383501021
52	NC_017058	ATACA	2	10	100343	100352	60 %	20 %	0 %	20 %	383501024
53	NC_017058	ATTTA	2	10	101663	101672	40 %	60 %	0 %	0 %	383501026
54	NC_017058	AAAAG	2	10	102439	102448	80 %	0 %	20 %	0 %	383501026
55	NC_017058	GGGTT	2	10	102649	102658	0 %	40 %	60 %	0 %	383501026
56	NC_017058	TTTAT	2	10	103025	103034	20 %	80 %	0 %	0 %	383501026
57	NC_017058	GCTTA	2	10	104211	104220	20 %	40 %	20 %	20 %	383501027
58	NC_017058	ACAAT	2	10	104572	104581	60 %	20 %	0 %	20 %	383501028
59	NC_017058	GTTAT	2	10	105197	105206	20 %	60 %	20 %	0 %	383501029
60	NC_017058	GTAGA	2	10	105503	105512	40 %	20 %	40 %	0 %	383501029
61	NC_017058	TAAAT	2	10	107227	107236	60 %	40 %	0 %	0 %	383501030
62	NC_017058	CAATG	2	10	107855	107864	40 %	20 %	20 %	20 %	383501031
63	NC_017058	ATAAA	2	10	108318	108327	80 %	20 %	0 %	0 %	383501032
64	NC_017058	ATTAA	2	10	109024	109033	60 %	40 %	0 %	0 %	383501032
65	NC_017058	GAAAA	2	10	109508	109517	80 %	0 %	20 %	0 %	383501033
66	NC_017058	AACAA	2	10	112786	112795	80 %	0 %	0 %	20 %	383501037
67	NC_017058	TAAAA	2	10	114229	114238	80 %	20 %	0 %	0 %	383501039
68	NC_017058	TCAAA	2	10	117576	117585	60 %	20 %	0 %	20 %	383501043
69	NC_017058	AAAGA	2	10	118206	118215	80 %	0 %	20 %	0 %	383501044
70	NC_017058	CGTTA	2	10	121216	121225	20 %	40 %	20 %	20 %	383501047
71	NC_017058	GTGTT	2	10	124584	124593	0 %	60 %	40 %	0 %	383501048
72	NC_017058	GCAAA	2	10	125822	125831	60 %	0 %	20 %	20 %	383501048
73	NC_017058	ATTTA	2	10	127185	127194	40 %	60 %	0 %	0 %	383501050
74	NC_017058	TTAAT	2	10	129641	129650	40 %	60 %	0 %	0 %	383501053
75	NC_017058	TTAGT	2	10	132642	132651	20 %	60 %	20 %	0 %	383501056
76	NC_017058	TATGT	2	10	134284	134293	20 %	60 %	20 %	0 %	383501057
77	NC_017058	CGGAT	2	10	135470	135479	20 %	20 %	40 %	20 %	383501058
78	NC_017058	TAATA	2	10	136290	136299	60 %	40 %	0 %	0 %	383501059
79	NC_017058	ATAAC	2	10	136358	136367	60 %	20 %	0 %	20 %	383501059
80	NC_017058	TTAAC	2	10	136764	136773	40 %	40 %	0 %	20 %	383501060
81	NC_017058	ATTAT	2	10	137258	137267	40 %	60 %	0 %	0 %	383501060
82	NC_017058	TCTTT	2	10	137859	137868	0 %	80 %	0 %	20 %	383501060
83	NC_017058	TTTGT	2	10	139347	139356	0 %	80 %	20 %	0 %	383501060
84	NC_017058	ATTGT	2	10	139994	140003	20 %	60 %	20 %	0 %	383501060
85	NC_017058	TGCTT	2	10	140069	140078	0 %	60 %	20 %	20 %	383501060
86	NC_017058	GATTT	2	10	140295	140304	20 %	60 %	20 %	0 %	383501060
87	NC_017058	TTATA	2	10	154037	154046	40 %	60 %	0 %	0 %	383501066
88	NC_017058	TTGTC	2	10	154111	154120	0 %	60 %	20 %	20 %	383501066
89	NC_017058	ATAAA	2	10	154198	154207	80 %	20 %	0 %	0 %	383501066
90	NC_017058	TAAAA	2	10	156463	156472	80 %	20 %	0 %	0 %	383501069
91	NC_017058	AAAAC	2	10	157159	157168	80 %	0 %	0 %	20 %	383501069
92	NC_017058	TTTAA	2	10	157235	157244	40 %	60 %	0 %	0 %	383501069
93	NC_017058	TATGC	2	10	157490	157499	20 %	40 %	20 %	20 %	383501070
94	NC_017058	TGAAA	2	10	158685	158694	60 %	20 %	20 %	0 %	383501071
95	NC_017058	TAGAA	2	10	161849	161858	60 %	20 %	20 %	0 %	383501076
96	NC_017058	GTATT	2	10	163130	163139	20 %	60 %	20 %	0 %	383501078
97	NC_017058	CACTA	2	10	164833	164842	40 %	20 %	0 %	40 %	383501079
98	NC_017058	ATTTA	2	10	165154	165163	40 %	60 %	0 %	0 %	383501079
99	NC_017058	TAAAT	2	10	167161	167170	60 %	40 %	0 %	0 %	383501080
100	NC_017058	ATTAA	2	10	168070	168079	60 %	40 %	0 %	0 %	383501081
101	NC_017058	CGTTA	2	10	168956	168965	20 %	40 %	20 %	20 %	383501082
102	NC_017058	AAAAT	2	10	170926	170935	80 %	20 %	0 %	0 %	383501084
103	NC_017058	GAAAG	2	10	171347	171356	60 %	0 %	40 %	0 %	383501084
104	NC_017058	TCTAT	2	10	171528	171537	20 %	60 %	0 %	20 %	383501085
105	NC_017058	AGTAG	2	10	172132	172141	40 %	20 %	40 %	0 %	383501085
106	NC_017058	AAATT	2	10	174781	174790	60 %	40 %	0 %	0 %	383501088
107	NC_017058	CATTA	2	10	176005	176014	40 %	40 %	0 %	20 %	383501089
108	NC_017058	ATAGT	2	10	181234	181243	40 %	40 %	20 %	0 %	383501093
109	NC_017058	ATGAA	2	10	181630	181639	60 %	20 %	20 %	0 %	383501093
110	NC_017058	TTGGC	2	10	182299	182308	0 %	40 %	40 %	20 %	383501095
111	NC_017058	GCATG	2	10	183138	183147	20 %	20 %	40 %	20 %	383501096
112	NC_017058	TTGCT	2	10	184493	184502	0 %	60 %	20 %	20 %	383501098
113	NC_017058	AATAA	2	10	184615	184624	80 %	20 %	0 %	0 %	383501098
114	NC_017058	ATTTC	2	10	186047	186056	20 %	60 %	0 %	20 %	383501099
115	NC_017058	ACAGA	2	10	186612	186621	60 %	0 %	20 %	20 %	383501100
116	NC_017058	TCTTA	2	10	187957	187966	20 %	60 %	0 %	20 %	383501100
117	NC_017058	TAAAT	2	10	188135	188144	60 %	40 %	0 %	0 %	383501100
118	NC_017058	AAAGC	2	10	188580	188589	60 %	0 %	20 %	20 %	383501101
119	NC_017058	TAAAT	2	10	188723	188732	60 %	40 %	0 %	0 %	383501101
120	NC_017058	TAAAA	2	10	189083	189092	80 %	20 %	0 %	0 %	383501101
121	NC_017058	TAAAA	2	10	189122	189131	80 %	20 %	0 %	0 %	383501101
122	NC_017058	ATAAA	2	10	189226	189235	80 %	20 %	0 %	0 %	383501101
123	NC_017058	AAAGT	2	10	189937	189946	60 %	20 %	20 %	0 %	383501102
124	NC_017058	AAAAT	2	10	190836	190845	80 %	20 %	0 %	0 %	383501103
125	NC_017058	AAAAT	2	10	190967	190976	80 %	20 %	0 %	0 %	383501104
126	NC_017058	ATACT	2	10	191898	191907	40 %	40 %	0 %	20 %	383501104
127	NC_017058	AAATA	2	10	192293	192302	80 %	20 %	0 %	0 %	383501105
128	NC_017058	AAAAC	2	10	192609	192618	80 %	0 %	0 %	20 %	383501105
129	NC_017058	AAATC	2	10	193331	193340	60 %	20 %	0 %	20 %	383501106
130	NC_017058	GTTTA	2	10	193499	193508	20 %	60 %	20 %	0 %	383501106
131	NC_017058	TTATA	2	10	195969	195978	40 %	60 %	0 %	0 %	383501113
132	NC_017058	TAAAA	2	10	196376	196385	80 %	20 %	0 %	0 %	383501113
133	NC_017058	TGTTC	2	10	197307	197316	0 %	60 %	20 %	20 %	383501115
134	NC_017058	CTTTA	2	10	197380	197389	20 %	60 %	0 %	20 %	383501115
135	NC_017058	ATTAT	2	10	197987	197996	40 %	60 %	0 %	0 %	383501115
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