MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 2816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017057	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	383500101
2	NC_017057	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383500101
3	NC_017057	AT	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	383500103
4	NC_017057	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	383500103
5	NC_017057	AG	3	6	2238	2243	50 %	0 %	50 %	0 %	383500104
6	NC_017057	TA	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	383500104
7	NC_017057	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	383500104
8	NC_017057	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	383500104
9	NC_017057	TC	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	383500105
10	NC_017057	AT	3	6	3393	3398	50 %	50 %	0 %	0 %	383500105
11	NC_017057	GA	3	6	3473	3478	50 %	0 %	50 %	0 %	383500105
12	NC_017057	AT	4	8	3896	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	383500105
13	NC_017057	GA	3	6	4226	4231	50 %	0 %	50 %	0 %	383500105
14	NC_017057	TA	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	383500105
15	NC_017057	AT	3	6	5770	5775	50 %	50 %	0 %	0 %	383500105
16	NC_017057	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017057	TA	4	8	6157	6164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017057	TC	3	6	6786	6791	0 %	50 %	0 %	50 %	383500106
19	NC_017057	AT	3	6	7581	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017057	TA	3	6	8302	8307	50 %	50 %	0 %	0 %	383500108
21	NC_017057	TA	3	6	8734	8739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017057	TG	3	6	9911	9916	0 %	50 %	50 %	0 %	383500109
23	NC_017057	GA	3	6	10054	10059	50 %	0 %	50 %	0 %	383500109
24	NC_017057	AT	3	6	10971	10976	50 %	50 %	0 %	0 %	383500110
25	NC_017057	AT	4	8	12035	12042	50 %	50 %	0 %	0 %	383500111
26	NC_017057	TA	3	6	12058	12063	50 %	50 %	0 %	0 %	383500111
27	NC_017057	TA	3	6	12483	12488	50 %	50 %	0 %	0 %	383500112
28	NC_017057	TA	3	6	12832	12837	50 %	50 %	0 %	0 %	383500112
29	NC_017057	CT	3	6	12923	12928	0 %	50 %	0 %	50 %	383500112
30	NC_017057	TA	3	6	13514	13519	50 %	50 %	0 %	0 %	383500113
31	NC_017057	TG	3	6	13648	13653	0 %	50 %	50 %	0 %	383500113
32	NC_017057	TA	3	6	14390	14395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017057	AT	3	6	14558	14563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017057	TA	3	6	14586	14591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017057	AT	3	6	15003	15008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017057	AG	3	6	15848	15853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017057	TA	3	6	16977	16982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017057	AT	3	6	17310	17315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017057	TA	3	6	17485	17490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017057	TA	3	6	18616	18621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017057	AT	3	6	18673	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017057	AT	3	6	19681	19686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017057	TA	3	6	19868	19873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017057	AT	3	6	19881	19886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017057	TA	3	6	20437	20442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50	NC_017057	AT	3	6	24349	24354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53	NC_017057	AT	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	383500122
54	NC_017057	AT	3	6	25992	25997	50 %	50 %	0 %	0 %	383500122
55	NC_017057	TA	3	6	26495	26500	50 %	50 %	0 %	0 %	383500122
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64	NC_017057	AT	3	6	29067	29072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017057	AT	3	6	29268	29273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_017057	TA	3	6	29684	29689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_017057	AT	3	6	30911	30916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_017057	TA	3	6	31231	31236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017057	AT	3	6	31448	31453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017057	TA	3	6	31545	31550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_017057	TA	3	6	44798	44803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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117	NC_017057	TA	3	6	46653	46658	50 %	50 %	0 %	0 %	383500136
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119	NC_017057	AG	3	6	47120	47125	50 %	0 %	50 %	0 %	383500136
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121	NC_017057	AG	3	6	49657	49662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017057	AG	3	6	49715	49720	50 %	0 %	50 %	0 %	383500138
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130	NC_017057	TA	3	6	53276	53281	50 %	50 %	0 %	0 %	383500141
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132	NC_017057	TA	3	6	53909	53914	50 %	50 %	0 %	0 %	383500141
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141	NC_017057	TA	3	6	56050	56055	50 %	50 %	0 %	0 %	383500143
142	NC_017057	AT	4	8	56545	56552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017057	AT	3	6	56556	56561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_017057	TA	3	6	58178	58183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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