MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 3876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017058	TAAC	2	8	95	102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017058	TTGC	2	8	607	614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017058	TTGC	2	8	814	821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017058	AAGA	2	8	1175	1182	75 %	0 %	25 %	0 %	383500938
5	NC_017058	ATTA	2	8	1479	1486	50 %	50 %	0 %	0 %	383500939
6	NC_017058	GCCC	2	8	1568	1575	0 %	0 %	25 %	75 %	383500939
7	NC_017058	TTAG	2	8	1972	1979	25 %	50 %	25 %	0 %	383500939
8	NC_017058	CACC	2	8	2176	2183	25 %	0 %	0 %	75 %	383500940
9	NC_017058	TTGC	2	8	2387	2394	0 %	50 %	25 %	25 %	383500940
10	NC_017058	TCTT	2	8	2475	2482	0 %	75 %	0 %	25 %	383500941
11	NC_017058	CTTT	2	8	2542	2549	0 %	75 %	0 %	25 %	383500941
12	NC_017058	TAAT	2	8	2661	2668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017058	CAAT	2	8	2896	2903	50 %	25 %	0 %	25 %	383500942
14	NC_017058	TTTC	2	8	3071	3078	0 %	75 %	0 %	25 %	383500942
15	NC_017058	ATCA	2	8	3642	3649	50 %	25 %	0 %	25 %	383500942
16	NC_017058	TTTA	2	8	3696	3703	25 %	75 %	0 %	0 %	383500942
17	NC_017058	TAAA	2	8	3887	3894	75 %	25 %	0 %	0 %	383500943
18	NC_017058	TTAA	2	8	4942	4949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017058	TCAT	2	8	5420	5427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017058	TATT	2	8	5616	5623	25 %	75 %	0 %	0 %	383500945
21	NC_017058	GATC	2	8	5629	5636	25 %	25 %	25 %	25 %	383500945
22	NC_017058	GCTT	2	8	5661	5668	0 %	50 %	25 %	25 %	383500945
23	NC_017058	TATC	2	8	5974	5981	25 %	50 %	0 %	25 %	383500945
24	NC_017058	CTTT	2	8	6086	6093	0 %	75 %	0 %	25 %	383500945
25	NC_017058	ATTT	2	8	6679	6686	25 %	75 %	0 %	0 %	383500945
26	NC_017058	ATTC	2	8	6745	6752	25 %	50 %	0 %	25 %	383500945
27	NC_017058	CATT	2	8	6808	6815	25 %	50 %	0 %	25 %	383500945
28	NC_017058	TTTG	2	8	6869	6876	0 %	75 %	25 %	0 %	383500945
29	NC_017058	GCTT	2	8	6891	6898	0 %	50 %	25 %	25 %	383500945
30	NC_017058	AAAT	2	8	7149	7156	75 %	25 %	0 %	0 %	383500945
31	NC_017058	AACG	2	8	7638	7645	50 %	0 %	25 %	25 %	383500945
32	NC_017058	AAAT	2	8	7669	7676	75 %	25 %	0 %	0 %	383500945
33	NC_017058	TAGA	2	8	7721	7728	50 %	25 %	25 %	0 %	383500945
34	NC_017058	AAGA	2	8	7748	7755	75 %	0 %	25 %	0 %	383500945
35	NC_017058	ATTA	2	8	7904	7911	50 %	50 %	0 %	0 %	383500945
36	NC_017058	AATA	2	8	7950	7957	75 %	25 %	0 %	0 %	383500945
37	NC_017058	AATA	2	8	9975	9982	75 %	25 %	0 %	0 %	383500946
38	NC_017058	GTTA	2	8	10074	10081	25 %	50 %	25 %	0 %	383500946
39	NC_017058	GTAT	2	8	10119	10126	25 %	50 %	25 %	0 %	383500946
40	NC_017058	TAAC	2	8	10301	10308	50 %	25 %	0 %	25 %	383500946
41	NC_017058	ACTA	2	8	10422	10429	50 %	25 %	0 %	25 %	383500946
42	NC_017058	TTAT	2	8	10681	10688	25 %	75 %	0 %	0 %	383500946
43	NC_017058	AGCA	2	8	10925	10932	50 %	0 %	25 %	25 %	383500946
44	NC_017058	AATT	2	8	10967	10974	50 %	50 %	0 %	0 %	383500946
45	NC_017058	AAAT	2	8	12785	12792	75 %	25 %	0 %	0 %	383500947
46	NC_017058	AGAA	2	8	12965	12972	75 %	0 %	25 %	0 %	383500947
47	NC_017058	AAAC	2	8	13070	13077	75 %	0 %	0 %	25 %	383500947
48	NC_017058	AATA	2	8	14180	14187	75 %	25 %	0 %	0 %	383500947
49	NC_017058	AATA	2	8	14455	14462	75 %	25 %	0 %	0 %	383500947
50	NC_017058	CATT	2	8	14628	14635	25 %	50 %	0 %	25 %	383500947
51	NC_017058	GACC	2	8	14800	14807	25 %	0 %	25 %	50 %	383500947
52	NC_017058	CTTT	2	8	15304	15311	0 %	75 %	0 %	25 %	383500948
53	NC_017058	CATA	2	8	15676	15683	50 %	25 %	0 %	25 %	383500948
54	NC_017058	ATAC	2	8	15738	15745	50 %	25 %	0 %	25 %	383500948
55	NC_017058	GAAT	2	8	15796	15803	50 %	25 %	25 %	0 %	383500948
56	NC_017058	CAAT	2	8	16137	16144	50 %	25 %	0 %	25 %	383500948
57	NC_017058	TTTA	2	8	16412	16419	25 %	75 %	0 %	0 %	383500948
58	NC_017058	ATTA	2	8	16616	16623	50 %	50 %	0 %	0 %	383500948
59	NC_017058	TGCT	2	8	17684	17691	0 %	50 %	25 %	25 %	383500949
60	NC_017058	TACC	2	8	18305	18312	25 %	25 %	0 %	50 %	383500949
61	NC_017058	TTGC	2	8	18320	18327	0 %	50 %	25 %	25 %	383500949
62	NC_017058	AGCT	2	8	18384	18391	25 %	25 %	25 %	25 %	383500949
63	NC_017058	TAAC	2	8	18434	18441	50 %	25 %	0 %	25 %	383500949
64	NC_017058	GCAA	2	8	18442	18449	50 %	0 %	25 %	25 %	383500949
65	NC_017058	AAGC	2	8	19052	19059	50 %	0 %	25 %	25 %	383500949
66	NC_017058	AAAT	2	8	19108	19115	75 %	25 %	0 %	0 %	383500949
67	NC_017058	TAAG	2	8	19352	19359	50 %	25 %	25 %	0 %	383500949
68	NC_017058	GCTT	2	8	20068	20075	0 %	50 %	25 %	25 %	383500949
69	NC_017058	AATT	2	8	20160	20167	50 %	50 %	0 %	0 %	383500949
70	NC_017058	TAAA	2	8	20270	20277	75 %	25 %	0 %	0 %	383500949
71	NC_017058	TGTT	2	8	21030	21037	0 %	75 %	25 %	0 %	383500950
72	NC_017058	AAAT	2	8	21563	21570	75 %	25 %	0 %	0 %	383500950
73	NC_017058	TTTC	2	8	22622	22629	0 %	75 %	0 %	25 %	383500950
74	NC_017058	TAAG	2	8	22931	22938	50 %	25 %	25 %	0 %	383500950
75	NC_017058	TCTT	2	8	23094	23101	0 %	75 %	0 %	25 %	383500950
76	NC_017058	ATTT	2	8	23173	23180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017058	CTAC	2	8	23389	23396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017058	TTTA	2	8	23512	23519	25 %	75 %	0 %	0 %	383500951
79	NC_017058	AAAT	2	8	23616	23623	75 %	25 %	0 %	0 %	383500951
80	NC_017058	TACT	2	8	23664	23671	25 %	50 %	0 %	25 %	383500951
81	NC_017058	TAAT	2	8	23856	23863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017058	ACAT	2	8	24691	24698	50 %	25 %	0 %	25 %	383500952
83	NC_017058	TCAA	2	8	24868	24875	50 %	25 %	0 %	25 %	383500952
84	NC_017058	TAAT	2	8	24920	24927	50 %	50 %	0 %	0 %	383500952
85	NC_017058	TATT	2	8	25085	25092	25 %	75 %	0 %	0 %	383500952
86	NC_017058	CAAA	2	8	25812	25819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017058	GAAA	2	8	25846	25853	75 %	0 %	25 %	0 %	383500953
88	NC_017058	GATT	2	8	25895	25902	25 %	50 %	25 %	0 %	383500953
89	NC_017058	TAAT	2	8	26880	26887	50 %	50 %	0 %	0 %	383500956
90	NC_017058	TCTT	2	8	27086	27093	0 %	75 %	0 %	25 %	383500956
91	NC_017058	TTAA	2	8	27283	27290	50 %	50 %	0 %	0 %	383500957
92	NC_017058	GCTT	2	8	29139	29146	0 %	50 %	25 %	25 %	383500959
93	NC_017058	CTCC	2	8	29525	29532	0 %	25 %	0 %	75 %	383500959
94	NC_017058	CTAT	2	8	29947	29954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017058	TGAT	2	8	30090	30097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017058	AGTT	2	8	30948	30955	25 %	50 %	25 %	0 %	383500960
97	NC_017058	CATG	2	8	31950	31957	25 %	25 %	25 %	25 %	383500961
98	NC_017058	TTGG	2	8	32621	32628	0 %	50 %	50 %	0 %	383500961
99	NC_017058	TAAA	2	8	33022	33029	75 %	25 %	0 %	0 %	383500962
100	NC_017058	TAAA	2	8	33049	33056	75 %	25 %	0 %	0 %	383500962
101	NC_017058	TAAA	2	8	33208	33215	75 %	25 %	0 %	0 %	383500962
102	NC_017058	TCAT	2	8	33329	33336	25 %	50 %	0 %	25 %	383500962
103	NC_017058	CTTT	2	8	33463	33470	0 %	75 %	0 %	25 %	383500962
104	NC_017058	TAAA	2	8	33764	33771	75 %	25 %	0 %	0 %	383500963
105	NC_017058	CAAT	2	8	34014	34021	50 %	25 %	0 %	25 %	383500964
106	NC_017058	GTTT	2	8	34063	34070	0 %	75 %	25 %	0 %	383500964
107	NC_017058	GATA	2	8	34228	34235	50 %	25 %	25 %	0 %	383500964
108	NC_017058	TGAA	2	8	34498	34505	50 %	25 %	25 %	0 %	383500965
109	NC_017058	GCTT	2	8	34782	34789	0 %	50 %	25 %	25 %	383500965
110	NC_017058	AATT	2	8	34984	34991	50 %	50 %	0 %	0 %	383500965
111	NC_017058	AATA	2	8	35560	35567	75 %	25 %	0 %	0 %	383500966
112	NC_017058	GTAA	2	8	36002	36009	50 %	25 %	25 %	0 %	383500966
113	NC_017058	TCTA	2	8	36021	36028	25 %	50 %	0 %	25 %	383500966
114	NC_017058	CTTG	2	8	36412	36419	0 %	50 %	25 %	25 %	383500966
115	NC_017058	TGTA	2	8	36480	36487	25 %	50 %	25 %	0 %	383500966
116	NC_017058	AGCA	2	8	37071	37078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017058	TAAT	2	8	37235	37242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017058	AAGC	2	8	37286	37293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017058	ATTA	2	8	37371	37378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017058	TGAA	2	8	37413	37420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017058	TAAA	2	8	37644	37651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017058	TAAA	2	8	38007	38014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017058	GATA	2	8	38089	38096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017058	AGCA	2	8	38157	38164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017058	AAAC	2	8	38413	38420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017058	AAGC	2	8	38460	38467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017058	ATAA	2	8	38534	38541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017058	TTAT	2	8	38726	38733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017058	TAAA	2	8	38949	38956	75 %	25 %	0 %	0 %	383500967
130	NC_017058	ACAG	2	8	39517	39524	50 %	0 %	25 %	25 %	383500967
131	NC_017058	GTAA	2	8	39617	39624	50 %	25 %	25 %	0 %	383500967
132	NC_017058	CTAG	2	8	39830	39837	25 %	25 %	25 %	25 %	383500967
133	NC_017058	CAAA	2	8	40365	40372	75 %	0 %	0 %	25 %	383500967
134	NC_017058	AAGT	2	8	40563	40570	50 %	25 %	25 %	0 %	383500967
135	NC_017058	GAAG	2	8	40640	40647	50 %	0 %	50 %	0 %	383500967
136	NC_017058	AGCA	2	8	41466	41473	50 %	0 %	25 %	25 %	383500967
137	NC_017058	GAAA	2	8	41671	41678	75 %	0 %	25 %	0 %	383500967
138	NC_017058	CGAG	2	8	42096	42103	25 %	0 %	50 %	25 %	383500967
139	NC_017058	TTCA	2	8	42789	42796	25 %	50 %	0 %	25 %	383500967
140	NC_017058	TAAA	2	8	43428	43435	75 %	25 %	0 %	0 %	383500967
141	NC_017058	ATTT	2	8	43887	43894	25 %	75 %	0 %	0 %	383500968
142	NC_017058	TTTA	2	8	44250	44257	25 %	75 %	0 %	0 %	383500968
143	NC_017058	TTAT	2	8	44801	44808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017058	TAAA	2	8	44911	44918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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