MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017057	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383500103
2	NC_017057	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383500104
3	NC_017057	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383500104
4	NC_017057	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383500105
5	NC_017057	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383500105
6	NC_017057	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383500105
7	NC_017057	AATGC	2	10	5707	5716	40 %	20 %	20 %	20 %	383500105
8	NC_017057	AATAC	2	10	6936	6945	60 %	20 %	0 %	20 %	383500106
9	NC_017057	AAACC	2	10	8105	8114	60 %	0 %	0 %	40 %	383500108
10	NC_017057	TTAAT	2	10	10608	10617	40 %	60 %	0 %	0 %	383500109
11	NC_017057	ACAAT	2	10	11057	11066	60 %	20 %	0 %	20 %	383500110
12	NC_017057	TAAAA	2	10	20920	20929	80 %	20 %	0 %	0 %	383500114
13	NC_017057	TTTGT	2	10	21432	21441	0 %	80 %	20 %	0 %	383500115
14	NC_017057	TAAAT	2	10	21623	21632	60 %	40 %	0 %	0 %	383500115
15	NC_017057	TTTGT	2	10	21940	21949	0 %	80 %	20 %	0 %	383500116
16	NC_017057	AATAA	2	10	22873	22882	80 %	20 %	0 %	0 %	383500118
17	NC_017057	CTATA	2	10	23532	23541	40 %	40 %	0 %	20 %	383500120
18	NC_017057	TAATA	2	10	23755	23764	60 %	40 %	0 %	0 %	383500120
19	NC_017057	GTATT	2	10	26353	26362	20 %	60 %	20 %	0 %	383500122
20	NC_017057	CCATA	2	10	27816	27825	40 %	20 %	0 %	40 %	383500123
21	NC_017057	GTTTC	2	10	30294	30303	0 %	60 %	20 %	20 %	383500124
22	NC_017057	AAATT	2	10	32768	32777	60 %	40 %	0 %	0 %	383500125
23	NC_017057	TTTTA	2	10	33598	33607	20 %	80 %	0 %	0 %	383500126
24	NC_017057	TTGAT	2	10	39555	39564	20 %	60 %	20 %	0 %	383500130
25	NC_017057	AATTG	2	10	39589	39598	40 %	40 %	20 %	0 %	383500130
26	NC_017057	ATATG	2	10	39748	39757	40 %	40 %	20 %	0 %	383500130
27	NC_017057	ATTAT	2	10	40655	40664	40 %	60 %	0 %	0 %	383500130
28	NC_017057	ATAAC	2	10	43780	43789	60 %	20 %	0 %	20 %	383500132
29	NC_017057	TAACA	2	10	44009	44018	60 %	20 %	0 %	20 %	383500132
30	NC_017057	AATAT	2	10	46188	46197	60 %	40 %	0 %	0 %	383500136
31	NC_017057	TACCT	2	10	47329	47338	20 %	40 %	0 %	40 %	383500136
32	NC_017057	TGGTA	2	10	48849	48858	20 %	40 %	40 %	0 %	383500137
33	NC_017057	AACTA	2	10	51749	51758	60 %	20 %	0 %	20 %	383500139
34	NC_017057	ACTTT	2	10	53187	53196	20 %	60 %	0 %	20 %	383500141
35	NC_017057	TTAAA	2	10	54104	54113	60 %	40 %	0 %	0 %	383500141
36	NC_017057	CAAGT	2	10	54486	54495	40 %	20 %	20 %	20 %	383500142
37	NC_017057	CTATG	2	10	55333	55342	20 %	40 %	20 %	20 %	383500142
38	NC_017057	GCTAA	2	10	56344	56353	40 %	20 %	20 %	20 %	383500143
39	NC_017057	TTTAC	2	10	58695	58704	20 %	60 %	0 %	20 %	383500145
40	NC_017057	AGCAT	2	10	58720	58729	40 %	20 %	20 %	20 %	383500145
41	NC_017057	GGGTT	2	10	60281	60290	0 %	40 %	60 %	0 %	383500146
42	NC_017057	TTTAT	2	10	60657	60666	20 %	80 %	0 %	0 %	383500146
43	NC_017057	GTTTT	2	10	61848	61857	0 %	80 %	20 %	0 %	383500147
44	NC_017057	ACAAT	2	10	62328	62337	60 %	20 %	0 %	20 %	383500148
45	NC_017057	TTTTC	2	10	62716	62725	0 %	80 %	0 %	20 %	383500148
46	NC_017057	CAATG	2	10	65608	65617	40 %	20 %	20 %	20 %	383500151
47	NC_017057	ATAAA	2	10	66023	66032	80 %	20 %	0 %	0 %	383500152
48	NC_017057	TAAAT	2	10	66429	66438	60 %	40 %	0 %	0 %	383500152
49	NC_017057	ATTAA	2	10	66777	66786	60 %	40 %	0 %	0 %	383500152
50	NC_017057	TGAAA	2	10	77670	77679	60 %	20 %	20 %	0 %	383500160
51	NC_017057	TTGAT	2	10	78997	79006	20 %	60 %	20 %	0 %	383500161
52	NC_017057	ATTTA	2	10	80843	80852	40 %	60 %	0 %	0 %	383500163
53	NC_017057	TTAGT	2	10	85839	85848	20 %	60 %	20 %	0 %	383500169
54	NC_017057	ATAAA	2	10	101175	101184	80 %	20 %	0 %	0 %	383500176
55	NC_017057	TATAA	2	10	101209	101218	60 %	40 %	0 %	0 %	383500176
56	NC_017057	TAAAA	2	10	103426	103435	80 %	20 %	0 %	0 %	383500179
57	NC_017057	AAAAC	2	10	104122	104131	80 %	0 %	0 %	20 %	383500179
58	NC_017057	TTTAA	2	10	104198	104207	40 %	60 %	0 %	0 %	383500179
59	NC_017057	TGAAA	2	10	105648	105657	60 %	20 %	20 %	0 %	383500181
60	NC_017057	CTTGT	2	10	108416	108425	0 %	60 %	20 %	20 %	383500183
61	NC_017057	ATGAT	2	10	109333	109342	40 %	40 %	20 %	0 %	383500184
62	NC_017057	AAATC	2	10	112543	112552	60 %	20 %	0 %	20 %	383500188
63	NC_017057	TTATA	2	10	113849	113858	40 %	60 %	0 %	0 %	383500189
64	NC_017057	TGCTT	2	10	114354	114363	0 %	60 %	20 %	20 %	383500190
65	NC_017057	TTTTA	2	10	115471	115480	20 %	80 %	0 %	0 %	383500190
66	NC_017057	GCTTT	2	10	117047	117056	0 %	60 %	20 %	20 %	383500191
67	NC_017057	TATGT	2	10	117700	117709	20 %	60 %	20 %	0 %	383500191
68	NC_017057	TCTAC	2	10	118045	118054	20 %	40 %	0 %	40 %	383500191
69	NC_017057	AGAAA	2	10	119661	119670	80 %	0 %	20 %	0 %	383500191
70	NC_017057	GTTTT	2	10	120346	120355	0 %	80 %	20 %	0 %	383500192
71	NC_017057	TGCAG	2	10	120679	120688	20 %	20 %	40 %	20 %	383500192
72	NC_017057	GGTAT	2	10	121376	121385	20 %	40 %	40 %	0 %	383500192
73	NC_017057	ATCTA	2	10	122554	122563	40 %	40 %	0 %	20 %	383500193
74	NC_017057	GTTTG	2	10	122985	122994	0 %	60 %	40 %	0 %	383500193
75	NC_017057	ACAAG	2	10	124940	124949	60 %	0 %	20 %	20 %	383500193
76	NC_017057	AGTTT	2	10	125251	125260	20 %	60 %	20 %	0 %	383500194
77	NC_017057	TTAGT	2	10	125774	125783	20 %	60 %	20 %	0 %	383500194
78	NC_017057	GTTAT	2	10	127175	127184	20 %	60 %	20 %	0 %	383500194
79	NC_017057	ATGGT	2	10	128316	128325	20 %	40 %	40 %	0 %	383500195
80	NC_017057	TATTT	2	10	129250	129259	20 %	80 %	0 %	0 %	383500195
81	NC_017057	CAAAG	2	10	129642	129651	60 %	0 %	20 %	20 %	383500195
82	NC_017057	GAACA	2	10	130052	130061	60 %	0 %	20 %	20 %	383500195
83	NC_017057	TGATA	2	10	131028	131037	40 %	40 %	20 %	0 %	383500195
84	NC_017057	TTTAA	2	10	136769	136778	40 %	60 %	0 %	0 %	383500201
85	NC_017057	GGTTT	2	10	137883	137892	0 %	60 %	40 %	0 %	383500202
86	NC_017057	TATCA	2	10	143760	143769	40 %	40 %	0 %	20 %	383500207
87	NC_017057	TAGCT	2	10	143847	143856	20 %	40 %	20 %	20 %	383500207
88	NC_017057	TTATT	2	10	144709	144718	20 %	80 %	0 %	0 %	383500208
89	NC_017057	ATTTT	2	10	145505	145514	20 %	80 %	0 %	0 %	383500209
90	NC_017057	ACAAA	2	10	149108	149117	80 %	0 %	0 %	20 %	383500212
91	NC_017057	TAAAA	2	10	149625	149634	80 %	20 %	0 %	0 %	383500213
92	NC_017057	TGGTG	2	10	149759	149768	0 %	40 %	60 %	0 %	383500213
93	NC_017057	TATAA	2	10	150676	150685	60 %	40 %	0 %	0 %	383500215
94	NC_017057	AAGAA	2	10	152268	152277	80 %	0 %	20 %	0 %	383500215
95	NC_017057	TGGAT	2	10	154457	154466	20 %	40 %	40 %	0 %	383500219
96	NC_017057	ACAGA	2	10	156990	156999	60 %	0 %	20 %	20 %	383500221
97	NC_017057	GCAAA	2	10	159125	159134	60 %	0 %	20 %	20 %	383500224
98	NC_017057	TGAAG	2	10	167593	167602	40 %	20 %	40 %	0 %	383500227
99	NC_017057	TATAC	2	10	168200	168209	40 %	40 %	0 %	20 %	383500227
100	NC_017057	GTAGA	2	10	168609	168618	40 %	20 %	40 %	0 %	383500227
101	NC_017057	ATTAT	2	10	175694	175703	40 %	60 %	0 %	0 %	383500232
102	NC_017057	TAAAA	2	10	176875	176884	80 %	20 %	0 %	0 %	383500232
103	NC_017057	ACTAA	2	10	177514	177523	60 %	20 %	0 %	20 %	383500233
104	NC_017057	ATATT	2	10	178654	178663	40 %	60 %	0 %	0 %	383500234
105	NC_017057	ATACC	2	10	183217	183226	40 %	20 %	0 %	40 %	383500238
106	NC_017057	ATATA	2	10	186480	186489	60 %	40 %	0 %	0 %	383500242
107	NC_017057	AATTT	2	10	186490	186499	40 %	60 %	0 %	0 %	383500242
108	NC_017057	TTAAT	2	10	186522	186531	40 %	60 %	0 %	0 %	383500243
109	NC_017057	AAAAC	2	10	186910	186919	80 %	0 %	0 %	20 %	383500243
110	NC_017057	AAAGT	2	10	187232	187241	60 %	20 %	20 %	0 %	383500243
111	NC_017057	AATAA	2	10	187798	187807	80 %	20 %	0 %	0 %	383500243
112	NC_017057	AAATT	2	10	189920	189929	60 %	40 %	0 %	0 %	383500245
113	NC_017057	AGAAA	2	10	190661	190670	80 %	0 %	20 %	0 %	383500245
114	NC_017057	AGCTA	2	10	190783	190792	40 %	20 %	20 %	20 %	383500245
115	NC_017057	TTTAT	2	10	190934	190943	20 %	80 %	0 %	0 %	383500245
116	NC_017057	AAGTG	2	10	191773	191782	40 %	20 %	40 %	0 %	383500245
117	NC_017057	CAATA	2	10	193220	193229	60 %	20 %	0 %	20 %	383500246
118	NC_017057	GAGTT	2	10	194265	194274	20 %	40 %	40 %	0 %	383500248
119	NC_017057	AGGTT	2	10	195681	195690	20 %	40 %	40 %	0 %	383500249
120	NC_017057	TATTG	2	10	197242	197251	20 %	60 %	20 %	0 %	383500251
121	NC_017057	CCAAA	2	10	197386	197395	60 %	0 %	0 %	40 %	383500251
122	NC_017057	GGTTC	2	10	202539	202548	0 %	40 %	40 %	20 %	383500256
123	NC_017057	TATCA	2	10	206125	206134	40 %	40 %	0 %	20 %	383500259
124	NC_017057	CATCT	2	10	207445	207454	20 %	40 %	0 %	40 %	383500259
125	NC_017057	AATAA	2	10	208456	208465	80 %	20 %	0 %	0 %	383500260
126	NC_017057	TTTGA	2	10	208693	208702	20 %	60 %	20 %	0 %	383500260
127	NC_017057	TAATT	2	10	208842	208851	40 %	60 %	0 %	0 %	383500260
128	NC_017057	GCTAG	2	10	208945	208954	20 %	20 %	40 %	20 %	383500260
129	NC_017057	TTGCT	2	10	211127	211136	0 %	60 %	20 %	20 %	383500261
130	NC_017057	TACCA	2	10	212683	212692	40 %	20 %	0 %	40 %	383500263
131	NC_017057	CACAT	2	10	213756	213765	40 %	20 %	0 %	40 %	383500264
132	NC_017057	TGCCA	2	10	216282	216291	20 %	20 %	20 %	40 %	383500265
133	NC_017057	TATTT	2	10	219417	219426	20 %	80 %	0 %	0 %	383500267
134	NC_017057	ATATT	2	10	220217	220226	40 %	60 %	0 %	0 %	383500267
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