MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 2431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017057	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383500101
2	NC_017057	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383500101
3	NC_017057	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383500103
4	NC_017057	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383500104
5	NC_017057	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383500104
6	NC_017057	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383500104
7	NC_017057	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383500104
8	NC_017057	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383500105
9	NC_017057	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383500105
10	NC_017057	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383500105
11	NC_017057	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383500105
12	NC_017057	ACCT	2	8	6585	6592	25 %	25 %	0 %	50 %	383500106
13	NC_017057	ACCA	2	8	6669	6676	50 %	0 %	0 %	50 %	383500106
14	NC_017057	TAAA	2	8	6677	6684	75 %	25 %	0 %	0 %	383500106
15	NC_017057	ATAA	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	383500106
16	NC_017057	CCTG	2	8	7898	7905	0 %	25 %	25 %	50 %	383500108
17	NC_017057	CAAT	2	8	9863	9870	50 %	25 %	0 %	25 %	383500109
18	NC_017057	CATG	2	8	9886	9893	25 %	25 %	25 %	25 %	383500109
19	NC_017057	ATGA	2	8	9962	9969	50 %	25 %	25 %	0 %	383500109
20	NC_017057	TTGG	2	8	10134	10141	0 %	50 %	50 %	0 %	383500109
21	NC_017057	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	383500109
22	NC_017057	TAAA	2	8	10958	10965	75 %	25 %	0 %	0 %	383500110
23	NC_017057	TAAA	2	8	10985	10992	75 %	25 %	0 %	0 %	383500110
24	NC_017057	AAAG	2	8	11262	11269	75 %	0 %	25 %	0 %	383500110
25	NC_017057	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	383500110
26	NC_017057	TAAT	2	8	12432	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	383500112
27	NC_017057	GCTT	2	8	12447	12454	0 %	50 %	25 %	25 %	383500112
28	NC_017057	AATA	2	8	13360	13367	75 %	25 %	0 %	0 %	383500113
29	NC_017057	GCTC	2	8	13564	13571	0 %	25 %	25 %	50 %	383500113
30	NC_017057	TGAT	2	8	21835	21842	25 %	50 %	25 %	0 %	383500116
31	NC_017057	ATAC	2	8	22461	22468	50 %	25 %	0 %	25 %	383500118
32	NC_017057	AACT	2	8	22649	22656	50 %	25 %	0 %	25 %	383500118
33	NC_017057	AAAT	2	8	22883	22890	75 %	25 %	0 %	0 %	383500118
34	NC_017057	CACT	2	8	22979	22986	25 %	25 %	0 %	50 %	383500118
35	NC_017057	AAGT	2	8	23032	23039	50 %	25 %	25 %	0 %	383500118
36	NC_017057	ATTA	2	8	23414	23421	50 %	50 %	0 %	0 %	383500119
37	NC_017057	ATTT	2	8	23473	23480	25 %	75 %	0 %	0 %	383500120
38	NC_017057	TATT	2	8	23720	23727	25 %	75 %	0 %	0 %	383500120
39	NC_017057	AAAT	2	8	25621	25628	75 %	25 %	0 %	0 %	383500122
40	NC_017057	TTAA	2	8	27097	27104	50 %	50 %	0 %	0 %	383500123
41	NC_017057	TAGT	2	8	27260	27267	25 %	50 %	25 %	0 %	383500123
42	NC_017057	ATTT	2	8	27279	27286	25 %	75 %	0 %	0 %	383500123
43	NC_017057	TTGC	2	8	27554	27561	0 %	50 %	25 %	25 %	383500123
44	NC_017057	ATTT	2	8	27704	27711	25 %	75 %	0 %	0 %	383500123
45	NC_017057	TTCC	2	8	27794	27801	0 %	50 %	0 %	50 %	383500123
46	NC_017057	GCTT	2	8	27932	27939	0 %	50 %	25 %	25 %	383500123
47	NC_017057	ATTT	2	8	32842	32849	25 %	75 %	0 %	0 %	383500125
48	NC_017057	ATTT	2	8	33282	33289	25 %	75 %	0 %	0 %	383500126
49	NC_017057	AAAT	2	8	33306	33313	75 %	25 %	0 %	0 %	383500126
50	NC_017057	ATAA	2	8	33782	33789	75 %	25 %	0 %	0 %	383500126
51	NC_017057	AGCA	2	8	34270	34277	50 %	0 %	25 %	25 %	383500127
52	NC_017057	TTTC	2	8	34938	34945	0 %	75 %	0 %	25 %	383500128
53	NC_017057	ATTT	2	8	35803	35810	25 %	75 %	0 %	0 %	383500128
54	NC_017057	TTGA	2	8	36645	36652	25 %	50 %	25 %	0 %	383500129
55	NC_017057	AGTA	2	8	36764	36771	50 %	25 %	25 %	0 %	383500129
56	NC_017057	TACT	2	8	37114	37121	25 %	50 %	0 %	25 %	383500129
57	NC_017057	TAAA	2	8	38583	38590	75 %	25 %	0 %	0 %	383500130
58	NC_017057	GAGT	2	8	39877	39884	25 %	25 %	50 %	0 %	383500130
59	NC_017057	ATTA	2	8	42002	42009	50 %	50 %	0 %	0 %	383500131
60	NC_017057	ACTT	2	8	42950	42957	25 %	50 %	0 %	25 %	383500132
61	NC_017057	AATA	2	8	43439	43446	75 %	25 %	0 %	0 %	383500132
62	NC_017057	TAAA	2	8	43495	43502	75 %	25 %	0 %	0 %	383500132
63	NC_017057	AAAC	2	8	43792	43799	75 %	0 %	0 %	25 %	383500132
64	NC_017057	ATTT	3	12	43807	43818	25 %	75 %	0 %	0 %	383500132
65	NC_017057	TTTA	2	8	43994	44001	25 %	75 %	0 %	0 %	383500132
66	NC_017057	AGAA	2	8	45030	45037	75 %	0 %	25 %	0 %	383500133
67	NC_017057	AAAG	2	8	45410	45417	75 %	0 %	25 %	0 %	383500134
68	NC_017057	TAAA	2	8	45477	45484	75 %	25 %	0 %	0 %	383500134
69	NC_017057	AAGA	2	8	46455	46462	75 %	0 %	25 %	0 %	383500136
70	NC_017057	TAAT	2	8	46962	46969	50 %	50 %	0 %	0 %	383500136
71	NC_017057	ATTA	2	8	47038	47045	50 %	50 %	0 %	0 %	383500136
72	NC_017057	TTAT	2	8	47233	47240	25 %	75 %	0 %	0 %	383500136
73	NC_017057	GAAT	2	8	47810	47817	50 %	25 %	25 %	0 %	383500137
74	NC_017057	CTTA	2	8	48084	48091	25 %	50 %	0 %	25 %	383500137
75	NC_017057	ATGG	2	8	48364	48371	25 %	25 %	50 %	0 %	383500137
76	NC_017057	TATG	2	8	49092	49099	25 %	50 %	25 %	0 %	383500137
77	NC_017057	GCTA	2	8	51863	51870	25 %	25 %	25 %	25 %	383500139
78	NC_017057	AATT	2	8	51959	51966	50 %	50 %	0 %	0 %	383500139
79	NC_017057	CGAC	2	8	51982	51989	25 %	0 %	25 %	50 %	383500139
80	NC_017057	AAAT	2	8	52056	52063	75 %	25 %	0 %	0 %	383500140
81	NC_017057	ATAA	2	8	52419	52426	75 %	25 %	0 %	0 %	383500140
82	NC_017057	ATAA	2	8	52748	52755	75 %	25 %	0 %	0 %	383500140
83	NC_017057	TGTT	2	8	53027	53034	0 %	75 %	25 %	0 %	383500141
84	NC_017057	TTAA	2	8	53065	53072	50 %	50 %	0 %	0 %	383500141
85	NC_017057	TTAT	2	8	53163	53170	25 %	75 %	0 %	0 %	383500141
86	NC_017057	AACT	2	8	53552	53559	50 %	25 %	0 %	25 %	383500141
87	NC_017057	TAAT	2	8	54303	54310	50 %	50 %	0 %	0 %	383500142
88	NC_017057	TTGG	2	8	54348	54355	0 %	50 %	50 %	0 %	383500142
89	NC_017057	TAAA	2	8	54426	54433	75 %	25 %	0 %	0 %	383500142
90	NC_017057	TAGT	2	8	54669	54676	25 %	50 %	25 %	0 %	383500142
91	NC_017057	ATTT	2	8	54759	54766	25 %	75 %	0 %	0 %	383500142
92	NC_017057	TAAG	2	8	55026	55033	50 %	25 %	25 %	0 %	383500142
93	NC_017057	TGTA	2	8	55629	55636	25 %	50 %	25 %	0 %	383500142
94	NC_017057	ATCT	2	8	55680	55687	25 %	50 %	0 %	25 %	383500142
95	NC_017057	TTAT	2	8	55871	55878	25 %	75 %	0 %	0 %	383500142
96	NC_017057	TAAT	2	8	55966	55973	50 %	50 %	0 %	0 %	383500142
97	NC_017057	TAGT	2	8	56282	56289	25 %	50 %	25 %	0 %	383500143
98	NC_017057	ATAG	2	8	57258	57265	50 %	25 %	25 %	0 %	383500144
99	NC_017057	TCTT	2	8	57474	57481	0 %	75 %	0 %	25 %	383500144
100	NC_017057	TATT	2	8	58681	58688	25 %	75 %	0 %	0 %	383500145
101	NC_017057	AAGA	2	8	59342	59349	75 %	0 %	25 %	0 %	383500146
102	NC_017057	GATG	2	8	60016	60023	25 %	25 %	50 %	0 %	383500146
103	NC_017057	TAAA	2	8	60757	60764	75 %	25 %	0 %	0 %	383500146
104	NC_017057	TAAA	2	8	60781	60788	75 %	25 %	0 %	0 %	383500146
105	NC_017057	TTGG	2	8	61057	61064	0 %	50 %	50 %	0 %	383500147
106	NC_017057	TCAA	2	8	61250	61257	50 %	25 %	0 %	25 %	383500147
107	NC_017057	CTCA	2	8	61284	61291	25 %	25 %	0 %	50 %	383500147
108	NC_017057	TGTT	2	8	61610	61617	0 %	75 %	25 %	0 %	383500147
109	NC_017057	TGTT	2	8	61627	61634	0 %	75 %	25 %	0 %	383500147
110	NC_017057	TATG	2	8	61819	61826	25 %	50 %	25 %	0 %	383500147
111	NC_017057	TGCC	2	8	63250	63257	0 %	25 %	25 %	50 %	383500149
112	NC_017057	AAAT	2	8	63793	63800	75 %	25 %	0 %	0 %	383500149
113	NC_017057	TGAT	2	8	63976	63983	25 %	50 %	25 %	0 %	383500149
114	NC_017057	ATTT	2	8	64405	64412	25 %	75 %	0 %	0 %	383500149
115	NC_017057	ATTT	2	8	64575	64582	25 %	75 %	0 %	0 %	383500149
116	NC_017057	AAGT	2	8	64835	64842	50 %	25 %	25 %	0 %	383500150
117	NC_017057	TAAT	2	8	64916	64923	50 %	50 %	0 %	0 %	383500150
118	NC_017057	TGGT	2	8	66983	66990	0 %	50 %	50 %	0 %	383500153
119	NC_017057	AAAC	2	8	67028	67035	75 %	0 %	0 %	25 %	383500153
120	NC_017057	ATGG	2	8	67370	67377	25 %	25 %	50 %	0 %	383500153
121	NC_017057	TGCT	2	8	67406	67413	0 %	50 %	25 %	25 %	383500153
122	NC_017057	ATCA	2	8	68138	68145	50 %	25 %	0 %	25 %	383500153
123	NC_017057	TAGA	2	8	68474	68481	50 %	25 %	25 %	0 %	383500153
124	NC_017057	AAAT	2	8	68785	68792	75 %	25 %	0 %	0 %	383500154
125	NC_017057	TTTA	2	8	68794	68801	25 %	75 %	0 %	0 %	383500154
126	NC_017057	ATTT	2	8	69123	69130	25 %	75 %	0 %	0 %	383500155
127	NC_017057	TGCT	2	8	71924	71931	0 %	50 %	25 %	25 %	383500157
128	NC_017057	AATG	2	8	72250	72257	50 %	25 %	25 %	0 %	383500157
129	NC_017057	TTAT	2	8	72644	72651	25 %	75 %	0 %	0 %	383500157
130	NC_017057	GAAA	2	8	72705	72712	75 %	0 %	25 %	0 %	383500157
131	NC_017057	TAAA	2	8	72716	72723	75 %	25 %	0 %	0 %	383500157
132	NC_017057	AAAG	2	8	73236	73243	75 %	0 %	25 %	0 %	383500158
133	NC_017057	AAAT	2	8	73588	73595	75 %	25 %	0 %	0 %	383500158
134	NC_017057	TAGT	2	8	73600	73607	25 %	50 %	25 %	0 %	383500158
135	NC_017057	ATGA	2	8	73737	73744	50 %	25 %	25 %	0 %	383500158
136	NC_017057	ATAG	2	8	74091	74098	50 %	25 %	25 %	0 %	383500158
137	NC_017057	TATT	2	8	74926	74933	25 %	75 %	0 %	0 %	383500159
138	NC_017057	CGTG	2	8	75768	75775	0 %	25 %	50 %	25 %	383500160
139	NC_017057	TGGT	2	8	75866	75873	0 %	50 %	50 %	0 %	383500160
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