MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 4515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017057	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017057	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017057	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017057	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017057	TAG	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017057	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017057	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017057	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017057	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017057	CAT	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017057	TAA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017057	ATA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017057	ATT	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017057	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017057	ATT	2	6	7555	7560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017057	ACA	2	6	7638	7643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017057	TAT	2	6	8751	8756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017057	TTA	2	6	8864	8869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017057	TAA	2	6	8905	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017057	TTA	2	6	9009	9014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017057	ACC	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017057	GTA	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017057	CAT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017057	ATT	2	6	9156	9161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017057	CAT	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017057	ACA	2	6	9191	9196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017057	TAA	2	6	9200	9205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017057	TTA	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017057	TAT	2	6	9403	9408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017057	AAT	2	6	9453	9458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017057	TAT	2	6	9477	9482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017057	AGA	2	6	11811	11816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017057	ATA	2	6	14368	14373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017057	TTA	2	6	14378	14383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017057	GTT	2	6	14433	14438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017057	TTA	2	6	14447	14452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017057	GTA	2	6	14464	14469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017057	TTG	2	6	14500	14505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017057	ATT	2	6	14514	14519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017057	ATT	2	6	14665	14670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017057	ATC	2	6	14705	14710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017057	AAG	2	6	14816	14821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017057	ATT	2	6	14927	14932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017057	TTG	2	6	14940	14945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017057	ATT	2	6	14986	14991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017057	AAG	2	6	15196	15201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017057	ACA	2	6	15270	15275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017057	AGA	2	6	15328	15333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017057	AAT	2	6	15419	15424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017057	ACA	2	6	15470	15475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017057	ATT	2	6	15500	15505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017057	ACT	2	6	15521	15526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017057	TCA	2	6	15569	15574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017057	TAG	2	6	15685	15690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017057	AGC	2	6	15693	15698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017057	GTA	2	6	15752	15757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017057	AGT	2	6	15767	15772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017057	TGA	2	6	15814	15819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017057	ATC	2	6	15835	15840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017057	TAG	2	6	15885	15890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017057	GAA	2	6	16028	16033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017057	TGA	2	6	16087	16092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017057	GAA	2	6	16148	16153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017057	TAA	2	6	16186	16191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017057	CTA	2	6	16272	16277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017057	CAA	2	6	16305	16310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017057	TAT	2	6	16512	16517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017057	TAG	2	6	16545	16550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017057	TAC	2	6	16570	16575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017057	ATA	2	6	16623	16628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017057	CAG	2	6	16713	16718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017057	AGA	2	6	16759	16764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017057	AGA	2	6	16768	16773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017057	ATC	2	6	16783	16788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017057	CTT	3	9	16827	16835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017057	CAT	2	6	16862	16867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017057	GTT	2	6	16894	16899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017057	TGA	2	6	17026	17031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017057	ACA	2	6	17104	17109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017057	CAG	2	6	17141	17146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017057	AAG	2	6	17193	17198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017057	GTA	2	6	17201	17206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017057	ATT	2	6	17243	17248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017057	TAG	2	6	17299	17304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017057	ATA	2	6	17343	17348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017057	GAT	2	6	17405	17410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017057	GAA	2	6	17471	17476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017057	ATG	2	6	17529	17534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017057	GAA	2	6	17543	17548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017057	TTA	2	6	17595	17600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017057	AGG	2	6	17622	17627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017057	AAT	2	6	17678	17683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017057	GAA	3	9	17717	17725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017057	AAG	2	6	17733	17738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017057	AAG	2	6	17771	17776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017057	ATT	3	9	17812	17820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017057	GAT	2	6	17855	17860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017057	TAA	2	6	17863	17868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017057	GAA	3	9	17903	17911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017057	TTA	2	6	18055	18060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017057	AAT	2	6	18072	18077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017057	GTA	3	9	18114	18122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017057	GAA	2	6	18135	18140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017057	TAA	2	6	18188	18193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017057	TAA	2	6	18233	18238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017057	AAT	3	9	18270	18278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017057	AAT	2	6	18336	18341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017057	GTA	2	6	18358	18363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017057	ACA	2	6	18395	18400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017057	ATT	2	6	18460	18465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017057	CAT	2	6	18501	18506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017057	TAT	3	9	18563	18571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017057	AAT	2	6	18669	18674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017057	TAA	2	6	18734	18739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017057	TTA	2	6	18808	18813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017057	ATA	2	6	18823	18828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017057	TAT	2	6	18890	18895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017057	AAT	2	6	18906	18911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017057	TAA	2	6	18914	18919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017057	ATT	2	6	18935	18940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017057	TCA	2	6	18963	18968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017057	ATA	2	6	19084	19089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017057	ACC	2	6	19134	19139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017057	ATA	2	6	19231	19236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017057	TAA	2	6	19244	19249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017057	AAG	2	6	19266	19271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017057	TTA	2	6	19308	19313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017057	CTT	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017057	ATT	2	6	19409	19414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017057	TAG	2	6	19445	19450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017057	AAT	2	6	19574	19579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017057	CAT	2	6	19732	19737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017057	TAG	2	6	19901	19906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017057	GTA	2	6	20025	20030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017057	TAA	2	6	20031	20036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017057	AAT	2	6	20108	20113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017057	GAA	2	6	20208	20213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017057	TAA	2	6	20226	20231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017057	TAG	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_017057	TAT	2	6	20400	20405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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